甲型流感病毒基因变异与生存选择压力研究

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冰论
著冰
甲型流感病毒基因变异与生存选择压力研究
周晓明 ’，徐ｒ眉，赵慧芳，陆嘉良，赵根明，姜庆五
摘要：目的
研究甲型流感病毒基因变异与生存选择压力的关系，指导保守疫苗靶位点的寻找。方法
选择相同ＨＡ血清型具有全基因组序列的分化距离较近的多个流感病毒株系，利用Ｂａｔｌｓ２程序计算各株系之问的核酸保守性、蛋白质保守性、变异核苷酸在密码子序位中的频率以及生存选择压力指数，
分析与生存选择压力指数的相关性。结果Ｈ基因较其它基因的核酸保守性为显著低；Ｈ抗原蛋白ＡＡ
质保守性与ＮＳ基因同为较低；ＨＡ基因受生存选择压力作用；ＮＳＢ１基因受选择压力较小；Ｎ、ＰＡ、
Ｎ基因受选择压力较大；生存选择压力指数与核苷酸第３密码字位点变异频率完全相关。结论Ｐ
Fra Baidu bibliotek
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中图分类号：Ｒ５１；Ｒ１１ｌ．７８．２文献标识码：Ａ
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流感
病毒基因变异受复制机制形成差异和生存选择压力淘汰差异双重作用影响；各基因在流感病毒生物功能中地位不同，ＮＡ、ＮＰ基因保守性较强，适宜作为疫苗靶位点候选，ＨＡ基因相比较具有一定的保守性，有望寻找到保守区段，ＮＳＢ基因保守性较弱，不宜作为靶位点、Ｐ１关键词：甲型流感病毒；基因保守性；生存选择压力；疫苗靶位点；第３密码子
公共卫生与临床医学２１００年第６卷第４期
Ｐｂｃａｈｎｌｉｌｄｃｅｏｕ，ｕｅ４Ｎｏ００ｕｌｌｄｉｃｉｎｌｍｅＮｍｂｒ，ｖ２１ｉＨｅｔａＣｎａＭｅｉＶ６
‘６２９‘
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