上海交大团队揭示DNA磷硫酰化基因组修饰异质性特征

科学源流 \

ORIGIN & DEVELOPMENT 丿

的数学符号，改变了长期使用的从右至左的编排方式； 这一革新具有划时代的意义代数教科书的内容及其难

度不逊于欧美和日本。从这一点看，较之于前一个时期

有了明显的进步。其中较大的缺陷是代数教科书中的习

题太多，只能选做：当然这也可能是其优点之一，因为当 时学习数学的参考资料匮乏，即使有也需较大花销，教科 书貌似习题集恰也部分解决了学生的演练需要。师资方 面，由于学堂发展较快，教师供不应求：有些条件较好的

大中堂.还聘请欧美日籍教员。虽然这些外籍教师水平 参差不齐，有的甚至水平并不算高，但毕竟还是走在国人

的前面了。

总之，清末时期的代数水平远落后于世界水平，同时 在办学与传播过程中又受到了传统势力的阻挠，受困于 各种条件的制约。作为转型时期的教学内容，相关教学

机构代数课程的开设为清末数学家提供了开展数学教 学研究的舞台，同时也培养了一批适合社会需求的数学

人才。代数知识的学习，在一定程度上促进了清末学风

的转变：早期学习数学的毕业生主要承担了各学堂的代 数教学工作，为代数知识的普及做岀了巨大贡献。即使

后期大量的留学生回国，这些早期数学毕业生仍然活跃 于初、中等数学教育舞台。可以说.清末代数知识的传播 与普及，促进了数学教育的发展，使得民国成立以后代数

传播得以顺利进行。从这个角度说.清末代数传播也是 中国数学走向现代化的基石，具有不可忽视的历史地位。

［本文受内蒙古自然基金项目(2015MS0112),集宁师

范学院博士科研启动基金项目(JSBSJJ1704)支持。白欣 为通讯作者。］

［1］ 韩琦.康熙时代西方数学在宫廷的传播.自然科学史研究,2003 (2):

150.

［2］ 冯立昇，牛亚华.近代汉译西方数学著作对日本的影响.内蒙古师

范大学学报,2003(3): 85.

［3］ Ann Arbor, Michigan. Li shanlan, the Impact of Western Mathematics

in China during the late 19th Century. City University of NewYork, 1991: 328.

［4］ 赵栓林•对《代数学》和《代数术》术语翻译的研究.呼和浩特:

内蒙古师范大学,2005: 10.

［5］ 顾长声•传教士与近代中国.上海：上海人民岀版社,1982: 89.［6］ 李迪.中国数学史大系•中国算学书目汇编•北京：北京师范大学出

版社,2007: 124.

［7］ 郭金海.京师同文馆数学教学探析.自然科学史研究，2003(22): 53.［8］ 王秀良•清末杂志、社团与数学传播•天津：天津师范大学,2003: 1.

〔9］南洋官书局职董陈作霖呈书三十五种请审定禀批.学部官报，第31

期《审定书目》.

［10］ 张伟，董杰.近代数学教科书出版情况考•兰台世界,2015(1): 75.［11］ 张奠宙•二十世纪的中国数学与世界数学的主流•自然科学史研究,

1986(3): 274.

［12］ 桦正董.中学校数学教科书代数之部•赵缭，易应覘，译•上海：

上海群益书社，190&原序.

［13］ 魏庚人.数学教育文集.郑州：河南教育岀版社，1991:60.

关键词：清末代数西学东渐数学教科书代数之部

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上海交大团队揭示 DNA 磷硫酰化基因组 修饰异质性特征

［本刊讯］上海交通大学生命科学

技术学院微生物代谢国家重点实验室邓 子新院士团队由德林教授研究组与张大

兵教授团队杨立桃教授研究组合作，在

DNA 磷硫酰化修饰研究方面取得新进

展：幵发 了 PT-IC-seq 和 PT-IC-ddPCR

两种技术,首次定量地检测了基因组上

DNA 磷硫酰化修饰位点,揭示了磷硫酰

化修饰在全基因组水平上的修饰都存在

细胞之间异质性。相关成果于2019年4

月1曰在线发表于PLoS Genetics

DNA 是重要的遗传物质，储存着所 有蛋白质和RNA 的全部遗传信息。DNA

上的任何一个微小的变化都有可能改变

生命的遗传信息，影响生命活动,如经典 的DNA 甲基化修饰在生物界具有保护

遗传稳定，调控DNA 复制、转录以及翻

译过程等重要功能。DNA 磷硫酰化修饰

是由邓子新发现的，DNA 骨架上硫原子 取代磷原子上的非桥联氧原子形成的一

种新型DNA 修饰。它突破了 DNA 由碳、

氢、氧、氮、磷5种元素构成的结论，拓展 了经典的DNA 组成。由德林研究组曾

利用单分子实时测序和碘切割依赖的测

序技术绘制了大肠杆菌基因组DNA 磷 硫酰化修饰图谱，但这种新型DNA 修饰 的基因组分布规律和修饰频率尚未知。

该研究团队将碘乙醇对磷硫酰化修

饰位点的特异性切割和新一代DNA 测

序技术结合起来,幵发了 PT-IC-seq 技

术，该技术可用于高通量研究全基因组水 平上每个磷硫酰化位点的修饰频率。通

过PT-IC-seq 分析发现，在大肠杆菌B7A 和沙门氏菌Serovar Cerro 87中的大多

数磷硫酰化修饰位点都是保持着较低的

修饰频率(<5%),并且它们都表现出类 似于甲基化修饰的异质性特点“随后，研

究人员又引入了微滴式数字PCR 技术， 开发了可以绝对定量的PT-IC-ddPCR 方

法，相关分析进一步印证了 DNA 磷硫酰

化修饰具有低频和异质性特征的重要发

现。类似于甲基化异质性，这种磷硫酰 化异质性能否提高细菌在逆性环境下的 群体生存能力而赋予其种群进化上的优

势，目前还不得而知。

该研究团队持续关注DNA 磷硫酰

化修饰的生物学研究，相继解析了 DNA

磷硫酰化修饰基因组图谱、修饰基因的

功能和转录水平上的调控机制,以及发

现DNA 磷硫酰化修饰限制系统并阐明

了其作用机制。该工作是这种新型DNA

骨架修饰生物学研究上的又一重要进

展,相关研究为磷硫酰化修饰在全基因 组水平的精确定位和定量鉴定提供了重

要工具，对揭示修饰的过程和修饰的生

理功能具有重要的指导意义。(馨娅)

2019年5月丨71卷3期：：

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