基因组印记与研究方法汇总.

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Dlk1-Gtl2 印记区域: 该区域位于小鼠12号染色体远端、人 14q32、绵羊18号染色体远端。 Dlk1, Peg11,Dio3 是该区域的蛋白编码基 因,是Sushi-ichi 样逆转录因子的Gag、Pol 的同源物。
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4基因组印记异常与疾病
基因组印记异常常和各种发育紊乱和疾病相 关,这些紊乱和疾病通常是由不正确的调节、 剂量改变和突变造成的。 印记基因的表达异常可能引起癌症、神经行 为和发育异常,还能影响母性行为。
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3.3 Micro RNA MicroRNA(miRNA)是指长度为21-25nt
的小型非编码RNA,由具有发夹结构的约7090个碱基大小的单链RNA前体加工而成,通过 抑制翻译或导致mRNA降解机制参与广泛的 发育和细胞过程。 有些印记区域含有miRNA,参与印记的发生。 如Dlk1-Gtl2 区域中antipeg11。
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印记基因中来自双亲的两条等位基因只有一个表达, 另一个不表达或表达甚微。
母系印记:母本等位基因沉默(父本表达)的印记 基因称为母系印记基因。如:Igf2 ,Ins , Ndn. 父系印记:父本等位基因沉默的印记基因称为父系 印记基因。如:Cpa4, H19,Cd81.
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目前在昆虫、植物、在真兽哺乳亚纲动物 (eutherian mammals)和有袋类动物 (marsupials)中发现了印记现象;而在单 孔类(monotremes)和鸟类中没有发现印记 现象。
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5 基因组印记的研究方法
验证基因印记最基本的方法: Mat(AA) × Fat(BB) F1(AB) RT-PCR-SSCP
F1 (AB) 不印记 (A) 父系印记 (B) 母系印记
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5.1 构建单亲二体型胚胎 利用核移植技术和细胞核融合(HVJ或仙台 病毒辅助融合)生产单亲二体型胚胎,用以 研究印记和发现印记基因。
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2.5 基因印记的发生常有组织特异性和 发育阶段特异性。
2.6 基因组中存在印记维持元件,这些 印记维持元件的缺失会导致部分印记基 因印记的丢失。
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2.7 印记基因在真兽哺乳亚纲动物保守。在 小鼠中发现的印记基因一般在其他哺乳动物 也表现印记特征,但少数基因例外(Cd81、 Igf2r)。见表
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gene
gene
CTCF
gene
gene
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3.2 乙酰化 组成核小体的组蛋白的不同氨基酸残基的乙
酰化一般和活化的染色质构型和有表达活性 的基因相关联。 H4组蛋白的乙酰化可能通过调节染色质的结 构参与印记。
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Igf2-H19 区域启动子区内H4的乙酰化水平在 两条亲本染色体上存在差异,表达的等位基 因比沉默的等位基因乙酰化水平高 。 CTCF结合蛋白和组蛋白去乙酰化活性有关。
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2 .2印记基因复制的异步性。 Igf2-H19区域的复制:父源等位基因复制早 于母源等位基因。
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2.3 染色体上基因印记的发生具有空间位置 的限制性,同一条染色体上两个印记基因之 间的基因、与印记基因相邻的基因通常不表 现印记修饰。
2.4 印记基因的发生常与该基因编码区、启 动子区以及其上下游区域特定的CpG序列有 关,这些特定序列的甲基化状态常影响亲本 特异性。
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Igf2-H19 的印记机制: Igf2-H19 区域定位于小鼠7号染色体、人 11号染色体。 Igf2 编码胎儿的一个生长因子,父本等位 基因表达。 H19的转录物是功能未知的非编码 RNA, 母本等位基因表达。
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CTCF蛋白是一个锌指蛋白,结合到特定 DMR上起绝缘子作用,这种作用具有位置依 赖性。 CTCF还介导interchromosomal association,(小鼠7号染色体的Igf2-H19和染 11号色体的Wsb1-Nf1).这种 interchromosomal association 可能参与 基因组印记。
基因组印记与研究方法
报告人 : cgl 2006年10月17日
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主要ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ容
1 基因组印记与印记基因 2 印记基因的特征 3 可能的印记机制 4 基因组印记与疾病 5 基因组印记研究方法
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1 基因组印记与印记基因
1 Genomic imprinting is a phenomenon in which alleles of a gene are expressed differentially depending on their parental origin. Those whose expression is dependent on the parental origin of the allele are known as imprinted genes.
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5.1.1 孤雄胚胎(Androgenetic embryos AG ) 方法: 去核MⅡ期卵母细胞双精受精。 受精胚胎去雌原核,并用第二个精子来源的 雄原核取代雌原核。 细胞核融合。 AG胚胎发育迟缓,相对于胚胎,胚外组织发 育较好。
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3可能的印记作用机制
3.1 DNA甲基化 DNA甲基化是一种DNA结构修饰。它 一般和基因沉默相关联,去甲基化常和 沉默基因的重新激活有关。 DNA甲基化的转录调控可能参与哺乳动 物基因组印记的产生。
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在印记区域亲本等位基因一般存在甲基化差 异,这些区域称为差异甲基化区 ( differentially methylation region , DMR)。 DMR 在调控基因印记中起重要作用。
目前在小鼠和人上已经发现了100多个印记 基因(印记转录单元)。见表 Back
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2 印记基因的特征
2.1 印记基因常成簇存在。如印记基因 Mash2、Ins、Igf2、H19位于染色体上不到 400kb的范围内。 如小鼠7号染色体 p57KIP2, KvLQT1 and Mash2---Insulin-2(Ins-2) and Igf2---H19。 人15号染色体: ZNF127 --SNRPN---IPW (encodes RNA) 。
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