外文医学文献检索工具pubmed

1. PubMed检索机制
1. PubMed检索机制
（一）Automatic Term Mapping：词汇自 动转换
1. PubMed检索机制
（一）Automatic Term Mapping：词汇自动 转换
1. PubMed检索机制
自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)
基本检索举例2：北京大学医学部马大龙 教授发表的文献
我们分别得到了两个检索结果： 作者为：马大龙（ma dl）的检索结果； 作者单位为：北京大学（peking university[ad]）的检索结果。 现在我们要利用检索史把这两个检索结果用 AND组合起来。 注意：检索历史在高级检索里。
1. PubMed检索机制
（一）Automatic Term Mapping：词汇自动 转换
1、MeSH Translation table Vitamin c 转换为: “ascorbic acid”[MeSH Terms] OR “ascorbic”[All Fields] AND “acid”[All Fields]) OR "ascorbic acid"[All Fields] OR "vitamin c"[All Fields] 想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存检 索策略，可看右下角的“search details”按钮
Hale Waihona Puke 一、PubMed概况 PubMed comprises approximately 23million citations for biomedical literature from MEDLINE, life science journals, and online books. PubMed citations and abstracts include the fields of medicine, nursing, dentistry, veterinary medicine, the health care system, and preclinical sciences. PubMed also provides access to additional relevant Web sites and links to the other NCBI molecular biology resources.
liver cancer AND therapy
基本检索举例1：肝癌的治疗
基本检索举例2：北京大学医学部马大龙教授发表 的文献
分析该检索课题，包含两个方面： 作者为：马大龙（ma dl）； 作者单位为： 北京大学（peking university[ad]）。
马大龙
peking university[ad]
一、PubMed概况
PubMed is a free resource that is developed and maintained by the National Center for Biotechnology Information (NCBI), at the U.S. National Library of Medicine (NLM), located at the National Institutes of Health (NIH). Publishers of journals can submit their citations to NCBI and then provide access to the full-text of articles at journal Web sites using LinkOut.
界面
1. PubMed基本检索
直接输入检索词 默认检索字段为主题、作者、期刊
1. PubMed基本检索
检索词的输入形式：
输入单词或短语或表达式
aspirin；stomach ulcer；Iddm AND apoptosis；“cancer therapy” ；liver cancer[ti] 带有连接号”-”作为一个词组检索：interleukin6白细胞介素6 。
1.2 PubMed检索运算符
（三）逻辑运算符： AND、OR、NOT必须大写。
当一个检索表达式中同时含有三个运算符时，运算顺序从 左至右，括号可以改变运算顺序。
vitamin c OR ascorbic acid；Lead poising NOT children 运算优先级为: ()> NOT > AND > OR。
一、PubMed概况——收录范围
1、MEDLINE（Medline是PubMed的核心 內容） 2、PreMEDLINE 3、Publisher supplied citations
一、PubMed概况——PubMed数据来源
MEDLINE：[pubmed-indexed for medline] PreMedline:[pubmed-in process] In Process Citations：每天收录，尚未经规范处理
医学文献检索
第四章 外文医学文献检索工具
第二节 PubMed

1.PubMed概况
从字面上看，PubMed这一名称，源自“Public”和“Medline”两个 英语单词，顾名思义，意味着面向公众的、免费的医药信息检索服 务。 美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI) (National Center for Biotechnology Information，NCBI)建立的生 物医学文献检索系统，使用NCBI的Entrez检索平台。 1997年6月开始向全球开放 特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特 点，部分文献（约5%）可免费下载全文。。 与Medline光盘数据库的区别：检索机制、检索界面、检索方法以及 收录文献数量不同。
复杂表达式：liver cancer AND therapy 带有摘要文献的检索 ：liver cancer AND hasabstract
基本检索举例1：肝癌的治疗
分析该检索课题，包含两个方面： 肝癌：liver cancer； 治疗：therapy
两个主题之间的逻辑关系是AND，即
例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病 （leukemia）的文献 第1步：检索长春新碱/治疗应用
第1步：检索长春新碱/治疗应用
长春新碱治疗白血病（leukemia）的文献
第2步：检索白血病/药物疗法
长春新碱治疗白血病（leukemia）的文献 第2步：检索白血病/药物疗法
1.2 PubMed检索运算符
例如：drug therapy AND （asthma哮喘 OR hay fever枯草热 ） 布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识 例如：dna[mh] AND crick[au] AND 1993[dp] 查带文摘的文献（1975年以后出版的文章）检索 词AND hasabstract 例，Neoplasms AND hasabstract
对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进 行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺 序是：MeSH表(MeSH Translation Table)、期刊刊 名表(Journal Translation Table)、短语表 (Phrase list)、作者索引(Author Index)。如果在 以上4个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语 分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索 时各个词之间是AND逻辑关系。如果仍找不到相匹配 的词，则用单个词在所有字段查找，各个词之间也 是AND逻辑关系。
1. PubMed检索机制
1. PubMed检索机制
（二）短语检索(Phrase Searching)
也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作 为一个词组进行检索，可用双引号“ ”将其引 起来。如：“drug therapy”作为词组进行检索 的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行 MeSH词的扩检。
1. PubMed检索机制
（一）Automatic Term Mapping 2、Journals Translation table
New England journal of medicine 转换为 “N Engl J Med”[Journal]
3、Phrase List
. Cold compresses 在前两个表中均未找到，便在短语列表中找到这 个词
1. PubMed基本检索
著者姓名：weng xz、“weng xz ”[au]
姓+名首字母缩写(不用标点)的格式在检索框内 按照键入作者姓名，如Smith ja，系统会自动 在作者字段内进行检索。
1. PubMed基本检索
刊名标题：刊名全称、缩写、ISSN
Journal of leukocyte白血球 biology、J leukoc biol、0741-5400
三、检索途径与方法
. 基本检索- Basic Search . 高级检索- Advanced Search . 主题词检索- MeSH Databases . 期刊检索– Journal Databases .引文匹配- Citation Matcher . 临床查询– Clinical Queries
[ti]，[au]，[ta]， [la]，[pt]。
常用字段组成
标识符 TI AU AD AB DP TA MH PT 字段名称 中文释义 Title 题目 Author 作者 Affiliation 作者单位 Abstract 文摘 Publication Date 出版日期 Journal Title Abbreviation 刊名缩写 MeSH Terms 主题词 Publication Type 出版类型
的数据。因为未做主题标引，检索时采用自由词检索。
Publisher-Supplied Citations：由出版商提 供的电子文献，每条记录标有[PubMed-as supplied by Publisher]。
以下是几条PubMed的记录，标记不同，其出自的分库也不同
二、PubMed检索方法
例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病 （leukemia）的文献
第1步：检索长春新碱/治疗应用
例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病 （leukemia）的文献
第1步：检索长春新碱/治疗应用
例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病 （leukemia）的文献 第1步：检索长春新碱/治疗应用
检索结果
2.高级检索界面
3. 主题检索
点击MeSH Database打开主 题检索界面
根据medline数据主题标引的 规范性，利用主题词进行的研 究，可提高查全率、查准率
3. 主题检索
例：长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia） 的文献
分析该检索课题，有两个概念：长春新碱 （Vincristine ） 、白血病（leukemia）： 对长春新碱来说是利用其治疗疾病，故其应组 配副主题词“治疗应用（therapeutic use）”； 对白血病来说是利用药物来治疗，故其应组配 副主题词“药物疗法（drug therapy）”。 同时这两个概念之间是AND的关系。
1.2 PubMed检索运算符
（三）逻辑运算符：
截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上 一个截词符 infect*，可检出infection、 infectious,infective,infectivity,infector等 双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行检索。 检索字段标识符：[tag]，tag为字段名称。