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PubMed 简介的个性介绍PPT
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下图为检索“Cancer”的第9674页的前三个结果
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资料来源
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亲手下厨, 亲手下厨,亲自试验
盗用小惠老师的名字 咱注册了一个NCBI账户 结果中文用户名不给咱通过
客户端
pubmed客户端 pubmed客户端 完全免费,界面
汉化,支持中文查询,mesh词中英 文对照,可免费快速获得全文。
New Data
PubMed
Collect
Pre-Medline
Process
Medline
PubMed
• OLDMEDLINE 含1950年至1965年期间
发表的200万篇生物医学文献。 OldMedline的记录没有MeSH字段和摘 要,记录的标记为:[PubMedOLDMEDLINE for Pre1966]。
搜索试一试
1.在客户端的作者一栏中打“吴小慧”,结 果。。。。。。
2.在客户端的第一栏中打“wuxiaohui”,结 果。。。。。。
在网站上的搜索结果
• PreMedline 收集未正式给予MeSH词、
出版类型等深度标引信息的一个临时 库。NLM每天把最新记录加入到 PreMedline库中,每条记录均带有 [PubMed--in Process]标志。工作人 员在一周内将这些记录标引,然后转 入MEDLINE,同时从PreMedline中删去。
包含了什么? 包含了什么?
数据类型: 期刊论文 综述 与其它数据库的相关记录和链接 数据来源: MEDLINE OLDMEDLINE Record in process Record supplied by publisher ……
• MEDLINE ?收录1966年以来的包含医学、
pubmed文献检索PPT课件
![pubmed文献检索PPT课件](https://img.taocdn.com/s3/m/3990825a08a1284ac85043e1.png)
编辑版
77
2. PubMed的主题词检索是其最具特色的 功能之一,能保证较好的查准率及查准 率。主题词组配副主题词使检索结果更 为专指,限定在主要主题词检索能使结 果更准确。
编辑版
78
3.但是主题词检索也有一些固有的缺陷, 比如很多专指的概念没有相应的主题词, 一些新出现的概念要几年后才收录为主 题词这种情况下,不宜采用主题词检索, 采用字段限定检索等方法也能得到较好 的查准率。此外,主题词检索还可能会 漏掉一些最新的文献(in process citations),这也是需要注意的。
编辑版
69
Clinical Queries临床咨询
研究范畴:一般疾病的病因学、预后、
诊断、预防以及治疗 Finding Systematic Reviews:提供系统 评价、meta分析、临床试验综述临床指 南等循证医学文献信息的查找
Medical Genetics Searches
编辑版
70
编辑版
编辑版
59
4)应用MeSH主题词的Major Topic(主 要主题词)检索:
可以使检索结果更加准确。
点选Restrictions Search to Major Topic headings only,
限定检索结果为主要主题词。
编辑版
60
建立检索式
如果有多个主题词, 可以先分别对每个主题词进行检索, 再在高级检索的Search History中用检索 序号进行布尔逻辑运算; 也可以通过主题词检索页面的PubMed search 直接建立检索式
形变异词。 ▪ 截词功能只限于单词,对词组无效
编辑版
30
布尔检索
布尔运算符AND,OR,NOT必须大 写 从左至右进行布尔运算 以通过加圆括符改变运算顺序
新版PubMed文献检索ppt课件
![新版PubMed文献检索ppt课件](https://img.taocdn.com/s3/m/ad463679336c1eb91a375d74.png)
NCBI成立的主要任务为: 提供生物医学的分析与计算工具,协助研究人员了解生物的语言-DNA在健康与疾病中所扮演的角色 发展新技术协助了解调控健康与疾病的基本分子与遗传过程, 包 括建立储存与分析分子生物、生化与遗传学知识的自动系统;促 进研究与医学社群使用数据库与软件;协调生物技术信息的传递 与 管理;执行以计算机为基础的进阶信息分析过程,用以分析生 物重要分子的结构与功能。
BLAST是一个NCBI开发的序列相似搜索程序,还可作为鉴别 基因和遗传特点的手段。BLAST能够在小于15秒的时间内对整 个DNA数据库执行序列搜索。NCBI提供的附加的软件工具有: 开放阅读框寻觅器(ORF Finder),电子PCR,和序列提交工 具,Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以从 HTTP或FTP来获得。
与分子生物社群互动,利用计算与理论方法提 高实验研究质量。
NCBI组织架构
Information Engineering Branch(IEB)
进行数据表现与分析的应用研究,包括在分子生物、遗 传学与生物化学的计算机储存、管理与检索系统。
设计各种呈现分子生物信息的数据库架构与规格书,包 括核酸、蛋白质与结构信息。
Entrez可以检索的数据库
Books 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库 Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of
Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、 临床与文献相关数据 Conserved Domain Database(CDD),蛋白质功能区块保留序列数据库 3D Domains,蛋白质功能区块立体结构数据 Gene,包含许多物种的基因数据库 Genome,包含超过800种物种的基因组数据库 GENSAT,小鼠中枢神经系统基因表现图谱 GEO Datasets,基因表现实验与生物芯片数值结果数据 GEO Profiles,基因表现图谱 HomoloGene,同源基因批注数据库 Journals,期刊文献(包含PubMed) MeSH,医学主题词数据库 NCBI Web Site,所有NCBI网页 NLM Catalog,美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录 Nucleotide sequence database,核酸序列数据库(包含GenBank、 RefSeq和PDB等三大序列数据库)
BLAST是一个NCBI开发的序列相似搜索程序,还可作为鉴别 基因和遗传特点的手段。BLAST能够在小于15秒的时间内对整 个DNA数据库执行序列搜索。NCBI提供的附加的软件工具有: 开放阅读框寻觅器(ORF Finder),电子PCR,和序列提交工 具,Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以从 HTTP或FTP来获得。
与分子生物社群互动,利用计算与理论方法提 高实验研究质量。
NCBI组织架构
Information Engineering Branch(IEB)
进行数据表现与分析的应用研究,包括在分子生物、遗 传学与生物化学的计算机储存、管理与检索系统。
设计各种呈现分子生物信息的数据库架构与规格书,包 括核酸、蛋白质与结构信息。
Entrez可以检索的数据库
Books 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库 Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of
Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、 临床与文献相关数据 Conserved Domain Database(CDD),蛋白质功能区块保留序列数据库 3D Domains,蛋白质功能区块立体结构数据 Gene,包含许多物种的基因数据库 Genome,包含超过800种物种的基因组数据库 GENSAT,小鼠中枢神经系统基因表现图谱 GEO Datasets,基因表现实验与生物芯片数值结果数据 GEO Profiles,基因表现图谱 HomoloGene,同源基因批注数据库 Journals,期刊文献(包含PubMed) MeSH,医学主题词数据库 NCBI Web Site,所有NCBI网页 NLM Catalog,美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录 Nucleotide sequence database,核酸序列数据库(包含GenBank、 RefSeq和PDB等三大序列数据库)
pubmed数据库检索ppt课件
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Web of Science
学科覆盖面较广,不仅限于医学 领域,还涵盖了工程技术、物理 、化学、社会科学等众多领域, 提供引文追踪和分析功能;
Google Scholar
搜索引擎性质,可以搜索到各种 类型的文献,包括学术论文、专 利、会议论文等,覆盖面广泛。
06
PubMed数据库检索应用案 例
临床疾病研究检索案例
总结词
临床疾病研究检索案例
详细描述
PubMed数据库在临床疾病研究方面具有广泛的应用,例如检索关于糖尿病、心 血管疾病、癌症等领域的最新研究成果。通过关键词、主题词、作者等检索条件 ,研究人员可以快速获取相关文献,为临床实践和研究提供科学依据。
药物研发检索案例
总结词
药物研发检索案例
详细描述
在药物研发过程中,PubMed数据库也发挥了重要作用。研究人员可以利用PubMed数据库检索新药 研发相关的文献,了解药物的作用机制、药效学和药代动力学等方面的信息。这有助于加速药物研发 进程,提高新药的成功率和效益。
基础医学研究检索案例
总结词
基础医学研究检索案例
详细描述
基础医学研究是医学领域的重要组成部分,而PubMed数据库在基础医学研究检索方面 也有广泛应用。例如,研究人员可以利用PubMed数据库检索基因、蛋白质、细胞等方 面的最新研究成果,了解生命科学领域的最新进展,为进一步的基础医学研究提供思路
和方向。
提供多种检索方式,支持 关键词、作者、标题等字 段的检索,同时支持高级 检索和模糊检索。
数据库发展历程
01
02
03
04
1996年
美国国家医学图书馆(NLM) 建立PubMed数据库,最初只 收录MEDLINE数据库中的文献。
MedLinePUBMED数据库检索.ppt
![MedLinePUBMED数据库检索.ppt](https://img.taocdn.com/s3/m/b0e8884501f69e3142329426.png)
PUBMED应用Entrez系统实现MEDLINE的检索。Entrez系统 是基于文本的检索系统,NCBI的多个重要数据库都使用了这个 平台,如:PubMed, Nucleotide(核酸),Protein Sequences (蛋白质序列), Protein Structures(蛋白结构), Complete Genomes(全基因组), Taxonomy等。 数据来源
限定条件
主题词
•点击PubMed主页 “Mesh Database”链接,或在“search”后的数据库选择下拉框中选择 “Mesh”可进入主题词检索。 •在检索框内输入检索词,如:heart surgery ,点击“Search”或“Go”。 •有匹配主题词时或款目词,列出相关的主题词及其解释。 •若没有匹配的主题词或款目词,Suggestions中列出与输入词“heart surgery”词形相近的词。
检索式输入框
数据库选择
个性化注册
基本检索 高级(限定)检索 主题词检索 辅助检索 预检索/索引检索(Preview/Index)
1.
2.
3. 4.
5.
6.
Search Field Descriptions and Tags Affiliation [AD] All Fields [ALL] Author [AU] First Author Name [1AU] 关键词检索:在检索框中输入单个或多个关键词,中间可空格、逗号或逻辑组 Full Author Name [FAU] 配符将关键词隔开。空格、逗号时默认的是逻辑组配符 AND。 Issue [IP] 期刊检索:在输入框中输入刊名进行检索,刊名可以是MEDLINE认可的标准 Journal Title [TA] 缩写或全称、NLM ID, ISO缩写或ISSN号。也可以先点击左边Journals Language [LA] Database进行期刊检索。在Journals Database界面下列出了提供全文的期刊列 MeSH Major Topic [MAJR] 表,部分期刊提供免费全文,有些期刊浏览全文时需要注册或订购。 MeSH Subheadings [SH] 作者检索:输入作者(姓在前,名在后)进行检索,通常姓用全称,名用缩写。 MeSH Terms [MH] 字段限定检索: 一般格式为“检索词 [字段名或缩写]”,如cirrhosis[ti]表示在题 Publication Date [DP] 名中检索 cirrhosis。 Publication Type [PT] Subset [SB] 支持布尔逻辑组配,逻辑组配符大小写均可,但最好使用 逻辑组配: PubMed Substance Name [NM] 大写字母,逻辑组配式的运行次序是从左至右按逻辑运算符运算级别进行运算, Text Words [TW] 可使用括号改变其运算次序。 Title [TI] 可采用星号(*)进行截词检索,如检索neoplas*,则表示 截词检索: PubMed Title/Abstract [TIAB] 检索所有词以 neoplas开始的词,如 neoplasia、neoplasm、neoplasticism等单词。 Transliterated Title [TT] Volume [VI]
PubMed数据库检索教程培训课件
![PubMed数据库检索教程培训课件](https://img.taocdn.com/s3/m/1de4c1aaa26925c52dc5bf37.png)
COMPANY LOGO
直接输检索词,查询 结果是与输入词相关
的主题词,共8个
PubMed数据库检索教程
28
主题词/副主题词选择
主题词 副主题词
选择主/副主题词 后,送到检索框
COMPANY LOGO
主要主题词 下位词扩展
加权检索,即查重 点论述的主题, 提高文献相关度
PubMed数据库检索教程
29
COMPANY LOGO
PubMed数据库检索教程
20
查看邮件
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PubMed数据库检索教程
21
邮件保留相关链接
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PubMed数据库检索教程
22
期刊网站全文(网页格式)
COMPANY LOGO
PubMed数据库检索教程
23
PMC原文
COMPANY LOGO
注意限定条件的使用 与修改
PubMed数据库检索教程
11
Summary显示(默认格式)
COMPANY LOGO
题名
作者
出处(刊名、年、卷、期、页)
PMID 相关链接
检索明 细框
PubMed数据库检索教程
12
改变显示格式
COMPANY LOGO
PubMed数据库检索教程
13
摘要显示及全文链接
COMPANY LOGO
树状结构表
COMPANY LOGO
款目词(同 义词)
系统自动扩展 检索
❖了解同一概念的同义词、近义词,供自由 词检索参考;
❖根据树形结构调整检索词
缩小:不扩展下位词,或选用某个下位词; 扩大:选用上位词,或选用多个同位词;
【医学PPT课件】PubMed检索指南
![【医学PPT课件】PubMed检索指南](https://img.taocdn.com/s3/m/b842e0290242a8956aece445.png)
龄(Ages )、文献子集限定(Subsets ) 自由词可以结合以上各种限定进行。
限 定 检 索 窗 口 全 貌
添加作者检索
添加期刊检索
限定记录有全文、免费全文或 摘要
文献发表时间限定
记录添加到PubMed时间限定
限定记录有全文、免费全文或 摘要
人类与动物限定 性别限定
文献语种限定
文献子集限定
Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等 字段
Title/Abstract [TIAB]
四、PubMed检索功能
检索
1、自由词智能检索
在检索框中键入一到多个单词,如键入: vitamin c AND common cold hepatitis b AND (diagnosis OR therapy)
SubHeadings 副主题词
对一个主题词的多个方面进行修饰限定 的词,又称限定词。
特征栏功能介绍-Clipboard
(四) Clipboard功能介绍
将每次满意的检索结果暂时保存至此 最后集中处理(下载存盘或发E-mail) 最多500条记录,断开连接后保存8小时
(五) Details功能介绍
Details:显示计算机响应的本次检索式。
点击“URL”
/entrez/query.fcgi?cmd=Pu reSearch&db=pubmed&details_term=effect%5BAll%2 0Fields%5D%20AND%20%28%28%22magnetic%20r esonance%20imaging%22%5BTIAB%5D%20NOT%2 0Medline%5BSB%5D%29%20OR%20%22magnetic% 20resonance%20imaging%22%5BMeSH%20Terms% 5D%20OR%20MRI%5BText%20Word%5D%29%20A ND%20Review%5Bptyp%5D%20AND%20%222005/0 2/13%2000.01%22%5BEDAT%5D%20%3A%20%222
限 定 检 索 窗 口 全 貌
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文献发表时间限定
记录添加到PubMed时间限定
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人类与动物限定 性别限定
文献语种限定
文献子集限定
Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等 字段
Title/Abstract [TIAB]
四、PubMed检索功能
检索
1、自由词智能检索
在检索框中键入一到多个单词,如键入: vitamin c AND common cold hepatitis b AND (diagnosis OR therapy)
SubHeadings 副主题词
对一个主题词的多个方面进行修饰限定 的词,又称限定词。
特征栏功能介绍-Clipboard
(四) Clipboard功能介绍
将每次满意的检索结果暂时保存至此 最后集中处理(下载存盘或发E-mail) 最多500条记录,断开连接后保存8小时
(五) Details功能介绍
Details:显示计算机响应的本次检索式。
点击“URL”
/entrez/query.fcgi?cmd=Pu reSearch&db=pubmed&details_term=effect%5BAll%2 0Fields%5D%20AND%20%28%28%22magnetic%20r esonance%20imaging%22%5BTIAB%5D%20NOT%2 0Medline%5BSB%5D%29%20OR%20%22magnetic% 20resonance%20imaging%22%5BMeSH%20Terms% 5D%20OR%20MRI%5BText%20Word%5D%29%20A ND%20Review%5Bptyp%5D%20AND%20%222005/0 2/13%2000.01%22%5BEDAT%5D%20%3A%20%222
pubmed检索方法ppt课件
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医学文献数据库成质立信的息原,因同是时为 亦已可故连的结参到议生院物议分员类C数la据u库de查P询ep生pe物r发分现类 全文电子期刊库计信算息信。息处理方法对生物医学研究的重要性,因此,在 人基类因孟 图德 谱尔遗传1部目下9门前:88之,年N一11C。月BI4提日供成的立公N开CB(I。OpNeCnBAI是ccNesIHs)底数下据的库NL包M括的如 DNA与蛋白质序列 3D蛋白质结构 NCBI分类学
匹配器
• Journal Database-期刊库
• Batch Citation Matcher-多篇引文 • Clinical trails-对公众提供临床科研
匹配器
的当前信息
• Clinities-Entrez程序设计公用程序 ,诊断,病因,预后
7
(三)PubMed与MEDLINE
+ Not MEDLINE 出版商提供的电子文献中MEDLINE不收录的数 据。出版商一般提供的是整本期刊的信息,一 部分数据每日将被添加到PreMedline中去,若有 部分没有被MEDLINE收录,PubMed仍保存。每 条记录标有[PubMed-as supplied by publisher]。
- 累积了2200多万篇文献,年收录文献约40万篇,涉 及37个语种,回溯至1950年的数据涉及60个语种。数据库 47%为美国本土出版的文献,90%为英文文献,79%的文献有 著者撰写的英文摘要。
4
- 是一个免费的生物医学文摘数据库,约10%论文提 供全文(PMC),大部分论文提供指向全文提供者(付费 或免费)的链接。 + 学科范围:
1
一、 数据库概况 二、 检索体系 三、 结果处理 四、 PMC
2
/pubmed/
匹配器
• Journal Database-期刊库
• Batch Citation Matcher-多篇引文 • Clinical trails-对公众提供临床科研
匹配器
的当前信息
• Clinities-Entrez程序设计公用程序 ,诊断,病因,预后
7
(三)PubMed与MEDLINE
+ Not MEDLINE 出版商提供的电子文献中MEDLINE不收录的数 据。出版商一般提供的是整本期刊的信息,一 部分数据每日将被添加到PreMedline中去,若有 部分没有被MEDLINE收录,PubMed仍保存。每 条记录标有[PubMed-as supplied by publisher]。
- 累积了2200多万篇文献,年收录文献约40万篇,涉 及37个语种,回溯至1950年的数据涉及60个语种。数据库 47%为美国本土出版的文献,90%为英文文献,79%的文献有 著者撰写的英文摘要。
4
- 是一个免费的生物医学文摘数据库,约10%论文提 供全文(PMC),大部分论文提供指向全文提供者(付费 或免费)的链接。 + 学科范围:
1
一、 数据库概况 二、 检索体系 三、 结果处理 四、 PMC
2
/pubmed/
PubMed检索系统——文献检索精品课件
![PubMed检索系统——文献检索精品课件](https://img.taocdn.com/s3/m/08b4a52d580216fc700afd48.png)
PubMed系统包括
1966年以来的文献数据 1400万,5164种 记录状况注释标识 OLDMEDLINE 1949-65年的文献数据 (1930) , 180万 [PubMED—In Process] 23 万余篇
MEDLINE
The out-of-scope from MEDLINE
使用Preview/Index
1)MeSH database
gastric ulcer
1)MeSH database
1)MeSH词表
1 )MeSH database 仅检索该主题词
使用links对该主题词进行全部选项的检索
与其他主题词运算检索
使用Send to将主题词发送到 检索框进行逻辑运算检索
PubMed 检索系统
主要内容
概况 检索主界面 常用检索方法 结果显示输出
使用提示
一、简 介
/entrez
PubMed是位于美国国家卫生研究院(NIH)
的美国国家医学图书馆(NLM)开发的基于WEB
的生物医学信息检索系统,建立于国家生物技术 信息中心(NCBI)平台上,是NCBI Entrez检索 系统的重要组成部分之一,在网上免费向公众开 放使用。
对主题词进行选项检索
点击主题词进行选项检索
主题词检索选项
cimetidine 副主题词
√
主要主题词
不扩展
2)字段限定
Stomach Ulcer [MeSH] Stomach Ulcer/dt [MeSH]
Esophageal Neoplasms [MAJR]
Hypertension [MeSH:NoEXP]
Clipboard:保存检索结果或检索词,可用于检索结果 的集中输出。可存储500条记录,保存8小时。 Details:显示检索细节,修订检索方案。
PubMedPPT课件
![PubMedPPT课件](https://img.taocdn.com/s3/m/eadc3d4a4b73f242326c5f06.png)
1133
医学医文学献文检献索检索
基本检索—截词检索
❖使用无限通配符“*”,可实现截词检索。 ❖PubMed会关闭自动词语匹配功能,在所有字段中执行检索。 ❖各检索词间为逻辑OR关系。
在所有字段检索前缀为 acupunctur的检索词
1144
医学医文学献文检献索检索
基本检索—字段限定检索
❖ 在检索词后输入检索字段标识可进行字段限定检索,以提高查准率。 ❖ 输入格式为:检索词[字段标识]。如检索标题中含Diabetes(糖尿病)
44
医学医文学献文检献索检索
检索方法
主界面 常用检索途径
检索方法 检索结果显示和输出
检索实例
55
医学医文学献文检献索检索
数据库选择
66
检检索索方输式入、帮框助
检索、清除
检索区
主题检索 期刊检索
PubMed 功能服务区索
77
医学医文学献文检献索检索
基本检索 (search) 高级检索(Advanced search) 限定检索 (Limits) 主题检索 (MeSH Database) 期刊检索 (Journals Database) 其他检索功能
❖ NOTEDLINE NIH资助的研究人员的手稿、向PubMedCentral提交全文的 生命科学期刊论文、及接受NLM评审的文献,这些记录均不被MEDLINE 收录,末尾标注为[PubMed]。
注意:许多出版商通过电子期刊平台发布最新的文献信息,这些先于印刷版
期刊发表的电子期刊文献加标[Epub ahead of print]标识。
❖ PreMEDLINE 临时存放尚未标引MeSH主题词、文献类型的最新数据,待 数据完成标引后再转入MEDLINE,记录末尾标有[PubMed-in Process]。
pubmed检索教程PPT课件
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12 .
2020/5/19
(三) PubMed收录数据
MEDLINE Inprocess
最新的MEDLINE处理中数据,未标引,无MeSH字段。每 条记录标有:
[PubMed-in process]。
Publisher-Supplied
出版商提供的电子文献题录,每条记录标有:
[PubMed-as supplied by publisher],分为两类:
三、PubMed 基本检索规则
刊名检索:全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如:Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
输入刊名检索发表在该刊上 的文献(限定出处字段SO)
18 .
2020/5/19
PubMed记录字段说明
30 .
2020/5/19
六、PubMed其他资源
1. Mesh Database(规范化医学主题词表)
功能:
确定规范化主题词
查看主题词词义注释、树状结构表
选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词
进入途径:
MeSH Database链接:PubMed主页,Advanced Search界面
MeSH选项:基本检索框前Search下拉菜单的
11 .
2020/5/19
(三) PubMed收录数据
MEDLINE Indexed
1966 to prensent 的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和 摘要,每条记录标有: [PubMed-indexed for MEDLINE]
OldMEDLINE
1949-1965年间的MEDLINE数据,无MeSH字段和摘要,每 条记录标有: [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]
《ubMed检索》课件
![《ubMed检索》课件](https://img.taocdn.com/s3/m/b3c5cb4302d8ce2f0066f5335a8102d276a261dc.png)
优势
• 提供各种文献类型的详细索引信息,方便用 户筛选和排序
• 提供丰富的专业术语词表,方便用户选择关 键词进行检索
• 提供可视化数据分析和统计工具,方便用户 对检索结果进行深度分析和研究
Hale Waihona Puke 使用ubMed检索的步骤1
第二步:调整检索条件
2
根据您的搜索结果,调整检索条件,如
语言、日期等。
3
第四步:筛选和排序
使用高级检索工具,如Boolean运 算符、括号等,优化检索策略。
筛选和排序检索结果
使用筛选和排序工具,如日期、 文献类型、地理位置等,对检索 结果进行二次筛选和排序。
结果解读与分析
浏览和筛选论文
根据摘要、关键词、作者等信息,筛选符合要求的文献,并进行阅读。
评估论文的质量和可信度
评估文献的质量和可信度,考虑文献的来源、作者、样本量、方法等因素。
课程总结
1 总结课程内容
本课程向您介绍了ubMed 检索的基本方法和高级技 巧,帮助您提高科研工作 的效率。
2 提供其他学习资源
3 开放问答时间
为您提供更多的学习资源, 了解科研进展和最新技术。
为您提供问答环节,解答 您在学习中遇到的问题。
如何高效使用ubMed检索 论文
本课程将向您介绍如何使用ubMed检索不同的论文,提高您的检索效率,降 低您的时间成本,让您更加专注于学术研究。
什么是ubMed检索
1 ubMed是什么?
ubMed是美国国家医学图 书馆提供的生命科学和医 学领域的文献数据库。
2 为什么使用ubMed检
索?
ubMed包含了海量的生命 医学相关文献,对于科研 人员和临床医生来说是必 不可少的信息工具。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
PubMed
网址: /pubmed
主讲:何卫华 (广西医科大学图书馆)
教学要求
了解PubMed数据库的基本概况 熟悉PubMed的检索界面 掌握PubMed的基本检索方法
PubMed
美国国立医学图书馆国家生物技术 信息中心开发
特点:
1.免费提供题录和文摘
PreMEDLINE:提供MEDLINE尚未经规范 处理的数据,经标引后再加入MEDLINE。 记录中有[in process]的标记,日更新。
Publisher Supplied Citations:出版商直接 向PubMed提供电子记录,包括MEDLINE 未收录的部分记录,时时更新。
PubMed主页
字段限制:著者、刊名、篇名等 数据录入时间:限制选择30天~10年 出版日期限制 文献类型限制: 7种 语种限制: 7种 子文档: 13种
检索词来源 字段限制
文献类型 选择限制
数据录入 时间限制
文献发表 日期限制
研究对象年龄限制
输入检索词,系统默 认空格为AND关系
限制检索界面
3.保存后一起打印
六.获取原文及相关资源
1.联机获取原文(文摘中超链) 2.向NLM索取原文(order)(由
图书馆出面向成员馆订购) 3.相关文献查找(related article) 4.其他数据库资源(生物信息学
等)
Pubmed演示题
1、查找乳腺癌与BRCA1基因突变相关的 文献。
显示字段选择(Display)
Abstract:来源期刊、标题、著者、著者 地址、记录性质、文献类型、勘误、评 论、PMID或UI、摘要。
Citation: 显示除上述内容外,加MeSH 词、化学物质名称、资助项目号等字段。
MEDLINE: 字段最完整,有标识符
显示格式选择
有文摘
有免费全 文链接
语种 限制
只要有文摘 的文献限制
子文档
2、预览/索引(Previw/Index) 预览检索式和检索结果的记录数 修改检索策略
(可用检索式编号#1 OR #2) 从索引表(Index)中选词检索
检索预览
检索结果
索引加词 检索
步骤1 点击预览 和索引
步骤2 输入待选词
步骤4 确定与检索栏中 检索提问的逻辑关系
2.可与提供原文的网址链接 (部分免费获取)
3.提供检索词自动转换匹配 4.操作简便、快捷
数据收录范围
OldMEDLINE:1966年以前的文献
MEDLINE:1966至今,收录世界上70多 个国家和地区的4500多种生物医学期刊, 数据每周更新。[indexed for MEDLIEN]
1.选择 记录
2.选择Clipboard
记录编号的颜色变绿
5、细节(Details)
显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:
(1)转换、确定规范词 如:liver cancerliver neoplasms
(2)修改检索策略
检索明细
数据库匹配过程
规范词转换
你输入的检索式
修改检索策略的方法:
相关文 献链接
翻页
可获电子全文的链接
输出格式选择(send to )
选中记录后——
Text当前网页文本格式 用浏览器文件保存 File所有记录文本格式:最多10000条 Clipboad 剪贴板:允许最多存储500
条,多项检索后一起保存 Email:通过邮件发送
保存检索策略
如查找:由 Chang PY撰写在 1975年 taiwan yi xue hui za zhi 上发表的文 献的其他著者
输入待检刊名 输入出版年 输入待检第一著者
特定文献查找(已知文献第一著 者,欲查其他信息如其他著者等)
得出其他著者
3.期刊数据库 (Journal database):
通过输入刊名全称或缩写名等浏 览期刊文献。
1991年开始,美国卫生健康 研究所( NIH )不定期公布能 引起死亡率和致病率升高的临床 试验项目重要新闻稿。
6、PMC (PubMed Center)
生命科学期刊资源中心
免费提供185多种期刊全文(至 2005/5/11止)
检索结果输出
显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果
2、已知:第一作者是Challis DE,出处是 Pediatric Research,2000,47(3):309~15。 要求写出其他合著者。
1.检索框中随时修改
2.利用“Limit” 、 “Preview/Index”、 “History”、 “Details”功能键实现。
二、左侧栏检索功能
1.Mesh Database
功能:确定规范检索词;查看词义注释、 树状结构表;副主题词、扩展主要主题 词等。
例:欲查SARS(严重急性呼吸窘迫综合 症)是否有相关规范词,什么时候在系 统中建立该词,有关治疗有无文献?
2.输入检索词 3.执行检索
4.点按此处可获详细注解 1.选择MeSH数据库检索
点击此处 执行检索
点击此 处确认
选择副 主题词
通过MeSH
Database 检索的结果
2.引文匹配器(Citation Matcher):
功能:输入题录信息,查找特定文 献进行补缺。
注意:刊名要准确,缩写要标准;著 者姓名大小写均可
有字段中转换
2、截词检索功能:treat*
3、强制检索功能:“single cell” (不再自动转换匹配和扩展检索)
4、链接功能: (1)链接相关文献。 (2)链接 NCBI其他数据库。 (3)链接外部资源。 (4)链接相关图书。
高级检索 一、PubMed的辅助检索(特征栏)
1、限制检索( Limits )
一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)
如:hepatitis virus
著者姓名,姓在前,名在后,如:smith ab
刊名,可输全称或MEDLINE认可的标准缩写
形式如: clin exp immunol
布尔逻辑运算式(运算符须大写)如:
stem[ti] AND neuroscience
步骤3 索引选词
3、检索史(History) 检索式回顾:检索号、检索式、
检索时间、检索记录数 编辑检索式
如:#3 AND child 注:最多可保留100个检索式。
检索历史回顾
检索号
清除检索史
检索式
检索时间
检出篇数
4、粘贴板(Clipboard)
存放检索结果,最多可存放500条记录。
提供电子原文的超链接。
期刊数据库检索
输入待检期刊名 得出期刊详细信息
4.临床问题 (Clinical Queries):
专门检索临床研究方法学(循证 医学)文献,主要涉及治疗、诊 断、病因、和预后四个分类,并 提供强调选择,即敏感度(强调 查全)或专指度(强调查准)。5.临床警Βιβλιοθήκη (Clinical Alerts):
多个检索词输入: Moore AM撰写的有关接
触性皮炎的文章
刊名的输入 (字段限定来源出处SO)
著者检索
检索式输入
仅检索有文摘 的文献
常用字段标识符:
AD 作者地址 AB 文摘 AU 著者姓名 JA 期刊名称 LA 语言文种 MAJR 主要MeSH主题词 MH 全部MeSH主题词
PG 期刊页码 DP 文献出版日期 PT 文献类型 SH 副主题词 TW 文本词 TI 题名词 VI 卷 IP 期
检索系统的主要特点:
1、检索词自动转换功能
自动对照MeSH词表、刊名转换表、短 语表、著者名索引, 依次寻找转换
短语寻找转换单词转换 单词在上述四个字段寻找转换在所
Details 中的URL ,可以让检索匹配 的详细策略放入检索框,该检索页 面可以存储入浏览器收藏夹。
Cubby 灰色栏中的功能按钮,存储 在数据库的个人文档中。
需先注册, 填写用户 名和口令
打印检索结果
1.浏览器打印(当前显示的网页)
2.show功能键,增加网页显示的记 录数
执行检索
基本检索输入框 特征栏提供辅 助检索功能
侧栏提供其他检索 如期刊数据库检索、 规范词数据库检索、 特定文献检索
PubMed检索方法
1.基本检索:在基本检索界面下 完成的检索方法。
2.高级检索:在特征栏和左侧栏 的辅助下进行的检索方法。
PubMed 基本检索规则
在检索栏中输入:
网址: /pubmed
主讲:何卫华 (广西医科大学图书馆)
教学要求
了解PubMed数据库的基本概况 熟悉PubMed的检索界面 掌握PubMed的基本检索方法
PubMed
美国国立医学图书馆国家生物技术 信息中心开发
特点:
1.免费提供题录和文摘
PreMEDLINE:提供MEDLINE尚未经规范 处理的数据,经标引后再加入MEDLINE。 记录中有[in process]的标记,日更新。
Publisher Supplied Citations:出版商直接 向PubMed提供电子记录,包括MEDLINE 未收录的部分记录,时时更新。
PubMed主页
字段限制:著者、刊名、篇名等 数据录入时间:限制选择30天~10年 出版日期限制 文献类型限制: 7种 语种限制: 7种 子文档: 13种
检索词来源 字段限制
文献类型 选择限制
数据录入 时间限制
文献发表 日期限制
研究对象年龄限制
输入检索词,系统默 认空格为AND关系
限制检索界面
3.保存后一起打印
六.获取原文及相关资源
1.联机获取原文(文摘中超链) 2.向NLM索取原文(order)(由
图书馆出面向成员馆订购) 3.相关文献查找(related article) 4.其他数据库资源(生物信息学
等)
Pubmed演示题
1、查找乳腺癌与BRCA1基因突变相关的 文献。
显示字段选择(Display)
Abstract:来源期刊、标题、著者、著者 地址、记录性质、文献类型、勘误、评 论、PMID或UI、摘要。
Citation: 显示除上述内容外,加MeSH 词、化学物质名称、资助项目号等字段。
MEDLINE: 字段最完整,有标识符
显示格式选择
有文摘
有免费全 文链接
语种 限制
只要有文摘 的文献限制
子文档
2、预览/索引(Previw/Index) 预览检索式和检索结果的记录数 修改检索策略
(可用检索式编号#1 OR #2) 从索引表(Index)中选词检索
检索预览
检索结果
索引加词 检索
步骤1 点击预览 和索引
步骤2 输入待选词
步骤4 确定与检索栏中 检索提问的逻辑关系
2.可与提供原文的网址链接 (部分免费获取)
3.提供检索词自动转换匹配 4.操作简便、快捷
数据收录范围
OldMEDLINE:1966年以前的文献
MEDLINE:1966至今,收录世界上70多 个国家和地区的4500多种生物医学期刊, 数据每周更新。[indexed for MEDLIEN]
1.选择 记录
2.选择Clipboard
记录编号的颜色变绿
5、细节(Details)
显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:
(1)转换、确定规范词 如:liver cancerliver neoplasms
(2)修改检索策略
检索明细
数据库匹配过程
规范词转换
你输入的检索式
修改检索策略的方法:
相关文 献链接
翻页
可获电子全文的链接
输出格式选择(send to )
选中记录后——
Text当前网页文本格式 用浏览器文件保存 File所有记录文本格式:最多10000条 Clipboad 剪贴板:允许最多存储500
条,多项检索后一起保存 Email:通过邮件发送
保存检索策略
如查找:由 Chang PY撰写在 1975年 taiwan yi xue hui za zhi 上发表的文 献的其他著者
输入待检刊名 输入出版年 输入待检第一著者
特定文献查找(已知文献第一著 者,欲查其他信息如其他著者等)
得出其他著者
3.期刊数据库 (Journal database):
通过输入刊名全称或缩写名等浏 览期刊文献。
1991年开始,美国卫生健康 研究所( NIH )不定期公布能 引起死亡率和致病率升高的临床 试验项目重要新闻稿。
6、PMC (PubMed Center)
生命科学期刊资源中心
免费提供185多种期刊全文(至 2005/5/11止)
检索结果输出
显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果
2、已知:第一作者是Challis DE,出处是 Pediatric Research,2000,47(3):309~15。 要求写出其他合著者。
1.检索框中随时修改
2.利用“Limit” 、 “Preview/Index”、 “History”、 “Details”功能键实现。
二、左侧栏检索功能
1.Mesh Database
功能:确定规范检索词;查看词义注释、 树状结构表;副主题词、扩展主要主题 词等。
例:欲查SARS(严重急性呼吸窘迫综合 症)是否有相关规范词,什么时候在系 统中建立该词,有关治疗有无文献?
2.输入检索词 3.执行检索
4.点按此处可获详细注解 1.选择MeSH数据库检索
点击此处 执行检索
点击此 处确认
选择副 主题词
通过MeSH
Database 检索的结果
2.引文匹配器(Citation Matcher):
功能:输入题录信息,查找特定文 献进行补缺。
注意:刊名要准确,缩写要标准;著 者姓名大小写均可
有字段中转换
2、截词检索功能:treat*
3、强制检索功能:“single cell” (不再自动转换匹配和扩展检索)
4、链接功能: (1)链接相关文献。 (2)链接 NCBI其他数据库。 (3)链接外部资源。 (4)链接相关图书。
高级检索 一、PubMed的辅助检索(特征栏)
1、限制检索( Limits )
一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)
如:hepatitis virus
著者姓名,姓在前,名在后,如:smith ab
刊名,可输全称或MEDLINE认可的标准缩写
形式如: clin exp immunol
布尔逻辑运算式(运算符须大写)如:
stem[ti] AND neuroscience
步骤3 索引选词
3、检索史(History) 检索式回顾:检索号、检索式、
检索时间、检索记录数 编辑检索式
如:#3 AND child 注:最多可保留100个检索式。
检索历史回顾
检索号
清除检索史
检索式
检索时间
检出篇数
4、粘贴板(Clipboard)
存放检索结果,最多可存放500条记录。
提供电子原文的超链接。
期刊数据库检索
输入待检期刊名 得出期刊详细信息
4.临床问题 (Clinical Queries):
专门检索临床研究方法学(循证 医学)文献,主要涉及治疗、诊 断、病因、和预后四个分类,并 提供强调选择,即敏感度(强调 查全)或专指度(强调查准)。5.临床警Βιβλιοθήκη (Clinical Alerts):
多个检索词输入: Moore AM撰写的有关接
触性皮炎的文章
刊名的输入 (字段限定来源出处SO)
著者检索
检索式输入
仅检索有文摘 的文献
常用字段标识符:
AD 作者地址 AB 文摘 AU 著者姓名 JA 期刊名称 LA 语言文种 MAJR 主要MeSH主题词 MH 全部MeSH主题词
PG 期刊页码 DP 文献出版日期 PT 文献类型 SH 副主题词 TW 文本词 TI 题名词 VI 卷 IP 期
检索系统的主要特点:
1、检索词自动转换功能
自动对照MeSH词表、刊名转换表、短 语表、著者名索引, 依次寻找转换
短语寻找转换单词转换 单词在上述四个字段寻找转换在所
Details 中的URL ,可以让检索匹配 的详细策略放入检索框,该检索页 面可以存储入浏览器收藏夹。
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1.浏览器打印(当前显示的网页)
2.show功能键,增加网页显示的记 录数
执行检索
基本检索输入框 特征栏提供辅 助检索功能
侧栏提供其他检索 如期刊数据库检索、 规范词数据库检索、 特定文献检索
PubMed检索方法
1.基本检索:在基本检索界面下 完成的检索方法。
2.高级检索:在特征栏和左侧栏 的辅助下进行的检索方法。
PubMed 基本检索规则
在检索栏中输入: