遗传学图谱

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向太和遗传图绘制

§2.1 2.1 遗传学图与物理图

遗传学图与物理图§2.2 2.2 遗传学作图的标记

遗传学作图的标记§2.3 2.3 遗传学作图的方法

遗传学作图的方法§2.4 2.4 人类遗传图

人类遗传图

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向太和为何要绘制遗传图与物理图？

1)基因组太大,必需分散测序,然后将分散的顺序按原来位置组装,需要图谱进行指导 。

2)基因组存在大量重复顺序,会干扰排序,因此要高密度基因组图。

3)遗传图和物理图各有优缺点,必须相互整合校正。

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基因组学基因组学 杭州师范大学生命与环境科学学院杭州师范大学生命与环境科学学院 向太和向太和•结构基因组的研究策略结构基因组的研究策略

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基因组测序的策略---

由上至下(左)和由下至上的测序(右)

克隆重叠群指

导的测序

重叠群（重叠群（contig): contig): contig): 指相互间存在重叠顺序的一组克隆。指相互间存在重叠顺序的一组克隆。

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基因组学基因组学 杭州师范大学生命与环境科学学院杭州师范大学生命与环境科学学院 向太和向太和Clone-by-clone 测序

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法测

序

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向太和一 、遗传图谱与物理图谱

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向太和§2 遗传学图谱

§2.1遗传图与物理图

2.1.1 2.1.1 遗传图

遗传图遗传图是应用遗传学分析方法将基因或其他遗传图是应用遗传学分析方法将基因或其他DNA DNA DNA顺序

顺序标定在染色体上构建的连锁图。

这一方法包括杂交实验，家系分析等。

遗传图距单位为厘摩厘摩(cM),(cM), 每单位厘摩定义为每单位厘摩定义为1%1%1%交换率。

交换率。2.1.2 2.1.2 物理图

物理图物理图是应用分子生物学技术来直接将物理图是应用分子生物学技术来直接将DNA DNA DNA分子标记、

分子标记、基因或克隆标定在基因组实际位置。

物理图的距离依作图方法而异，如辐射杂种作图的计算

单位为厘镭厘镭(cR),

(cR), 限制性片段作图与克隆作图的图距为DNA DNA的分子长度，即的分子长度，即碱基对碱基对(bp, kb

(bp, kb )。

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§2.2 遗传作图的标记

遗传标记的类型遗传标记的类型:

: •基因标记 • DNA DNA标记

标记遗传标记的特征遗传标记的特征:

: • 亲本间存在着多态性（即差异），也就是说具有可识别性。 • 亲本间存在的多态性在后代中可以重演，即具有可遗传性。

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向太和§2 遗传学图谱§2.2 2.2 遗传作图的标记遗传作图的标记•个体上可以看见的遗传标记基因，如花色（红花、白花）、株高（高秆、矮秆）等。

•生化性状基因生化性状基因

，如血型系列(ABO)(ABO)分析、血清蛋白、分析、血清蛋白、免疫蛋白、同工酶等。

2.2.1 2.2.1 基因标记基因标记基因标记((性状标记性状标记):):

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向太和

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向太和水稻部分形态学标记性状及其基因

性状分类标记性状已鉴定的基因举例

色素

紫色叶耳Pau 紫色叶舌Plg 紫色谷壳Pr 黑色谷壳Bh 紫色柱头Wh 紫色叶鞘Psh

籽粒

有芒

An-1, An-2, An-3内颖发育不全dp-1, dp-2大胚ge

圆粒rk-1,rk-2多雌蕊

mp-1,mp-2

资料来源：资料来源： Rice Genet. News. Vol.6 Rice Genet. News. Vol.6 。

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向太和同工酶标记

是指以同工酶带型为标记，通过电泳使同工酶带型产生多态性。是指以同工酶带型为标记，通过电泳使同工酶带型产生多态性。

§2 遗传学图谱

§2.2 2.2 遗传作图的标记

遗传作图的标记

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向太和水稻部分同工酶基因

同工酶基因座位

染色体 等位基因等位基因酸性磷酸酯酶

Acp-112

0-3Acp-2120,3Acp-4 71,2乙醇脱氢酶Adh-1110-3β-淀粉酶βAmy-1 70-3过氧化氢酶Cat-1 60-3酯酶

Est-2 60,1,2Est-3 91,2Est-5 10,1,2Est-7 70,1Est-9

7

1,2

资料来源：资料来源： Rice Genet. News. Vol.7 Rice Genet. News. Vol.7 。

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