分子生物学

最大的细胞

在动物领域中，体积最大的细胞是鸵鸟的卵细胞（一般0.07m）；长度最长的是巨型乌贼的神经细胞（12m）；

在植物领域中，最长的单核细胞应该为苎麻的韧皮纤维细胞（0.5m），体积最大的细胞应该为蕨藻的核胞体（3m）。

综上所述，动植物领域中，

体积最大的单核细胞应该为鸵鸟的卵细胞；

体积最大的细胞应该为蕨藻的核胞体；

最长的应该是巨型乌贼的神经细胞。

起始甲硫氨酸与延伸甲硫氨酸的识别

蛋白质合成的启动：

起始于甲硫氨酸的参与，一个特殊的起始tRNA对所有蛋白质合成中起始氨基酸——甲硫氨酸的掺入负责，即tRNAiMet，细胞中只有两种tRNA可以携带甲硫氨酸，把另外一种携带甲硫氨酸掺入到蛋白质内部的tRNA写作tRNAMet。但是只有一种甲硫氨酰-tRNA合成酶参与了这两种甲硫氨酰-tRNA的合成。对这两种甲硫氨酰-tRNA的识别是由参与蛋白质合成的起始和延伸因子决定的，起始因子识别tRNAiMet，延伸因子识别tRNAMet。

原核细胞中AUG的识别

细菌的mRNA通常含有一段富含嘌呤碱基的序列，现被称作SD序列，它们通常在起始AUG 序列上游10个碱基左右的位置，能与细菌16S核糖体RNA 3’端的7个嘧啶碱基进行碱基互补性的识别，以帮助从起始AUG处开始翻译。原核细胞中，有一种特异的甲酰化酶，能够使得tRNAiMet中的氨基发生甲酰化，这样可使得参与起始的tRNAiMet不参与肽链的延伸过程。甲酰甲硫氨酸，起始AA-tRNA为fMet-tRNAfMet

真核细胞中AUG的识别

在真核生物的mRNA中，最靠近5’端的AUG序列通常是起始密码。核糖体小亚基首先结合在mRNA的5’端，然后向3’端移动，直到AUG序列被tRNAiMet上的反密码子识别。这种识别为类似GCCGCCpurCCAUGG这样序列所加强。起始AA-tRNA为Met-tRNAMet

蛋白质合成的过程

(一)氨基酸的活化

(二)翻译的起始

原核生物（细菌）为例：

所需成分：

30S小亚基、50S大亚基、模板mRNA、

fMet-tRNAfMet、GTP、Mg2+

翻译起始因子：IF-1、IF-2、IF-3、

(三)肽链的延伸

肽链延伸由许多循环组成，每加一个氨基酸就是一个循环，每个循环包括：AA-tRNA与核糖体结合、肽键的生成和移位。

延伸因子(elongation factor, EF) ：

原核生物：EF-T (EF-Tu, EF-Ts), EF-G

真核生物：EF-1 、EF-2

肽链的终止

(五)蛋白质前体的加工

两个半胱氨酸-SH -- -SH 二硫键

特定氨基酸的修饰

磷酸化、糖基化、甲基化、乙基化、羟基化和羧基化

切除新生肽链中非功能片段

概念

Motif(基序)

定义：在许多蛋白质中，有两个或三个具有二级结构的肽段在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，称为基序。他们是二级结构有序的组合体。它们可直接作为三级结构的“建筑块”或结构域的组成单位，是蛋白质发挥特定功能的基础。

分类：

螺旋/转角/螺旋（Helix-turn-helix,HTH）基序

锌指(Zinc finger)基序

亮氨酸拉链(Leucine-Zipper)基序

螺旋-环-螺旋(Helix-loop-Helix，HLHt)基序

（这几种都是反式作用因子与顺式作用元件相互作用时的特征结构）

Domain（结构域）

指在较大的蛋白质分子中形成的某些在空间上可以辨别的结构，往往是球状压缩区或纤维状压缩区。在结构上相对独立于蛋白分子的其他部位，有些结构域含有特殊的二级结构组合（motif）。

特点：

介于二级结构和三级结构之间的超二级结构具有部分生物学功能。

对于较小的蛋白质分子或亚基来说，结构域和它的三级结构往往是一个意思。

哺乳动物中，脂肪酸的合成需要七种不同的催化反应，这些反应则由一条多肽链的七个结构域来完成。

亚基

1）蛋白质的最小共价单位。由一条多肽链或以共价键

连接在一起的几条多肽链组成。

(2)寡蛋白质的功能单位；大分子的亚结构，如细菌70S核

蛋白体中的30S或50S亚基。

基序，结构域，亚基之间的关系

基序是结构域的组成单位，有些结构域具有部分生物学功能，是介于二级结构与三级结构的超二级结构。

亚基是寡蛋白结构和功能的单位，一个亚基可能含有几个结构域。

我们姑且可以认为：基序，结构域，亚基之间的关系为包含关系，由低到高。

硒半胱氨酸和吡咯赖氨酸（21,22号氨基酸）

疏水作用

Define：

Substances characterized by a positive Gibbs energy of transfer from a nonpolar to a polar solvent are called hydrophobic.

However, when many solute molecules cluster together, fewer (albeit larger) cages are required and more solvent molecules are free to move. The net effect increase in entropy of the system. This increase in entropy of the solvent is large enough to render spontaneous the association of hydrophobic molecules in a polar solvent.

The increase in entropy that results from fewer structural demands on the solvent placed by the clustering of nonpolar molecules is the origin of the hydrophobic interaction, which tends to stabilize groupings of hydrophobic groups in micelles and biopolymers.

表观遗传调控----DNA 甲基化（methylation）

Genetics : The branch of biology that deals with heredity, especially the mechanisms of hereditary transmission and the variation of inherited characteristics among similar or related organisms.

Epigenetics is the study of heritable changes in phenotype (appearance) or gene expression caused by mechanisms other than changes in the underlying DNA sequence.

Genotype：identical Phenotype：different

表观遗传调控: 不涉及DNA序列改变，可随细胞分裂稳定保持的基

因表达调控方式。