微生物分类学及系统发育PPT课件

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微生物的分类和系统发育

微生物的分类和系统发育
影响
病毒
定义:病毒是一种非细胞微生物, 必须寄生在活细胞中才能复制繁殖。
形态:病毒的形态各异,常见的有 球形、杆形和丝形等。
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分类:病毒可以根据其宿主范围和 基因组类型进行分类,如DNA病毒 和RNA病毒,以及单链和双链病毒。
繁殖方式:病毒通过吸附、侵入、 复制和释放等过程在宿主细胞内繁 殖。
应用:藻类在食品、饲料、医药、化工等领域具有广泛的应用价值
微生物的系统发育
进化树
定义:表示生物进化关系的图形,由共同祖先出发,随着时间发展而分支 进化 作用:揭示生物之间的亲缘关系和进化历程
构建方法:基于基因序列、蛋白质序列等分子生物学数据
应用领域:生物分类学、进化生物学、古生物学等
基因组学
基因组学在微生物系统发育研究中的应用 基因组学在微生物分类中的作用 基因组学在微生物进化研究中的应用 基因组学在微生物生态学研究中的应用
微生物的分类和系统发育
汇报人:XX
微生物的分类 微生物的系统发育
微生物的分类
细菌ห้องสมุดไป่ตู้
定义:细菌是 一种单细胞微 生物,是所有 生物中最原始
的一种
分类依据:根 据细菌的形态、 染色反应、培 养特性等特征
进行分类
常见种类:球 菌、杆菌、螺
旋菌等
生物学意义: 细菌在自然界 中分布广泛, 是地球生态系 统的重要组成 部分,对人类 也有着重要的
真菌
真菌分为酵母菌、霉菌和蘑 菇三大类
真菌属于真核生物,具有细 胞核和细胞器
真菌通过无性繁殖和有性繁 殖的方式进行繁殖
真菌在生态系统中扮演着分 解者、生产者和消费者的角

章十 微生物的分类和鉴定ppt(共71张PPT)

章十 微生物的分类和鉴定ppt(共71张PPT)
(2)细胞壁成分独特而多样有的以蛋白质为主,有的含杂多糖,有的类似于 肽聚糖(“假肽聚糖”),但不论是何种成分,它们都不含胞壁酸、D型氨基酸和二氨基庚二酸
。 (3)核糖体的16SrRNA其核苷酸顺序独特,既不同于真细菌,也不同于真核生物。 (4)tRNA成分其核苷酸顺序也很特殊,且不存在胸腺嘧啶。
(5)蛋白质合成的起始密码始于甲硫氨酸,与真核生物相同。 (6)对抗生素等的敏感性对那些作用于真细菌细胞壁的抗生素如青霉素、头 孢霉素和D-环丝氨酸等不敏感;对真细菌的转译有抑制作用的氯霉素不敏感;对真 核生物的转译有抑制作用的白喉毒素却十分敏感。 (7)生态条件独特有的是严格厌氧菌,如产甲烷菌(metnanogens);有的 是极端嗜盐菌(extremehalophiles);有的则是嗜热嗜酸菌
(用菌物代替以往的真菌)
目前广为接受Ainsworth第7版的分类系统及第八版
菌物界
Ainsworth等人的菌物分类系统纲要
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
第四节 微生物分类鉴定的方法
一、微生物分类鉴定的经典方法 二、微生物分类鉴定中的现代方法
微生物的鉴定
▪ 主要步骤:纯化、测定一系列必要的指标、查找权威性鉴 定手册
▪ 鉴定方法分四个水平:
▪ 菌株的确定:实验室可以自己命名。 1963年,Able等首次通过细胞脂肪酸的分析来对细菌进行分类,同时,Oyama等又提出了用裂解气相色谱法(Pyrolysisgaschromatography,
PGC,是一种热裂解法与色谱技术相结合的方法)来鉴定细菌。 Enterotube 系统
▪ Escherichia coli K12, O-157:H7
三域学说及其生物进化谱系树
促使人们提出三原界学说的最重要原因是具有一系列独特性状的曾称作“第三生物 ”的古细菌的发现。与真细菌相比,古细菌有以下几个特点:

微生物基础知识培训(常用微生物知识)ppt课件

微生物基础知识培训(常用微生物知识)ppt课件
呼吸作用
主要通过氧化磷酸化途径进行 ,少数真菌可通过无氧呼吸产 生能量。
物质代谢
能分解纤维素、木质素等复杂 有机物,同时合成自身所需的 营养物质。
生长发育
包括菌丝的生长、孢子的形成 和萌发等过程。
常见真菌种类及其特性
酵母菌
单细胞真菌,可发酵糖类产生酒精和二氧化 碳,广泛应用于食品、酿造等领域。
蘑菇
流感病毒、冠状病毒、艾滋病病毒、疱疹病毒等。
病毒的危害
导致人类和动植物疾病,如流感、艾滋病、口蹄疫等,严重危害人类健康和生 命安全。同时,病毒也对社会经济和生态环境造成巨大影响。
05 微生物在自然界 中的作用
微生物在土壤中的作用
促进土壤形成
微生物通过分解有机物和 矿物质,促进土壤的形成 和发育。
微生物的收多 、转化快和生长旺等特点。
功能
微生物在自然界中发挥着重要作用, 如参与物质循环、维持生态平衡、促 进动植物生长等。
微生物与人类的关系
01
02
03
有益关系
微生物在食品、医药、农 业等领域有着广泛应用, 如制作面包、酿造啤酒、 生产抗生素等。
有害关系
属于担子菌门,是一种大型真菌,具有食用 和药用价值。
霉菌
多细胞真菌,菌落呈绒毛状、絮状或蜘蛛网 状,可引起食品、衣物等物品的霉变。
青霉
属于半知菌类,是一种广泛分布的真菌,可 引起水果、蔬菜等农产品的腐烂。
04 病毒
病毒的结构与分类
病毒的基本结构
由核酸(DNA或RNA)和蛋白质外壳组成,无细胞结构。
某些微生物能引起人类和 动植物的病害,如细菌引 起的痢疾、病毒引起的流 感等。
中性关系
许多微生物与人类和平共 处,不引起疾病,也不产 生明显的益处或害处。

微生物总结_PPT幻灯片

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五种有益微生物的应用形式微生物发酵原料灭菌接种微生物发酵发酵产品提取纯化代谢产物微生物代谢产物的修饰和改造菌体有益微生物在食品工业中的应用形式?微生物菌体的应用?微生物发酵食品的应用?微生物代谢产物的应用?微生物酶制剂的应用?微生物在食品工厂废弃物处理方面的应用第二部分微生物分类鉴定进展微生物的命名学名scientificname林奈的双名法binominalnomenclature生物界的分类及微生物在生物界中位置六界系统五界系统1969年whittaker三大领域woese16srrna序列分析比较提出将生物分成为三界kingdom后来改称三个域
2021/3/10
25
第九版伯杰氏细菌鉴定手册设立35个群,将古 细菌部改编为5个群,全书描写了约500个属。
划分为四大类: 第一类 具细胞壁的革兰氏阴性真细菌 第二类 具细胞壁的革兰氏阳性真细菌 第三类 无细胞壁的真细菌 第四类 古细菌
1984-1989年陆续出版的四卷册《伯杰氏系统 细菌学手册》第一版,在着重于表观特征描述 的基础上,结合化学分类、数值分类特别是 DNA相关性分析,及16S rRNA寡核苷酸编目 在生物种群间的亲缘关系研究中的应用作了详 细的阐述,体现了细菌分类的研究从表观向系 统发育体系的发展。除此,还附有每个菌群的 生态、分离、保藏及鉴定的方法。
B:核酸分子杂交——DNA-DNA和DNA-RNA 杂交
C:16SrRNA寡核苷酸编目分析
微生物分类方法
1.传统分类法(classical classification) 以细菌的形态和生理生化特征为依据。
2.数值分类法(numerical classification) 20世纪60年代兴起,细菌的各种生物学性状“等重要 原则”分类,性状数量超过50个。

《微生物学课件PPT》

《微生物学课件PPT》
繁殖
微生物有多种繁殖方式,包括二分裂、孢子形成和性繁殖,以适应不同环境 条件。
微生物在生态系统中的角色
1
分解者
微生物在生态系统中分解有机物,将其转化为可供其他生物利用的营养物质。
2
氮固定
一些微生物能够固定大气中的氮气,并将其转化为植物可吸收的形式。
3
环境监测
某些微生物对环境中的污染物和毒性有敏感反应,可以用作环境监测的指示器。
传染病与病原微生物
传染病
流感 肺炎 霍乱 疟疾
病原微生物
流感病毒 肺炎球菌 霍乱弧菌 疟原虫
微生物学研究方法
显微镜观察
显微镜是观察微生物形态和结构的重要工具,通过放大镜头可见微观世界。
培养和鉴定
通过培养微生物并进行鉴定,了解其生长特征和分类等信息。
分子生物学技术
利用PCR和基因测序等技术研究微生物的DNA和基因组,揭示其遗传信息。
微生物与人类健康
有益微生物
人体内有益的微生物有助于免疫系统发育、食物消 化和预防疾病。
病原微生物
某些微生物可以引起传染病,如细菌感染、病毒感 染和真菌感染。
Байду номын сангаас
免疫系统
微生物在免疫系统中起关键作用,帮助识别和抵御 病原微生物的入侵。
预防措施
保持良好的卫生习惯、接种疫苗和用抗生素等措施 可预防微生物相关疾病。
微生物与环境保护
1 生物降解
某些微生物可以利用有机污染物作为 能源,进行降解和净化。
2 生物控制
应用有益微生物来控制害虫和病原微 生物的生长,减少使用化学农药。
3 环境监测
微生物在环境中的分布和数量可以反映环境污染的程度。
细菌是微生物中最常见的一类,以原核细胞 结构为特点。

微生物学课件ppt完整版

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医院感染
分为内源性感染(由体内正常菌 群引起的感染)和外源性感染( 由外界环境中的微生物引起的感
染)。
感染类型
局部感染局限于某一部位,而全 身感染则涉及多个器官和系统。
局部感染与全身感染
在医院等医疗机构内获得的感染 ,多由耐药菌引起,治疗难度较 大。
微生物感染的预防与治疗
预防措施
包括个人卫生、环境卫生、疫苗接种等,以 降低感染风险。
无菌操作
进行微生物实验时,要保 持无菌操作环境,避免杂 菌污染。
实验记录
详细记录实验过程和结果 ,包括培养基的配制、接 种方法、培养条件、观察 结果等。
实验后处理
实验结束后,要对实验器 材进行清洗和消毒处理, 保持实验室的整洁和卫生 。
2023
REPORTING
THANKS
感谢观看
食品工业
利用微生物发酵技术生产酒类、面 包、酸奶等食品。
03
02
农业应用
利用微生物制剂防治植物病害、促 进作物生长等。
生物能源
利用微生物发酵产生沼气、生物柴 油等可再生能源。
04
2023
PART 05
微生物的免疫与感染
REPORTING
微生物的免疫机制与特点
先天性免疫
通过遗传获得的非特异性免疫,包括皮肤、黏膜 屏障、吞噬细胞等。
病原学检查
通过直接涂片镜检、分离培养等方法确定病 原微生物种类。
免疫学检查
利用抗原抗体反应等免疫学原理检测病原微 生物及其产物。
2023
PART 06
微生物学实验技术与方法
REPORTING
微生物学实验室常用设备与器材
培养箱
提供适宜的温度和湿度条件, 用于培养微生物。

微生物学课件ppt完整版x

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微生物育种的方法与应用
传统育种方法 利用自然变异进行选择育种,或通过 诱变育种增加变异。
基因工程育种
通过基因克隆、基因编辑等技术对微 生物进行遗传改造。
代谢工程育种
通过改变微生物代谢途径,提高目标 产物的产量或改变产物性质。
合成生物学育种
设计和构建人工生物系统,实现新的 功能或优化现有功能。
06
微生物的分类
根据形态结构和生理特性,微生物 可分为细菌、放线菌、真菌、病毒、 立克次体、支原体、衣原体、螺旋 体等八大类。
微生物学的研究内容与意义
微生物学的研究内容
微生物学主要研究微生物的形态结构、 生理生化、遗传变异、生态分布和分 类鉴定等方面的内容。
微生物学的研究意义
微生物学在医学、农业、工业、环保等 领域都有广泛的应用,对于揭示生命本 质、探索生命起源和进化等方面也有重 要意义。
07
微生物的分类与系统发育
微生物的分类方法与命名规则
数值分类法
利用计算机对微生物的多个性状进行数值 化分析,通过聚类分析等方法进行分类。
传统分类法
基于形态学、生理生化特性和生态 学特征进行分类,如细菌的形态、 革兰氏染色反应、氧化发酵类型等。
A
B
C
D
分子生物学分类法
基于微生物基因序列、蛋白质序列等分子 水平信息进行分类,如16S rRNA基因序 列分析。
培养基的类型
根据物理性质可分为液体培养基、固体培养基和半固体培养基;根 据成分可分为合成培养基、天然培养基和复合培养基。
培养基的配制原则
满足微生物的营养需求,提供适宜的物理化学条件,以及具有选择性 和鉴别作用。
微生物的生长曲线与测定方法
生长曲线的四个阶段

微生物的进化系统发育

微生物的进化系统发育

系统发育树的解读
物种分类
01
系统发育树可以帮助我们了解不同物种之间的亲缘关系,从而
进行正确的物种分类。
生物进化历程
02
系统发育树揭示了生物的进化历程,有助于我们理解生物进化
的规律和机制。
生物多样性的起源
03
通过系统发育树的研究,我们可以了解生物多样性的起源和演
化过程,为生物多样性的保护和利用提供科学依据。
01
环境污染
人类活动造成的环境污染可能影响微生物的生存和进化,如工业废水排
放可能影响水生微生物群落结构。
02
城市化与生态系统变化
城市化进程中生态系统发生变化,可能影响自然微生物群落的平衡和进
化。
03
农业活动与转基因生物
农业活动中使用农药和转基因生物可能对土壤微生物群落产生影响,改
变其进化轨迹。
THANKS
病原微生物在进化过程中可能发生变异,导致其致病力增强或传播 方式改变,从而引发新的疾病或使原有疾病更难治疗。
耐药性进化
微生物在进化过程中可能发展出对抗生素等药物的耐药性,使得一 些常见的感染病变得难以治疗。
共生微生物进化
共生微生物与人体和谐共存,其进化可能影响人体健康状况,如肠 道微生物群落的改变可能影响人体消化、免疫等方面。
微生物的进化机制
基因突变
基因突变是微生物进化的重要机制之一。基因突变可以产生新的 基因和性状,使微生物能够适应新的环境。
基因重组
基因重组也是微生物进化的重要机制之一。通过基因重组,微生物 可以获得新的遗传物质,从而产生新的性状和适应性。
自然选择
自然选择是微生物进化的关键机制之一。在自然环境中,只有适应 环境的微生物才能生存和繁殖,从而推动微生物的进化。

微生物课件ppt

微生物课件ppt

病毒的防治与利用
防治
预防病毒传播的措施包括个人卫生、环境卫生、接种疫苗等 。对于已经感染的患者,医生通常会使用抗病毒药物、对症 治疗等方法进行治疗。
利用
虽然病毒对人类健康有一定威胁,但它们也可以被用于研究 和治疗。例如,病毒载体可以用于基因治疗和疫苗研发。此 外,病毒还可以被用于检测和鉴定细菌、病毒等病原体。
微生物的分类
根据微生物的生物学特性和系统发育关系,可以将微 生物分为细菌、病毒、真菌、原生动物、小型藻类等 几大类。其中,细菌是微生物中最常见的一类,包括 革兰阳性菌、革兰阴性菌等;病毒则是一类非细胞型 微生物,需要寄生在宿主细胞内才能增殖;真菌则是 一类具有细胞壁和细胞核的微生物,包括霉菌和酵母 等;原生动物和藻类则是单细胞生物中的两大类。
02
CATALOGUE
原核微生物
细菌
细菌的基本特征
细菌是一类具有细胞壁、细胞膜、细 胞质和核区的微生物,具有多种形态 、大小和颜色,如球菌、杆菌、螺旋 菌等。
细菌的繁殖方式
细菌的分类
根据革兰染色法的不同,可将细菌分 为革兰阳性菌和革兰阴性菌两类。
细菌通过二分裂方式进行繁殖,繁殖 周期短,数量增长快。
微生物的繁殖方式
微生物主要通过二分裂、裂殖、芽殖和孢子生殖等方式进行繁殖 。
遗传变异与进化
微生物在繁殖过程中会发生基因突变、基因重组和染色体变异等遗 传变异,这些变异为微生物的进化提供了基础。
微生物的遗传工程
通过遗传工程手段对微生物进行改造和优化,提高其生产效率或改 良其性状,为人类生产和生活服务。
06
CATALOGUE
微生物的应用
在工业上的应用
微生物发酵
利用微生物发酵生产各种工业原料,如酒精、酵母、柠檬酸等。

第十一章微生物的分类和鉴定ppt课件

第十一章微生物的分类和鉴定ppt课件

例1:苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种 Bacillus thuringiensis (subsp)galleria 例2:椭圆酿酒酵母(或酿酒酵母椭圆变种) Saccharomyces cerevisiae (var)ellipsoideus
由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准, 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱, 细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”
学名(scientific name)
指一个菌种的科学名称,它是按照《国际 细菌命名法规》命名的、国际学术界公认并通 用的正式名字。
一、双名法(binominal nomenclature)
双名法指一个物种的学名由前面一个属名(generic name)和后面一个种名加词(specific epithet)两部分
Ainsworth从1966年起,就把真菌界分为两大门 (粘菌门和真菌门),并把真菌门再分成五个亚门。 目前,该系统已为各国广大真菌分类学者所普遍采 用,影响较大。
三、酵母菌的分类
酵母菌的分类普遍采用荷兰的Loddov在1970 年提出的分类系统。
在这个分类系统中,以是否形成各类有性孢子 作为分类的起点,
细致的观察和测试,参照一定的,用对比的方法来 确定该微生物的分类地位。
第一节 通用分类单元
三、种以下的分类单元
亚种(subspecies,subsp.,ssp.) 变种(variety,var.) 型(form) 类群(group) 菌株(strain) 小种(race) 相(phase) 态(state)
一般指自然存在的微生物交互变异中的一定阶段。
(八)态(state)
通常指微生物的菌落变异状态,如粗糙、光 滑或粘液状等。

环境微生物ppt课件

环境微生物ppt课件

环境微生物在可持续发展中的作用
生物降解与转化
生物修复
利用微生物的代谢活动, 实现有机污染物的生物 降解和转化,降低环境
污染程度。
通过微生物的作用,促 进土壤和水体的自净能 力,修复受污染的环境。
资源循环利用
利用微生物的发酵、转 化等功能,实现废弃物 的资源化利用,提高资
源利用效率。
新能源开发
发掘产氢、产甲烷等具 有新能源开发潜力的微 生物资源,推动清洁能
污染物对微生物酶活性的影响
与酶活性中心结合,降低酶活性,影响微生物的代 谢过程。
污染物对微生物遗传物质的影响
造成DNA损伤、基因突变等,影响微生物的遗传稳 定性和进化。
微生物在污染治理中的应用
生物修复技术
利用特定微生物或微生物 群落的降解能力,去除或 降低环境中污染物的浓度。
生物处理技术
通过微生物的代谢活动, 将污染物转化为无害或低 毒物质,如废水处理中的 活性污泥法。
环境微生物ppt课件
contents
目录
• 环境微生物概述 • 环境微生物的生理功能 • 环境微生物与污染物的相互作用 • 环境微生物的监测与评价 • 环境微生物资源与利用 • 环境微生物的未来展望
01
环境微生物概述
定义与分类
定义
环境微生物是指存在于自然环境中, 对环境产生直接或间接影响的微生 物群体。
适应性多样性
环境微生物能够适应各种极端环 境,如高温、低温、高盐、高酸
等,展现出强大的生命力。
02
环境微生物的生理功能
物质循环与能量流动
微生物在生态系统中的物质循环
01
通过分解有机物和无机物,将营养物质释放到环境中,供其他
生物利用。

微生物基础知识ppt课件

微生物基础知识ppt课件

微生物基础知识ppt课件目录CONTENCT •微生物概述•微生物的形态与结构•微生物的生长与繁殖•微生物的遗传与变异•微生物的生态与环境•微生物的分类与鉴定01微生物概述定义微生物是一类形体微小、结构简单、必须借助显微镜才能观察到的低等生物体的总称。

分类根据形态和结构,微生物可分为细菌、真菌、病毒、原生动物和藻类等几大类。

特点微生物具有体积小、比表面积大、代谢旺盛、繁殖快、易变异等特点。

功能微生物在自然界中发挥着重要作用,如参与物质循环、促进生物地球化学循环、降解有机污染物等。

微生物的研究历史与现状研究历史微生物学的发展经历了漫长的过程,从列文虎克用显微镜发现微生物到巴斯德提出疾病的微生物理论,再到科赫建立纯培养技术,微生物学逐渐发展成为一门独立的学科。

研究现状随着生物技术的不断发展,微生物学的研究领域不断扩大,涉及到环境、医学、农业、工业等多个领域。

同时,微生物资源的开发和利用也受到了广泛关注,如利用微生物生产抗生素、酶制剂、有机酸等。

02微生物的形态与结构细菌的基本形态球菌、杆菌、螺旋菌细菌的结构细胞壁、细胞膜、细胞质、核质特殊结构荚膜、鞭毛、菌毛、芽孢010203真菌的基本形态真菌的结构特殊结构酵母菌、霉菌、大型真菌菌丝、孢子、细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核菌丝体、菌核、子实体010203病毒的基本形态:球形、杆形、砖形、蝌蚪形等病毒的结构:核酸(DNA或RNA)、蛋白质外壳特殊结构:包膜、刺突03微生物的生长与繁殖80%80%100%提供微生物合成细胞物质和代谢产物的碳素来源。

主要用于合成蛋白质、核酸等含氮物质。

维持细胞渗透压、酸碱平衡及酶的活性等。

碳源氮源无机盐水分细胞的主要组成成分,参与代谢反应。

生长因子某些微生物生长所必需的微量有机物质。

温度影响微生物体内生化反应的速率和酶的活性。

pH值影响细胞膜的通透性和酶的活性。

氧气好氧微生物需要氧气进行呼吸作用,厌氧微生物则需要在无氧环境下生长。

《农业微生物学》课件

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目录
• 农业微生物学简介 • 农业微生物的种类与特性 • 农业微生物的应用 • 农业微生物的未来发展前景
01
农业微生物学简介
农业微生物的定义与分类
农业微生物
在农业生产、植物保护和土壤改 良等方面发挥重要作用的微生物 。
分类
细菌、真菌、病毒等,每种微生 物都有其特定的生态位和作用。
土壤微生物的特性
土壤微生物具有适应土壤环境的特点,如耐酸、耐盐、耐旱 等。同时,土壤微生物的繁殖能力强,可以在短时间内迅速 繁殖,对土壤的改良和肥力的提高具有重要作用。
水体微生物
水体微生物的种类
水体中存在的微生物种类繁多,包括细菌、藻类、原生动物等。这些微生物在 水体生态平衡中发挥着重要的作用,如净化水质、提供氧气等。
农业微生物参与土壤有机质的分解、 养分转化和土壤结构的改善,提高土 壤肥力和可持续生产能力。
提高农作物抗病性
促进绿色农业发展
利用农业微生物资源替代化学肥料和 农药,发展绿色、环保、可持续的农 业生产方式,保障食品安全和生态安 全。
通过接种有益微生物,增强农作物对 病害的抵抗能力,减少化学农药的使 用,降低环境污染。
促进植物生长
一些微生物可以分泌植物 生长激素或生长调节剂, 促进植物生长,提高产量 。
生物防治
利用有益微生物防治植物 病害,减少化学农药的使 用,降低环境污染。
在环境保护中的应用
污水处理
微生物通过分解作用将污水中的 有机物转化为无害物质,净化水
质。Biblioteka 生物修复利用微生物降解有毒有害物质,修 复被污染的环境。
空气微生物的特性
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真核生物有甘油脂二酯膜脂glycerol fatty acy diesters
細菌生物有diacyl glycerol diesters
古細菌diether or diglycerol tetraether lipid (醚鍵)
-
8
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9
現代真核生物細胞起源於14億年前的原核生物(有些化 學數據證明在27億年前),兩個假說
BMSB
以16S rRNA 基因序列比對為基礎建構系統,
做成分類層級,並把原核生物分為古生物域
和細菌域,兩域分別包含2門和 23 門
-
4
➢ 微生物的演化和多樣性 MICROBIAL EVOLUTION AND DIVERSITY
地球年齡估計約有46億年 疊層石 (stromatolites)和沉積岩中之化石遺 骸發現原核細胞約有35至38億年 微生物化石清晰地在20億年之岩石上 現代疊層石由藍細菌所形成
-
1
微生物分類學及系統發育
➢ 大綱
19.1 一般介紹和概況
19.2 微生物的進化和多樣性
19.3 分類等級
19.4 分類系統
19.5 分類學中使用之主要特性
19.6 微生物系統發育的評估 19.7 生命的主要劃分
19.8 伯杰氏系統細菌學手冊
19.9 原核系統發育和多樣調查
-
2
➢ 一般介紹和概況 GENERAL INTRODUCTION
第一個字母大寫是屬名,第二個字母小寫 Escherichia coli
種名常代表特定性質,是穩定的,某一特定生物最 早的特定性質有優先權 如果由於新的信息把某一個生物分到另一屬中,而 改變屬名
根據 rRNA分析和其他特徵,鏈球菌屬 (Streptococcus)分為 2個新屬,腸道球菌屬 (Enterococcus)和乳酸球菌屬 (Lactococcus) 糞鏈球菌(Streptococcus faecalis)現在為糞腸 球菌(Enterococcus faecalis) 菌名常被縮寫,屬名用一個大寫字母表示,例如E. coli,文章中第二次出現菌名時才可縮寫,第一次 出現還是要寫全名
菌株(strain)
在一個特定分類學中至少與其他一些群體可 以區別之生物群體,來自單一生物或純培養 物的分離株
-
15
一個種內其菌株間在許多方面上可能有小差異
變種(biovars) 是生化或生理上有差異之各色 各樣的原核菌株
形態變種(morphovars)是指形態上不同
血清變種 (serovars)則指具有獨特抗原特性
最早原核生物可能是厭氧性 藍細菌和產氧之光合作用菌大概在25-30億年 或更早 隨著氧變得較豐富,微生物多樣性大大增加
-
5
-
6
-
7
1977 Carl Woese等學者對原核生物細胞rRNA 序列研究後提出
原核生物應分為兩個類:群細菌、古細菌
真核生物
這三個基本類群稱為『域』domains,在門 和界水準之上
模式菌株(type strain) 通常是首先被研究的菌 株,其特徵比其他菌株瞭解得多,它不 一定是 最具代表性的菌株
模式種 (type species) 種的模式菌株:是命名 的模版或擁有種名
每一個種都屬於一個屬(genus) ,將種置於一個 屬有相當主觀,有些分類學家也許不同意屬的 組成
-
16
微生物學家採用雙名系統(binomial system)命名微生 物 由瑞典植物學家Carl von Linne所提 系統為拉丁 化,斜體名稱分為兩部分
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13
-
14
此定義非常主 觀
更精確的定義。一個種(基因型種)是有相 似G +C組成和有70%或以上之DNA雜交 實驗判定之集合
由於基因體序列之數據增加,種或許可以 定義為具有相同序列
種可能是生物其主要管家基因 housekeeping gene(所有細胞皆需之基 因,其通常持續表達)具有相同序列之集 合
可能祖先:農桿菌屬、根瘤菌屬和立克次氏 體屬
內共生的證據
藍細菌定居在雙生鞭毛原生生物,作為寄主葉 綠體
內共生體稱為藍色小體
與藍細菌在光合作用色素系統和存有類似肽 聚糖層的構造
缺少脂多糖外層膜特徵
進化成葉綠體 -
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➢ 分類等級TAXONOMIC RANKS 種、屬、科、目、綱 和門 每個水平或等級的微生物類群的命名都有特定字尾 特徵 常使用非正式的名稱:如紫細菌、螺旋體、甲烷氧 化菌、硫酸還原菌和乳酸菌 微生物分類中基本分類類群是種species 與高等生物研究的分類學家定義種的概念不同 高等生物的種是一群彼此雜交能繁殖或潛在 的雜種繁殖的自然群體,對能有性生殖的生 物是很好的定義 但對不是有性繁殖的微生物則不宜 原核生物的種是根據表型和基因型的不同而定 義 原核生物的種是菌株的一個集合,這些菌株有 許多共同穩定特徵而- 與他類菌株有顯著的區別 12
對微生物精確鑑定是必要的
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3
系統學systematics (系統分類學)
以分析生物特徵並按順序排列為最終目的的 科學研究
任何生物特性的研究是系統學的一部分
涵蓋了形態學、生態學、流行病學、生物化 學、分 子生物學和生理學
微生物分類使用新的分子技術
也介紹許多傳統方法
主要以伯杰氏系統細菌學手冊Bergey‘s Manual of Systematic Bacteriology,簡稱
古生菌喪失了它的細胞壁和原生質膜
宿主細菌形成膜折疊,宿主基因體轉移至古 生菌中,形成核和內生網狀
在形成真核生物基因體時,細菌和古生菌基
因可能關係更近,認 為真核生物直接從古生菌分化而來
葉綠體的可能源自光合細菌
藍細菌是葉綠體最可能的祖先
粒線體來源於原始真核生物和好氧呼吸真細菌 的共生
核、粒線體 和葉綠體是由原生質膜內陷形成包含遺 傳物質的雙層膜結構形成的
葉綠體,粒線體和現代細菌之間的相似性源自 於原核生物保留性的胞器緩慢的改變
內共生假說(endosymbiotic hypothesis)
真核細胞祖先可能由古代的細菌和古生菌融合 而形成
失去了細胞壁之G(-)宿主細胞吞了古生細菌 形成共生
AND OVERVIEW
分類學Taxonomy(希臘語taxis安排或順序; nomos法則或nemein分類或治理):定義為生 物分類的科學
包含分類、命名和鑑定
分類學的重要性
讓人們整理有關生物大量的知識,分類愈精 細,系統信息愈豐富和愈有用
對相似生物的知識,對進一步研究推測和假 設
將微生物給予精確命名、分成有意義和有用 之類群
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