《微生物学》主要知识点 11 第十一章 微生物的分类和鉴定

《微生物学》主要知识点 11 第十一章微生物的分类和鉴定
《微生物学》主要知识点-11第十一章微生物的分类和鉴定
第十一章微生物分类鉴定席
概论：地球上到底有多少物种至今仍无准确答案，估计有分类记录的各类物种大约有150万，其中微生物超过10万。

微生物学工作者要认识、研究和利用微生物或控制有害微生物，必须对它们进行分类（classification）。

微生物分类学（microbialtaxonomy）
是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（taxon）的
科学。

具体任务――分类、鉴定（identification）和命名（nomenclature）。

11.1通用分类单元
11.1.1分类单元及其等级：分类单元是指特定的分类单元，如原核亚科、肠杆菌科、枯草芽孢杆菌等，分别代表一个分类单元。

微生物分类单元通常分为七个基本分类级别
（等级或类别）或分类级别。

从上到下依次为：分界、门、纲、目、科、属和种。

分类单
元的秩（秩元素）只是分类单元水平的概括，并不代表特定的分类单元。

种以上的分类单元：domain(域)、kingdom(界)、phylum(门)、class(纲)、
order(目)、family(科)、genus(属)、species(种)。

11.1.2物种的概念：物种是生物分类中的基本分类单元和分类级别。

它是指一大类菌株的总称，这些菌株具有高度相似的表型特征，亲缘关系密切，与同一属中的其他物种有
明显差异。

在微生物中，一个物种只能使用该物种内的一个典型菌株作为特定样本，因此
该典型菌株是该物种的类型物种。

11.1.3学名：学名是指一个菌种的科学名称，它是按照《国际细菌命名法规》命名的、国际学术界公认并通用的正式名字。

一个种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组组成。

escherichiacoli(migula)castellanietchalmers1919。

学名=属名+种的加词+（首次定名人）+现名定名人+定名年份。

属（或亚属）名：是一个表示该种微生物主要特征的名词或
用作名词的形容词，单数，其第一个字母应大写。

种的加词：代表一个种的次要特征，同
样由拉丁词或拉丁化的外来词所组成。

字首一律小写，可以是一个形容词或名词。

学名的
发音：均应按拉丁字母发音规则发音。

11.1.4亚种以下分类群：亚种以下有许多分类群，它们的提议和使用不受细菌命名规则的限制。

1.亚种，亚种。

，过磷酸钙；2.品种（变种）；3.形式；4.团体；5.应变；6.
种族；7.阶段；8.国家。

11.2微生物在生物世界中的地位11.2.1生物边界分类理论：1。

两个边界理论——动物王国和植物王国。

2.三界论——动物界、植物界和原生动物界。

3.
动物王国、植物王国、原生动物王国和原核生物王国四个领域的理论。

4.五大王国体系——动物王国、植物王国、原生动物王国、真菌王国和原核生物王国。

5.六边界系统加病毒
边界。

6.三大边界和五大边界系统——非细胞通用边界、原核通用边界和真核通用边界。

五域系统：1969年，R.H.惠塔克发表了一篇关于科学的著名论文《生物圈分类的新观点》。

本文在吸收前人工作经验的基础上，提出了五圈理论。

五界制包括：
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动物界(animalia)、植物界(plantae)、原生生物界(protista)、真菌界(fungi)、原
核生物界(monera)。

11.2.2三结构域理论及其发展：1977年，c.r.woese对各种生物的16S rRNA或18S rRNA的核苷酸序列进行了比较和研究，并提出了一个不同于以往边界分类的新体系——三结构域理论。

三域学说主要内容：三域是细菌域(bacteria)、古菌域(archaea)、真核生物域(eukarya)。

现在的一切生物都由一种共同远祖(universalancestor)进化而来，它原是一
种小细胞，先后分化出细菌和古菌这两类原核生物，后来在古菌分支上的细胞先后吞噬了
α-朊细菌(protobacteria)和蓝细菌，并发生了内共生(endosymbiosis)，从而两者进化
成与宿主细胞难分难解的细胞器――叶绿体和线粒体，于是，宿主最终也就发展成为各类
真核生物。

11.3各类微生物的分类体系：分类学的最终目标是建立一套接近生物系统发育规律的自然分类体系。

11.3.1原核微生物分类系统：伯杰氏细菌系统学手册
（(bergey’smanualofsystematicbacteriology)
11.3.2真核微生物分类系统：真菌词典
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11.4微生物的鉴定：菌种鉴定工作是各类微生物学实验室经常遇到的基础性的工作。

工作步骤：获得该种微生物的纯种培养物（pureculture）；测定一系列必要的鉴定指标；查找权威性的鉴定手册。

11.4.1经典分类鉴定方法：经典指标：形态学、生理生化、生态学、生活史、血清学反应等。

11.4.2现代分类鉴定方法
1.微生物基因型鉴定：测定DNA碱基比率（G+CMoL%）；核酸分子杂交；rrnagesequenceanalysis
2、细胞化学成分的鉴定：细胞壁化学组分；全细胞水解液的糖型；磷酸类脂成分的分析；枝菌酸的分析；醌的分析。

3.数值分类法：数值分类法是基于数值分析原理，借助现代计算机技术，根据大量表型性状的相似性，对待分类微生物对象进行计数和分类的方法。

数值分类的基本步骤是：（1）计算两种应变之间的相似系数；（2）列出相似矩阵；（3）将矩阵图转换为树状图
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数值分类的比较方法：匹配系数方法（matchingcoefficientmethod）：匹配系数对于2个比较菌株都是阳性或都是阴性的特征计算在内。

相似系数方法（similaritycoefficientmethod）：似系数不计算2个比较菌株都是阴性的特征，该方法认为如果对于2个比较菌株而言，都是阴性的特征根本就是不合适的比较特征。

数值分类法与传统分类法的比较：比较项目分类原则鉴定项目数据整理检索方法确定种属传统分类法所用特征有主次之分较少人工统计使用双歧检索表数值分类法所用特征无主次之分大量（50-100以上）计算机运算根据相关系数大小主要特征相同者为同属，相关系数小者为同属，相关次要特征相同者为同种系数大者为同种54。