核酸的分离纯化精品PPT课件
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
需要量大,一般要求低温操作。
返回
(2)异丙醇
优点: 需体积小,速度快,适于浓度低、体积大的
DNA样品沉淀。一般不需低温长时间放置。 缺点:
易使盐类、蔗糖与DNA共沉淀.异丙醇难以挥 发除去。所以,最后用75%乙醇漂洗数次。
返回
(3)聚乙二醇(PEG)
优点: 可用不同浓度的PEG选择沉淀不同相对分子质量
所用器械和一些试剂需高温灭菌,提取缓 冲液中需加核酸酶抑制剂。
返回
1.2.1 DNA酶抑制剂
(1) 金属离子螯合剂: DNA酶需要金属二价离子Mg2+、Ca2+的激活,因
此使用金属二价离子螯合剂,可抑制DNA酶活性。 如EDTA-Na2(乙二胺四乙酸二钠)、8-羟基喹啉; (2) 阴离于型表面活性剂:
粘性液体,很强的核酸酶抑制剂。
作用机制:与蛋白质中His结合使蛋白变性。
使用注意:
1)DEPC也能破坏单链核酸中大部分腺嘌呤环。 但浓度比使蛋白质变性的浓度大100~1000倍。
2)容易降解,保存在4 ℃或液氮中; 3)提RNA时,0.1% DEPC浸泡器皿,180℃ 6 h。
4)剧毒。
返回
2.分离提取核酸的主要步骤
的DNA片段。应用6000相对分子质量的PEG进行DNA 沉淀时,使用浓度与DNA片段的大小成反比。 注意:
PEG沉淀一般需加0.5mol/L的NaCl或10 mmol/L 的MgCl2。
返回
(4)精胺
精胺不是有机溶剂,但可快速有效沉淀DNA。
原理是: 精胺与DNA结合后,使DNA在溶液中结构凝
缩而发生沉淀,并可使单核苷酸和蛋白质 杂质与DNA分开,达到纯化DNA的目的。
I.材料准备
破碎细胞
II.破碎细胞或包膜-内容物释放
提取
III.核酸分离
纯化
IV.沉淀或吸附核酸,纯化并去除杂质
V.核酸溶解在适量缓冲液或水中
返回
2.1 细胞的破碎
(1)玻璃匀浆器匀浆
(2)液氮研磨法
富含DNA酶的胰、脾、胸腺、淋巴; 富含胶原蛋白的皮肤、肌腱; 坚硬的组织如骨骼。
返回wk.baidu.com
(3)高速组织捣碎机捣碎 (4)超声波处理法
(5)化学处理法(SDS、吐温80等) (6)生化法(溶菌酶、纤维素酶等)
返回
2.2 核蛋白的解聚、变性蛋白的去除
核酸与蛋白质的结合力主要是正负静电吸力(核酸与碱性蛋白 的结合)、氢键和非极性的范德华力。 分离核酸最困难的是将与核酸紧密结合的蛋白质分开,同时避 免核酸降解。
返回
2.2.1 加入浓盐溶液(如NaCl)
前言
核酸(nucleic acid)是遗传信息的携带者, 是基因表达的物质基础。
无论是进行核酸结构还是功能研究,首先 需要对核酸进行分离和纯化。
核酸样品质量将直接关系到实验的成败。
返回
1 核酸分离、纯化原则
1.1 保持核酸分子一级结构的完整性 1.1.1 意义:遗传信息全部储存在一级结构之中,核酸
盐
MgCl2 NaAc KAc NH4Ac NaCl LiCl
贮存液浓度(mol/L)
1 3 (pH5.2) 3 (pH5.2)
10 5 8
终浓度(mol/L)
0.01 0.3 0.3 2.5 0.2 0.8
返回
2.3.2 有机沉淀剂
(1)乙醇
优点: 对盐类沉淀少,沉淀中所含迹量乙醇易
挥发除去,不影响以后实验。 缺点:
核酸的分离纯化
主要内容
前言 1 核酸分离、纯化原则 1.1 保持核酸分子一级结构的完整性 1.2. 防止核酸的生物降解 2 分离提取核酸的主要步骤 2.1 细胞的破碎 2.2 核蛋白的解聚、变性蛋白的去除 2.3 核酸的沉淀 2.4 核酸的浓度测定 2.5 核酸的保存 3 核酸分离纯化实例 3.1 DNA纯化实例 3.2 RNA纯化实例
核酸-蛋白质加入NaCl后,破坏静电吸力, 使氢键破坏,核蛋白解聚;
2.2.2 加入SDS
SDS除有破胞和抑制核酸酶的作用外,还 具有使核酸从蛋白质上游离出来的功能;
返回
2. 2.3 酚/氯仿抽提
酚/氯仿混合使用能增加去除蛋白的效果, 并对核酸酶有抑制作用。
氯仿比重大,能加速有机相与水相分层,减 少残留在水相中的酚,同时氯仿具有去除植物色 素和蔗糖的作用。
如SDS,该试剂除对核酸酶有抑制作用外,还 能使蛋白质变性,并与变性蛋白结合成带负电荷 的复合物,该复合物在高盐溶液中沉淀。
返回
1.2.2 RNA酶(RNAase)抑制剂
RNA酶分布广泛,极易污染样品,而且耐 高温、耐酸碱、不易失活,生物降解是 RNA提取过程中的主要危害因素。
返回
DEPC(二乙基焦碳酸盐) (C2H5OCOOCOOC2H5)
的—级结构还决定其高级结构的形式以及和其他生物 大分子结合的方式。
1.1.2 分离核酸原则: 1)温度不要过高; 2)控制pH值范围(pH值5-9); 3)保持一定离子强度; 4)减少物理因素对核酸的机械剪切力.
返回
1.2 防止核酸的生物降解
细胞内或外来的各种核酸酶能消化核酸链 中的磷酸二酯键,破坏核酸一级结构。
在酚/氯仿抽提核酸提取液时,需要振摇,为 防止起泡和促使水相与有机相的分离,再加上一 定量的异戊醇(酚:氯:异戊醇=25:24:1)。
返回
使用酚时应注意
(1)使用注意 酚通常是透明无色的结晶,如果酚结晶呈现粉 红色或黄色,表明其中含有酚的氧化产物,例如 醌、二酸等。变色的酚不能用于核酸抽提实验, 因为氧化物可破坏核酸的磷酸二酯键。 (2)安全操作 酚腐蚀性很强,并可引起严重的灼伤,操作时 应戴手套。
返回
2.3.3 核酸沉淀的温度和时间
一般强调,核酸沉淀在低温长时间下进行。 低温长时间沉淀,易导致盐与DNA共沉淀, 影响以后的实验。一般使用0℃冰水,1015min, DNA样品足可达到实验要求。
返回
2.4 核酸的浓度测定
2.4.1 紫外分光光度法测DNA和RNA的含量
前提:核酸样品要较纯,无显著蛋白质、酚、 琼脂糖及其他核酸污染。测定浓度应大于0.25 μg/ml 。 结论:在波长260nm紫外光下,1 OD值的吸光度 相当于双链DNA浓度为50μg/ml;单链DNA为37 μg/ml;RNA为40 ug/ml。
返回
2.3 核酸的沉淀
• 重新调整核酸的浓度,起到浓缩核酸的作用; • 去除溶液中某些盐离子与杂质; • 改变核酸的溶解缓冲液。
DNA纯化柱
核酸提取(离心柱型) 利用硅胶膜特异吸附核酸
返回
2.3.1 核酸沉淀的盐类及浓度
当核酸溶液的pH值大于4时,核酸分子呈多聚阴离子 状态,它与1价或2价阳离子形成的盐在许多有机溶剂中 不溶解,也不会被有机溶剂变性。
返回
(2)异丙醇
优点: 需体积小,速度快,适于浓度低、体积大的
DNA样品沉淀。一般不需低温长时间放置。 缺点:
易使盐类、蔗糖与DNA共沉淀.异丙醇难以挥 发除去。所以,最后用75%乙醇漂洗数次。
返回
(3)聚乙二醇(PEG)
优点: 可用不同浓度的PEG选择沉淀不同相对分子质量
所用器械和一些试剂需高温灭菌,提取缓 冲液中需加核酸酶抑制剂。
返回
1.2.1 DNA酶抑制剂
(1) 金属离子螯合剂: DNA酶需要金属二价离子Mg2+、Ca2+的激活,因
此使用金属二价离子螯合剂,可抑制DNA酶活性。 如EDTA-Na2(乙二胺四乙酸二钠)、8-羟基喹啉; (2) 阴离于型表面活性剂:
粘性液体,很强的核酸酶抑制剂。
作用机制:与蛋白质中His结合使蛋白变性。
使用注意:
1)DEPC也能破坏单链核酸中大部分腺嘌呤环。 但浓度比使蛋白质变性的浓度大100~1000倍。
2)容易降解,保存在4 ℃或液氮中; 3)提RNA时,0.1% DEPC浸泡器皿,180℃ 6 h。
4)剧毒。
返回
2.分离提取核酸的主要步骤
的DNA片段。应用6000相对分子质量的PEG进行DNA 沉淀时,使用浓度与DNA片段的大小成反比。 注意:
PEG沉淀一般需加0.5mol/L的NaCl或10 mmol/L 的MgCl2。
返回
(4)精胺
精胺不是有机溶剂,但可快速有效沉淀DNA。
原理是: 精胺与DNA结合后,使DNA在溶液中结构凝
缩而发生沉淀,并可使单核苷酸和蛋白质 杂质与DNA分开,达到纯化DNA的目的。
I.材料准备
破碎细胞
II.破碎细胞或包膜-内容物释放
提取
III.核酸分离
纯化
IV.沉淀或吸附核酸,纯化并去除杂质
V.核酸溶解在适量缓冲液或水中
返回
2.1 细胞的破碎
(1)玻璃匀浆器匀浆
(2)液氮研磨法
富含DNA酶的胰、脾、胸腺、淋巴; 富含胶原蛋白的皮肤、肌腱; 坚硬的组织如骨骼。
返回wk.baidu.com
(3)高速组织捣碎机捣碎 (4)超声波处理法
(5)化学处理法(SDS、吐温80等) (6)生化法(溶菌酶、纤维素酶等)
返回
2.2 核蛋白的解聚、变性蛋白的去除
核酸与蛋白质的结合力主要是正负静电吸力(核酸与碱性蛋白 的结合)、氢键和非极性的范德华力。 分离核酸最困难的是将与核酸紧密结合的蛋白质分开,同时避 免核酸降解。
返回
2.2.1 加入浓盐溶液(如NaCl)
前言
核酸(nucleic acid)是遗传信息的携带者, 是基因表达的物质基础。
无论是进行核酸结构还是功能研究,首先 需要对核酸进行分离和纯化。
核酸样品质量将直接关系到实验的成败。
返回
1 核酸分离、纯化原则
1.1 保持核酸分子一级结构的完整性 1.1.1 意义:遗传信息全部储存在一级结构之中,核酸
盐
MgCl2 NaAc KAc NH4Ac NaCl LiCl
贮存液浓度(mol/L)
1 3 (pH5.2) 3 (pH5.2)
10 5 8
终浓度(mol/L)
0.01 0.3 0.3 2.5 0.2 0.8
返回
2.3.2 有机沉淀剂
(1)乙醇
优点: 对盐类沉淀少,沉淀中所含迹量乙醇易
挥发除去,不影响以后实验。 缺点:
核酸的分离纯化
主要内容
前言 1 核酸分离、纯化原则 1.1 保持核酸分子一级结构的完整性 1.2. 防止核酸的生物降解 2 分离提取核酸的主要步骤 2.1 细胞的破碎 2.2 核蛋白的解聚、变性蛋白的去除 2.3 核酸的沉淀 2.4 核酸的浓度测定 2.5 核酸的保存 3 核酸分离纯化实例 3.1 DNA纯化实例 3.2 RNA纯化实例
核酸-蛋白质加入NaCl后,破坏静电吸力, 使氢键破坏,核蛋白解聚;
2.2.2 加入SDS
SDS除有破胞和抑制核酸酶的作用外,还 具有使核酸从蛋白质上游离出来的功能;
返回
2. 2.3 酚/氯仿抽提
酚/氯仿混合使用能增加去除蛋白的效果, 并对核酸酶有抑制作用。
氯仿比重大,能加速有机相与水相分层,减 少残留在水相中的酚,同时氯仿具有去除植物色 素和蔗糖的作用。
如SDS,该试剂除对核酸酶有抑制作用外,还 能使蛋白质变性,并与变性蛋白结合成带负电荷 的复合物,该复合物在高盐溶液中沉淀。
返回
1.2.2 RNA酶(RNAase)抑制剂
RNA酶分布广泛,极易污染样品,而且耐 高温、耐酸碱、不易失活,生物降解是 RNA提取过程中的主要危害因素。
返回
DEPC(二乙基焦碳酸盐) (C2H5OCOOCOOC2H5)
的—级结构还决定其高级结构的形式以及和其他生物 大分子结合的方式。
1.1.2 分离核酸原则: 1)温度不要过高; 2)控制pH值范围(pH值5-9); 3)保持一定离子强度; 4)减少物理因素对核酸的机械剪切力.
返回
1.2 防止核酸的生物降解
细胞内或外来的各种核酸酶能消化核酸链 中的磷酸二酯键,破坏核酸一级结构。
在酚/氯仿抽提核酸提取液时,需要振摇,为 防止起泡和促使水相与有机相的分离,再加上一 定量的异戊醇(酚:氯:异戊醇=25:24:1)。
返回
使用酚时应注意
(1)使用注意 酚通常是透明无色的结晶,如果酚结晶呈现粉 红色或黄色,表明其中含有酚的氧化产物,例如 醌、二酸等。变色的酚不能用于核酸抽提实验, 因为氧化物可破坏核酸的磷酸二酯键。 (2)安全操作 酚腐蚀性很强,并可引起严重的灼伤,操作时 应戴手套。
返回
2.3.3 核酸沉淀的温度和时间
一般强调,核酸沉淀在低温长时间下进行。 低温长时间沉淀,易导致盐与DNA共沉淀, 影响以后的实验。一般使用0℃冰水,1015min, DNA样品足可达到实验要求。
返回
2.4 核酸的浓度测定
2.4.1 紫外分光光度法测DNA和RNA的含量
前提:核酸样品要较纯,无显著蛋白质、酚、 琼脂糖及其他核酸污染。测定浓度应大于0.25 μg/ml 。 结论:在波长260nm紫外光下,1 OD值的吸光度 相当于双链DNA浓度为50μg/ml;单链DNA为37 μg/ml;RNA为40 ug/ml。
返回
2.3 核酸的沉淀
• 重新调整核酸的浓度,起到浓缩核酸的作用; • 去除溶液中某些盐离子与杂质; • 改变核酸的溶解缓冲液。
DNA纯化柱
核酸提取(离心柱型) 利用硅胶膜特异吸附核酸
返回
2.3.1 核酸沉淀的盐类及浓度
当核酸溶液的pH值大于4时,核酸分子呈多聚阴离子 状态,它与1价或2价阳离子形成的盐在许多有机溶剂中 不溶解,也不会被有机溶剂变性。