抗体库技术

四、噬菌体抗体库的应用
研制疫苗和诊断试剂 有学者用乙肝病人的 阳性血清中的抗体从噬菌体随机肽库中分离 到乙肝病毒特异性的噬菌体模拟肽；Lundin 等对HIV-1 病毒也做了相应的研究,从噬菌体 抗体库中分离到能够诱发针对HIV-1 的免疫 反应的噬菌体肽。
表位研究 确定核酸结合蛋白 通过构建锌指的随 机肽库,采用核酸作为靶分子进行筛选,可 以得到其相应的结合蛋白。 药物开发 利用噬菌体肽库的多样性,筛 选出能同受体特异结合的重组噬菌体多 肽，可作为受体的激动剂或拮抗剂。
一、噬菌体展示技术的原理
•在噬菌体衣壳蛋 白基因中插入外 源基因，形成融 合蛋白表达在噬 菌体颗粒蛋白的 表面，被展示的 多肽或蛋白质可 保持相对独立的 空间结构和生物 学活性。
Phage Display of Peptides
Selection From Library of Random Mutants
2个月之后，Science上发表了美国 Scripps研究所Huse等的完整的抗体库工 作,他们用逆转录-PCR技术从淋巴细胞克 隆出抗体轻链基因repertoire和重链Fd 段基因repertoire,将两者分别组建到噬 菌体表达载体中（如下图）。
Fab=VL+CL (L) VH+CH1(Fd) Fab片段结合抗原 Fc=CH2+CH3
酶切轻链PCR 产物和表达载体
二者连接，转入感受态细胞中扩增 重链的PCR产物 酶切 酶切 二者按照一定比例连接 转化入感受态细胞 加入噬菌体 收集噬菌体颗粒 噬菌体总抗体库 成为轻链库
表达载体
噬菌体抗体库的表达载体可分为λ 噬菌体 (phageλ ) 、单链丝状噬菌体(filamentous phage) 及噬菌粒(phagemid) 三种系统 噬菌粒是应用最多的表达载体,也是简便高 效模拟B 细胞产生抗体的原核表达系统。
一、选择性感染噬菌体展示 SIP技术的原理 294页
gIII蛋白
N1结构域 N2结构域 CT结构域
将筛选配体与N1、N2复合物化学偶联作为接头，与gIII融合蛋白特异 性结合，重组噬菌体恢复感染大肠杆菌的能力
a体内SIP
PHale Waihona Puke Baiduage display vector & Library Generation
The population of antibody scFv genes are cloned in a phage display vector to create a fusion with the phage coat protein. In this way a "library" is created in bacteria
Antibody IgG structure
VL
Fab
C VH CH1
L
(Fab’)2 Hinge
Fc
CH2 CH3
Membrane Extension
Fv
VH
VL C
L
CH1
CH2 C
H3
VL
VL
Fv
scFv
VH VH
Single Chain Fragment variable
免疫球蛋白基因可来源
噬菌体抗体 展示技术
细菌 107109 几周 相对简单 可避免 + 低 无限 直接
应用前景:
有限
不可估
前景
• 噬菌体抗体库技术的发展具有很大优越 性。它简单易行，筛选容量大，效率高， 绕过了细胞融合及免疫等步骤，而且在 表型一基因型的统一和识别一增殖过程 上模拟了B细胞的成熟过程，从而在实际 应用上具有很大意义。
第三节 选择性感染噬菌体 展示抗体库技术
选择性感染噬菌体展示(selectively infective phage display)技术即SIP技 术,是在噬菌体展示技术的基础上发展起 来的。该技术通过将候选蛋白与配体之 间的结合反应与噬菌体感染和扩增直接 联系起来,不必经过亲和筛选与洗脱,直 接获得特异性候选蛋白基因。
用固相化抗原经“亲和结合一洗脱一扩增”数个循环直接、 方便、简捷、高效地筛选出表达特异性好、亲和力强的抗 体噬菌体库。 筛选到的噬菌体再将基因g3或g8切除后，转入大肠杆菌， 使翻译出的抗体分泌到细菌的质周腔内，形成游离的抗体 片段，经过纯化即可获得目的抗体。
首先提取细胞的总RNA ,经过RTPCR 扩增可变区基因
英国剑桥的Ward等最早尝试了抗体库的构建， 他们用PCR从溶菌酶免疫后的小鼠脾细胞DNA扩 增出VH基因,测序证实了其多样性,在大肠杆菌 表达出VH段(单区抗体),检测2000个克隆得到 21个可以与溶菌酶特异结合的克隆。 这一工作未构建完整的抗原结合部位(无轻链), 也未提出有效的筛选方法,但它表明了抗体库 技术的可行性。
Antibody Gene Isolation
Antibody binding specificities are defined by the variable regions of the heavy (VH) and light chains (VL). The DNA encoding the VH and VL genes are amplified by PCR from human B lymphocytes and are joined together by DNA encoding a flexible peptide linker. This combinatorial assembly creates a whole repertoire of antibody genes encoding many different antibody fragments in the form of single chain Fvs (scFvs).
第十三章 抗体库技术
鲍永华 (baoyonghua2005@126.com)
新乡医学院免疫学教研室
丹麦
Niels K. Jerne
Georges J.F. Köhler
César Milstein
多克隆抗体的制备
B
A
Antigen
C
D
a
b
Antibody b
c
d
B
Antibody a
A
D
C
Antibody c
噬菌体抗体库技术(phage display antibody library techniques) 是指用聚合酶链反应 (polymerase chain reaction ,PCR) 扩增抗体的 全套可变区基因,通过噬菌体表面展示技术,把 Fab 段或单链抗体(ScFv) 表达在噬菌体的表面, 经过“吸附-洗脱-扩增”过程筛选并富集特异 性抗体。 构建Fab抗体库和ScFv抗体库的差别２８５页
组合抗体库的表达载体
A：重链载体 B：轻链载体 C：组合后的Fab段表达载体
抗体库技术较细胞融合杂交瘤技术 制备单抗有着明显的优越性：
1.抗体库技术省去了细胞融合的步骤,省时省力,避免了 因杂交瘤不稳定而需要反复亚克隆的繁琐程序。 2.扩大了筛选容量,用杂交瘤技术一般筛选能力在上千 个克隆以内,而抗体库可筛选106以上个克隆。 3.抗体库技术直接得到抗体的基因,既无杂交瘤丢失之 虞,又便于进一步构建各种基因工程抗体。 4.抗体库技术得到的抗体可以在大肠杆菌表达,可利用 原核表达系统的优势。 5.一些难于制备的抗体,如针对弱免疫原、毒性抗原的 抗体,以及人源抗体的制备可以得到解决。
噬菌体展示技术最关键的优势有三：
• 第一：淘选的高效率使得在极低的存在
水平下，挑选到高亲和力噬菌体成为可能； • 第二：所挑选到的噬菌体可在微量存在的情况 下，通过感染细菌得到富集； • 第三：展示的多肽或蛋白质与其包含在噬菌体 内部的基因密码的连接，使得结合肽或蛋白质 的序列分析既快速又简便。
二、噬菌体抗体库的构建
（一）能模拟天然抗体库,不需要免疫人和动物 在噬菌体抗体库中, 含有人抗体各种基因信息 的全部mRNA ,为全套抗体基因的获得提供了 良好材料。 构建噬菌体抗体库时,抗体重链基因和轻链基因 在体外的重组,造成重、轻链间的配对具有很大 的随机性, 一般认为,107个特异性抗体分子就 能识别全部抗原决定簇的99 %。因此,构建一 个库容量为108的组合噬菌体抗体库,理论上认 为基本上包括了所有的抗体分子。
基因治疗 有学者将呼吸道内皮细胞暴 露于随机肽库中,筛选出与之相结合的高 亲和力的肽分子,分离相应基因,以重组腺 病毒作为载体将外源基因导入呼吸道内 皮细胞内,使外源基因得到高效表达,治疗 效果明显。
单克隆抗体 杂交瘤技术
宿主细胞: 筛选范围 : 时间: 操作: 免疫: 人源抗体: 费用: 生产量: 基因获取: 杂交瘤 ~103 几个月 繁杂 必须 高 有限 再克隆
经典的筛选方法有两种290页
一是将纯抗原包被在固相介质上,如酶标 板、免疫试管或亲和层析柱,然后加入待 筛选的噬菌体,洗去非亲和性的噬菌体,回 收高亲和性的噬菌体。（固相筛选） 二是将抗原与生物素基团相连,再将其固 定在包被有链霉蛋白抗生素的顺磁珠上 对噬菌体进行筛选。（液相筛选）
三、噬菌体抗体库技术优势
（二）适应于大规模工业化生产
DNA 操作是在细菌中增殖,比杂交瘤技术 简单快速,制备单抗从取脾细胞到稳定的 克隆株至少需要数月,而噬菌体抗体库技 术最短只需几周的时间。
（三）可获得不同亲和力的抗体
在构建噬菌体抗体库时,抗体重链与轻链 基因的重组,就模拟了机体内抗体亲和力 的成熟过程。在噬菌体抗体库中,抗体重 链与轻链间的配对存在着很大的随意性, 这往往能改变B 细胞中原有的抗体重、 轻链间的配对方式,产生出不同亲和力的 抗体。
概念
所谓抗体库(antibody library)技术,就是 用基因克隆技术克隆全套抗体重链和轻 链可变区基因,然后重组到特定的原核表 达载体中,再转化大肠杆菌以表达有功能 的抗体分子片段,并通过亲和筛选获得特 异性抗体可变区基因的技术。
抗体库技术经历了组合抗体库、噬 菌体抗体库、核糖体展示(ribosome display)抗体库3个发展阶段。
Random Library of DNA Sequences + Gene 3 Fusions Gene 3 or 8
Translated from DNA to Peptide in E. coli
Each Phage Displays One Peptide Sequence
非展示系统
展示系统
杂交瘤细胞 体外免疫的细胞 致敏及非致敏的B 淋巴细胞(骨髓、外周血) 病灶局部引流淋巴结 扁桃体或经过免疫的小鼠脾脏等 其中以淋巴结的B 淋巴细胞较好
单链抗体(ScFv) 表达在噬菌体的表面
噬菌体表面展示文库技术的要点:
从免疫或未被免疫的B细胞中PCR扩增抗体全套基因片段 随机克隆入相应载体形成组合文库 将基因组合文库插入噬菌体编码膜蛋白的基因 g3或 g8 的先导系列的紧靠下游 外源基因表达多肽以融合蛋白形式展示在外壳蛋白N端
组合抗体库技术出现后不到一年, 即被 噬菌体抗体库技术所代替, 该技术是在 噬菌体表面展示(phage display)技术基 础上建立起来的, 是迄今为止发展最成 熟、应用最为广泛的抗体库技术。
第二节 噬菌体抗体库技术
1985年Smith — 证实噬菌体fd基因组能通过基因工 程的手段进行改造。 1988年Parmley — 将已知抗原决定簇与噬菌体PⅢ N端融合呈现在其表面。 1990年McCafferty — 用噬菌体展示技术筛选溶菌酶 的单链抗体成功使噬菌体展示技术进入一个广泛应用 的时代。 一系列噬菌体文库的构建—噬菌体展示技术焕发出了 新的生命力。
Antibody d
单克隆抗体的制备
基因工程抗体技术
20世纪80年代, DNA重组技术发展使制备 部分或全部人源化的基因工程抗体成为 可能，因此产生了基因工程抗体技术。
第一节 抗体库技术
进入20世纪90年代，组合化学技术与基因工程 抗体技术相互结合产生了抗体库技术。从此抗 体工程技术进入了一个新的发展阶段。 抗体库技术的产生基于两项关键技术的突破： ①PCR技术的出现和发展使人们能够使用一套 引物扩增出全套免疫球蛋白可变区基因;②利 用大肠杆菌成功表达出具有抗原结合功能的抗 体分子片段。