网络上的疾病传播及演化博弈
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近邻耦合网络 (规则网络)
随机网络
科学家合作网 (复杂网络)
复杂网络的两个主要数学模型
➢ Watts-Strogatz(WS)小世界网络模型(1998)
当 p在大约0.001到0.1的变化范围内,称为小世界网络
➢ Barabási和Albert无标度网络模型(1999)
✓ 不断生长:从 m0个全连通的节点出发,每一时步增加一个 节点;
复杂网络的基本概念
➢ 不同领域的大量的网络分析产生了一系列不可预期的结果。 首先要面临的问题无疑就是结构问题。复杂网络的研究一 开始就努力定义新的概念和手段来标记网络的拓扑;
➢ 图论是用数学来描述复杂网络的自然框架,复杂网络可以 看作是一个图。一个非定向图 G (N, ) 是由两个子集 N 和
•平均度为 k 8, N 2000 的BA网络上 的平均值随有效传
播速率 的变化,图中黑色为标准的SIS模型,红色、绿色、
蓝色分别是 A 4, 3, 2 的目前的SIS模型。
➢ 不同结构的随机网络和BA网络上的 的平均值随着有效
传染速率 的变化
随机网络和 m 3 的BA网络
不同 m 值的BA网络
播速率 ,其中g定义为网
络中免疫节点占的比例。利
用 c
1 A
我们得到免疫阈值
gc
1
1
A
•而BA网络上标准SIS模型的
随机免疫阈值是 gc 1 k / k2
在热力学极限 N 下,我 们得到 gc (N ) 1,即免疫无 效。
随机免疫
•模拟结果(gc ; 0.36 )与解 析结果( gc 0.375)符合的 很好。
然是邻居占总的可能性的百分比。若节点 i 有 ki个邻居, 那么这 ki个节点之间实际有的边数 Ei 与它们之间总的可能
有的边数 ki (ki 1) / 2 之比就给出了节点i 的簇系数值,即
Ci
2Ei ki (ki 1)
整个网络的簇系数就是所有节点 Ci 的平均值。
复杂网络的结构特征
➢ 网络不依赖于节点的具体位置和边的具体形态就能表现出 来的性质叫做网络的拓扑性质,相应的结构叫做网络的拓 扑结构;
✓ 偏好连接:每个新增加的节点伸出 m条边,以概率
连接到节点 i 上。
pi
ki k N
j 1 j
两要素缺一不可,这样的机制生成的网络就是无标度网络, 其度分布服从幂律分布。
(二)复杂网络上的疾病传播
疾病传播的研究背景
➢ Daniel Bernoulli早在1760年就建立了一个天花传播的 模型,以此来评估天花病毒侵入健康人群的有效性;
R. Pastor-Satorras, A. Vespignani, Phys. Rev. Lett.86 (2001) 3200.
✓ 现实中病毒的存活概率
✓ 存活概率Ps (t) 在不同 尺寸的无标度网络上随
时间的变化, 0.065
Ps (t) : exp(t / )
✓对于不同的网络大小,感
➢ 网络的平均度就是对所有节点的度取平均,即
k
N
ki / N
i
➢ 假设 dij是从节点 i 到 j 所要经过的边的最少数目,那么网
络中最大的 dij 就称为网络的直径;
➢ 对网络中所有的节点对的最短距离去平均,就得到网络的
平均最短路径,即
L
1 N (N 1) i, jN ,i j dij
➢ 簇系数:单个节点的簇系数定义为它所有的邻居节点中仍
我们的工作: ——具有单一传染能力的疾病传播与免疫
➢ 在以往的工作中,节点的传染能力往往跟它的度成正比。 但是在有些情况下,节点只有有限的能力去传染其他个体, 比如性接触网络中一个人在一段限定的时期内有有限的能 力去接触其他人;Gmail系统中,使用者只被赋予有限的 能力来邀请其他人也成为使用者(通过发送一封邀请信)。
染密度 与1/ 的关系
: exp(C / )
✓ 动态的平均场反应速率
方程可以写为:
t k (t) k (t) k[1 k (t)]()
最后得到:
; 2e1/ m
: exp(C / )
➢指数网络上的流行病传播
✓ 在WS网络上对SIS模型进行了研究,重现了临界阈值,并 从解析和模拟两方面进行了证明;
➢ 感染密度随时间的变化
对速率方程两边同时乘以 P(k ) 并对 k 求和,忽略 I 2 高
阶项,得到: t I (t) I (t) AI (t)
得到 I (t)的时间行为是:
I (t) : ect
其中 c ( A 1)
➢随机免疫、比例免疫和目标免疫的效果
•统一免疫的存在将有效的通
过一个因子(1-g)来减小传
➢SIS模型
动态变化的微分方程为:
ds is i, di is i
dt
dt
其中 和 分别指传染
率和康复率。
人 易感类(S) 传染类(I)
前人的工作
➢ 无标度网络上的流行病传播
✓ Pastor-Satorras和Vespignani对真实计算机病毒传播的数据 进行分析,通过大规模的数值模拟来研究无标度网络上的 SIS模型。他们发现传播阈值以及与之相关联的临界行为 的缺失,彻底改变了流行病建模中得到的许多标准的结论, 并指出不管个体的传播速率如何,无标度网络都适于病毒 的传播和生存。
➢ 到了二十世纪五十年代末期,Erdös和Rényi建立了随机网 络的基本模型,后来的进半个世纪,随机图一直是科学家 研究真实网络最有利的武器;
➢ 随着数学图论的发展,网络的研究在一些特定的情况下也 有了长足的进步,比如在社会科学方面;
➢ 过去几十年见证了复杂网络研究的大浪潮,研究重点从小 网络的分析转移到具有成千上万节点的大系统,同时也注 意到了动态单位的网络特性。这种浪潮是由两篇极具开创 性的文章引发的,一篇是Watts和Strogatz发表的1998年的 Nature上的关于小世界网络的文章,另一篇是Barabási和 Albert一年后发表在Science上的关于无标度网络的文章。
✓ 从平均场反应等式出发,
t (t) (t) k (t)[1 (t)]高阶项 得到
[1 k (1 )] 0
定义了传播阈值 c k 1
于是得到了
0 : c
当 c 当 c
重现了平均场临界行为。
百度文库
✓ WS网络(实线)和BA网 络(虚线)上感染节点密
度 随 的变化。
✓ WS网络上感染节点密度
arXiv: physics/0611095, 9Nov 2006.
(三) 复杂网络上的演化博弈
博弈论的概述
➢ 博弈就是一些个人、队伍或其他组织,面对 一定的环境条件下,同时或先后、一次或多 次从各自允许选择的行为或策略中进行选择 并加以实施,各自取得相应结果的过程。
➢ 合作演化是生物学的基本问题,在自然界普 遍的存在。而博弈论是研究合作演化的重要 工具,是一系列分析工具和解决方案的集合, 已经形成了一个饱含模型和方法的统一框架。
组成,其中 N ,并且 是 N 中的元素的无序组合的对。
N n1,n2,...,nN 中的元素是图 G 的节点,而 l1,l2,...,lN 中
的元素是边。一个节点通常用其在 N 中的编号 i 来表示, 每条边定义为节点 i 和 j 的配对,表示为lij 。有连边的两
个节点成为邻居。
➢ 节点 i 的度 ki 定义为与这个节点相连的边的数目;
复杂网络的几个例子
➢ 神经网络可看作是大量神经细胞通过神经纤维相互连接形成的网络; ➢ 计算机网络可以看作是自主工作的计算机通过通信介质如光缆、双绞
线、同轴电缆等相互连接形成的网络; ➢ 类似的还有电力网络、社会关系网络、交通网络等。
因特网
社会网络
研究复杂网络的历程
➢ 传统上来说,网络的研究主要是属于离散数学的一个分支 图论的范畴。由于人们认识的局限,经典的图论总是倾向 于用某种规则的拓扑结构模拟真实网络;
网络上的疾病传播及演化博弈
答辩人: 张明锋 单位: 中国科技大学近代物理系 学科专业:理论物理 课题方向:统计物理和复杂性科学 导师: 汪秉宏 教授
全文的主要结构
➢ 本文主要研究网络上的动力学过程,如疾病传 播、演化博弈等,并观察网络拓扑对各种动力 学过程的影响,全文结构如下:
一. 复杂网络的概述、网络上的动力学过程简介 (疾病传播、演化博弈)(第一章);
➢ Hamer于1906年建立并分析了一个离散时间模型尝试 着理解麻疹病的死灰复燃;
➢ Ross于1911年提出了疟疾的微分方程; ➢ 从1926年Kermack和McKendrick发表了一系列关于疾
病传播模型的文章;
➢ 从二十世纪中期开始,大量的各种各样的模型应用 到传染病研究上;
➢ 流行病传播过程可以被看作是渗流过程,因此物理 学家开始对这一类模型感兴趣。
m k /2 ,A2
➢不同尺寸上的BA网络上 的平均值随有效传播速率 的变化
在原始的SIS模型中节点的传染能力严格依赖于它的
度 k ,而阈值c k / k2 ,度的方差随着网络尺寸的增
长逐渐发散,所以会有一个明显的尺寸效应;但是目 前这个模型由于节点传染能力与度无关,所以没有发 现明显的尺寸效应。
疾病传播的两个重要模型
➢ SIR模型:
人
动态的微分方程为:
ds is, di is i, dr i
dt
dt
dt
s, i和r分别是类S, I和R 的个体数占个体总数的 比例;
是任一易感类个体 每单位时间被任一传染 类个体感染的概率;
是传染类个体康复
并具备免疫力的比率。
易感类(S) 传染类(I) 康复类(R)
➢ 自然界中存在的大量复杂系统都可以通过形形色色 的网络加以描述:一个典型的网络是由许多节点与 连接两个节点之间的一些边组成的,其中节点用来 代表真实系统中不同的个体,而边则用来表示个体 之间的关系,通常是当两个节点之间具有某种特定 的关系时连一条边,反之则不连边。有边相连的两 个节点在网络中被看作是相邻的。
二. 复杂网络上的疾病传播(研究背景、主要模型 及主要工作)(第二章);
三. 复杂网络上的演化博弈(研究背景、两个经典 案例及主要工作)(第三章);
四. 总结与展望(第四章)。
(一)复杂网络的概述
复杂网络的介绍
➢ 网络可以是欧几里德空间中实体的对象,如电力网、 因特网、高速公路和地铁网以及神经网络;或者在 抽象空间中,也可以定义为一个实体,比如熟人网 络或者个体间合作网等。
• 于是得到一个非零解
kA k
k
1 kA/
k
• 稳态的网络的感染密度为
对于临界点 ~0,我们
得到:
k
A
1
k kP(k)
k
A
k
1
kP(k )
Ak /
k
即传播阈值 c
1 A
其中 k P(k)k 是处在稳定态的整个网络的感染密度。
➢数值模拟
• 令传播过程进行2000步, 并对后1000步取平均作 为稳定态的平均感染密 度。所有的模拟结果是 在300个不同的网络实 现上分别进行100次独 立的运行,然后取平均 得到的。初始时刻随机 的令一半的节点受感染。
➢ 于是在SIS模型中,我们假定每个节点有相同的接触传染 能力A,也就是说,在每一个时间步,每个受感染的节点 将发出A个接触,A为常数。
➢平均场近似
• 在度分布为 P(k)的网络中的部分密度Ik (t)的速率方程可以 写为:
• 假定网络为非关联网络,P(k | k) kP(k) / k
• 用 k 表示足够长时间稳定态中 Ik (t) 的值,那么 t k 0
在双对数坐标上随 变化,c 0.1643 0.01
c
的
: ( c )
✓ WS网络上超临界传播实验 ✓ WS网络上亚临界传播
中的感染节点密度 (t )随
实验中的感染节点密
时间的变化
度 (t) 随时间的变化
R.Pastor-Satorras, A. Vespignani. Phys. Rev. E 63 (2001) 066117.
比例免疫
目标免疫
0.8, A 2, k 6, N 2000
➢ I (t)的平均值随时间的变化 BA网络: N 2000, k 6, A 2
➢小结
• 假定节点的接触传染能力为A,我们发现传播阈值为1/A, 而与网络的结构无关,解析和模拟计算都证实了这一点;
• 在这个模型中没有发现明显的尺寸效应,网络规模对结果 的影响不大;
• 感染密度随时间指数变化,并且数值模拟在较小的时间内 证实了这一点;
• 对随机网络和BA网络进行免疫,发现目标免疫的效果最 好,比例免疫次之,随机免疫的效果最差;但是随机免疫 仍然对于BA网络有效,这与之前随机免疫对BA没效果不 同;
• 目标免疫需要最长的时间进入稳定态,比例免疫次之,随 机免疫最短。