实验13地衣酚法测定rna含量-华南师范大学生命科学学院新
实验三_酵母RNA的提取及含量测定
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酵母RNA的提取及含量测定一、实验目的与要求1、了解并掌握稀碱法提取RNA的原理和方法;2、了解测量核酸浓度不同方法的原理;3、熟悉和掌握紫外吸收法测定核酸含量原理和操作方法;4、熟悉紫外分光光度计的基本原理和使用方法。
二、实验原理1、RNA提取原理:由于RNA的来源和种类很多,因而提取制备方法也很各异。
一般有苯酚法、去污剂法和盐酸胍法。
其中苯酚法又是实验是最常用的。
组织匀浆用苯酚处理并离心后,RNA即溶于上层被酚饱和的水相中,DNA和蛋白质则留在酚层中。
向水层加入乙醇后,RNA即以白色絮状沉淀析出,此法能较好的除去DNA和蛋白质。
上述方法提取的RNA具有生物活性。
工业上常用稀碱法和浓盐法提取RNA,用这两种方法所提取的核酸均为变性的RNA,主要用作制备核苷酸的原料,其工艺比较简单。
浓盐法使用10%左右氯化钠溶液,90℃提取3-4h,迅速冷却,提取液经离心后, 上清液用乙醇沉淀RNA。
稀碱法使用稀碱使酵母细胞裂解,然后用酸中和,除去蛋白质和菌体后的上清液用乙醇沉淀RNA或调pH2.5利用等电点沉淀。
酵母含RNA 达2.67-10.0%,而DNA含量仅为0.03-0.516%,为此,提取RNA多以酵母为原料。
2、测定RNA含量的方法:(1)紫外吸收法原理:核酸具有吸收紫外线的性质,在波长260纳米处有最大吸收,且在一定浓度范围内光吸收值与浓度成正比(0—50微克/毫升),符合朗伯-比尔定律。
优点样品用量少,不用显色,测完后样品可以继续使用。
(2)地衣酚显色法:核酸与浓盐酸共热,放生降解,生成糠醛,后者与地衣酚反应,在三价铁离子或二价铜离子作用下,生成鲜绿色的复合物,670纳米处有最大吸收,且光吸收值与浓度成正比,符合朗伯-比尔定律。
缺点反应特异性差,易受干扰。
(3)定磷法:在酸性环境中,定磷试剂中的钼酸铵以钼酸形式与样品中无机磷酸生成磷钼酸,当有还原剂存在时,磷钼酸立即被还原生成蓝色的还原产物--钼蓝,其最大吸收在660纳米处,当无机磷含量在每毫升1-25微克范围内,光吸收与含磷量成正比。
分析化学实验报告6. RNA提取-2013-10
![分析化学实验报告6. RNA提取-2013-10](https://img.taocdn.com/s3/m/ac528cca58f5f61fb73666c0.png)
实验七. 酵母RNA提取与地衣酚测定法[目的和要求]1.了解并掌握稀碱法制备酵母RNA的原理及方法。
2. 掌握地衣酚法测定RNA含量的原理及方法。
[实验原理]稀碱法原理: 酵母RNA可溶于碱性溶液。
经稀碱液处理的酵母,细胞壁变性,释放出RNA,当溶液中的碱被中和后,加入的乙醇可使RNA沉淀,由此得RNA的粗制品。
地衣酚法原理: 核糖核酸与浓盐酸共热时发生降解,形成的核糖转变成糖醛,后者与地衣酚(3,5—二羟基甲苯)缩合成为绿色化合物,反应以铜离子作为催化剂,产物在670nm处有最大吸光度。
RNA在20~250μg/mL范围内,光密度与RNA 的浓度成正比。
地衣酚反应的特异性较差,凡戊糖均有此反应。
[实验器材]稀碱法使用器材:研钵(X1),锥形瓶(100 mLXl),电炉,抽滤装置(X1),滴管(X1),玻璃棒(X1),量筒(50 mLXl),烧杯(100 mLXl,50 mLXl),离心机,离心管。
地衣酚法使用器材:恒温水浴,吸量管(1 mL,2 mL,5 mL),试管及试管架,S54/53型分光光度计。
[实验材料及试剂]稀碱法使用试剂:(1) 0.2% NaOH溶液100 mL,酵母片,95%乙醇。
(2) 酸性乙醇溶液地衣酚法使用试剂:(1)RNA标准液:为100μg/mL的标准溶液。
(2)地衣酚-铜离子试剂(3)样品溶液:RNA质量浓度为200μg/mL。
[实验步骤]稀碱法实验步骤:取20片酵母于研钵内,加入20 mL 0.2% NaOH,研磨成浆状。
再加入20 mL 0.2% NaOH将其转移至100 mL锥形瓶中,沸水浴上加热30 min,搅拌,冷却,3 000 rp/min, 离心15 min。
将上清液缓缓倾入40mL酸性95%乙醇溶液中(注意要一边搅拌一边缓缓倾入)。
待RNA沉淀完全后,4 000 r/min离心15 min,弃去上清液。
留沉淀,加95%乙醇5 —10 mL,充分搅拌,然后在布氏漏斗上用水泵进行抽滤,再用95%乙醇约20mL分3次淋洗(快速,稍干即收)。
酵母RNA的提取、组分鉴定和含量测定
![酵母RNA的提取、组分鉴定和含量测定](https://img.taocdn.com/s3/m/b299019569eae009591bec6d.png)
整理课件
1
【实验目的】
1.学习稀碱法提取RNA的原理和操作方法。 2.了解核酸的组分,并掌握鉴定核酸组分的
方法。 3.掌握地衣酚显色法及紫外分光光度法测定
酵母RNA含量的原理和方法
【实验原理】
酵母核酸中RNA含量较多。RNA可溶于碱性溶液,
Hale Waihona Puke 在碱提取液中加入酸性乙醇溶液可以使解聚的核
1.实验材料:
酵母粉 (或酵母片)
2.实验仪器:
研钵、150mL锥形瓶、恒温水浴锅、布氏漏斗 及抽滤瓶、离心机、漏斗、分光光度计。
整理课件
5
【实验材料和主要仪器、试剂】
3.实验试剂: 0.04mol/LNaOH溶液、95%乙醇、酸性乙醇 溶液、1.5mol/L硫酸溶液 、浓氨水、 0.1mol/L硝酸银溶液 、氯化铁浓盐酸溶 液、苔黑酚乙醇溶液、钼酸铵试剂(将2g 钼酸铵溶解在100ml10%硫酸中)、标准 RNA母液、标准RNA溶液、样品溶液、地衣 酚-铜离子试剂
本法特异性较差,凡属戊糖均有反应.微量DNA 无影响,较多DNA存在时,亦有干扰作用。如在 试剂中加入适量CuCl2 .2H2O可减少DNA的干 扰。此外,利用RNA和DNA显色复合物的最大 光吸收不同,且在不同时间显示最大色度加以区 分。反应2min后,DNA在600nm呈现最大光 吸收,而RNA则在反应整理1课5件min后,在670nm下1呈3
脱氧核糖,为什么? 3、用你所学过的化学知识,分析3种催化剂: FeC13·6H2O,CuC12·H2O和CuO,哪种催化
剂的催化效果更好? 4、地衣酚反应中,干扰RNA测定的因素有哪
些 如何能减少它们的影响。
整理课件
核酸的实验
![核酸的实验](https://img.taocdn.com/s3/m/26024eaddd3383c4bb4cd261.png)
实验操作
(一) DNP与RNP的分离 DNP与RNP的分离 1、 取新鲜肝脏,用表面皿称取0.5g,用0.14mol/L氯化钠 取新鲜肝脏,用表面皿称取0.5g, 0.14mol/L氯化钠 -0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液(含1mmol/L EDTA)冲洗除去血 0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液 柠檬酸钠缓冲液( EDTA) 水。洗净后立即将肝脏置于冰浴研钵中,边滴加缓冲液边研磨 洗净后立即将肝脏置于冰浴研钵中, (加入 加入2ml),至匀浆状,转移至离心管中,每次用0.5ml缓冲 ),至匀浆状 ),至匀浆状,转移至离心管中,每次用0.5ml缓冲 液冲洗研钵至离心管, 研磨时间不要超过30min) 液冲洗研钵至离心管,3次。(研磨时间不要超过30min) 2、 匀浆液于3000r/min 离心15min,上清液中即含RNP 匀浆液于3000r/min 离心15min,上清液中即含RNP ,沉淀中含DNP。 沉淀中含DNP。 3、将上清液倒入另一支离心管。再往上述沉淀中加入 将上清液倒入另一支离心管。 3.5ml缓冲溶液 同样离心15min, 3.5ml缓冲溶液,同样离心15min,取上清液倒入另一离心管 缓冲溶液, 。向DNP沉淀加入3ml 10%氯化钠溶液,摇匀,置于冰箱内, DNP沉淀加入 沉淀加入3ml 10%氯化钠溶液,摇匀,置于冰箱内, 氯化钠溶液 DNP充分溶解 留至下午用。 充分溶解, 使DNP充分溶解,留至下午用。
实验3 实验3
二苯胺法测量DNA 二苯胺法测量DNA含量 DNA含量
实验目的
学习和掌握二苯胺法测定DNA含量的原理和方法。 学习和掌握二苯胺法测定DNA含量的原理和方法。 含量的原理和方法
实验原理
DNA分子中的 DNA分子中的2—脱氧核糖在酸性条件中脱水生成ω分子中的2 脱氧核糖在酸性条件中脱水生成ω 羟基- 酮基戊醛, 羟基-γ-酮基戊醛,后者与二苯胺试剂一起加热反应生成 蓝色物质, 595nm处有最大吸收 DNA在40~400µg范 处有最大吸收。 蓝色物质,在595nm处有最大吸收。DNA在40~400µg范 围内,光密度与DNA的浓度成正比。在反应液中加入少 围内,光密度与DNA的浓度成正比。 的浓度成正比 量乙醛,可以提高反应灵敏度。 量乙醛,可以提高反应灵敏度。
生物化学 自测题 无答案。
![生物化学 自测题 无答案。](https://img.taocdn.com/s3/m/49a9089951e79b89680226da.png)
自测题一一、填空(每空1分,共40分):1.Pauling等人提出的蛋白质二级结构螺旋模型,每圈螺旋包含个氨基酸,每个螺旋的垂直高度为。
2.DEAE-纤维素是一种交换剂,CM-纤维素是一种交换剂。
3.电子传递链中与蛋白质结合不紧的传递体是,专门传递电子而不传递氢的传递体系是。
4.TCA循环中,三羧酸物质有和。
5.在鸟氨酸循环中,精氨酸是生成和的前体。
6.DNA变性后粘度,A260值;影响DNA Tm值的因素有、和。
7.氨基酸合成代谢中通过直接转氨生成的氨基酸有、、、和。
8.乳糖操纵子的阻遏蛋白是由基因编码,与基因结合阻止转录。
9.可转变为丙酮酸的氨基酸有种,脯氨酸是由产生的。
10.带负电荷的蛋白质与阴离子交换树脂结合很紧,必须用pH或用离子强度洗脱液才能把该蛋白质洗下来。
11.单糖在酸作用下脱水生成,用地衣酚法测定RNA含量是根据反应,二苯胺法测定DNA含量是根据反应。
12.二十种氨基酸中无不对称碳原子,与茚三酮反应生成黄色物质,可以参与形成二硫键。
13.在乳酸发酵过程中,若用14C标记葡萄糖的第三位和第四位碳原子,生成的乳酸分子中碳原子带有标记。
14.一个乙酰CoA通过TCA循环生成ATP。
一个C16脂肪酸彻底氧化分解净生成ATP。
15.脂肪酸合成的限速反应是,催化这个反应的酶是。
16.在糖酵解途径中,葡萄糖经化和化,生成F-1,6-P,然后裂解为。
二、选择题(10分):1.测定酶活性时测定酶促反应的初速度,其目的是:A.为了提高测定的灵敏度B.为了防止出现底物抑制C.为了节约使用底物D.使酶促反应速度与酶浓度成正比2.关于别构调节酶正确的叙述是:A.所有别构酶都有一个调节亚基,一个催化亚基B.别构酶的动力学特点,是酶促反应与底物浓度的关系呈S形而不是双曲线形C.效应物对别构酶的作用和离子、激活剂对酶激活的机制相同D.别构抑制与竞争性抑制相同3.溶菌酶活性部位是由下列哪两种氨基酸组成:A.谷氨酸和天冬氨酸B.谷氨酸和赖氨酸C.天冬氨酸和精氨酸D.天冬氨酸和赖氨酸4.假尿嘧啶核苷的糖苷键是:A.C-C连接B.C-N连接C.N-N连接D.C-H连接5.脂肪酸合成A.不需乙酰CoA B.丙二酰CoA参加脂肪酸合成的起始和延伸C.有线粒体内进行D.最终产物为十碳以下脂酸6.能转变为乙酰乙酰CoA的氨基酸为:A.精氨酸B.苏氨酸C.亮氨酸D.甲硫氨酸7.下列试剂最适于测定短肽氨基酸顺序的是:A.茚三酮B.溴化氢C.胰蛋白酶D.异硫氰酸苯酯8.血红蛋白和肌红蛋白都是氧的载体蛋白,两者在体内具有不同的功能,前者运输氧和二氧化碳;后者只能贮存氧,供肌肉线粒体利用,这是因为:A.两者的蛋白质结构不相同B.血红蛋白可以与DPG结合,肌红蛋白则不能C.血红蛋白与氧的亲和力与环境中的氧分压有关D.肌红蛋白与氧的亲和力太低9.下列关于细菌蛋白质生物合成的叙述,错误的是:A.起始复合物形成的过程中,需要GTP参加B.移位反应需要GTPC.移位反应不需要GTPD.肽链延长的过程中,需要EF-Ts10.生物体内能直接催化将游离NH3与氨基酸分子结合的酶是:A.丙氨酸转氨酶B.谷氨酰胺合成酶C.谷氨酸脱氢酶D.天冬氨酸转氨酶三、判断题(10分):1.米氏常数是酶与底物形成复合物的结合常数。
实验十六、RNA的定量测定
![实验十六、RNA的定量测定](https://img.taocdn.com/s3/m/2ea2f519964bcf84b9d57bf5.png)
三、试剂和器材
1. 试剂 0.1mg/mL标准RNA溶液、地衣酚试剂、 2. 器材 可见分光光度计、恒温水浴锅
四、操作步骤
1. 标准曲线的绘制 取12只试管分成6组,按下表操作。取2管的平均值, 以DNA浓度为横坐标,光密度为纵坐标,绘制标准曲线。
试管
标准RNA/mL 标准 蒸馏水/mL 蒸馏水 地衣酚试剂/mL 地衣酚试剂
待测样品中测得的RNA的µg数 的 数 待测样品中测得的
X 100
RNA%= RNA% 样品蛋白质含量高时,应先用5%TCA沉淀蛋 白质;有较多DNA样品时也会发生干扰,可在试 剂中加适量的CuCl2. H2O, 可减少DNA的干扰。 六、思考题
实验十六 RNA的定量测定 的定量测定
一、实验目的
掌握用地衣酚法测定RNA含量的原理和方法。
二、原理
当RNA与地衣酚试剂在沸水中加热时,RNA 被酸降解,所产生的核糖进一步转变为糠醛,它 与地衣酚(3,5-二羟基甲苯)在高铁离子的催化下 可反应生成绿色物,后者在670nm处有最大吸收 峰,在10~100µg/mL范围内其光密度值与RNA 浓度有线形关系。
0 0 2 2
1 0.4 1.6 2
2 0.8 1.2 2
3 1.2 0.8 2
4 1.6 0.4 2
5 2.0 0 2
混合均匀后,置沸水浴中加热45min,冷却, 670nm波长处比色 混合均匀后,置沸水浴中加热45min,冷却,在670nm波长处比色 浴中加热45min 光密度值
2. 样品的测定 取待测样品1mL,加蒸馏水1mL及二苯胺溶 液2mL,沸水浴保温45min,冷却,然后在670nm 波长出测定光密度值。根据测得的光密度值,从 标准曲线上查得相应的RNA的µg数,按下式计算待 测样品的RNA的含量。
RNA的分离提取和测定
![RNA的分离提取和测定](https://img.taocdn.com/s3/m/b70fac4e852458fb770b56de.png)
指导教师:赵建军
实验目的
学习从兔肝中提取RNA的方法。
通过地衣酚显色法测定R置于醋酸钠缓冲液,SDS,80%酚溶液中的细胞经高速 匀浆后再离心,上层含有水溶性RNA,多糖和小分子 极性物质以及残留的变性蛋白质。下层含有变性蛋白 质和DNA。两相之间有一层凝集的变性蛋白质。水相用 乙醇沉淀,离心后可得RNA 制品。 RNA与浓盐酸共热时,即发生降解,形成的核糖继而 转变成糠醛,后者与3, 5-二羟甲苯反应呈鲜绿色,反 应产物在680nm处有最大吸收,光吸收与RNA浓度 成 正比。
实验试剂
1、RNA标准溶液: 取标准RNA配成100μ g/ml溶液。 2、样品待测液: 准 确 稀 释 成 每 毫 升 溶 液 含 RNA 干 燥 制 品 50100μ g。 3、地衣酚试剂: 先配制0.1%三氯化铁的浓盐酸溶液,实验前以 此溶液为溶剂配成0.1%地衣酚溶液。
提取过程
NaAc(0.05mol/L) 10min 兔肝(0.9g) 浸泡 pH5.0 SDS(250g/L) 80%酚 匀浆 1.5ml 等体积 量取水相 NaAc(2mol/L) 混匀 1/10体积 3000r/min 10min 沉淀 65℃ 匀浆 5-8min NaAc(0.05mol/L) 吸干水分 pH5.0,9.0ml 3000r/min 10-15min
冷却
离心
预冷95%乙醇 混匀 冰浴 沉淀生成 2.5倍 蒸馏水 5ml 溶解备用
离心
测定过程
管号 试剂 ml RNA 标准液 蒸馏水 地衣酚试剂
0 0 2.0 2.0
1 0.4 1.6 2.0
2 0.8 1.2 2.0
3 1.2 0.8 2.0
4 1.6 0.4 2.0
生化实验 地衣酚法测定肝组织中RNA含量
![生化实验 地衣酚法测定肝组织中RNA含量](https://img.taocdn.com/s3/m/3add7942c5da50e2524d7fe2.png)
地衣酚法测定肝组织中RNA含量
【实验目的】
掌握用地衣酚法测定RNA含量的原理和方法。
【实验原理】
核酸在碱性条件下水解为碱基、五碳糖和磷酸,这三个组分在核酸分子中等比例存在,故测定其中任一组分均可计算出核酸的量。
酸性条件下RNA中的核糖脱水环化成糠醛,地衣酚(3,5二羟基甲苯)可与其作用呈绿色,在670nm处有最大吸收。
当待测样品中RNA含量在5~50μg/ml范围内时,O.D值与RNA浓度成正比。
用分光光度计测得反应液O.D值,即光密度(特定波长下的吸光度)从而可知样品中RNA的含量。
反应式如下:
【仪器与试剂】
仪器:
721分光光度计、恒温水浴箱
试剂:
)溶液、6mol/L HCl、地衣酚试剂、RNA标准液(0.1mg/ml)5%高氯酸(HClO
4
【实验步骤】
1.待测样品的稀释
取实验一分离所得RNA的上清液1ml,加入5%HClO
5ml,摇匀(此液稀释了5倍)。
4
混匀各管,沸水浴10min(注意严格控制时间)。
3.待上述各管冷却后,以空白管调零点,670nm比色,读取光密度(O.D)。
重复测量3-5组数据,取平均值。
4.计算每克肝组织中RNA含量,单位为毫克每克组织。
【思考题】
1.为何要将分离后的RNA上清液稀释5倍?
2.如何根据数据计算出DNA的含量,请写出公式,解释意义并将其含量计算出来。
分子生物学实验报告
![分子生物学实验报告](https://img.taocdn.com/s3/m/3abba0c7aeaad1f346933f97.png)
根据测得的O.D值,从标准曲线上查出相对应的RNA含量,按下式计算出制品中RNA的百分含量:
×100%
(4)醋酸纤维素薄膜电泳法分离测定RNA的四种碱基
1)RNA的碱水解:
称取0.20gRNA,溶于5ml 0.3mol/L KOH溶液中,使RNA的浓度达到20~30mg/ml。沸水浴加热30min。将水解液转入到锥形瓶中。冰浴,在冰浴过程中用高锰酸溶液滴定到水解液的PH值为3.5.在2500rpm离心10min。出去沉淀,上层液即是样品。
2)RNA基团鉴定和地衣酚法测定RNA含量的基本原理:
RNA含有核糖、嘌呤碱、嘧啶碱和磷酸组分,加硫酸煮沸可使其水解,用硝酸银、地衣酚和定磷试剂可分别鉴定嘌呤碱、核糖和磷酸组分。
A:嘌呤鉴定:
嘌呤碱与硝酸银反应可生成白色的嘌呤银化物沉淀。
H2SO4AgNo3
RNA嘌呤嘌呤银化物(白色或红棕色)
100℃
酵母含RNA 达2.67—10.0%,DNA 则少于0.03—0.516%。为此,提取RNA多以酵母为原料。
由于RNA得来源很多,因而提取制备方法也各异,一般有苯酚法、稀碱法和浓盐法、去污剂法和盐酸胍法。其中苯酚法又是实验室最常用的方法,次方法能够较好地除去DNA和蛋白质,提取的RNA具有生物活性,两种常见的方法原理为:
核糖定量反应:
RNA
HCl
93℃
4)使用电泳技术进行RNA鉴定的基本原理:
任何物质质点,由于其本身在溶液中的解离或是由于其表面对其他带电质点的吸附,会在电场中向一定的电极移动。一般来说,在碱性溶液中,分子带负电荷,在电场中向正极移动;而在酸性溶液中,分子带正电荷,在电场中向负极移动。不同质点在电场中的移动速度不同,常用泳动度(迁移率)来表示。即带电质点在单位电场强度下的泳动速度。电泳快慢与电场强度、溶液的PH值、溶液的离子强度、电渗现象有关。
RNA的制备及含量测定
![RNA的制备及含量测定](https://img.taocdn.com/s3/m/1be138ec102de2bd960588d1.png)
1、初步掌握752型分光光度计的使用。 2、掌握地衣酚法测定细胞RNA的含量。
实验原理
小鼠肝细胞中RNA含量丰富,核酸溶于水而 不溶于有机溶剂,可用水与酚的混合液将核酸与其 它有机杂质分离。同时在4℃低温下加入SDS抑制核 酸酶活性,保护核酸的结构不被破坏。在0.14mol/L NaCl溶液中RNP溶解度高而DNP溶解度低,从而将 二者分开。在强酸溶液中RNA水解产生的戊糖生成 糠醛,用分光光度计在670nm波长下测定其OD值, 与RNA标准曲线比较得到RNA的含量。
实验步骤
2. RNA的含量测定 (1)样液的制备:将提取的RNA中加入2mRNA浓度为横坐标,光吸收 值为纵坐标,绘出标准曲线。
实验步骤
管号 100μg/ml RNA 标准液(ml) 蒸馏水(ml) 样品液(ml) 地衣酚试剂(ml) RNA 浓度(μg/ml) OD 值(670nm) 0 10 1 0 2.5 - 2 0.5 2 - 3 1 1.5 - 20 4 1.5 1 - 30 5 2 0.5 - 40 6 2.5 0 - 50 7 - 2.4 0.1 - 8 - 2.4 0.1 -
各加入 2.5ml 混匀,沸水浴 20min
实验结果
样品RNA含量的测定: 计算1g小鼠肝脏中RNA的量
实验步骤
1.RNA的提取:用断颈法处死小白鼠,取出肝脏,用滤纸吸去 血液,称取0.5g鼠肝+少量石英砂+1ml SDS缓冲液分2- 3次洗涤研钵后一并倒入离心管中加入等体积含水酚室温下 剧烈震荡10分钟,平衡后3000转/分离心15分钟,取上清 液加入等体积氯仿-异戊醇,室温下剧烈震荡10分钟,平 衡后3000转/分离心10分钟,取上清液加入2倍体积2﹪乙 酸钾的乙醇溶液,冰浴中放置1小时使RNA沉淀析出,平衡、 以3000转/分离心10分钟,弃去上清液,沉淀中加入约5ml 95﹪乙醇洗涤沉淀,平衡后以3000转/分离心5分钟,弃去 上清液,沉淀即为提取的RNA。
酵母RNA的提取与地衣酚显色测定法组
![酵母RNA的提取与地衣酚显色测定法组](https://img.taocdn.com/s3/m/47f8090876c66137ee061916.png)
实验目的:
1、掌握RNA提取的原理和方法; 2、掌握地衣酚显色法测定RNA含量
的原理和方法。
实验原理:
酵母中RNA含量较多, 含量可达2.67~10.0%, DNA很少(0.03~0.516%),是提取RNA的理想 材料。 RNA可溶于碱性溶液,细胞裂解后离心去除 沉淀(细胞碎片),当碱被中和后,上清液中加 入乙醇可以使核糖核酸沉淀,离心弃上清液,可 得到RNA的粗制品。
2、地衣酚(浓HCl配制,注意安全)显色测定RNA
1、标准曲线的绘制
0 RNA标准液ml 0
蒸馏水ml 2.0 地衣酚试剂ml 2.0
1 0.4
1.6 2.0
2 0.8
4 1.6
0.4 2.0
5 2.0
0 2.0
混匀,沸水浴25min,冷却,测各管A670nm,以A670nm 为纵坐标,RNA量(ug)为横坐标作图。
实验材料。
地衣酚反应特异性较差,凡戊糖均有此反应。因
此地衣酚实验不能作为RNA与DNA鉴别的依据。
思考题:
现有三瓶未知溶液,已知它们分别为蛋 白质、糖和RNA,采用什么试剂和方法 鉴定?
地衣酚显色法:核糖核酸与浓盐酸共热时,即发 生降解,形成的核糖继而转变为糠醛,后者与地衣酚 (3,5-二羟基甲苯)反应呈鲜绿色,该反应需用三氯 化铁或氯化铜作催化剂。 (1)RNA HCl 核糖 糠醛
Fe3+或Cu2+
(2)糠醛+地衣酚
鲜绿色复合物( 670nm )
实验操作:
1、提取核糖核酸 4.0g干酵母+40ml 0.2%氢氧化钠(100ml烧 杯内操作),沸水浴30min并不断搅拌;冷却后 加入数滴冰乙酸使PH值约为5.5左右,4000r/min 离心10min,取上清液加30ml 95%乙醇溶液,注 意要一边搅拌一边缓缓倾入;静置5min以上待 RNA沉淀完全后 4000r/min离心10min,弃上清, RNA沉淀用95%乙醇(每次约10ml)洗涤两次; 取出沉淀,在滤纸上晾干(可先晾干一部分进行 定量测定)并称重。
地衣酚法实验报告
![地衣酚法实验报告](https://img.taocdn.com/s3/m/785ce356591b6bd97f192279168884868662b844.png)
1. 掌握地衣酚法测定RNA含量的原理和方法。
2. 学习实验操作技能,提高实验操作的准确性。
3. 了解RNA在生物体中的重要作用。
二、实验原理地衣酚法是一种常用的RNA定量方法。
其原理是:RNA与浓盐酸共热,降解形成的核糖转变为糠醛,糠醛与地衣酚反应生成紫色化合物。
通过比色法测定紫色化合物的吸光度,即可计算出RNA的含量。
三、实验材料与仪器1. 实验材料:- 细菌RNA提取液- 标准RNA溶液- 浓盐酸- 地衣酚- 氢氧化钠- 无水乙醇- 水浴锅- 离心机- 移液器- 比色计2. 实验试剂:- 地衣酚试剂:将地衣酚0.5g溶于100mL 95%乙醇中。
- 氢氧化钠溶液:称取10g氢氧化钠,加入少量蒸馏水溶解,转移至100mL容量瓶中,加蒸馏水定容至刻度。
1. 准备工作- 将细菌RNA提取液和标准RNA溶液分别用移液器移取适量至试管中,加入等体积的浓盐酸,混匀后置于水浴锅中加热10分钟。
- 加热结束后,加入等体积的无水乙醇,混匀后静置10分钟,离心取沉淀。
- 将沉淀用少量蒸馏水洗涤两次,离心取沉淀。
- 将沉淀溶于少量蒸馏水中,加入等体积的氢氧化钠溶液,混匀。
2. 比色- 将上述溶液加入地衣酚试剂,混匀后置于室温下反应30分钟。
- 使用比色计在540nm波长下测定吸光度。
3. 数据处理- 以标准RNA溶液的吸光度为纵坐标,RNA浓度为横坐标,绘制标准曲线。
- 根据实验样品的吸光度,从标准曲线上查得对应的RNA浓度。
五、实验结果与分析1. 标准曲线绘制- 标准曲线线性良好,相关系数R²=0.99。
2. 实验样品RNA含量测定- 实验样品的吸光度为0.65,从标准曲线上查得RNA浓度为100ng/μL。
六、实验讨论1. 实验过程中,RNA降解可能受到多种因素的影响,如温度、时间、酸碱度等。
因此,在实验过程中应严格控制实验条件,以保证实验结果的准确性。
2. 地衣酚法测定RNA含量具有较高的灵敏度,但特异性较差,戊糖等物质也会产生类似的紫色化合物。
酵母RNA的提取与测定
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实验项目名称酵母RNA的提取与测定一、实验目的1.了解并掌握稀碱法提取 RNA。
2.学习地衣酚显色法测定RNA含量的基本原理和具体方法。
二、实验原理1. 细胞内大部分RNA均与蛋白质结合在一起,并且多以核蛋白的形式存在。
因此,分离制备RNA时,首先遇到的是必须使RNA与蛋白解离,并除去蛋白质。
2. 由于RNA的来源和种类很多,因而提取制备方法也各异。
一般有苯酚法、去污剂法和盐酸胍法。
其中苯酚法又是实验室最常用的。
组织匀桨用苯酚处理并离心后,RNA即溶于上层被饱和的水相中,DNA和蛋白质则留在酚层中,向水层加人乙醇后,RNA即以白色絮状沉淀出,此法能较好地除去DNA和蛋白质。
上述方法提取的RNA具有生物活性。
工业上常用碱法和浓盐法提取RNA,用这2种方法所提取的核酸均为变性的RNA,主要用作制备核酸的原料,其工艺比较简单。
浓盐法是用有10%左右氯化纳溶液,90℃提取3~4 h , 迅速冷却,提取液经离心后,上清液用乙醇沉淀 RNA。
稀碱法使用稀碱(本实验用0.2% NaOH 溶液)使酵母细胞裂解,然后用酸中和,除去蛋白质和菌体后的上清液用乙醇沉淀 RNA 或调pH 2.5 利用等电点沉淀。
酵母含 RNA 达2.67~10.0%,而 DNA 含量仅为0.03 - 0.516%,为此,提取RNA多以酵母为原料。
DNA和RNA都有吸收紫外线的性质,最大吸收峰在260 nm波长处。
紫外吸收是嘌呤环和嘧啶环的共轭双键系统所具有的性质,所有含嘌呤和嘧啶的物质,都具有吸收紫外线的特性。
因此,RNA含量测定,可用紫外吸收法。
紫外吸收法具有操作简便、快速、灵敏度高、对被测样品无损、用量少等优点,适合于核酸分离纯化过程的检测。
该法对纯品核酸准确度高,但由于有紫外吸收的物质对测定有干扰,对不纯核酸样品误差较大。
若样品内混杂大量的蛋白质和核苷酸等吸收紫外线的物质,应设法事先除去。
3.细胞破碎方法-机械物理法:可以用研磨和组织捣碎法。
实验13地衣酚法测定rna含量-华南师范大学生命科学学院新
![实验13地衣酚法测定rna含量-华南师范大学生命科学学院新](https://img.taocdn.com/s3/m/6e4093ca71fe910ef12df874.png)
一、目的学习和掌握测定RNA含量的定糖法(地衣酚法)的原理和操作技术。
二、原理核糖核酸与浓盐酸共热时,即发生降解,形成的核糖继而转变成糖醛,后者与3,5—二羟基甲苯(地衣酚)反应呈鲜绿色,该反应需用三氯化铁或氯化铜作催化剂,反应产物在670nm处有最大吸收,RNA浓度在20~200微克/毫升范围内,光密度与RNA的浓度成正比关系,在反应液中如混有DNA或其他杂质。
也能给出类似的颜色。
因此测定RNA时可先测定DNA的含量,再计算RNA的含量。
地衣酚法只能测定RNA中与嘌呤连接的核糖,不同来源的RNA所含嘌呤与嘧啶的比例各不相同,因此,用所测得的核糖量来换算各种RNA的含量存在误差。
最好用被测样品相同来源的纯化RNA作RNA-核糖标准曲线,然后从曲线求得被测样品的RNA含量。
三、材料、试剂和器具(一)试剂1、RNA标准溶液:取酵母RNA配成200微克/毫升的标准溶液(如不溶,可滴加氢氧化铵溶液,调至pH=)2、样品溶液:RNA浓度在20~100微克/毫升范围内。
(自己提取)3、地衣酚试剂,先配制%三氯化铁浓盐酸溶液(A、R)。
使用前再用上述溶液为溶剂配成%的地衣酚溶液。
(临用时配制)(二)器具1、试管及管架2、水浴锅3、移液管(1,2,5ml)4、可见光分光光度计四、操作步骤(一)RNA标准曲线的制作取8支试管,编号,按下表加入试剂加毕,摇匀,置沸水浴中加热15分钟,冷却,测值。
以值为纵坐标,RNA含量(微克/毫升)为横坐标作图绘制标准曲线。
(二)样品的测定取~毫升样品液于试管中,加蒸馏水稀释至2毫升,后加2毫升地衣酚试剂摇匀,于沸水中煮15分钟,冷却,测。
根据测得的光密度值,从标准曲线上查出相当该光密度的RNA 的含量,按下式计算样品中RNA的百分含量。
RNA含量/毫升待测液=标准曲线查得值×稀释倍数RNA产率(%)=含量/毫升×总体积×100新鲜肝重(g)×106五、注意事项样品中蛋白质含量较高时,应先用5%三氯乙酸溶液沉淀蛋白质后再测定。
生物化学实验报告参考地衣酚法测定RNA含量
![生物化学实验报告参考地衣酚法测定RNA含量](https://img.taocdn.com/s3/m/709ef4252f60ddccda38a0d3.png)
生物化学实验报告参考实验13 地衣酚法测定RNA 含量一、实验目的学习和掌握定糖法(地衣酚法)测定RNA 含量的原理和操作技术。
二、实验原理CHOC H C H C H CH 2OHOHOH OH浓HCl-3H 2O O CHO OH O H CH3Fe 3+,O C O CH 3OH O H反应产物在670nm 处有最大吸收,RNA 浓度在20~200μg/ mL 范围内,光密度与RNA 的浓度成正比关系,因而可用分光光度法测定RNA 含量。
三、材料、试剂和器具(一)试剂1、RNA 标准液;2、样品溶液(未知和提取的);3、地衣酚试剂(二)器具比色管、水浴锅、移液管、721分光光度计等四、操作步骤 (按下表进行) 1、RNA 标准曲线的制作; 2、样品的测定序号 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 RNA标准液/mL0 0.2 0.4 0.8 1.0 1.2 1.6 2.0 未知样/mL0.5 0.1 蒸馏水/mL2.0 1.8 1.6 1.2 1.0 0.8 0.4 0 1.5 1.9 地衣酚试剂/mL2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 摇匀,沸水浴加热20min ,冷却,各管补加蒸馏水2.0mL ,测其OD 670nm 值 RNA 含量 (μg/mL)0 6.7 13.3 26.7 33.3 40.0 53.3 66.7 OD 670nm 0 0.052 0.118 0.190 0.30 0.375 0.467 0.54 0.165 0.326 注:RNA 标准液浓度为200μg/ mL五、数据记录与数据处理1、数据记录见上表2、数据处理以上表中的OD 670nm 纵坐标,RNA 含量(μg/mL)为横坐标作图绘制标准曲线,结果见下图。
由标准曲线查得相当该光密度的未知样和提取的RNA 含量分别为18.93μg/mL 、37.87μg/mL.(或把OD 670nm =0.165、0.326分别代入回归方程:y=0.0085x+0.0041得x 1=18.93、x 2=37.87).R A N 标准曲线图y = 0.0085x + 0R 2 = 0.9900.10.20.30.40.50.601020304050607080R N A 含量(u g /mO D 670n 由公式:待测液RNA μg/mL=标准曲线查得x 稀释倍数,得未知样RNA 含量=18.93 x (6÷0.5)=227.16μg/mL ;提取液RNA 含量=37.87 x ( 6 ÷0.1 )=2272.2μg/mL 。
实验五RNA的定量测定
![实验五RNA的定量测定](https://img.taocdn.com/s3/m/ade7e7d8240c844769eaee8b.png)
5、本方法的干扰物及其去除方法
(1)戊糖或含戊糖的物质对本法有干扰;某些己糖 也对本法有干扰(糖经浓无机酸脱水产生糠醛或糠醛衍 生物,在浓无机酸作用下,与苯酚生成缩合物);去除 方法为,低浓度乙醇沉淀法和醋酸钾沉淀法,提高缓冲 液中NaCl浓度也可;在高浓度钠钾盐中,通过苯酚-氯 仿抽提可去除一些多糖(实际是去除糖蛋白);用LiCl 沉淀RNA,可将部分多糖留在上清液中。 (2)因不同时期酵母RNA含量有所变化,若样品光密 度值均不在标准曲线范围,可减少加样品液量或增加 RNA粗品溶液的浓度。
(5)苔黑酚-三氯化铁试剂需临用时配制,由于试 剂中有浓盐酸,反应时 需加盖保险膜,防止盐酸挥发。
6、原始数据
管号
A670nm
0
1
2
3
4
5
样液 (上次实验 保存样品)
7、数据处理
• 7.1、标准曲线 • 7.2、样液的浓度 • 7.3、
样 0.1
浓度(ug/mL) A670nm
试剂加完后,摇匀,置沸水浴中煮45min。冷却后, 在670 nm波长处测各管光密度值。以A670为横坐标, 每管标准液浓度为纵坐标,绘制标准曲线。 4.2.样品中RNA的测定 取1支试管,加入2.Oml样品液,再加2.0ml苔黑酚 试剂,按标准曲线制作方法,测得吸光度值后,折算 成浓度。 注:样品液即上次实验提取的酵母RNA。
4、实验操作
4.1.标准曲线的制作
取6支试管,按下表1编号加入试剂。
表l.制作RNA标准曲线时各试剂用量
RNA标准液(m1) 蒸馏水(m1) 苔黑酚试剂(m1)
0 1 2 3 4 5 0 0.4 0.8 1.2 1.6 2.0 2.0 1.6 1.2 0.8 0.4 0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 2.0 0 20 40 60 80 100
地衣酚法鉴定rna原理
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地衣酚法鉴定rna原理
地衣酚法鉴定RNA的原理是利用地衣酚与RNA分子中的核糖-磷酸骨架相互作用,生成具有蓝色荧光的复合物。
在一定浓度范围内,荧光强度与RNA浓度成正比,因此可以用来定量测定RNA的浓度。
该方法具有灵敏度高、操作简便、快速等优点,被广泛应用于RNA 的检测和定量分析。
需要注意的是,地衣酚法只能检测具有完整核糖-磷酸骨架结构的RNA,对于部分被修饰或破坏的RNA可能无法准确检测。
地衣酚法鉴定RNA的原理是利用地衣酚与RNA分子中的核糖-磷酸骨架相互作用,生成具有蓝色荧光的复合物。
在一定浓度范围内,荧光强度与RNA浓度成正比,因此可以用来定量测定RNA的浓度。
该方法具有灵敏度高、操作简便、快速等优点,被广泛应用于RNA 的检测和定量分析。
地衣酚法的具体操作步骤包括将待测RNA溶液与地衣酚混合,然后在沸水浴中加热,使地衣酚与RNA分子发生反应。
反应完成后,将溶液冷却至室温,加入荧光素,形成具有荧光的复合物。
最后,通过荧光强度测量仪测定荧光强度,并根据标准曲线计算RNA的浓度。
需要注意的是,地衣酚法只能检测具有完整核糖-磷酸骨架结构的RNA,对于部分被修饰或破坏的RNA可能无法准确检测。
此外,地衣酚法还存在一些局限性,例如对于低浓度的RNA可能不敏感,对于不同种类的RNA可能存在差异等。
因此,在使用地衣酚法进行RNA检测和定量分析时,需要结合其他方法进行综合分析。
实验二 紫外光吸收法测RNA的含量
![实验二 紫外光吸收法测RNA的含量](https://img.taocdn.com/s3/m/f649487d5acfa1c7aa00cc0f.png)
实验二紫外光吸收法测RNA的含量生命科学学院生科四班张行润200900140177一、实验目的1.了解紫外吸收法测定RNA含量的原理2.熟悉紫外分光光度计的使用二、实验原理RNA在260nm处有最大吸收峰,一定浓度范围内其浓度与吸光度成正比,故可以用紫外分光光度计通过比色来测定RNA含量。
由于蛋白质在280nm波长处也有光吸收,对RNA测定有一定的干扰作用,但蛋白质的最大吸收峰在280nm处,如同时测定280nm的光吸收,通过计算可消除其对RNA测定的影响。
因此如其中含有蛋白质时必须同时测定280nm和260nm的吸光度,可通过计算测定溶液中RNA的含量。
三、实验器材1.材料:第一次实验所提取的酵母RNA,标准RNA液(100ug/ml),0.2%NaoH溶液,蒸馏水2.主要仪器(1)分析天平(2)紫外分光光度计(3)烧杯(100mL)(4)容量瓶(100mL)(5)移液管(0.5ml、2mL 和5mL)(6)药品勺和玻璃棒(7)试管和试管架(8)试管9支四、实验步骤1.样品处理称取0.2—0.25g粗品RNA,加入2ml 0.2%氢氧化钠溶液和1ml 蒸馏水溶解,调成糊状,再加入40ml-50ml蒸馏水溶解,调PH至7.0,待液体透明清澈后定容至100ml(再取2ml定容至100ml)待测注:本次实验中我们所取粗酵母RNA样品为0.1268g(由于实验材料不够)2.设计一系列浓度梯度的标准RNA溶液(5-45ug/ml),然后测得其各个浓度的Abs值,求其直线关系(标准RNA 100ug/ml),实验设计如下:五、注意事项1.在由标准RNA溶液所配置的系列梯度溶液必须含有0这个浓度,用于参比校准;2.用紫外分光光度计测定Abs值时应首先用系列溶液中的0浓度进行校准;3.紫外分光光度计所使用的比色皿必须保证其光面洁净,若有液体可用吸水纸吸干,不可以擦,其他可用擦镜纸擦干净,以免影响实验结果六、实验结果1.2.由紫外分光光度计所测得的待测液结果取平均后得其Abs值为0.450,以系列浓度梯度的标准RNA溶液与吸光度作图成直线关系图一:酵母RNA OD值——标准RNA溶液浓度工作线(λ=260nm)✧作图得待测液(稀释后)的浓度为20.03ug/ml✧酵母RNA的含量m=20.03×100×50=100150 ug=0.10015g✧称取的粗酵母RNA的质量M=0.1268g✧所得酵母RNA的纯度w=m/M×100%=0.10015/0.1268×100%=79.0%七、分析讨论及误差分析本次实验所测的的酵母RNA纯度为79.0%,经过查阅资料和与其他小组相比较,这一纯度还是比较高的,分析应有以下四点原因:1.在第一次提取酵母RNA时按照步骤规范操作,包括离心过程也进行的比较顺利,所得酵母RNA经过在通风橱中风干后才将其取出,致使纯度相对较高;2.在称取酵母RNA的时候按照分析天平的使用方法,包括调平等细节都注意到,所称得的酵母RNA质量比较准确;3.使用紫外分光光度计时操作规范,包括比色皿的干净程度等;当然实验中也不可避免的产生一些误差,分析主要有一下几点:1.酵母RNA被溶解后调PH时由于用的是PH试纸而不是PH计这种较为准确精密的仪器,所以可能会影响测定结果,造成一定的误差;2.酵母RNA溶解不是很彻底,虽然按照实验要求,并搅拌足够长的时间,但是还可以看到悬液中有少许不溶物;3.实验中的未在280nm处测定,蛋白质会对实验结果造成一定的影响。
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一、目的
学习和掌握测定RNA含量的定糖法(地衣酚法)的原理和操作技术。
二、原理
核糖核酸与浓盐酸共热时,即发生降解,形成的核糖继而转变成糖醛,后者与3,5—二羟基甲苯(地衣酚)反应呈鲜绿色,该反应需用三氯化铁或氯化铜作催化剂,反应产物在670nm处有最大吸收,RNA浓度在20~200微克/毫升范围内,光密度与RNA的浓度成正比关系,在反应液中如混有DNA或其他杂质。
也能给出类似的颜色。
因此测定RNA时可先测定DNA的含量,再计算RNA的含量。
地衣酚法只能测定RNA中与嘌呤连接的核糖,不同来源的RNA所含嘌呤与嘧啶的比例各不相同,因此,用所测得的核糖量来换算各种RNA的含量存在误差。
最好用被测样品相同来源的纯化RNA作RNA-核糖标准曲线,然后从曲线求得被测样品的RNA含量。
三、材料、试剂和器具
(一)试剂
1、RNA标准溶液:取酵母RNA配成200微克/毫升的标准溶液(如不溶,可滴加氢氧化铵溶液,调至pH=)
2、样品溶液:RNA浓度在20~100微克/毫升范围内。
(自己提取)
3、地衣酚试剂,先配制%三氯化铁浓盐酸溶液(A、R)。
使用前再用上述溶液为溶剂配成%的地衣酚溶液。
(临用时配制)
(二)器具
1、试管及管架
2、水浴锅
3、移液管(1,2,5ml)
4、可见光分光光度计
四、操作步骤
(一)RNA标准曲线的制作
取8支试管,编号,按下表加入试剂
加毕,摇匀,置沸水浴中加热15分钟,冷却,测值。
以值为纵坐标,RNA含量(微克/毫升)为横坐标作图绘制标准曲线。
(二)样品的测定
取~毫升样品液于试管中,加蒸馏水稀释至2毫升,后加2毫升地衣酚试剂摇匀,于沸水中煮15分钟,冷却,测。
根据测得的光密度值,从标准曲线上查出相当该光密度的RNA 的含量,按下式计算样品中RNA的百分含量。
RNA含量/毫升待测液=标准曲线查得值×稀释倍数
RNA产率(%)=含量/毫升×总体积
×100新鲜肝重(g)×106
五、注意事项
样品中蛋白质含量较高时,应先用5%三氯乙酸溶液沉淀蛋白质后再测定。
六、实验报告
附上绘制标准曲线图,并计算RNA的含量及产率。
七、思考题
1、采用该法测定RNA的含量有何优点及缺点?
2、地衣酚反应中,干扰RNA测定的因素有哪些?如何能减少它们的影响?。