071020生物信息学专业硕士研究生培养方案

071020 生物信息学专业硕士研究生培养方案
一、培养目标
培养适应我国社会主义现代化建设需要的，德、智、体全面发展的生物信息学专业高级专门人才。

要求硕士研究生：
1、较好地掌握马列主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”的重要思想，拥护党的基本路线和方针政策，热爱祖国，遵纪守法，品德高尚，学风严谨，具有较强的事业心和团结协作精神及为科学勇于献身的精神，积极为社会主义现代化建设事业服务。

2、掌握本学科坚实宽广的基础理论及某一领域内系统深入的专门知识、技术和方法，了解本学科现代理论和技术的发展水平，以及所从事研究方向的国内外发展动态；能用一门外国语较熟练地阅读本专业的书刊，具有较好的外语听说和科学论文写作能力；具备从事本学科科学研究、教学、技术开发、应用或技术管理的工作能力；具有良好的综合素质、严谨的科学态度和理论联系实际的工作作风。

3、身心健康。

二、研究方向
1、新（功能）基因的发现与鉴定
在植物方面，主要结合和利用模式植物拟南芥、水稻基因组以及基因组学的最新成果，采用现有的基因组学方法，以水稻、小麦、玉米等农作物为对象，发现、标记、鉴定、分离和克隆重要的功能或调节基因。

在动物基因组方面，将在全基因组水平上开展功能基因的研究，主要是定位和克隆影响农业动物重要经济性状的基因，并分析这些基因调控性状的规律。

2、基因组与蛋白质组分析
利用模式生物基因组的完整信息分析基因组进化的分子机制，基因组多态性、基因产物的系统功能和相互作用, 研究个体基因组变异与其性状表达的相关
机理，对动植物重要农艺形状进行基因组单体型多态性的研究。

大规模的基因表达谱的分析处理。

RNA(核糖核酸)的结构模拟和反义RNA的分子设计。

蛋白质资源库的建立及其基础与应用研究：建立蛋白组系列数据库、蛋白组功能连锁群分析的理论模型及相应的算法；探索与生物性状相关的蛋白质表达谱，在网络水平上探讨如生物发育及生理等调控规律和相关蛋白质相互作用。

蛋白质空间结构模拟和分子设计算法的研究。

3、生物信息数据挖掘
DNA和蛋白质序列比较，编码区及非编码区分析，分子进化机制演绎，大规模数据整合和可视化，基因表达谱网络解析，代谢网络分析研究，蛋白质组技术数据分析处理。

4、DNA芯片与相关的信息学技术
基因芯片是基因表达谱数据的重要来源。

基因芯片实验设计，操作，技术研发及质量控制。

大规模基因表达谱分析，及基因表达调控网络相关研究。

三、培养年限
硕士研究生学习年限一般为3年。

第一年一般以课程学习为主，后两年以论文工作为主。

允许研究生分段完成学业。

提前完成培养计划所规定的学习任务并通过学位论文答辩者，经研究生院批准可以提前毕业。

硕士研究生的培养可采用全日制和非全日制两种培养方式。

四、课程设置及学分要求
硕士研究生课程学习实行学分制，硕士生获得学位要求总学分不低于30学分（不包括专业外语1学分、实践教育2学分、文献综述与开题报告2学分、学术交流2学分）。

硕士研究生中期考核前必须修满专业培养方案规定的所有课程，考试成绩合格方可获得学分，学位课程70分及格，选修课程60分及格。

跨专业考取或同等学力人员攻读硕士学位研究生，由导师提出具体意见，决定其是否补修大学本科专业主干课程，并报研究生院培养处备案。

补修成绩以60分为及格，并记入成绩档案，注明“本科”字样，不计入总学分。

硕士生入学前三年内通过大学英语六级的学生可以免修免考英语，成绩按照
六级成绩登录，取得相应学分。

(一) 学位课（不同研究方向根据需要在5-8中任选2门）
1、外国语 3.0学分
2、自然辩证法 2.0学分
3、科学社会主义理论与实践 1.0学分
4、生物信息学 1.5学分
5、分子遗传学 3.0学分
6、高级生化专题 3.0学分
（蛋白质化学、核酸化学、生物膜、酶学及代谢调控任选其三）
7、*生物信息学算法 2.0学分
8、*PERL语言设计 3.0学分
9、*生物信息学Seminar 2.0学分
（二）选修课
1、二外 3.0学分
2、Linux系统分析 1.5学分
3、C语言程序设计 2.0学分
4、JAVA语言程序设计 2.0学分
5、分布式数据库系统 2.0学分
6、算法与算法复杂性理论 1.5学分
7、数据库技术 2.0学分
8、数据挖掘 2.0学分
9、多元统计分析 2.0学分
10、生物化学与分子生物学研究技术 3.5学分
11、动物生物化学研究技术 3.5学分
12、细胞遗传学 2.5学分
13、真核基因的表达调控 3.0学分
14、分子生物学 3.0学分
15、科技发展战略与政策 2.0学分
16、人力资源开发与管理 2.0学分
（三）跨专业补修课程
根据本人情况与导师具体要求，补修相关专业本科课程，60分及格。

（四）必修环节（不计入总学分）
1、专业外语1学分
2、实践教育2学分
3、文献综述与开题报告2学分
4、学术交流2学分
五、培养环节
1、制定个人培养计划：硕士研究生培养计划分课程学习计划和论文研究计划。

课程学习计划应在研究生入学一个月内提交，在导师指导下根据本学科培养方案制定论文研究计划，一般在第三学期末提交。

2．文献综述与开题报告：在导师指导下，明确研究方向，查阅与收集中外文献资料，确定研究课题，在第四学期初向本学科专家组成的评审小组作开题报告，广泛听取意见，由专家对学生所做的开题报告进行评审，提出具体的评价和修改意见，开题报告不通过者可限期重做，重做仍不通过者终止培养。

中期考核具体工作参照《中国农业大学硕士研究生中期考核规定》进行。

3、学术交流：硕士生在学期间应参加6次（其中至少一次为学生本人所作的学术报告）以上课程学习以外的学术交流活动，填写“硕士生参加学术活动记录册”，经导师签字后交所在学院核定，登录成绩，记2学分。

4、实践教育：实践教育是全面提高研究生培养质量的重要环节，包括教学实践、科研实践和社会实践。

研究生参加实践教育的具体办法参照《中国农业大学关于研究生实践教育的规定》执行。

5、专业外语：硕士生可以通过下面的任何一种方式获得学分。

•在校期间参加外教开设的专业外语课程
•公开发表专业译文
•在国内外期刊或学术际会议上用外文发表论文或宣读论文
•由导师指定翻译不少于6000汉字的专业文章（导师签字并给出成绩）。

•在学校和学院举行的对外学术交流活动中担任外国专家学术报告的翻译。

培养环节对应的学分：实践教育2学分，文献综述与开题报告2学分，学术交流2学分，专业外语1学分。

六、学位论文工作
学位论文工作是研究生培养的重要组成部分，是对研究生进行科学研究或承担专门技术工作的全面训练，是培养研究生创新能力、综合运用所学知识发现问题、分析问题和解决问题能力的主要环节。

1、导师要加强从开题到科研、论文写作、答辩的全过程指导。

2、研究工作必须坚持实验性原则，论文内容应以研究生本人从事的实验、
观测和调查的材料为主。

3、一般硕士生论文科研时间不少于1年。

4、学位论文实行中期检查制度，一般应在第五学期中（12月中旬之前）进行，由本学科专业组织专家小组对研究生论文研究的工作态度、论文进展情况、存在问题等全方位考察，通过者准予继续进行论文工作；问题较多者或不符合要求者，提出整改意见。

5、研究生在读期间在国内核心期刊发表文章1篇。

6、按照《中国农业大学学位授予细则》的有关要求组织论文评审和答辩委员会，论文答辩做到公正、公开，严格要求。