原核生物基因表达调控(新)

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B.subtilis不同发育阶段基因表达亦通过σ因子的更替来控 制噬菌体的基因时序表达。
抗终止因子的调节作用
2. T7 RNA聚合酶控制时序表达 E.coli RNA聚合酶: 噬菌体T7感染后其早期基因表达由
E.coli RNA聚合酶转录,合成T7 RNA聚合酶(早期Ⅰ
基因)。 T7 RNA聚合酶: 晚期Ⅱ/ Ⅲ类基因由T7 RNA聚合酶转
部份被其他官能团所取代,不受-半乳糖苷酶的
催化分解,却也能与调节基因特异性结合使调节 基因构象变化,诱导lac操纵子的开放。
异 丙 基 -β-D- 硫 代 半 乳 糖 苷 (IPTG):是经常被用来作 为乳糖操纵子的诱导物。 IPTG与阻遏基因结合并使之 不活跃,但却非β-半乳糖苷酶 的底物。IPTG在体内研究的 一个优点是它不能被大肠杆 菌所代谢,它的浓度在实验 中并不会改变。再者,IPTG 能在缺乏lacY基因下而有效地 被运送。
1 --- 5-bromo-4-chloro-3-hydroxyindole 2 --- 5,5’-dibromo-4,4’-dichloro-indigo,an insoluble blue product
IPTG和X-gal常被用作基因工程的蓝-白斑筛选:
克隆质粒含LacZ基因,该酶能
分解生色底物X-gal产生蓝色, 从而使菌株变蓝。当外源DNA
插入LacZ基因后失活,菌株呈
白色,称之为蓝-白斑筛选。
2. 色氨酸操纵子 色氨酸是构成蛋白质的组分,一般的环境难以给细 菌提供足够的色氨酸,细菌要生存繁殖通常需要自 己经过许多步骤合成色氨酸,但是一旦环境能够提 供色氨酸时,细菌就会充分利用外界的色氨酸、减
少或停止合成色氨酸,以减轻自己的负担。细菌所
大肠杆菌二阶段生长现象
大肠杆菌利用乳糖至少需要两个酶: 促使乳糖进入细菌的乳糖透过酶 ---- lactose permease 催化乳糖分解第一步的-半乳糖苷酶 --- -galactosidase
在环境中没有乳糖或其他β-半乳糖苷时,大肠杆菌合成β半乳糖苷酶量极少,加入乳糖2-3分钟后,细菌大量合成 β-半乳糖苷酶,其量可提高千倍以上。
半乳糖操纵子(gal operon)中也有CAP结合位点,CAP也起
类似的正调控作用。
乳糖操纵子调控的渗漏现象
乳糖操纵子不是完全彻底地关闭 着,即存在调控的渗漏现象。乳 糖操纵子基因在极低水平上表达, 合成相应的酶,将痕量的乳糖转 变成异构乳糖。
乳糖类似物 取代半乳糖苷 这些化合物主要是取代半乳糖苷,乳糖的葡萄糖
阻遏过程和弱化过程的作用方向是相同的。前者主要控制 操纵子基因表达的启动,而后者主要决定转录和翻译是否
能继续进行下去。
3. 精氨酸合成酶操纵子
在操纵子调控中,有时一个调控基因可调控多个操纵子的
表达,将受控于同一个调节蛋白的多个操纵子,称为调节 子(regulon)。
精氨酸合成途径所需要的酶类分别由多个基因编码,并分
布于5个操纵子中,而这5个操纵子却受1个调节基因R的 调节。
A G R D BCEH F
Arg
(二) RNA聚合酶控制的转录时序
1. σ因子控制时序表达 σ因子识别启动子: 原核RNA pol的σ70因子识别大多数基 因的启动子,多个σ因子参与不同基因的转录起始,其亲
和性不同,如热激蛋白为σ32,枯草杆菌(B.subtilis)为σ55,
但是,当细胞内有葡萄糖存在时,葡萄糖抑制腺苷酸环化酶的
活性,不能形成cAMP,使得细胞中cAMP的水平下降,CAP 不能与cAMP形成复合物,就不能与CAP结合序列结合,这样 就降低转录效率。
由于Plac是弱启动子,单纯因乳糖的存在发生去阻遏使lac操
纵子转录开放,还不能使细菌很好利用乳糖,必需同时有 CAP来加强转录活性,细菌才能合成足够的酶来利用乳糖。
lac操纵子的强诱导既需要有乳糖的存在又需要没有葡萄糖
可供利用。通过这机制,细菌是优先利用环境中的葡萄糖, 只有无葡萄糖而又有乳糖时,细菌才去充分利用乳糖。
细菌对葡萄糖以外的其他糖(如阿拉伯糖、半乳糖、麦芽糖
等)的利用上也有类似对乳糖利用的情况,在含有编码利用 阿拉伯糖的酶类基因群的阿拉伯糖操纵子(ara operon)、
性。
基因表达的时空有序性:在生物体发育的不同阶段、 不同部位的细胞,开放表达的基因数量、种类和表达 强度不一样,合成蛋白质的数量和种类也不相同,显 示出基因表达的时空有序性,从而逐步形成形态与功 能各不相同、协调有序的组织和器官。
一、转录水平的调控 二、翻译水平的调控
一、转录水平的调控 (一)操纵子 操纵子(operon):原核生物基因表达和调控的一个完整单 元,包括调节基因,启动子和操纵基因(Operator) 及相邻 的结构基因。
编码蛋白质的基因,却是起着调控基因表达强弱的作用,正如
启动序列不叫启动基因而称为启动子一样,操纵序列就可称为 操纵区。operon译为操纵子,即基因表达操纵的单元之意。
④ 调控基因(regulatory gene) 是编码能与操纵序列结合的调控蛋白的基因。 根据基因所编码的调控蛋白可分为:
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a. 阻遏蛋白(repressive protein):是与操纵子结合后能
cAMP-CAP复合物是乳糖操纵元的正调控因子。
当cAMP-CAP复合物与位于乳糖操纵元启动子区域的CAP 结合序列相结合时,使启动子区域的DNA序列弯曲成新的 构型,这种新构型有利于提高RNA聚合酶的工作效率。
当细胞中既有别乳糖与阻遏蛋白结合,又有cAMP-CAP复合物与
启动子DNA序列结合时,乳糖操纵元的转录效率最高。
以能做到这点是因为有色氨酸操纵子( trp operon) 的调控。
实验观察表明:在色氨酸阻遏与除阻遏状态下, Trp操纵子的表达水平相差600倍,然而阻遏作用 仅使转录水平降低70倍。 这种调控现象与色氨酸操纵子特殊的结构有关。
(二)衰减子系统
mRNA前导区序列分析 trp前导区的碱基序列已经全部测定,发现完整的前导序列可 分为1、2、3、4区域,这四个区域的片段能以两种不同的方 式进行碱基配对。
减弱或阻止结构基因转录的调控蛋白。 b. 激活蛋白(activating protein):与操纵基因或位于启动 子上游的控制因子结合后能增强或启动结构基因转录的 调控蛋白。
根据操纵子对调控蛋白的反应:
正调控:调节蛋白不存在时基因是关闭的,调节
蛋白出现后基因的活性被开启。如乳糖操纵子中
CAP蛋白与启动子的结合。 负调控:调节蛋白不存在时基因是表达的,调节 蛋白出现后基因活性被关闭。如阻遏蛋白与操纵 子的结合。
在正常情况下,E.coli是以葡萄 糖作为碳源的,在没有葡萄糖, 只有乳糖存在的条件下,E.coli 也能以乳糖为碳源而生存。葡 萄糖是单糖,E.coli利用它最为 方便和经济。乳糖是双糖,是 葡萄糖和半乳糖的复合物。以 乳糖为碳源必须先将乳糖分解 为葡萄糖和半乳糖,再将半乳 糖转化为葡萄糖,这就需要额 外的酶。
效应物(effector):操纵子的开启和关闭均受到环境因 子的诱导,这种因子能与调控蛋白结合,改变调控蛋白的 空间构象,从而改变其对基因转录的影响,因此这种因子 称为效应物。
诱导物(inducer):凡能诱导操纵子开启的效应物。 辅助阻遏物(corepressor):凡能导致操纵子关闭, 阻遏转录过程发生的效应物。
乳糖操纵子的负调控
当有乳糖存在时,乳糖受-半乳糖苷酶的催化转变为别乳糖, 与调节蛋白结合,使其构象变化,R四聚体解聚成单体,失去
与o的亲和力,与o解离,基因转录开放。
乳糖操纵子的正调控
ATP
腺苷酸环化酶
cAMP
CAP (catabolite-activating protein)是cAMP的受体蛋白
依赖ρ因子的终止子
1. 乳糖操纵子
第一个被发现的操纵子。
乳糖操纵子含有一个调控基因(I),一个启动子(P), 一个操纵基因(O)和受操纵基因调控的3个乳糖代谢相 关基因Z、Y和A。
大肠杆菌可以利用葡萄糖、乳糖、麦芽糖、阿拉伯糖 等作为碳源而生长繁殖,当培养基中含有葡萄糖和乳 糖时,细菌优先利用葡萄糖,当葡萄糖耗尽,细菌停 止生长,经过短时间的适应,就能利用乳糖,细菌继 续呈指数式繁殖增长。
这种典型的诱导现象,是研究基因表达调控极好的模型。
针 对 大 肠 杆 菌 利 用 乳 糖 的 适 应 现 象 , 法 国 的 Jocob 和 Monod等人于1961年提出乳糖操纵子(lac operon)学说。
β-半乳糖苷酶(lacZ),将乳糖分解成半乳糖和葡萄 糖。 半乳糖渗透酶(lacY),一种在细胞膜的运送蛋白质, 负责将乳糖逼入细胞中,帮助细菌从培养基中摄取乳 糖。 半乳糖苷转乙酰酶(lacA),将乙酰基从乙酰辅酶A 转移至β-半乳糖苷。
第七章 原核生物基因表达调控
管家基因:是指维持细胞的基本代谢过程所必需 的、在不同的细胞类型和细胞生长时期组成型表 达的基因。 奢侈基因:是指为细胞分化、生物的发育以及生 物适应环境所需要的基因,其表达表现出明显的
时空调控特性。
基因表达的组织特异性:不同组织和器官的细胞,由 于其所行使的功能不同,所表达的基因数量和种类也不 相同,表现为基因表达的组织特异性。 基因表达的阶段性:组织细胞中分化发育的不同时期, 基因表达数量和种类也不相同,表现为基因表达的阶段
操纵子的基本组成 ① 结构基因群 操纵子中被调控的编码蛋白质的基因可称为结构基因 (structural gene)。一个操纵子中含有2个以上的结构基 因,多的可达十几个。每个结构基因是一个连续的开 放阅读框(open reading frame),5’端有起始密码ATG, 3’端有终止密码TAA、TGA或TAG。各结构基因头尾衔 接、串连排列,组成结构基因群。
扣留,而只有10%的RNA聚合酶可以通过。
由此可见,弱化子对RNA聚合酶转录的终止依赖于前导肽
翻译中核糖体所处的位置,而细胞中色氨酸存在与否,决
定了mRNA 转录的弱化子结构,使弱化子中1、2、3、4 区域呈现竞争性配对,从而产生弱化效应,这是色氨酸操
纵子第二水平调控的机制。应该指出,色氨酸含量变化对
录,合成T7噬菌体DNA复制有关的酶类及噬菌体颗
粒结构蛋白,晚期Ⅲ基因的启动子不同于E.coli RNA 聚合酶转录控制表达的基因启动子,无-35和-10共
指示剂 有些化合物可作为β半乳糖苷酶活动的颜色指示剂: 邻硝基苯基-β- 半乳糖苷(ONPG):会被分开来产 D-
生黄色的化合物:邻硝基苯基。它一般会被用来作为β半乳糖苷酶试管分析的底物。 5-溴-4-氯-3-吲哚-α -D-半乳糖苷(X-gal):会将产生
β-半乳糖苷酶的细菌转为蓝色。
② 启动子(promoter) 能被依赖于DNA的RNA聚合酶所识别的碱基顺序,是RNA聚 合酶的结合部位和转录起点,在许多情况下还包括促进这一 过程的调节蛋白结合位点。
③ 操纵基因(operator gene) 是指能被调控蛋白特异性结合、并影响基因转录的一段DNA 序列,常与启动子邻近或与启动子序列重叠。 以前将操纵区称为操纵基因(operator gene)。但现在基因 定义是为蛋白质或RNA编码的核酸序列,而操纵序列并不是
当色氨酸浓度高时,核糖体可顺利通过两个相邻的色氨酸密码 子,在4区被转录之前,核糖体就到达2区,3-4区可以自由配 对形成茎-环式的终止子结构,使得只有约10%的RNA聚合酶 能继续参与色氨酸操纵子结构基因的转录。
在无色氨酸存在时,所有转录Trp操纵元的RNA聚合酶 都可以通过衰减子。 当有色氨酸存在时,一部分RNA聚合酶逃过阻遏蛋白的 监督起始转录;而这些RNA聚合酶在衰减子处大部分被
根据操纵子对效应物的反应:
可诱导操纵子:诱导物,负责物质的分解,如乳 糖操纵子
可阻遏操纵子:辅阻遏物,负责物质的合成,如
色氨酸操纵子
⑤ 终止子 终止子是给予RNA聚合酶转录终止信号的DNA序列。在一个
操纵子中至少在结构基因群最后一个基因的后面有一个终止子。
终止子至少可以分为两类: 不依赖ρ因子
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