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PubMed
网址: /pubmed
主讲:何卫华 (广西医科大学图书馆)
教学要求
了解PubMed数据库的基本概况 熟悉PubMed的检索界面 掌握PubMed的基本检索方法
PubMed
美国国立医学图书馆国家生物技术 信息中心开发
特点:
1.免费提供题录和文摘
PreMEDLINE:提供MEDLINE尚未经规范 处理的数据,经标引后再加入MEDLINE。 记录中有[in process]的标记,日更新。
Publisher Supplied Citations:出版商直接 向PubMed提供电子记录,包括MEDLINE 未收录的部分记录,时时更新。
PubMed主页
字段限制:著者、刊名、篇名等 数据录入时间:限制选择30天~10年 出版日期限制 文献类型限制: 7种 语种限制: 7种 子文档: 13种
检索词来源 字段限制
文献类型 选择限制
数据录入 时间限制
文献发表 日期限制
研究对象年龄限制
输入检索词,系统默 认空格为AND关系
限制检索界面
3.保存后一起打印
六.获取原文及相关资源
1.联机获取原文(文摘中超链) 2.向NLM索取原文(order)(由
图书馆出面向成员馆订购) 3.相关文献查找(related article) 4.其他数据库资源(生物信息学
等)
Pubmed演示题
1、查找乳腺癌与BRCA1基因突变相关的 文献。
显示字段选择(Display)
Abstract:来源期刊、标题、著者、著者 地址、记录性质、文献类型、勘误、评 论、PMID或UI、摘要。
Citation: 显示除上述内容外,加MeSH 词、化学物质名称、资助项目号等字段。
MEDLINE: 字段最完整,有标识符
显示格式选择
有文摘
有免费全 文链接
语种 限制
只要有文摘 的文献限制
子文档
2、预览/索引(Previw/Index) 预览检索式和检索结果的记录数 修改检索策略
(可用检索式编号#1 OR #2) 从索引表(Index)中选词检索
检索预览
检索结果
索引加词 检索
步骤1 点击预览 和索引
步骤2 输入待选词
步骤4 确定与检索栏中 检索提问的逻辑关系
2.可与提供原文的网址链接 (部分免费获取)
3.提供检索词自动转换匹配 4.操作简便、快捷
数据收录范围
OldMEDLINE:1966年以前的文献
MEDLINE:1966至今,收录世界上70多 个国家和地区的4500多种生物医学期刊, 数据每周更新。[indexed for MEDLIEN]
1.选择 记录
2.选择Clipboard
记录编号的颜色变绿
5、细节(Details)
显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:
(1)转换、确定规范词 如:liver cancerliver neoplasms
(2)修改检索策略
检索明细
数据库匹配过程
规范词转换
你输入的检索式
修改检索策略的方法:
相关文 献链接
翻页
可获电子全文的链接
输出格式选择(send to )
选中记录后——
Text当前网页文本格式 用浏览器文件保存 File所有记录文本格式:最多10000条 Clipboad 剪贴板:允许最多存储500
条,多项检索后一起保存 Email:通过邮件发送
保存检索策略
如查找:由 Chang PY撰写在 1975年 taiwan yi xue hui za zhi 上发表的文 献的其他著者
输入待检刊名 输入出版年 输入待检第一著者
特定文献查找(已知文献第一著 者,欲查其他信息如其他著者等)
得出其他著者
3.期刊数据库 (Journal database):
通过输入刊名全称或缩写名等浏 览期刊文献。
1991年开始,美国卫生健康 研究所( NIH )不定期公布能 引起死亡率和致病率升高的临床 试验项目重要新闻稿。
6、PMC (PubMed Center)
生命科学期刊资源中心
免费提供185多种期刊全文(至 2005/5/11止)
检索结果输出
显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果
2、已知:第一作者是Challis DE,出处是 Pediatric Research,2000,47(3):309~15。 要求写出其他合著者。
1.检索框中随时修改
2.利用“Limit” 、 “Preview/Index”、 “History”、 “Details”功能键实现。
二、左侧栏检索功能
1.Mesh Database
功能:确定规范检索词;查看词义注释、 树状结构表;副主题词、扩展主要主题 词等。
例:欲查SARS(严重急性呼吸窘迫综合 症)是否有相关规范词,什么时候在系 统中建立该词,有关治疗有无文献?
2.输入检索词 3.执行检索
4.点按此处可获详细注解 1.选择MeSH数据库检索
点击此处 执行检索
点击此 处确认
选择副 主题词
通过MeSH
Database 检索的结果
2.引文匹配器(Citation Matcher):
功能:输入题录信息,查找特定文 献进行补缺。
注意:刊名要准确,缩写要标准;著 者姓名大小写均可
有字段中转换
2、截词检索功能:treat*
3、强制检索功能:“single cell” (不再自动转换匹配和扩展检索)
4、链接功能: (1)链接相关文献。 (2)链接 NCBI其他数据库。 (3)链接外部资源。 (4)链接相关图书。
高级检索 一、PubMed的辅助检索(特征栏)
1、限制检索( Limits )
一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)
如:hepatitis virus
著者姓名,姓在前,名在后,如:smith ab
刊名,可输全称或MEDLINE认可的标准缩写
形式如: clin exp immunol
布尔逻辑运算式(运算符须大写)如:
stem[ti] AND neuroscience
步骤3 索引选词
3、检索史(History) 检索式回顾:检索号、检索式、
检索时间、检索记录数 编辑检索式
如:#3 AND child 注:最多可保留100个检索式。
检索历史回顾
检索号
清除检索史
检索式
检索时间
检出篇数
4、粘贴板(Clipboard)
存放检索结果,最多可存放500条记录。
提供电子原文的超链接。
期刊数据库检索
输入待检期刊名 得出期刊详细信息
4.临床问题 (Clinical Queries):
专门检索临床研究方法学(循证 医学)文献,主要涉及治疗、诊 断、病因、和预后四个分类,并 提供强调选择,即敏感度(强调 查全)或专指度(强调查准)。5.临床警Βιβλιοθήκη (Clinical Alerts):
多个检索词输入: Moore AM撰写的有关接
触性皮炎的文章
刊名的输入 (字段限定来源出处SO)
著者检索
检索式输入
仅检索有文摘 的文献
常用字段标识符:
AD 作者地址 AB 文摘 AU 著者姓名 JA 期刊名称 LA 语言文种 MAJR 主要MeSH主题词 MH 全部MeSH主题词
PG 期刊页码 DP 文献出版日期 PT 文献类型 SH 副主题词 TW 文本词 TI 题名词 VI 卷 IP 期
检索系统的主要特点:
1、检索词自动转换功能
自动对照MeSH词表、刊名转换表、短 语表、著者名索引, 依次寻找转换
短语寻找转换单词转换 单词在上述四个字段寻找转换在所
Details 中的URL ,可以让检索匹配 的详细策略放入检索框,该检索页 面可以存储入浏览器收藏夹。
Cubby 灰色栏中的功能按钮,存储 在数据库的个人文档中。
需先注册, 填写用户 名和口令
打印检索结果
1.浏览器打印(当前显示的网页)
2.show功能键,增加网页显示的记 录数
执行检索
基本检索输入框 特征栏提供辅 助检索功能
侧栏提供其他检索 如期刊数据库检索、 规范词数据库检索、 特定文献检索
PubMed检索方法
1.基本检索:在基本检索界面下 完成的检索方法。
2.高级检索:在特征栏和左侧栏 的辅助下进行的检索方法。
PubMed 基本检索规则
在检索栏中输入:
网址: /pubmed
主讲:何卫华 (广西医科大学图书馆)
教学要求
了解PubMed数据库的基本概况 熟悉PubMed的检索界面 掌握PubMed的基本检索方法
PubMed
美国国立医学图书馆国家生物技术 信息中心开发
特点:
1.免费提供题录和文摘
PreMEDLINE:提供MEDLINE尚未经规范 处理的数据,经标引后再加入MEDLINE。 记录中有[in process]的标记,日更新。
Publisher Supplied Citations:出版商直接 向PubMed提供电子记录,包括MEDLINE 未收录的部分记录,时时更新。
PubMed主页
字段限制:著者、刊名、篇名等 数据录入时间:限制选择30天~10年 出版日期限制 文献类型限制: 7种 语种限制: 7种 子文档: 13种
检索词来源 字段限制
文献类型 选择限制
数据录入 时间限制
文献发表 日期限制
研究对象年龄限制
输入检索词,系统默 认空格为AND关系
限制检索界面
3.保存后一起打印
六.获取原文及相关资源
1.联机获取原文(文摘中超链) 2.向NLM索取原文(order)(由
图书馆出面向成员馆订购) 3.相关文献查找(related article) 4.其他数据库资源(生物信息学
等)
Pubmed演示题
1、查找乳腺癌与BRCA1基因突变相关的 文献。
显示字段选择(Display)
Abstract:来源期刊、标题、著者、著者 地址、记录性质、文献类型、勘误、评 论、PMID或UI、摘要。
Citation: 显示除上述内容外,加MeSH 词、化学物质名称、资助项目号等字段。
MEDLINE: 字段最完整,有标识符
显示格式选择
有文摘
有免费全 文链接
语种 限制
只要有文摘 的文献限制
子文档
2、预览/索引(Previw/Index) 预览检索式和检索结果的记录数 修改检索策略
(可用检索式编号#1 OR #2) 从索引表(Index)中选词检索
检索预览
检索结果
索引加词 检索
步骤1 点击预览 和索引
步骤2 输入待选词
步骤4 确定与检索栏中 检索提问的逻辑关系
2.可与提供原文的网址链接 (部分免费获取)
3.提供检索词自动转换匹配 4.操作简便、快捷
数据收录范围
OldMEDLINE:1966年以前的文献
MEDLINE:1966至今,收录世界上70多 个国家和地区的4500多种生物医学期刊, 数据每周更新。[indexed for MEDLIEN]
1.选择 记录
2.选择Clipboard
记录编号的颜色变绿
5、细节(Details)
显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:
(1)转换、确定规范词 如:liver cancerliver neoplasms
(2)修改检索策略
检索明细
数据库匹配过程
规范词转换
你输入的检索式
修改检索策略的方法:
相关文 献链接
翻页
可获电子全文的链接
输出格式选择(send to )
选中记录后——
Text当前网页文本格式 用浏览器文件保存 File所有记录文本格式:最多10000条 Clipboad 剪贴板:允许最多存储500
条,多项检索后一起保存 Email:通过邮件发送
保存检索策略
如查找:由 Chang PY撰写在 1975年 taiwan yi xue hui za zhi 上发表的文 献的其他著者
输入待检刊名 输入出版年 输入待检第一著者
特定文献查找(已知文献第一著 者,欲查其他信息如其他著者等)
得出其他著者
3.期刊数据库 (Journal database):
通过输入刊名全称或缩写名等浏 览期刊文献。
1991年开始,美国卫生健康 研究所( NIH )不定期公布能 引起死亡率和致病率升高的临床 试验项目重要新闻稿。
6、PMC (PubMed Center)
生命科学期刊资源中心
免费提供185多种期刊全文(至 2005/5/11止)
检索结果输出
显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果
2、已知:第一作者是Challis DE,出处是 Pediatric Research,2000,47(3):309~15。 要求写出其他合著者。
1.检索框中随时修改
2.利用“Limit” 、 “Preview/Index”、 “History”、 “Details”功能键实现。
二、左侧栏检索功能
1.Mesh Database
功能:确定规范检索词;查看词义注释、 树状结构表;副主题词、扩展主要主题 词等。
例:欲查SARS(严重急性呼吸窘迫综合 症)是否有相关规范词,什么时候在系 统中建立该词,有关治疗有无文献?
2.输入检索词 3.执行检索
4.点按此处可获详细注解 1.选择MeSH数据库检索
点击此处 执行检索
点击此 处确认
选择副 主题词
通过MeSH
Database 检索的结果
2.引文匹配器(Citation Matcher):
功能:输入题录信息,查找特定文 献进行补缺。
注意:刊名要准确,缩写要标准;著 者姓名大小写均可
有字段中转换
2、截词检索功能:treat*
3、强制检索功能:“single cell” (不再自动转换匹配和扩展检索)
4、链接功能: (1)链接相关文献。 (2)链接 NCBI其他数据库。 (3)链接外部资源。 (4)链接相关图书。
高级检索 一、PubMed的辅助检索(特征栏)
1、限制检索( Limits )
一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)
如:hepatitis virus
著者姓名,姓在前,名在后,如:smith ab
刊名,可输全称或MEDLINE认可的标准缩写
形式如: clin exp immunol
布尔逻辑运算式(运算符须大写)如:
stem[ti] AND neuroscience
步骤3 索引选词
3、检索史(History) 检索式回顾:检索号、检索式、
检索时间、检索记录数 编辑检索式
如:#3 AND child 注:最多可保留100个检索式。
检索历史回顾
检索号
清除检索史
检索式
检索时间
检出篇数
4、粘贴板(Clipboard)
存放检索结果,最多可存放500条记录。
提供电子原文的超链接。
期刊数据库检索
输入待检期刊名 得出期刊详细信息
4.临床问题 (Clinical Queries):
专门检索临床研究方法学(循证 医学)文献,主要涉及治疗、诊 断、病因、和预后四个分类,并 提供强调选择,即敏感度(强调 查全)或专指度(强调查准)。5.临床警Βιβλιοθήκη (Clinical Alerts):
多个检索词输入: Moore AM撰写的有关接
触性皮炎的文章
刊名的输入 (字段限定来源出处SO)
著者检索
检索式输入
仅检索有文摘 的文献
常用字段标识符:
AD 作者地址 AB 文摘 AU 著者姓名 JA 期刊名称 LA 语言文种 MAJR 主要MeSH主题词 MH 全部MeSH主题词
PG 期刊页码 DP 文献出版日期 PT 文献类型 SH 副主题词 TW 文本词 TI 题名词 VI 卷 IP 期
检索系统的主要特点:
1、检索词自动转换功能
自动对照MeSH词表、刊名转换表、短 语表、著者名索引, 依次寻找转换
短语寻找转换单词转换 单词在上述四个字段寻找转换在所
Details 中的URL ,可以让检索匹配 的详细策略放入检索框,该检索页 面可以存储入浏览器收藏夹。
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2.show功能键,增加网页显示的记 录数
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基本检索输入框 特征栏提供辅 助检索功能
侧栏提供其他检索 如期刊数据库检索、 规范词数据库检索、 特定文献检索
PubMed检索方法
1.基本检索:在基本检索界面下 完成的检索方法。
2.高级检索:在特征栏和左侧栏 的辅助下进行的检索方法。
PubMed 基本检索规则
在检索栏中输入: