人群中PTC味盲基因频率的分析
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人群中PTC味盲基因频率的分析
余振洋(高山山、潘红芳)、09级生技1班、200900140156、2011/12/14
摘要通过实验掌握人群中PTC味盲基因频率的分析方法,加深对群体遗传学中遗传平衡定律的认识,同时了解本班同学中味盲基因分布情况。
关键词PTC;基因频率;遗传平衡定律
1.引言
苯硫脲(phenythiocarbamide,PTC)是一种白色结晶状化合物,其结构由于有N-C=S基团(硫化酰胺基)而呈苦味对人无毒,在不同人群中对该物质的尝味能力不同。这种尝味能力是由一对等位基因(T.t)所决定的,其中T对t为不完全显性。基因型为TT,能尝出1/6000000—1/750000的PTC的苦味;Tt基因型,能尝出1/480000—1/380000溶液的苦味,基因型为tt,能尝出1/24000以上浓度PTC的苦味。极个别体甚至对PTC的结晶也尝不出,这类个体在遗传学上称为PTC味盲。尝味者为AD,味盲者为AR。PTC尝味能力的调查在研究人类群体遗传学、种族学方面有其科学价值;亦可作为双生子、亲子鉴定的简便易行的方法之一。
将PTC配制成各种浓度的溶液,由低浓度到高浓度逐步测试学生的尝味能力,由此可区分出味盲(隐性纯合体)、高度敏感(显性纯合体)和介于二者之间的人(杂合体)。据此可对人群中味盲基因的频率进行分析。
哈迪—温伯格定律也称遗传平衡定律,是由英国数学家哈迪(G.H.Hardy)和德国医生温伯格分别于1908年和1909年各自提出的。两个等位基因的哈迪一温伯格定律的公式为:
(p+q)2=p2+2pq+q2=1
其中p代表一个等位基因(如A)的频率,q代表另一个等位基因(如a)的频率, p2代表一个等位基因纯合子(如AA)的频率,q2代表另一个等位基因纯合子(如aa)的频率,2pq代表杂合子(如Aa)的频率。
世界不同民族和地区的PTC味盲率与隐性基因频率有很大差异,最高值在印度,为52.8%,澳大利亚土著也高达49.3%。欧洲的英国、德国、挪威、瑞士和芬兰等国人群味盲率在30%左右,南欧的意大利、西班牙只有24% ~25%。亚洲尼泊尔人为22.8%。日本、韩国均在8% ~15%,中国人味盲率在7.27% ~10.13%。黑人在3% ~4%,印第安人味盲率最低,有的仅有1.2%,甚至为0。
PTC尝味的敏感性与某些疾病存在一定的相关性,如甲状腺瘤、糖尿病、青光眼、呆小
病、慢性消化溃疡、抑郁症,乃至某些癌症等。研究者发现PTC味盲者更容易患结节性甲状肿瘤,而先天愚型患者中PTC味盲率也大大高于正常人群。近年来西欧等国家的学者利用PTC等位基因进行味觉试验以研究原发性青光眼的遗传基因,Parr的研究表明PTC味尝者中抑郁症患者显著高于味盲者。
检测PTC味盲有纸片法(filter paper method)、结晶法(crystal method)、阈值法(threshold method)等方法。近年来通常采用的是1949年Harris和Kalmus改进的阈值法。本实验按此方法配置PTC溶液,对全班同学进行PTC味盲基因频率的测定和分析,为群体遗传学的学习提供基本数据。
2.实验材料
2.1实验器材和药品:
2.1.1器材:一次性塑料吸管
2.1.2药品:苯硫脲(phenythiocarbamide , PTC)
2.1.3实验材料:09级生技班全体同学
2.2实验过程:
2.2.1配制苯硫脲溶液,对半稀释成14种浓度:
取PTC粉末0.65克,加蒸馏水500ml,在室温下溶解,原液浓度1/750,为1号液。取原液100ml,用蒸馏水稀释1倍,为2号液。取2号液100ml,蒸馏水稀释1倍为3号液。以此类推。直到14号液,为1/6000000。尝味能力在1-6之间的为tt型,7-10之间的为Tt型,11-14之间的为TT型。
2.2.2味觉测试:
每人按浓度由低到高依次尝味,记录基因型。
①测试时,让受试者正坐,仰头张口伸舌,用滴管滴4~6滴14号液于受试者舌根部,让受试者慢慢咽下尝味,然后用蒸馏水做同样的试验。
②询问受试者能否鉴别此两种溶液的味道。若不能鉴别或鉴别不准,则依次用13号、12 号溶液重复试验,直到能明确鉴别出PTC的苦味为止。
③当受试者鉴别出某一号溶液时,应当用此号溶液重复尝味3次,3次结果相同时,才是可靠的,并记录首次尝到PTC苦味的浓度等级号。如果受试者直到1号液仍尝不出苦味,则其尝味浓度等级定为<1号。
④在测定时,注意用蒸馏水交替给受试者尝味,避免受试者的臆意猜测而影响结果的准确。
2.2.3数据处理:
根据一个实验班的测定结果,求出基因T、t的频率,并应用X2检验去确定实验班这个群体是否为平衡群体。
基因频率的计算方法:通过获得的不同基因型的数目或基因型频率求得。
基因频率=群体中某个座位的特定等位基因的拷贝数/群体中该座位所有等位基因数
p=f(T)=(2×TT+Tt)/(2×N)(N为个体总数)
q=f(t)=(2×tt+Tt)/(2×N)
两个等位基因的频率,f(T)和f(t)一般以p和q来表示。一个座位上的基因频率相加总是等于1,因此一旦计算出了q,那么p=1-q。
3.实验结果
3.1数据统计
表一 09级生技班同学测得数据
PTC溶液号<1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 人数 2 1 0 0 2 0 3 1 7 3 3 8 2 2 0
表二基因型数据
基因型TT Tt tt
人数12 14 8
3.2结果计算及分析
3.2.1 基因频率的计算
根据哈代温伯格定律:
T基因频率:p=(14+12×2)/2×(12+14+8)=0.559
t基因频率:q=(14+8×2)/2×(12+14+8)=0.441
3.2.2 平衡群体基因型频率的计算
按哈代温伯格定律公式:p2+2pq+q2=1,得:
TT: p2=0.559×0.559=0.312