蛋白质组学与分析技术第一讲
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蛋白质组学与分析技术课程教学大纲
课程名称：蛋白质组学与分析技术
英文名称：Proteomics and its Analysis Technology
讲课课时：
百度文库
56
学分：3
教学目的和要求
教学对象：中国农科院硕士研究生 知识背景：要求选修该课的学生基本掌握有关生 物化学、分子生物学、普通生物学等相关农业学 科的基本理论及实验方法。 目的：通过农业蛋白质应用技术与实践学习掌握 蛋白质组学的基本概念和学习了解蛋白质组学的 现代分析技术。 要求：通过课程的学习要求选修课程的学生熟知 和掌握一个以上的蛋白质组学的分析技术及方法， 促进蛋白质分析技术在今后研究生科研工作中的 运用。
第十章 基因敲除和RNA干扰技术在蛋白质组学中应用
一、基因敲除的原理 二、基因敲除技术的分析与应用 三、RNA干扰原理 四、 RNA干扰技术的分析与应用
第十一章 蛋白质表达系统的建立及应用
一、各种蛋白质表达系统及其特点 二、在大肠杆菌中表达蛋白 三、问题探讨 四、蛋白质在植物中的表达
第六章PCR 技术在蛋白质组学中的应用
一、PCR的发展概况 二、PCR技术的基本原理 三、PCR的反应动力学 四、PCR扩增产物 五、PCR循环的主要参数 六、PCR相关技术
第七章 基因文库与cDNA文库在蛋白质中的应用
一、基因文库 二、基因文库的分析方法与技术 三、cDNA文库 四、cDNA文库的分析方法与技术
第十二章 蛋白质结构与功能解析
一、蛋白质结构与功能分析 二、蛋白质结构研究的历史回顾 三、蛋白质结构与功能研究的国内外现状 四、蛋白质单晶的培养 五、生物大分子结构的测定 六、蛋白质结构研究的最新方法
参考书
1、《蛋白质组学导论》 [美] D. C. 利布莱尔. 科学出版社 2、《蛋白质化学与蛋白质组学》. 夏其昌，曾嵘. 科学出版社 3、《蛋白质结构分析：制备、鉴定与微量测定.》[德]RM 坎普. 科学出版社 4、蛋白质与蛋白质组学实验指南》（影印版）. [澳]R.J. 辛普森 5、《蛋白质组学》 [中] 钱小红 贺福初. 科学出版社 6、《蛋白质组学原理》 [英] 特怀曼. 化学工业出版社 7、《药物研究中的蛋白质组学》 [美]哈马驰 科学出版社 8、《植物基因组学与蛋白质组学》 [英] 卡利斯 化学工业出版社 9、《基因组学、蛋白质组学与疫苗》 [意] 格兰迪 10、《药物蛋白质组学》 [中] 郭葆玉 人民卫生出版社 11、《基因组研究手册基因组学、蛋白质组学、代谢组学、信息生物学、伦 理学和法律问题》 [加拿大] 森森 科学出版社 12、《蛋白质与蛋白质组学：生命科学新视野2》 [英] 索伦森 科学出版社 13、《Bayesian Inference for Gene Expression and Proteomics基因表达与 蛋白质组学贝氏分析》 Marina Vannucci 14、《蛋白质生物农药》 [中] 邱德文等. 科学出版社
课程重点与难点
教学方法与教学设备要求：课堂讲解及提问讨论， 多媒体教学与黑板书写相结合 重点： 讲授蛋白质组学的基本理论所涉及的研究 内容（蛋白质分离纯化及制备）及分析技术（蛋 白质相互作用、液质联仪及蛋白质结构与功能的 分析技术）； 难点： 该课程内容多所设及的分析技术面广，有 关仪器设备难以普及， 实验费用比较高目前不能 安排相关试验课程， 所以有关内容比较抽象。
考试方式
课程论文： 20%，根据所学蛋白质组学的 概念和蛋白质组学在农业生产上的应用与 蛋白质组学的现代分析技术和研究方法结 合个人的科学研究或设想提出一个蛋白质 组学分析技术的科学研究技术路线和主要 研究内容。 平时成绩： 20%（课堂回答及出勤） 期末考试（笔试）： 60%
第八章 基因芯片技术在蛋白质组学中的应用
一、基因芯片技术及应用 二、基因芯片操作流程图 三、基因芯片操作实例
第九章 酵母双杂交技术在蛋白质组学中的应用
一、酵母双杂交的基本原理 二、酵母双杂交系统的应用 三、酵母双杂交体系的实验程序 四、酵母双杂交系统的优缺点 五、酵母双杂交技术应用的趋势及展望
课程内容：蛋白质组学主要讲授内容
第一章 蛋白质组学概念 一、蛋白质组学概念 二、蛋白质组学研究与分析技术特点 三、蛋白质组学研究目的和意义 四、蛋白质组学研究技术简介 五、蛋白质组学与分析技术课参考书
第二章 蛋白质分离和提取的技术与方法
一、蛋白质的分离技术 二、蛋白质样品的制备原则 三、从生物样品中抽提蛋白质时需要考虑 的几个因素 四、影响蛋白质纯化的因素 五、蛋白纯化技术 六、蛋白质的浓缩技术 七、蛋白质组学与分析技术课参考书
第五章 高效液相色谱和质谱联用仪在蛋 白质组学中的应用
一、高效液相色谱发展历史 二、高效液相色谱的仪器组成、应用及特点 三、样品的预处理技术 四、高效液相色谱法的固定相和流动相的选择 五、液相色谱法的蛋白质分离 六、高效液相色谱的定性分析 七、高效液相色谱在蛋白质研究中的应用 八、质谱（Mass Spectrometry，MS）
第三章 蛋白质电泳分析技术
一、蛋白电泳类型 二、2-DE电泳的蛋白样品制备技术 三、2-DE电泳技术 三、2-DE分离后的蛋白检测 四、蛋白质电泳图像分析 五、双向凝胶电泳面临的问题
第四章 蛋白质层析分析技术与方法
一、吸附层析（AdsorptionChromatography） 二、离子交换层析(Ion Exchange Chromatography，IEC) 三、 凝胶过滤层析(gel filtration chromatograpHy) 四、亲和层析(affinity chromatograpHy) 五、聚焦层析 (focusing chromatography) 六、蛋白质的分析制备 七、高效液相层析与质谱分析
课程名称：蛋白质组学与分析技术
英文名称：Proteomics and its Analysis Technology
讲课课时：
百度文库
56
学分：3
教学目的和要求
教学对象：中国农科院硕士研究生 知识背景：要求选修该课的学生基本掌握有关生 物化学、分子生物学、普通生物学等相关农业学 科的基本理论及实验方法。 目的：通过农业蛋白质应用技术与实践学习掌握 蛋白质组学的基本概念和学习了解蛋白质组学的 现代分析技术。 要求：通过课程的学习要求选修课程的学生熟知 和掌握一个以上的蛋白质组学的分析技术及方法， 促进蛋白质分析技术在今后研究生科研工作中的 运用。
第十章 基因敲除和RNA干扰技术在蛋白质组学中应用
一、基因敲除的原理 二、基因敲除技术的分析与应用 三、RNA干扰原理 四、 RNA干扰技术的分析与应用
第十一章 蛋白质表达系统的建立及应用
一、各种蛋白质表达系统及其特点 二、在大肠杆菌中表达蛋白 三、问题探讨 四、蛋白质在植物中的表达
第六章PCR 技术在蛋白质组学中的应用
一、PCR的发展概况 二、PCR技术的基本原理 三、PCR的反应动力学 四、PCR扩增产物 五、PCR循环的主要参数 六、PCR相关技术
第七章 基因文库与cDNA文库在蛋白质中的应用
一、基因文库 二、基因文库的分析方法与技术 三、cDNA文库 四、cDNA文库的分析方法与技术
第十二章 蛋白质结构与功能解析
一、蛋白质结构与功能分析 二、蛋白质结构研究的历史回顾 三、蛋白质结构与功能研究的国内外现状 四、蛋白质单晶的培养 五、生物大分子结构的测定 六、蛋白质结构研究的最新方法
参考书
1、《蛋白质组学导论》 [美] D. C. 利布莱尔. 科学出版社 2、《蛋白质化学与蛋白质组学》. 夏其昌，曾嵘. 科学出版社 3、《蛋白质结构分析：制备、鉴定与微量测定.》[德]RM 坎普. 科学出版社 4、蛋白质与蛋白质组学实验指南》（影印版）. [澳]R.J. 辛普森 5、《蛋白质组学》 [中] 钱小红 贺福初. 科学出版社 6、《蛋白质组学原理》 [英] 特怀曼. 化学工业出版社 7、《药物研究中的蛋白质组学》 [美]哈马驰 科学出版社 8、《植物基因组学与蛋白质组学》 [英] 卡利斯 化学工业出版社 9、《基因组学、蛋白质组学与疫苗》 [意] 格兰迪 10、《药物蛋白质组学》 [中] 郭葆玉 人民卫生出版社 11、《基因组研究手册基因组学、蛋白质组学、代谢组学、信息生物学、伦 理学和法律问题》 [加拿大] 森森 科学出版社 12、《蛋白质与蛋白质组学：生命科学新视野2》 [英] 索伦森 科学出版社 13、《Bayesian Inference for Gene Expression and Proteomics基因表达与 蛋白质组学贝氏分析》 Marina Vannucci 14、《蛋白质生物农药》 [中] 邱德文等. 科学出版社
课程重点与难点
教学方法与教学设备要求：课堂讲解及提问讨论， 多媒体教学与黑板书写相结合 重点： 讲授蛋白质组学的基本理论所涉及的研究 内容（蛋白质分离纯化及制备）及分析技术（蛋 白质相互作用、液质联仪及蛋白质结构与功能的 分析技术）； 难点： 该课程内容多所设及的分析技术面广，有 关仪器设备难以普及， 实验费用比较高目前不能 安排相关试验课程， 所以有关内容比较抽象。
考试方式
课程论文： 20%，根据所学蛋白质组学的 概念和蛋白质组学在农业生产上的应用与 蛋白质组学的现代分析技术和研究方法结 合个人的科学研究或设想提出一个蛋白质 组学分析技术的科学研究技术路线和主要 研究内容。 平时成绩： 20%（课堂回答及出勤） 期末考试（笔试）： 60%
第八章 基因芯片技术在蛋白质组学中的应用
一、基因芯片技术及应用 二、基因芯片操作流程图 三、基因芯片操作实例
第九章 酵母双杂交技术在蛋白质组学中的应用
一、酵母双杂交的基本原理 二、酵母双杂交系统的应用 三、酵母双杂交体系的实验程序 四、酵母双杂交系统的优缺点 五、酵母双杂交技术应用的趋势及展望
课程内容：蛋白质组学主要讲授内容
第一章 蛋白质组学概念 一、蛋白质组学概念 二、蛋白质组学研究与分析技术特点 三、蛋白质组学研究目的和意义 四、蛋白质组学研究技术简介 五、蛋白质组学与分析技术课参考书
第二章 蛋白质分离和提取的技术与方法
一、蛋白质的分离技术 二、蛋白质样品的制备原则 三、从生物样品中抽提蛋白质时需要考虑 的几个因素 四、影响蛋白质纯化的因素 五、蛋白纯化技术 六、蛋白质的浓缩技术 七、蛋白质组学与分析技术课参考书
第五章 高效液相色谱和质谱联用仪在蛋 白质组学中的应用
一、高效液相色谱发展历史 二、高效液相色谱的仪器组成、应用及特点 三、样品的预处理技术 四、高效液相色谱法的固定相和流动相的选择 五、液相色谱法的蛋白质分离 六、高效液相色谱的定性分析 七、高效液相色谱在蛋白质研究中的应用 八、质谱（Mass Spectrometry，MS）
第三章 蛋白质电泳分析技术
一、蛋白电泳类型 二、2-DE电泳的蛋白样品制备技术 三、2-DE电泳技术 三、2-DE分离后的蛋白检测 四、蛋白质电泳图像分析 五、双向凝胶电泳面临的问题
第四章 蛋白质层析分析技术与方法
一、吸附层析（AdsorptionChromatography） 二、离子交换层析(Ion Exchange Chromatography，IEC) 三、 凝胶过滤层析(gel filtration chromatograpHy) 四、亲和层析(affinity chromatograpHy) 五、聚焦层析 (focusing chromatography) 六、蛋白质的分析制备 七、高效液相层析与质谱分析