伯杰氏系统分类手册

附录2 伯杰氏细菌系统分类学手册

《伯杰氏细菌系统分类学手册》（“Bergry’s Manual of Systematic Bacteriology”），第二版，2001 年春，Springer-Verlag 公司，Gerge M. Garrity, Mattew Winters和Nenise B. Searles

第二版五卷本与第一版相比又有较大改动，与第八、第九版伯杰氏细菌鉴定学手册也有明显区别。它不是根据表型，而是以系统发生（进化）的框架为基础。参照了16S rDNA的序列。编辑们预计在手册第一卷到最后一卷出版的5、6年间，可能会再发现100多个新属。他们会不断修订错误，在后继出版的各卷中，出一个新的分类大纲。伯杰氏手册公司的网站（/bergeys）也会定期更新。第二版的第一卷在2001年5月出版；第二卷在2004年2月出版。

古生菌域（Domain “Archaea”）

第AI门泉古生菌门(Crenarchaeota phy. nov.)

第I纲热变形菌纲(Thermoprotei class. nov.)

第I目热变形菌目(Thermoproteales)

第I科热变形菌科(Thermoproteaceae)

第I属热变形菌属(Thermoproteus)

第II属热杆菌属(Caldivirga)

第III属热棒菌属(Pyrobaculum)

第IV属热枝菌属(Thermocladium)

第II科热丝菌科(Thermofilaceae)

第I属热丝菌属(Thermofilum)

第II目硫还原古球菌目(Desulfurococcales ord. nov.)

第I科硫还原古球菌科(Desulfurococcaceae)

第I属硫还原古球菌属(Desulfurococcus)

第II属(Acidolobus)

第III属气热菌属(Aeropyrum)

第IV属浆果状火球菌属(Ignicoccus)

第V属葡萄嗜热菌属(Staphylothermus)

第VI属斯梯特氏菌属(Stetteria)

第VII属恐硫球菌属(Sulfophobococcus)

第VIII属热盘菌属(Thermodiscus gen. nov.)

第IX属耐热球菌属(Thermosphaera)

第II科热网菌科(Pyrodictiaceae)

第I属热网菌属(Pyrodictium)

第II属栖高温菌属(Hyperthermus)

第III属热叶菌属(Pyrolobus)

第III目硫化叶菌目(Sulfolobales)

第I科硫化叶菌科(Sulfolobaceae)

第I属硫化叶菌属(Sulfolobus)

第II属酸菌属(Acidianus)

第III属生金球菌属(Metallosphaera)

第IV属栖冥河菌属(Stygiolobus)

第V属硫代谢球菌属(Sulfurisphaera)

第VI属硫化球菌属(Sulfurococcus)

第AII门广古生菌门(Euryarchaeota phy. nov.)

第I纲甲烷杆菌纲(Methanobacteria class. nov.)

第I目甲烷杆菌目(Methanobacteriales)

第I科甲烷杆菌科(Methanobacteriaceae)

第I属甲烷杆菌属(Methanobacterium)

第II属甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)

第III属甲烷球形菌属(Methanosphaera)

第IV属甲烷嗜热杆菌属(Methanothermobacter) 第II科甲烷嗜热菌科(Methanothermaceae)

第I属甲烷嗜热菌属(Methanothermus)

第II纲甲烷球菌纲(Methanococci class. nov.)

第I目甲烷球菌目(Methanococcales)

第I科甲烷球菌科(Methanococcaceae)

第I属甲烷球菌属(Methanococcus)

第II属甲烷嗜热球菌属(Methanothermococcus gen. nov.) 第II科甲烷热球菌科(Methanocaldococcaceae fam. nov.) 第I属甲烷热球菌属(Methanocaldococcus gen. nov.)

第II属甲烷干热菌属(Methanotorris gen. nov.)

第II目甲烷微菌目(Methanomicrobiales)

第I科甲烷微菌科(Methanomicrobiaceae)

第I属甲烷微菌属(Methanomicrobium)

第II属甲烷袋状菌属(Methanoculleus)

第III属产甲烷袋菌属(Methanofollis)

第IV属产甲烷菌属(Methanogenium)

第V属叶形甲烷菌属(Methanolacinia)

第VI属甲烷盘菌属(Methanoplanus)

第II科甲烷粒菌科(Methanocorpusculaceae)

第I属甲烷粒菌属(Methanocorpusculum) 第III科甲烷螺菌科(Methanospirillaceae fam. nov.) 第I属甲烷螺菌属(Methanospirillum)

未定属

第I属产甲烷石状菌属(Methanocalculus)

第III目甲烷八叠球菌目(Methanosarcinales)

第I科甲烷八叠球菌科(Methanosarcinaceae)

第I属甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)

第II属甲烷拟球菌属(Methanococcoides)

第III属甲烷喜盐菌属(Methanohalobium)

第IV属甲烷嗜盐菌属(Methanohalophilus)

第V属甲烷叶菌属(Methanolobus)

第VI属甲烷微球菌属(Methanomicrococcus)

第VII属甲烷盐菌属(Methanosalsum gen.nov.) 第II科鬃毛甲烷菌科(Methanosaetaceae fam.nov.) 第I属鬃毛甲烷菌科属(Methanosaeta)

第III纲盐杆菌纲(Halobacteria class. nov.)

第I目盐杆菌目(Halobacteriales)

第I科盐杆菌科(Halobacteriaceae)

第I属盐杆菌属(Halobacterium)

第II属盐盒菌属(Haloarcula)

第III属盐棒杆菌属(Halobaculum)

第IV属盐球菌属(Halococcus)

第V属富盐菌属(Haloferax)

第VI属盐几何形菌属(Halogeometricum)

第VII属盐杆状菌属(Halorhabdus)

第VIII属盐红菌属(Halorubrum)

第IX属盐栖菌属(Haloterrigena)

第X属无色嗜盐菌属(Natrialba)

第XI属钠线菌属(Natrinema)

第XII属嗜盐碱杆菌属（Natronobacterium）

第XIII属嗜盐碱球菌属(Natronococcus)

第XIV属嗜盐碱单胞菌属(Natronomonas)

第XV属碱红菌属(Natronorubrum)

第IV纲热原体纲(Thermoplasmata class. nov.)

第I目热原体目(Thermoplasmatales ord. nov.)

第I科热原体科(Thermoplasmataceae fam. nov.)

第I属热原体属(Thermoplasma)