细粒棘球蚴原头蚴包囊和原头蚴成虫抑制差减杂交文库中差异表达基因的筛选及分析
合集下载
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
DevelopmentfromEchinococcusgranulosusLarvalProtoscolex （PSC）
ZHAOLi1# ，SHIBao-xin1# ，LIJun3，ZHANGZhuang-zhi1，MAZheng-hai2，ZHANGXu1， XUEJing1，JIN Ying-hong1，ZHANG Wen-bao3*
男 （1963-）， ，河北馆陶人，研究员，E-mail：2423930978@。石保新与赵莉为同等贡献的第一作者
通信作者 张文宝 研究员 *
：
，
，E-mail：wenbaozhang2013@
1216
畜牧兽医学报
卷 46
E.granulosusPSC-adult（AW）andE.granulosusPSC-cyst（CW）wereconnectedtothepGEMTeasyvector，and wereclonedandsequenced.Totally，280and200clones wereobtainedfrom PSC-CW andPSC-AM libraries，respectively，withthelengthoffragments200to1000bp.The clonesweresequenced.Sequencealignmentanalysisshowedthatthesesequencesbelongto16and 10geneclustersrepresenting16and10uniquegenesfromPSC-CMandPSC-AWlibrariesrespectively.AsthegenesarespecificallyordifferentiallyexpressedduringthedevelopmentofPSCto eitheradultworm orcyst，theyareimportantfortheparasitedevelopmentanddifferentiation， thuscanbecandidatesfordrugandvaccinedevelopment. Keywords：Echinococcusgranulosus；suppressionsubtractivehybridization （SSH）；thespecificalgenes
现频率较高的基因，其余12个基因仅出现1次，其中5个为未知基因，已知基因分别编码细胞色素 C 氧化酶Ⅰ、热休克
蛋白70和铁较高基因，8个基因仅出现
1次，4个为未知基因，6个已知基因分别编码基质蛋白1、延伸因子 和 1α 脂肪酸结合蛋白等功能蛋白质。本研究筛选
1# ，
军3，张壮志1，马正海2，张
旭1，薛
晶1，金映红1，张文宝3*
新 （1. 疆大学生命科学与技术学院重点实验室，乌鲁木齐 830046；
新 3. 疆医科大学第一附属医院医学研究中心，新疆包虫病基础医学重点实验室，乌鲁木齐 830054）
摘 要：细粒棘球绦虫原头蚴 具有 （PSC） 双向发育的特点，本文旨在利用SSH 和生物信息学方法筛选原头蚴包囊
和 （CW） 成虫 特 （AW） 异 性 的 基 因。将 PSC-CW 和 PSC-AW 双 相 发 育 差 减cDNA 文 库 的 差 减 PCR 产 物 克 隆 入
pGEM-T 载体并测序，利用 在 CAP3sequenceassembly 线软件、Blast2GO 软件与 数 GenBank 据库对测序结果进行
CollegeofLifeScienceandTechnology ，XinjiangUniversity，Urumqi830046，China； 3.XinjiangHydatidFundamentalMedicalKeyLab，FirstTeaching HospitalofXinjiang
MedicalUniversity，Urumqi830054，China）
关键词：细粒棘球绦虫；抑制差减杂交；特异性基因
中图分类号：S852.734
文献标志码：A
文 章 编 号 ：0366-6964（2015）07-1215-09
TheScreeningandAnalysisofDifferentiallyExpressedGenesinSuppression SubtractiveHybridizationLibrarywitheitherCyst（CW）orAdultWorm （AM）
Abstract：Accordingtothebidirectionaldevelopmentoftheprotoscolex （PSC）ofEchinococcus granulosus，thestudywasconductedtoscreenthespecificalgenesofE.granulosusPSCdevelopmentbetweenalarvalcystandadultworm.ThesubtractivePCRproductsoftheSSHlibraryof
畜牧兽医学报 2015，46（7）：1215-1223
ActaVeterinariaetZootechnicaSinica
doi：10.11843/j.issn.0366-6964.2015.07.019
细粒棘球文蚴库原中头差蚴异包表囊达和基原因头的蚴筛成选虫及抑分制析差减杂交
赵
莉 石保新 李 1# ，
获得原头蚴成囊和成虫发育时差异表达的基因，对这些基因异表达可能与原头
蚴处于不同的生长环境和发育方向有关，同时也为棘球蚴病免疫诊断、药物筛选和疫苗研制提供候选基因。
（1.VeterinaryResearchInstituteof AnimalScienceAcademyof Xinjiang UygurAutonomousRegion， Urumqi830000，China；2.XinjiangKeyLaboratoryofBiologicalResourcesandGeneticEngineering，
分析，筛选原头蚴成囊和成虫特异性的基因，并探讨这些基因的功能。结果显个阳性克隆，菌落 PCR鉴定结果表明，这些克隆均插入200～1000bp片段。测序结
果显示从 014-09-26
基金项目：公益性行业（农业）科研专项项目（201103008）
作者简介：赵 莉 女 （1982-）， ，江 苏 宿 迁 人，硕 士，助 理 研 究 员，主 要 从 事 生 物 化 学 与 分 子 生 物 学 研 究 石 ，E-mail：82285053@； 保 新
ZHAOLi1# ，SHIBao-xin1# ，LIJun3，ZHANGZhuang-zhi1，MAZheng-hai2，ZHANGXu1， XUEJing1，JIN Ying-hong1，ZHANG Wen-bao3*
男 （1963-）， ，河北馆陶人，研究员，E-mail：2423930978@。石保新与赵莉为同等贡献的第一作者
通信作者 张文宝 研究员 *
：
，
，E-mail：wenbaozhang2013@
1216
畜牧兽医学报
卷 46
E.granulosusPSC-adult（AW）andE.granulosusPSC-cyst（CW）wereconnectedtothepGEMTeasyvector，and wereclonedandsequenced.Totally，280and200clones wereobtainedfrom PSC-CW andPSC-AM libraries，respectively，withthelengthoffragments200to1000bp.The clonesweresequenced.Sequencealignmentanalysisshowedthatthesesequencesbelongto16and 10geneclustersrepresenting16and10uniquegenesfromPSC-CMandPSC-AWlibrariesrespectively.AsthegenesarespecificallyordifferentiallyexpressedduringthedevelopmentofPSCto eitheradultworm orcyst，theyareimportantfortheparasitedevelopmentanddifferentiation， thuscanbecandidatesfordrugandvaccinedevelopment. Keywords：Echinococcusgranulosus；suppressionsubtractivehybridization （SSH）；thespecificalgenes
现频率较高的基因，其余12个基因仅出现1次，其中5个为未知基因，已知基因分别编码细胞色素 C 氧化酶Ⅰ、热休克
蛋白70和铁较高基因，8个基因仅出现
1次，4个为未知基因，6个已知基因分别编码基质蛋白1、延伸因子 和 1α 脂肪酸结合蛋白等功能蛋白质。本研究筛选
1# ，
军3，张壮志1，马正海2，张
旭1，薛
晶1，金映红1，张文宝3*
新 （1. 疆大学生命科学与技术学院重点实验室，乌鲁木齐 830046；
新 3. 疆医科大学第一附属医院医学研究中心，新疆包虫病基础医学重点实验室，乌鲁木齐 830054）
摘 要：细粒棘球绦虫原头蚴 具有 （PSC） 双向发育的特点，本文旨在利用SSH 和生物信息学方法筛选原头蚴包囊
和 （CW） 成虫 特 （AW） 异 性 的 基 因。将 PSC-CW 和 PSC-AW 双 相 发 育 差 减cDNA 文 库 的 差 减 PCR 产 物 克 隆 入
pGEM-T 载体并测序，利用 在 CAP3sequenceassembly 线软件、Blast2GO 软件与 数 GenBank 据库对测序结果进行
CollegeofLifeScienceandTechnology ，XinjiangUniversity，Urumqi830046，China； 3.XinjiangHydatidFundamentalMedicalKeyLab，FirstTeaching HospitalofXinjiang
MedicalUniversity，Urumqi830054，China）
关键词：细粒棘球绦虫；抑制差减杂交；特异性基因
中图分类号：S852.734
文献标志码：A
文 章 编 号 ：0366-6964（2015）07-1215-09
TheScreeningandAnalysisofDifferentiallyExpressedGenesinSuppression SubtractiveHybridizationLibrarywitheitherCyst（CW）orAdultWorm （AM）
Abstract：Accordingtothebidirectionaldevelopmentoftheprotoscolex （PSC）ofEchinococcus granulosus，thestudywasconductedtoscreenthespecificalgenesofE.granulosusPSCdevelopmentbetweenalarvalcystandadultworm.ThesubtractivePCRproductsoftheSSHlibraryof
畜牧兽医学报 2015，46（7）：1215-1223
ActaVeterinariaetZootechnicaSinica
doi：10.11843/j.issn.0366-6964.2015.07.019
细粒棘球文蚴库原中头差蚴异包表囊达和基原因头的蚴筛成选虫及抑分制析差减杂交
赵
莉 石保新 李 1# ，
获得原头蚴成囊和成虫发育时差异表达的基因，对这些基因异表达可能与原头
蚴处于不同的生长环境和发育方向有关，同时也为棘球蚴病免疫诊断、药物筛选和疫苗研制提供候选基因。
（1.VeterinaryResearchInstituteof AnimalScienceAcademyof Xinjiang UygurAutonomousRegion， Urumqi830000，China；2.XinjiangKeyLaboratoryofBiologicalResourcesandGeneticEngineering，
分析，筛选原头蚴成囊和成虫特异性的基因，并探讨这些基因的功能。结果显个阳性克隆，菌落 PCR鉴定结果表明，这些克隆均插入200～1000bp片段。测序结
果显示从 014-09-26
基金项目：公益性行业（农业）科研专项项目（201103008）
作者简介：赵 莉 女 （1982-）， ，江 苏 宿 迁 人，硕 士，助 理 研 究 员，主 要 从 事 生 物 化 学 与 分 子 生 物 学 研 究 石 ，E-mail：82285053@； 保 新