高通量测序服务简介
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成后可以为客户提供完整的生物信息学分析,直至可以进行文章投稿或结题 等,这点在各个高通量测序服务企业中是非常有优势的,因为很多客户测序 完成后,如果缺乏此环节,其成果水平下降,甚至出现数据烂在手中的情况 ,并不是而事实上是因为缺乏分析环节的保障。
3、服务稳定。实验操作阶段的每个实验环节都有专门的人员负责
•其它企业:
1、美季生物。 -小型企业,偏重于454测序。
2、晶能科技。 -依托研究院所建立的高通量测序服务企业。有一定业务量,但不稳 定。
3、其他类企业: -还有一些小型企业,这些企业主要通过代理或只能承担小量样本测 序,其服务流动性较大而且服务质量无法保证。
欣景生物科技则拥有成熟的测序与分析流程、经验丰富的分析人员,可 以提供高质量的二代测序相关服务。
生物信息高级分析:
提供图型化界面由用户人工确认基因结构和基因功能注释。 重复序列识别和分类。 基因家族识别和聚类。 基因功能聚类,参照FunCatDB标准。 代谢调控途径识别和重建。 转录因子(Transcription Factor)识别和分类分析。 分泌蛋白识别和分析。 蛋白激酶识别和分析。 转运蛋白(Transporter)识别和分析。 假基因(pseudogene)识别和分析。 SSR标记模式识别和预测。
我们提供的测序服务内容(细致展开 )
表达组测序:
特定组织或者细胞中的mRNA经分离后制备成片段化的cDNA文库,通过solexa测 序仪对cDNA文库高通量测序,从而获得一个细胞或生物个体的全转录组信息。
miRNA测序 :
可对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。用于作 用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学 应用。
基因组测序:
1. 细菌基因组测序:对全新或不同菌株细菌基因组进行全测序研究。 2. 真菌全基因组测序(全新或不同菌株):对于真菌全基因组而言,可以得到到一个真
菌基因组的精细图(基因组覆盖度大于95%,基因区覆盖度达到98%以上,单碱 基错误率低于十万分之一)。 3. 全基因组重测序:全基因组重测序是对已知基因组序列的物种的个体进行 测序 ,并在个体或群体水平进行差异分析的方法。基于全基因组重测序的分子育种, 能够快速的进行种质资源普查筛选,寻找到大量基因差异,实现遗传进化分析及 重要性状候选基因的预测。在全基因组水平上扫描并检测与动植物重要性状相关 的突变位点,具有重大的科研价值和产业价值。
高通量测序数据分析服务适用范围
已进行高通量测序实验的机构,后续需要对所获
得的数据展开各种不同应用的研究。如基因组数据挖 掘、表达组的cSNP寻找、基因组的拼接与补洞、 miRNA的不同样本的表达差异分析等等。
一般的二代测序服务公司没有相应深度分析的能力, 而实验室很难独立展开深度分析的工作,可以采用合 作科研或纯服务委托形式。
更多相关内容不再展开
应用举例
•应用举例
•应用举例
高通量测序服务市场情况分析
大型知名品牌企业:
-华大基因。
-这类企业有完整的产业链,有着巨大规模的传统测序与二代 测序服务经验与市场拓展经验;但同时存在对具体客户服务不够 细致的缺点。
-2011年华大基因全球测序营业额1000000000元(人民币)
基于超级计算机、雄厚的生物信息学分析 经验与实力,欣景生物建立了成熟的高通量
测序数据的分析流程,有着经验丰富的生物信
息学分析人员,可提供针对各类二代测序数 据的深层数据分析服务。
高通量测序服务适用范围
mRNA或miRNA的表达组研究
进行高水准研究的医院、科研机构,涉及疾病样本、动物样本、 农业样本、微生物样本的表达组研究。
,有完善的质控标准。
4、服务灵活。针对客户不同的需求在可行的前提下可以制定不同
我们提供的数据分析服务(细致展开
)
基本数据分析:
序列前处理工作,包括成对测序数据的序列匹配,裁减低质量部分,数据格式转换等 序列拼接,Scaffolding,对454数据的homopolymer进行修正等。 用多种主流基因预测软件预测基因并挑选最合适的代表基因结构。 tRNA/rRNA识别和分类。 基因组GC含量分析,并识别特异区域。 基因功能注释(包括同源注释和蛋白结构域识别)。 基因功能分类,参照Gene Ontology或COG标准(由用户指定标准)。
基于illumina的solexa与罗氏454的高通量测序平台 ,欣景生物可提供不同物种样本的各种类型的二 代测序服务。根据样本RNA或者DNA的不同应用可 分为表达组测序、microRNA测序、基因组测序等 。
高通量测序数据分析简介
随着第二代测序技术的广泛应用,海量数据不 断产生,包括大量的各类测序结果,需要凭借 专业的人员和方法对数据进行各种分析和统计 ,才能得到有效的所需信息。
我们的优势
1、服务水准高。团队中有关高通量测序实验已经大量大型课题的锻炼
,包括大量基因组测序、转录组测序等等,并已有Nature、Science等高端杂 志文章数据分析经验,有一整套严格的实验质量标准和操作流程,且不断跟 踪国际最新的进展,可以在高起点为客户提供服务。
2、服务周到。技术团队中有专职的高通量数据信息分析人员,在测序完
新物种测序或已测序物种的重测序
开展基因组学研究的科研机构,或对特殊物种(农业经济作物, 如烟草、葡萄等;有价值的微生物,如致病菌、垃圾处理菌、农 业土壤改良菌、工业工程菌株等)进行基因组研究的机构,包括 一些发酵相关企业。
疾病相关或表型相关的人类基因组重测序
如华大之前做的炎黄计划,以及最近国际在进行的肿瘤基因组计 划等,一般是有较大科研经费实力的机构。
高通量测序服务简介
2020年8月2日星期日
高通量测序简介
高通量测序技术(第二代或下一代测序技术,next genewenku.baidu.comation sequencing) 是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万 到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在研究 中又被称为深度测序(deep sequencing) 。
3、服务稳定。实验操作阶段的每个实验环节都有专门的人员负责
•其它企业:
1、美季生物。 -小型企业,偏重于454测序。
2、晶能科技。 -依托研究院所建立的高通量测序服务企业。有一定业务量,但不稳 定。
3、其他类企业: -还有一些小型企业,这些企业主要通过代理或只能承担小量样本测 序,其服务流动性较大而且服务质量无法保证。
欣景生物科技则拥有成熟的测序与分析流程、经验丰富的分析人员,可 以提供高质量的二代测序相关服务。
生物信息高级分析:
提供图型化界面由用户人工确认基因结构和基因功能注释。 重复序列识别和分类。 基因家族识别和聚类。 基因功能聚类,参照FunCatDB标准。 代谢调控途径识别和重建。 转录因子(Transcription Factor)识别和分类分析。 分泌蛋白识别和分析。 蛋白激酶识别和分析。 转运蛋白(Transporter)识别和分析。 假基因(pseudogene)识别和分析。 SSR标记模式识别和预测。
我们提供的测序服务内容(细致展开 )
表达组测序:
特定组织或者细胞中的mRNA经分离后制备成片段化的cDNA文库,通过solexa测 序仪对cDNA文库高通量测序,从而获得一个细胞或生物个体的全转录组信息。
miRNA测序 :
可对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。用于作 用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学 应用。
基因组测序:
1. 细菌基因组测序:对全新或不同菌株细菌基因组进行全测序研究。 2. 真菌全基因组测序(全新或不同菌株):对于真菌全基因组而言,可以得到到一个真
菌基因组的精细图(基因组覆盖度大于95%,基因区覆盖度达到98%以上,单碱 基错误率低于十万分之一)。 3. 全基因组重测序:全基因组重测序是对已知基因组序列的物种的个体进行 测序 ,并在个体或群体水平进行差异分析的方法。基于全基因组重测序的分子育种, 能够快速的进行种质资源普查筛选,寻找到大量基因差异,实现遗传进化分析及 重要性状候选基因的预测。在全基因组水平上扫描并检测与动植物重要性状相关 的突变位点,具有重大的科研价值和产业价值。
高通量测序数据分析服务适用范围
已进行高通量测序实验的机构,后续需要对所获
得的数据展开各种不同应用的研究。如基因组数据挖 掘、表达组的cSNP寻找、基因组的拼接与补洞、 miRNA的不同样本的表达差异分析等等。
一般的二代测序服务公司没有相应深度分析的能力, 而实验室很难独立展开深度分析的工作,可以采用合 作科研或纯服务委托形式。
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高通量测序服务市场情况分析
大型知名品牌企业:
-华大基因。
-这类企业有完整的产业链,有着巨大规模的传统测序与二代 测序服务经验与市场拓展经验;但同时存在对具体客户服务不够 细致的缺点。
-2011年华大基因全球测序营业额1000000000元(人民币)
基于超级计算机、雄厚的生物信息学分析 经验与实力,欣景生物建立了成熟的高通量
测序数据的分析流程,有着经验丰富的生物信
息学分析人员,可提供针对各类二代测序数 据的深层数据分析服务。
高通量测序服务适用范围
mRNA或miRNA的表达组研究
进行高水准研究的医院、科研机构,涉及疾病样本、动物样本、 农业样本、微生物样本的表达组研究。
,有完善的质控标准。
4、服务灵活。针对客户不同的需求在可行的前提下可以制定不同
我们提供的数据分析服务(细致展开
)
基本数据分析:
序列前处理工作,包括成对测序数据的序列匹配,裁减低质量部分,数据格式转换等 序列拼接,Scaffolding,对454数据的homopolymer进行修正等。 用多种主流基因预测软件预测基因并挑选最合适的代表基因结构。 tRNA/rRNA识别和分类。 基因组GC含量分析,并识别特异区域。 基因功能注释(包括同源注释和蛋白结构域识别)。 基因功能分类,参照Gene Ontology或COG标准(由用户指定标准)。
基于illumina的solexa与罗氏454的高通量测序平台 ,欣景生物可提供不同物种样本的各种类型的二 代测序服务。根据样本RNA或者DNA的不同应用可 分为表达组测序、microRNA测序、基因组测序等 。
高通量测序数据分析简介
随着第二代测序技术的广泛应用,海量数据不 断产生,包括大量的各类测序结果,需要凭借 专业的人员和方法对数据进行各种分析和统计 ,才能得到有效的所需信息。
我们的优势
1、服务水准高。团队中有关高通量测序实验已经大量大型课题的锻炼
,包括大量基因组测序、转录组测序等等,并已有Nature、Science等高端杂 志文章数据分析经验,有一整套严格的实验质量标准和操作流程,且不断跟 踪国际最新的进展,可以在高起点为客户提供服务。
2、服务周到。技术团队中有专职的高通量数据信息分析人员,在测序完
新物种测序或已测序物种的重测序
开展基因组学研究的科研机构,或对特殊物种(农业经济作物, 如烟草、葡萄等;有价值的微生物,如致病菌、垃圾处理菌、农 业土壤改良菌、工业工程菌株等)进行基因组研究的机构,包括 一些发酵相关企业。
疾病相关或表型相关的人类基因组重测序
如华大之前做的炎黄计划,以及最近国际在进行的肿瘤基因组计 划等,一般是有较大科研经费实力的机构。
高通量测序服务简介
2020年8月2日星期日
高通量测序简介
高通量测序技术(第二代或下一代测序技术,next genewenku.baidu.comation sequencing) 是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万 到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在研究 中又被称为深度测序(deep sequencing) 。