NCBI检索方法
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2.NCBI数据库检索ຫໍສະໝຸດ Baidu统Entrez
• Entrez简介 Entrez是基于万维网的数据检索系统。 Entrez由NCBI开发,是一个综合的数据库检 索系统,运用简单的布尔算符,可在NCBI 所有数据库系统中进行文本搜索。
2.NCBI数据库检索系统Entrez
特征栏
• 检索策略表达式的建立与编辑
专家库 相关信息准确且全面
通过BLAST寻找该 序列的相似序列
可以将检索结果按PDB 结构数据库的登录号列表
登录http://www.rscb.org/ 利用PDB的ACCESSION号即可获得相应的PDB的文件
3.Entrez检索策略的定制
• Entrez蛋白专家数据库Swiss-Prot的检索 • 以人的细胞色素C蛋白序列为例
NCBI的检索方法
1.NCBI数据库
• 美国国家生物技术信息中心NCBI
1.NCBI数据库 • NCBI的数据库是多种生物信息 学数据库的集合。
• NCBI对其管理下的数据库进行了系统 整合,并建立了各数据库之间的信息 互联,在检索过程中只要定位其中的 一条记录,通过数据库之间的超链接 就可以定位其他的相关链接。
4.2NCBI数据库检索系统Entrez
2.NCBI数据库检索系统Entrez
• 结果输出、显示选项
2.NCBI数据库检索系统Entrez
• Entrez检索策略的定制 • 核酸序列数据库的检索
默认的显示结果类型 核酸库的结果显示
分 类 列 表
这些序列的功能一般是通过生物信息学分析得到的 ,未经过实验验证