动植物全基因组测序
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2013.07
2013.102014.09
2014.11
2015.04
图1 异源多倍体棉花基因组共线性分析与非对称进化分析
图2 MYB基因家族表达模式分析
, Jiang W, et al. Sequencing of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) provides a resource for fiber improvement [J]. Nature Biotechnology, 2015, 33(5): 531-537.
图3 金丝猴植食性机制的分析图4 金丝猴有效群体大小分析
参考文献
Zhou X, Wang B, Pan Q, Li R, Li M. Whole-genome sequencing of the nub-nosed monkey provides insights into folivory and evolutionary history [J]. Nature Genetics, 2014, 46(12):1303-1310.
图5 藏猪及其它猪种的群体遗传结构分析
参考文献
Li M, Tian S, Jin L, et al. Genomic analyses identify distinct patterns of selection in domesticated pigs and Tibetan wild boars [J]. Nature genetics, 2013, 45(12): 1431-1438.
图6 进化分析结果图7 脂肪酸能量代谢途径
蓝色表示正选择基因；红色表示特异性基因
参考文献
Qu Y, Zhao H, Han N, et al. Ground tit genome reveals avian adaptation to living at high altitudes in the Tibetan plateau [J]. Nature communications, 2013, 4.
图1 7株野生大豆共有和特有基因集图2 野生大豆开花时间调控基因SNP和InDel变异
参考文献
Li Y, Zhou G, Ma J, Jiang W, Li R#, et al. De novo assembly of soybean wild relatives for pan-genome analysis of diversity and agronomic traits [J]. Nature biotechnology, 2014.32(10):1045-1052.
图3 部分novel sequence在世界人群中的分布
参考文献
Li R, Li Y, Zheng H, et al. Building the sequence map of the human pan-genome [J]. Nature biotechnology, 2010, 28(1): 57-63.