第13章 蛋白质的生物合成
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第十三章蛋白质的生物合成(翻译)
蛋白质的生物合成也称为翻译,意思就是把核酸中由A,G,C,T/U四种符号组成
的遗传信息,破读为蛋白质分子中的20种氨基酸排列顺序。遗传信息贮存在DNA分子
上,转录生成mRNA。mRNA是指导翻译的直接模板,蛋白质是基因表达的最终产物。
翻译过程也可分为起始、延长、终止三个阶段来叙述。翻译出的多肽链,多数要经过翻
译后修饰成为具备活性的蛋白质。
第一节参与蛋白质生物合成的物质
合成蛋白质的原料是氨基酸。氨基酸在mRNA指引下逐一聚合。聚合过程中,氨基
酸需由tRNA携带。蛋白质合成的全过程是在由mRNA和蛋白质所组成的核蛋白体大分
子上进行的。换句话说:蛋白质的生物合成,以mRNA为模板,tRNA 为运载体,核蛋白体为装配场所,共同协调完成。
此外,翻译过程还需众多的蛋白质因子参加;起始阶段需要起始因子(initiation factors,IF),真核生物的起始因子冠以e字头(eukaryote),称为eIF。延长阶段需延长因子(elongation factor ,EF),原核和真核生物各自有不同的EF。终止阶段需要的蛋白质因子称为释放因子(release factors,RF)以及核蛋白体释放因子(ribosomal release factors,RR)。
本节先复习和深化有关RNA的基本知识。IF、EF、RF等各种因子,分别在起始。
延长、终止过程中论述。
一、mRNA是翻译的直接模板
mRNA种类很多,分子大小不一。在各种RNA中,mRNA的寿命(以半衰期表示)最短。这说明mRNA在生命活动中是非常活跃的大分子物质。原核生物一段连续的mRNA
往往为功能相关的几种蛋白质(例如一个酶系统)编码。例如E.coli血乳糖操纵子结构基
因转录出的mRNA,可翻译出利用乳糖的三种酶,即β-半乳糖苷酶、通透酶和乙酰转移酶。这段DNA或mRNA可以说是处于一个相同的基因单元内,用遗传学的互补试验(顺反实验)可以确定其功能关系。所以过去也把原核生物的一段mRNA称为一个顺反子
(cistron)。真核生物mRNA比原核生物种类更多。一个mRNA分子往往只带有一种蛋白
质编码信息,而且这些信息还是不连续的,经过剪接、修饰,成为成熟的mRNA才在翻译中起模板作用。
mRNA从5’至3’方向,若有AUG开始,可以称为一个开放读码框架(open reading,ORF)。读码框架内每3个碱基组成的三联体,就是决定一个氨基酸的遗传密码(genetic codon)。1965年,经过M.Nirenberg 等4年的研究,遗传密码表已被完整地编成
(表13-1)。
遗传密码有如下特点:
〔一〕遗传密码的连续性(commaless)
密码的三联体不间断,须3个一组连续读下去。mRNA链上碱基的插入或缺失,可
造成框移(frame shift),使下游翻译出的氨基酸完全改变。有关框移突变,已见第十一章
第四节。
(二)简并性(degeneracy)
遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅有一个密码子外,其余氨基酸有2,3,4个或
多至6个三联体为其编码。细看遗传密码表,有2个以上密码的氨基酸,三联体上一,二位碱基大多是相同的,只是第四位不同。例如ACU,ACC, ACA, ACG;都是苏氨酸的
密码子,UGU,UGC,UGA,UGG都是缬氨酸的密码子。这些密码子第三位碱基如出规
了点突变,并不影响所翻译出的氨基酸种类。遗传密码的简并性是指密码子上第三位碱
基改变往往不影响氨基酸翻译。同一氨基酸有多个密码子,其中会有一二个是被优先选
现的。研究翻译过程对密码的“偏爱性”.是生物进化研究中的~个有兴趣的课题。
(三)摆动性(wobble)
翻译过程氨基酸的正确加人,需靠mRNA上的密码子与tRNA上的反密码子相互以
碱基配对辨认(图13-l)。
密码子与反密码子配对,有时会出现不遵从碱基配对规律的情况,称为遗传密码的
摆动现象。这一现象更常见于密码子的第三位碱基对反密码子的第一位
碱基,二者虽不
严格互补,也能相互辨认。tRNA分子组成的特点是有较多稀有碱基,其中次黄嘌呤(inosine I)常出现于反密码子第一位,也是最常见的摆动现象(表13-2)。
(四)通用性(universal)
从最简单的生物例如病毒,~直至人类,在蛋白质的生物合成中都使用同一套遗传
密码。最近发现,动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体这些细胞器,有自身的DNA
和独立的复制系统,而且在翻译过程中,虽也是三联体密码子,但和普遍使用的“通用
密码子”有相当多差别。例如线粒体和叶绿体以AUG、AUU为起始密码子(initiation
codon),而AUA兼有起始密码子和甲硫(蛋)氨酸密码子的功能。终止密码子(stop codon)
是AGA、AGG,色氨酸密码子是UGA等。
遗传密码表好比一本字典,学习过程中不必强记。但要知道如何从碱基序列查出氨
基酸序列及反过来,用氨基酸查出碱基的三联体。理解遗传密码的上述特点,并记住表
上U、C、A、G编排次序,对遗传密码表就可应用自如。此外,起始密码子AUG和密码表右上方的3个终止密码子UAA、UAG、UGA,也是应该记住的。
二、核蛋白体是肽链合成的场所
50年代初已发现核蛋白体与蛋白质合成有关。P.Zamecnik用同位素标记的氨基酸
给动物作注射,然后取肝分离收集各种细胞器。数分钟内,有放射标记的蛋白质仅出现
于核蛋白体。经数小时或数天,标记的蛋白质才出现于细胞的其他组分。显然,氨基酸
是先在核蛋白体内合成蛋白质,然后分布于其他细胞组分。
核蛋白体由大、小亚基构成,每个亚基又含不同的蛋白质和rRNA,原核和真核生
物又各有不同(表13-3)。这些大分子又按一定的空间位置互相镶嵌,成为显微镜下可见的颗粒。核蛋白体蛋白(rps,rpl)种类繁多,其中有些就是参与蛋白质合成的酶和各种因子,靠这些蛋白质,rRNA,还有mRNA、tRNA等特异性的、准确的相互配合,使氨基酸按