DNA琼脂糖凝胶电泳分析
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤
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DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤DNA的琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,用于分析DNA 的大小和纯度,以及进行DNA分子的分离和纯化。
凝胶电泳实验可以帮助我们确定DNA样本的大小和获得纯化的DNA片段供进一步研究使用。
下面是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的原理和操作步骤。
【原理】DNA琼脂糖凝胶电泳是根据DNA分子在电场中的不同迁移速率来分离大小不同的DNA片段。
琼脂糖凝胶是一种凝胶状物质,其孔隙大小能够将DNA分子限制在一定范围内,较大的DNA分子迁移速率较慢,而较小的DNA分子迁移速率较快。
琼脂糖凝胶通常是在平均浓度为1%至2%之间的范围内制备,以便在不同大小的DNA分子之间提供适当的分辨率。
实验中,DNA样品通过切割酶或PCR等方法获得,样品经过核酸电泳缓冲液稀释,并在琼脂糖凝胶板上进行电泳。
凝胶板两侧连接电源,DNA 的带电粒子将在电场的作用下从负极迁移到正极,迁移过程中形成DNA的“条带”,条带的位置和长度反映了DNA的大小。
通常,DNA条带由荧光染料或核酸染料标记,以便在电泳结束后进行可视化。
【操作步骤】以下是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的一般操作步骤:1.制备琼脂糖凝胶板:a.准备琼脂糖粉末和核酸电泳缓冲液(通常为TAE或TBE缓冲液)。
b.按照说明书将琼脂糖粉末溶解于核酸电泳缓冲液中。
c.将溶液加热至沸腾并搅拌,使琼脂糖完全溶解。
d.将溶液倒入预先准备好的电泳仓中,插入梳子或制备好的孔板,使其凝固。
2.样品制备:a.提取DNA样品并测定其浓度。
b. 将DNA样品稀释到适当浓度,通常为10-50 ng/μL。
c. 添加适当的加载缓冲液,通常是一些染料和甘胺酸(glycine)或其他添加剂。
3.DNA加载和电泳:a.打开琼脂糖凝胶仓盖,将DNA样品负载于凝胶孔内。
b.将DNA负载区域和样品标注在电泳仓中,以便在电泳结束后可以准确识别DNA带。
c.关闭盖子,将电泳仓放入电泳设备中。
生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理步骤试剂配制结果分析分析
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生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理步骤试剂配制结果分析分析DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物化学分离和分析方法,可以根据DNA片段的大小进行分离和鉴定。
它通过将DNA样品加载在琼脂糖凝胶孔隙中,利用电场的作用使DNA片段沿电场方向迁移,从而实现分离和鉴定。
以下是关于DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制和结果分析的详细解释。
原理:DNA琼脂糖凝胶电泳原理是根据DNA片段的大小和电荷来进行分离。
琼脂糖凝胶是一种大分子网状结构,DNA片段在凝胶中迁移时受到阻碍,较短的DNA片段能够比较快速地通过凝胶,而较长的DNA片段迁移速度较慢。
步骤:1.准备琼脂糖凝胶:将琼脂糖粉溶解在缓冲液中,加热,混合均匀后倒入电泳槽。
插入槽糖待凝固。
2.准备DNA样品:将待测的DNA样品加入到琼脂糖样品缓冲液中。
可加入染料以便可视化DNA迁移。
3.加载DNA样品:将DNA样品缓冲液均匀地加载到琼脂糖凝胶孔隙中。
4.进行电泳:将电泳槽两端连接上电源,设定合适的电场强度和电泳时间,使DNA片段在凝胶中迁移。
5.可视化DNA片段:停止电泳后,将琼脂糖凝胶转移到紫外可视化仪中,或者使用DNA染料染色,然后观察和记录DNA片段的迁移位置。
试剂配制:1. 缓冲液(TAE缓冲液):配制1X TAE缓冲液的方法是将0.4 MTris(pH 8.0)、0.2 M醋酸和0.01 M EDTA混合,在加75 ml水至1 L,将该缓冲液与琼脂糖按比例混合。
2. DNA染料:可以使用SYBR Green I等DNA染料,按照厂家说明进行稀释。
结果分析:DNA琼脂糖凝胶电泳的结果主要通过观察和记录DNA片段的迁移位置来进行分析。
根据DNA片段的大小,可以判断不同样品中的DNA片段是否存在,或者根据已知大小的DNA片段作为标记物,来确定未知DNA片段的大小。
通常,较小的DNA片段迁移得更快,迁移距离较大,而较大的DNA片段迁移得更慢,迁移距离较短。
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
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3. 加样
• 将DNA样品(5ul)与6 × 上样缓冲液(1ul) 混匀后, 用微量加样枪小心加入样 品孔内。
– 注意加样枪的枪头不可插入 过深,以免刺穿凝胶,导致 样品外溢。
• 每加完一个样品要更换枪 头,以防止EB污染。电泳
• 接通电源,一般红色为正极,黑色为负极,切 记DNA样品由负极往正极泳动(靠近加样孔的 一端为负),电压为5 V/cm(长度以两个电极 之间的距离计算)
• 此外,还可以从电泳后的凝胶中回收特定的 DNA条带,用于以后的克隆操作。
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
电泳指示剂:
• 核酸电泳常用的指示剂有两种 – 溴酚蓝( bromophenol blue, Bb ); – 二甲苯青( xylene cyanol, Xc ), 它携带的电荷量比溴酚蓝少,在凝 胶中的迁移率比溴酚蓝慢
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
• 银染色
– 银染色液中的银离子(Ag+)可与核酸形 成稳定的复合物,然后用还原剂如甲 醛使Ag+还原成银颗粒,可把核酸电泳 带染成黑褐色。
– 主要用于聚丙烯酰胺凝胶电泳染色, 也用于琼脂糖凝胶染色。
– 灵敏度比EB高200倍,但银染色后, DNA不宜回收
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
• 根据指示剂泳动的位置,判断是否终止电泳 当溴酚蓝染料移动到距凝胶前沿1~2cm处,
停止电泳
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
5. 结果观察
• 电泳结束后,将凝胶板取出。 在紫外仪上观察电泳带及其位 置,记录实验结果。
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
注意事项
1、 倒胶时把握好胶的温度,不要高于60℃ ,否 则温度太高会使制板变形;
• 采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分子筛的作用下, 使分子大小和构象不同的核酸分子泳动率出现较大的差异,从而 达到分离核酸片段检测其大小的目的。
dna琼脂糖凝胶电泳实验报告
![dna琼脂糖凝胶电泳实验报告](https://img.taocdn.com/s3/m/a75e24996e1aff00bed5b9f3f90f76c661374cdf.png)
dna琼脂糖凝胶电泳实验报告DNA琼脂糖凝胶电泳实验报告引言:DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学实验技术,用于分离和分析DNA 分子。
本实验旨在通过琼脂糖凝胶电泳技术,对DNA分子进行分离和鉴定,以便更好地了解DNA的结构和功能。
实验材料和方法:实验所需的材料包括琼脂糖凝胶、DNA标准品、DNA样品、缓冲液和电泳仪等。
首先,我们制备了琼脂糖凝胶,然后将DNA标准品和待测DNA样品与DNA加载缓冲液混合。
接下来,将混合液注入琼脂糖凝胶槽中,并进行电泳。
实验结果:经过电泳后,我们观察到琼脂糖凝胶上出现了一系列DNA条带。
根据标准品的条带迁移距离,我们可以推断出待测DNA样品的分子大小。
通过比较待测样品与标准品的条带迁移距离,我们可以进一步确定待测样品中的DNA分子的大小。
讨论:琼脂糖凝胶电泳是一种基于DNA分子大小的分离技术。
在琼脂糖凝胶中,DNA 分子会受到凝胶孔隙的阻碍,较大的DNA分子迁移速度较慢,而较小的DNA分子则迁移速度较快。
通过测量DNA分子的迁移距离,我们可以推断出其分子大小。
在实验中,我们使用了DNA标准品作为参照物,通过标准品的迁移距离,我们可以建立一个标准曲线,从而对待测样品中的DNA分子大小进行估计。
这种方法可以应用于DNA样品的定性和定量分析。
需要注意的是,琼脂糖凝胶电泳实验的结果受到多种因素的影响,如琼脂糖凝胶浓度、电场强度和电泳时间等。
因此,在进行实验时,我们需要控制这些因素,以确保实验结果的准确性和可靠性。
结论:通过DNA琼脂糖凝胶电泳实验,我们成功地分离和鉴定了DNA分子。
这项实验为我们进一步研究DNA的结构和功能提供了基础。
同时,琼脂糖凝胶电泳技术也广泛应用于生物医学研究、法医学和遗传学等领域,为科学研究和医学诊断提供了重要的工具和方法。
总结:DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的DNA分离和鉴定技术。
通过电泳实验,我们可以分离不同大小的DNA分子,并通过测量其迁移距离来推断其分子大小。
DNA质量与浓度的琼脂糖凝胶电泳法测定试验原理
![DNA质量与浓度的琼脂糖凝胶电泳法测定试验原理](https://img.taocdn.com/s3/m/a2c64c67443610661ed9ad51f01dc281e43a567c.png)
在进行琼脂糖凝胶电泳时,应保证样品中DNA的质量浓度在一定范围内,以确保实验结果 的准确性和可靠性。
04 琼脂糖凝胶电泳法的操作 步骤
琼脂糖凝胶的制备
遗传病筛查
通过分析患者的基因组DNA,可 以诊断遗传性疾病,预测遗传风险。
个体化医疗
随着基因组学和分子生物学的发展, 琼脂糖凝胶电泳在个体化医疗领域 的应用前景广阔,如肿瘤诊断和治 疗、药物反应预测等。
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操作简便
该方法操作简单,易于掌握,适合于实验室常规应用。
适用范围广
琼脂糖凝胶电泳法可用于各种DNA样品的检测,如PCR 产物、基因组DNA等。
直观性
通过染色或荧光染料染色,可以直接观察DNA条带的位 置和大小,方便对结果进行判断。
缺点
易受DNA样品纯度的影响
检测灵敏度较低
琼脂糖凝胶电泳法对于DNA样品的纯度要 求较高,如果样品中含有蛋白质、RNA等 杂质,会影响电泳结果。
01
DNA分子在琼脂糖凝胶中迁移时 受到电场的作用,由于DNA分子 具有负电荷,因此会向正极方向 迁移。
02
DNA分子的迁移速率与DNA的大 小、构象和浓度等因素有关。较 小的DNA片段在凝胶中迁移较快 ,而较大的DNA片段则迁移较慢 。
DNA质量与浓度的关系
DNA的质量浓度是指单位体积中DNA分子的数量,通常以ng/μL或pg/μL表示。
分光光度法
总结词
利用DNA在280nm处的紫外吸收峰, 可以测定DNA的浓度。
琼脂凝胶实验报告
![琼脂凝胶实验报告](https://img.taocdn.com/s3/m/d0add2690a4c2e3f5727a5e9856a561253d32140.png)
实验名称:DNA琼脂糖凝胶电泳实验日期:2023年10月25日实验目的:1. 学习并掌握DNA琼脂糖凝胶电泳的基本原理和操作步骤。
2. 通过电泳分离不同分子量的DNA片段,观察并分析实验结果。
3. 了解DNA分子在琼脂糖凝胶中的迁移规律,并探讨影响迁移速度的因素。
实验原理:DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,用于分离、鉴定和定量DNA片段。
DNA分子在电场中带有负电荷,在琼脂糖凝胶的筛分作用下,根据分子大小和构型不同,迁移速度不同,从而实现分离。
溴化乙锭(EB)作为一种荧光染料,可以嵌入DNA分子中,在紫外光照射下发出橙红色荧光,便于观察DNA片段的位置和大小。
实验材料与仪器:- 仪器:电泳仪、紫外检测仪、水平电泳槽、移液器、一次性手套等。
- 试剂:琼脂糖、EB溶液、Tris-硼酸-EDTA缓冲液、加样缓冲液等。
- 材料:分子量不同的DNA片段。
实验步骤:1. 琼脂糖凝胶的制备:- 称取1g琼脂糖,加入10ml电泳缓冲液,再加入90ml蒸馏水,在电炉上加热溶解,配制成1%琼脂糖凝胶。
- 待凝胶冷却至60-70℃时,加入数滴EB溶液,混匀。
2. DNA样品的制备:- 将DNA片段用Tris-硼酸-EDTA缓冲液稀释至适当浓度。
3. 加样:- 将制备好的琼脂糖凝胶倒入电泳槽中,插入电泳梳子。
- 使用移液器将DNA样品加至凝胶孔中。
4. 电泳:- 将电泳槽放入电泳仪中,设定合适的电压和时间进行电泳。
5. 观察与分析:- 电泳完成后,取出凝胶,用紫外检测仪观察DNA片段的迁移情况。
- 比较不同分子量DNA片段的迁移速度,分析实验结果。
实验结果:- 通过电泳观察到,不同分子量的DNA片段在琼脂糖凝胶中迁移速度不同,分子量越小,迁移速度越快。
- EB染料嵌入DNA分子后,在紫外光照射下呈现橙红色荧光,便于观察DNA片段的位置和大小。
讨论:1. 影响DNA分子迁移速度的因素主要有:分子大小、构型、电场强度、凝胶浓度等。
DNA的琼脂糖凝胶电泳DNA实验技术方法
![DNA的琼脂糖凝胶电泳DNA实验技术方法](https://img.taocdn.com/s3/m/44b0388fdb38376baf1ffc4ffe4733687f21fc45.png)
DNA的琼脂糖凝胶电泳DNA实验技术方法琼脂糖凝胶电泳(Agarose gel electrophoresis)是一种常用的分离和分析DNA分子的技术方法。
本文将对DNA的琼脂糖凝胶电泳实验技术方法进行详细介绍。
1.原理琼脂糖凝胶电泳是一种基于DNA分子大小的分离方法。
DNA分子在电场的作用下,由于带负电荷,会向阳极移动。
由于琼脂糖凝胶的孔径不同,不同大小的DNA分子会被琼脂糖凝胶所阻碍,大分子相对较慢,小分子相对较快地通过凝胶孔隙。
通过电泳,可以将不同大小的DNA分子分离开来,形成一条条带状。
2.实验步骤(1)制备琼脂糖凝胶:将适量的琼脂糖加入1×TAE缓冲液中,加热溶解,冷却至约60℃时加入适量的乙溴酸溶液,振荡均匀后倒入电泳槽中,插入梳子形成孔洞。
(2)样品制备:将待测DNA溶解在缓冲液中(常用缓冲液为1×TBE或1×TAE),加入适量的显色剂(如溴化乙锭),混合均匀。
(3)装料和电泳:将样品倒入琼脂糖凝胶的样品槽中,注意避免气泡的产生。
将电泳槽连接电源,接通电源,设定适当的电压(通常为100-150V)进行电泳。
(4)分析结果:电泳结束后,关闭电源,取出凝胶,放入紫外光透射仪中观察凝胶上的DNA带状条带,并进行照相或记录。
3.实验注意事项(1)凝胶制备:凝胶溶液要充分均匀,避免不均匀分布造成的电泳结果不准确。
(2)样品制备:样品在加入缓冲液中时要充分混匀,避免DNA在样品中的不均匀性造成的电泳结果不准确。
(3)电泳条件:电泳条件包括电压、时间、缓冲液等。
较高的电压可以加快电泳速度,但会产生较多的带展平现象。
合适的电压应根据实验需要调整。
(4)结果分析:在紫外光透射仪下观察DNA带状条带时,要小心操作,避免DNA样品受到过长时间的紫外线照射。
4.应用领域琼脂糖凝胶电泳广泛应用于分离和分析DNA分子。
常见的应用领域包括:DNA片段的分子量测定、PCR产物分析、DNA测序结果的验证、突变检测等。
琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA
![琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA](https://img.taocdn.com/s3/m/bc5f9e213169a4517723a30e.png)
琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳是用琼脂或琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。
对于分子量较大的样品,如大分子核酸、病毒等,一般可采用孔径较大的琼脂糖凝胶进行电泳分离。
琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广,尤其适于分离大片段DNA。
普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用脉冲电泳,可分离高达10^7bp的DNA片段。
琼脂糖凝胶电泳操作流程准备干净的配胶板和电泳槽注意DNA酶污染的仪器可能会降解DNA,造成条带信号弱、模糊甚至缺失的现象。
选择电泳方法一般的核酸检测只需要琼脂糖凝胶电泳就可以;如果需要分辨率高的电泳,特别是只有几个bp的差别应该选择聚丙烯酰胺凝胶电泳;用普通电泳不合适的巨大DNA链应该使用脉冲凝胶电泳。
注意巨大的DNA链用普通电泳可能跑不出胶孔导致缺带。
正确选择凝胶浓度对于琼脂糖凝胶电泳,浓度通常在0.5~2%之间,低浓度的用来进行大片段核酸的电泳,高浓度的用来进行小片段分析。
低浓度胶易碎,小心操作和使用质量好的琼脂糖是解决办法。
注意高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。
适合的电泳缓冲液常用的缓冲液有TAE和TBE,而TBE比TAE有着更好的缓冲能力。
电泳时使用新制的缓冲液可以明显提高电泳效果。
注意电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,PH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。
电泳的合适电压和温度电泳时电压不应该超过20V/cm,电泳温度应该低于30℃,对于巨大的DNA 电泳,温度应该低于15℃。
注意如果电泳时电压和温度过高,可能导致出现条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。
特别是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象DNA样品的纯度和状态是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象DNA样品的纯度和状态注意样品中含盐量太高和含杂质蛋白均可以产生条带模糊和条带缺失的现象。
琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告
![琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告](https://img.taocdn.com/s3/m/a609739fa48da0116c175f0e7cd184254b351b3d.png)
琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验报告。
实验目的,通过琼脂糖凝胶电泳技术检测DNA分子的大小和数量,以验证DNA的提取和纯度。
实验材料与方法:1. 实验材料,琼脂糖凝胶、TAE缓冲液、DNA样品、DNA分子量标准品、电泳槽、电泳仪等。
2. 实验步骤:a. 制备琼脂糖凝胶,按照比例将琼脂糖和TAE缓冲液混合煮沸后倒入电泳槽中,待凝固后形成琼脂糖凝胶。
b. 样品处理,将待测DNA样品加入适量的载体溶液,并在65°C水浴中恒温30分钟。
c. 电泳操作,将处理后的DNA样品和DNA分子量标准品加载至琼脂糖凝胶孔中,进行电泳操作。
实验结果与分析:经过琼脂糖凝胶电泳检测,观察到DNA样品在电场作用下向阳极迁移,形成明显的DNA条带。
通过对DNA条带的位置和长度进行分析,可以初步判断DNA的大小和纯度。
同时,与DNA分子量标准品进行比对,可以更准确地确定DNA的分子量。
实验结论:本次实验通过琼脂糖凝胶电泳技术成功检测了DNA样品的大小和纯度,验证了DNA的提取和纯度。
实验结果为后续的分子生物学研究提供了重要的数据支持。
实验注意事项:1. 实验过程中需注意琼脂糖凝胶的制备和电泳操作的细节,保证实验结果的准确性。
2. 实验后要及时清洗和消毒实验器材,保持实验环境的整洁和卫生。
实验改进方向:1. 可以尝试不同浓度的琼脂糖凝胶和不同电泳条件,寻找更适合本实验的操作参数。
2. 可以尝试其他DNA检测技术,与琼脂糖凝胶电泳技术进行对比,寻找更准确、高效的检测方法。
总结:琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验是分子生物学实验中常用的技术手段,通过本次实验的学习和实践,对该技术有了更深入的了解,并为今后的科研工作打下了坚实的基础。
希望通过不断的实验探索和改进,能够为科学研究做出更大的贡献。
以上为琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验报告内容,如有不足之处,欢迎指正。
琼脂糖凝胶电泳 实验报告
![琼脂糖凝胶电泳 实验报告](https://img.taocdn.com/s3/m/9eb17a96b04e852458fb770bf78a6529647d35f4.png)
琼脂糖凝胶电泳实验报告琼脂糖凝胶电泳实验报告引言:琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和分析生物大分子的方法。
它基于琼脂糖凝胶的孔隙大小,通过电场作用下分离样品中的不同分子。
本实验旨在通过琼脂糖凝胶电泳技术,分离并分析DNA样品中的不同片段。
实验材料与方法:1. 实验材料:-琼脂糖凝胶:用于制备凝胶基质,提供分离分子的孔隙。
-缓冲液:用于维持凝胶的pH值和离子浓度稳定。
-DNA样品:包含待分离的DNA片段,可通过PCR扩增获得。
2. 实验步骤:(1)制备琼脂糖凝胶:将适量琼脂糖加入缓冲液中,加热搅拌至溶解,待冷却至大约60℃时,倒入凝胶模具中,插入梳子,待凝胶完全固化后,取出梳子。
(2)样品处理:将待分离的DNA样品与DNA加载缓冲液混合,加热至95℃,使DNA变性,然后迅速冷却至室温。
(3)电泳分离:将凝胶模具放入电泳槽中,加入足够的缓冲液,将DNA样品加入凝胶孔中,连接电源,施加适当电压,进行电泳分离。
结果与讨论:经过电泳分离后,我们观察到琼脂糖凝胶上出现了一系列DNA条带。
这些条带的迁移距离与DNA片段的大小成反比,即较小的片段迁移距离较远,较大的片段迁移距离较短。
实验结果的解释可以通过琼脂糖凝胶电泳的原理来理解。
琼脂糖凝胶的孔隙大小决定了不同大小的DNA片段在凝胶中的迁移速度。
较小的DNA片段能够更容易通过凝胶孔隙,因此迁移距离较远;而较大的DNA片段则受到凝胶孔隙的限制,迁移距离较短。
通过对DNA条带的大小和形状进行分析,我们可以获得关于DNA样品的重要信息。
例如,我们可以确定样品中是否存在特定的DNA片段,或者在PCR扩增中是否成功地放大了目标片段。
总结:琼脂糖凝胶电泳是一种简单而有效的生物大分子分离和分析方法。
通过电泳分离DNA样品,我们可以快速获得关于样品中DNA片段的信息。
这种技术在分子生物学、遗传学等领域有着广泛的应用,对于研究和诊断基因相关的疾病具有重要意义。
在今后的研究中,我们可以进一步探索琼脂糖凝胶电泳的应用,并结合其他分析技术,提高实验的准确性和灵敏度。
dna琼脂糖凝胶电泳
![dna琼脂糖凝胶电泳](https://img.taocdn.com/s3/m/a6574d0f30126edb6f1aff00bed5b9f3f90f72cd.png)
DNA琼脂糖凝胶电泳介绍DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物技术实验方法,用于分离DNA分子并确定其大小。
它基于DNA分子的电荷和大小不同,通过应用电场使DNA分子在琼脂糖凝胶中迁移,从而实现分离。
原理DNA琼脂糖凝胶电泳的基本原理是:DNA分子带负电荷,当置于电场中后,电场将使DNA分子向正电极移动。
然而,DNA分子在琼脂糖凝胶中的迁移速度取决于它的大小。
较长的DNA分子由于受阻力较大,迁移速度较慢,而较短的DNA分子迁移速度较快。
因此,琼脂糖凝胶电泳可以将DNA分子根据大小进行分离。
实验步骤1. 样品处理将待测DNA样品与凝胶电泳缓冲溶液混合,并加入负荷样品的染料来增加样品的重量和使其可见。
一般使用表现著名的溴化乙锭(Ethidium Bromide)来染色DNA分子。
2. 准备琼脂糖凝胶制备琼脂糖凝胶液,并根据实验需要将其倒入电泳槽中,并形成一个凝胶。
此过程需要使用琼脂糖凝胶制备缓冲液,一般为Tris–醋酸–EDTA缓冲液,简称TAE缓冲液。
3. 样品加载使用微量吸管或特殊的样品加载微孔将样品加载到琼脂糖凝胶上。
每个微孔能够承载一定量的样品,因此要根据样品的数量进行安排。
通常还会在凝胶上加载一个DNA分子大小标记(Marker)作为参考,以便确定未知样品的大小。
4. 电泳将凝胶放入电泳槽中,并将正负电极接入电源。
通过给定的电流和时间来进行电泳实验。
电流的选择取决于琼脂糖凝胶的密度和样品的大小范围。
5. 可视化和分析凝胶电泳完成后,通过紫外线照射或荧光成像系统来观察结果。
DNA分子在凝胶上能够与染料结合产生发光,从而可在琼脂糖凝胶上看到DNA分子的大小分布。
通过与已知DNA分子大小标记的对比,可以确定未知样品DNA分子的大小。
应用领域1. 分子生物学在分子生物学研究中,DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的手段。
它可以用于检测DNA分子的大小、评估PCR反应的效果、验证基因敲除和插入等分子操作的成功性等。
DNA琼脂糖凝胶电泳分析报告
![DNA琼脂糖凝胶电泳分析报告](https://img.taocdn.com/s3/m/ac205ff4ac51f01dc281e53a580216fc700a5322.png)
DNA琼脂糖凝胶电泳分析报告
DNA 凝胶电泳是用于分析检测 DNA 分子大小的生物化学分析方法,它可以用来比较
和筛选 DNA 样品。
它是一种分子遗传学研究的非常有用的技术,它可以检测到变异位点,以及不同样品之间 DNA 分子大小分布的差异。
DNA 凝胶电泳使用凝胶分离 DNA 胺基酸、核苷酸和外源 DNA 等其他分子,它可以在
短时间内产生准确的结果,是一种常用的实验方法。
由于 DNA 的电荷特性,当 DNA 从静
电场中移动时,它将分离成带电和不带电的不同分子,这就是用凝胶进行 DNA 分离的原理。
DNA 凝胶糖凝胶电泳通常使用琼脂糖凝胶来分离特定的 DNA 分子。
琼脂糖凝胶是一
种温和的添加剂,它可以减小电泳淤积,使 DNA 分子从膜上被吸附,从而更快地被分离
出来。
此外,琼脂糖凝胶还能够稳定化学反应,使 DNA 分子得到更好的保护,减少 DNA
的降解反应。
DNA 凝胶糖凝胶电泳在分子生物学实验中被广泛使用,以表达 DNA 片段大小,比较
和检测 DNA 样品之间的差异,提取和测量 DNA 片段,识别多态性,以及复制和定位 DNA 片段等。
DNA 凝胶糖凝胶电泳的数据显示,DNA 分子的大小可以用来确定正确的 DNA 分
子类型和多态性,并且能够说明各样品之间 DNA 分子的差异情况,因此有助于医学研究
等多种领域的发展。
简述dna琼脂糖凝胶电泳的原理及其应用
![简述dna琼脂糖凝胶电泳的原理及其应用](https://img.taocdn.com/s3/m/55c64f8609a1284ac850ad02de80d4d8d15a0103.png)
简述DNA琼脂糖凝胶电泳的原理及其应用1. 原理DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和分析DNA分子的方法。
它基于DNA分子在电场中的迁移速率与其分子大小的关系,通过在琼脂糖凝胶中进行电泳实验,将DNA分子按照大小进行分离。
在DNA琼脂糖凝胶电泳中,首先将琼脂糖粉末溶解成一定浓度的琼脂糖溶液,并加热使其溶解。
然后,将溶液浸泡在凝胶模板中,在溶液凝固前加入合适的电泳缓冲液。
凝胶模板通常是一个平板状的槽,中间有几个平行的凹槽,称为凝胶孔。
凝胶形成后,将待测的DNA样品混合与DNA加载缓冲液,并通过凝胶孔将混合物装入凝胶的孔中。
然后,将正负电极分别连接到凝胶上下两端的电泳缓冲液中,通过电极引导电场形成。
DNA分子会在电场的作用下从凝胶孔的上方向下迁移。
由于琼脂糖凝胶结构的特殊性质,DNA分子的迁移速率与其分子大小成反比,大分子迁移较慢,小分子迁移较快。
经过一段时间的电泳,DNA分子会在凝胶中形成一个带状分布。
根据DNA在凝胶中迁移的位置,可以判断DNA分子的大小。
通常,较小的DNA片段会迁移到凝胶的迁移前端,而较大的DNA片段会留在迁移过程中的后部。
可以根据这一原理进行DNA分子的定量分析和分离。
2. 应用DNA琼脂糖凝胶电泳广泛应用于分子生物学和遗传学研究中,具有以下几个主要的应用领域:2.1 DNA片段分析DNA琼脂糖凝胶电泳可以用于分析DNA的片段大小和含量。
通过在凝胶中电泳运行已知长度的DNA片段作为分子量标准,可以通过与这些标准片段对比,确定未知DNA片段的大小。
此外,通过测量不同片段在凝胶中的强度,可以估计DNA片段的相对含量。
2.2 基因型分析基因型通常由多个基因位点组成,每个位点上存在多个等位基因。
通过DNA琼脂糖凝胶电泳,可以将这些基因位点的DNA片段进行分离和分析。
通过比较样品与对照的电泳图谱,可以确定不同等位基因的存在与否,从而分析个体的基因型。
基因型分析在遗传学研究、法医学和疾病的分子诊断中具有重要作用。
琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告
![琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告](https://img.taocdn.com/s3/m/3c91a8bfc9d376eeaeaad1f34693daef5ef713b7.png)
琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验报告引言:DNA是生物体中的重要遗传物质,通过检测和分析DNA可以揭示生物体的遗传信息。
琼脂糖凝胶电泳是一种常用的DNA分析方法,本实验旨在通过琼脂糖凝胶电泳技术检测DNA样品的大小和纯度。
实验材料与方法:1. 实验材料:- DNA样品- DNA标准品- TBE缓冲液- 碱基对应的引物- DNA扩增反应体系- 琼脂糖凝胶- DNA电泳仪2. 实验方法:1) 准备琼脂糖凝胶:a. 取适量琼脂糖粉末加入TBE缓冲液中,搅拌均匀。
b. 将混合液加热至溶解,然后冷却至室温。
c. 将琼脂糖凝胶液倒入电泳槽中,插入梳子,待凝固。
2) 准备DNA样品:a. 取DNA样品,加入适量的DNA扩增反应体系。
b. 在PCR仪中进行DNA扩增反应,得到待检测的DNA样品。
3) 进行电泳检测:a. 取一定量的DNA样品和DNA标准品,加入电泳槽中的样品槽。
b. 打开电泳仪,设定适当的电压和时间。
c. 开始电泳,观察DNA在琼脂糖凝胶中的迁移情况。
结果与讨论:通过琼脂糖凝胶电泳检测,我们可以观察到DNA样品在电场作用下在琼脂糖凝胶中的迁移情况。
根据DNA片段的大小,我们可以通过比较DNA样品与DNA标准品的迁移距离,确定DNA样品的大小。
在实验中,我们发现不同大小的DNA片段会以不同的速度迁移,较小的DNA片段迁移速度较快,较大的DNA片段迁移速度较慢。
这是因为琼脂糖凝胶的孔径大小会影响DNA片段的迁移速度,较小的孔径会使DNA片段迁移速度变慢。
此外,我们还可以通过观察琼脂糖凝胶中DNA样品的带状图案来评估DNA样品的纯度。
如果带状图案清晰且无杂带,说明DNA样品较纯;而如果带状图案模糊或有多个杂带,说明DNA样品可能存在杂质或降解。
总结:琼脂糖凝胶电泳是一种常用的DNA分析技术,通过观察DNA片段在琼脂糖凝胶中的迁移情况,我们可以确定DNA样品的大小和纯度。
这种技术在生物学研究和医学诊断中具有重要意义,可以帮助科学家们更好地理解生物体的遗传信息。
琼脂糖凝胶电泳实验报告
![琼脂糖凝胶电泳实验报告](https://img.taocdn.com/s3/m/735e1d4311a6f524ccbff121dd36a32d7275c75e.png)
琼脂糖凝胶电泳实验报告一、实验目的琼脂糖凝胶电泳是分子生物学实验中常用的技术之一,其目的主要包括以下几个方面:1、分离和鉴定 DNA 片段:通过电泳可以将不同大小的 DNA 片段在琼脂糖凝胶中按照分子量大小进行分离,从而能够直观地观察到DNA 样品的组成和纯度。
2、检测 DNA 的质量:通过观察电泳图谱中 DNA 条带的亮度、清晰度和完整性,可以评估 DNA 样品的质量,判断是否存在降解、杂质污染等情况。
3、定量分析 DNA 浓度:结合已知浓度的 DNA 标准品,通过比较样品条带与标准品条带的亮度,可以对 DNA 样品的浓度进行大致的估算。
二、实验原理琼脂糖是一种从海藻中提取的线性多糖聚合物。
当琼脂糖溶液加热到沸点后冷却凝固,会形成网状的凝胶结构。
由于琼脂糖凝胶具有分子筛效应,DNA 分子在电场中会向正极移动,其迁移速度取决于 DNA 分子的大小和构象。
较小的 DNA 分子在凝胶中受到的阻力较小,迁移速度较快;较大的 DNA 分子受到的阻力较大,迁移速度较慢。
因此,不同大小的 DNA 分子在琼脂糖凝胶中会被分离成不同的条带。
在电泳过程中,通常使用溴化乙锭(EB)等荧光染料对 DNA 进行染色。
EB 能嵌入DNA 分子的碱基对之间,在紫外线照射下发出荧光,从而使 DNA 条带得以显现。
三、实验材料与设备1、实验材料DNA 样品:本次实验使用的是经过提取和纯化的λDNA 样品。
琼脂糖:选用高纯度的琼脂糖粉末。
电泳缓冲液:5×TBE 缓冲液(Tris硼酸EDTA),使用时稀释至1×TBE 工作液。
上样缓冲液(Loading Buffer):含有甘油、溴酚蓝等成分,用于增加样品密度,便于样品沉入加样孔,并指示电泳进程。
核酸染料:溴化乙锭(EB)溶液。
2、实验设备电泳仪:提供稳定的直流电源,用于产生电场。
水平电泳槽:放置琼脂糖凝胶,容纳电泳缓冲液。
凝胶成像系统:用于观察和拍摄电泳结果。
PCR产物的琼脂糖凝胶电泳分析
![PCR产物的琼脂糖凝胶电泳分析](https://img.taocdn.com/s3/m/7b85370668eae009581b6bd97f1922791688be9a.png)
PCR产物的琼脂糖凝胶电泳分析【实验目的】1.学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术;2.掌握群体遗传学基因频率与基因型频率的计算方法。
【实验原理】1. 凝胶电泳是分离、鉴定、纯化及制备DNA片段最常用的方法,可分为两类,一类是琼脂糖凝胶电泳,适用于l kb和大于l kb以上DNA;另一类是聚丙烯酰胺凝胶电泳,适用于小于l kb的DNA。
琼脂糖凝胶电泳是一种简便易行的分离、纯化和鉴定DNA片段的方法。
分为水平板和垂直板两种,一般采用水平电泳。
2. 琼脂糖凝胶在DNA分子泳动时兼有“分子筛”和“电荷”的双重作用。
3. DNA分子在碱性环境中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动。
4. 由于琼脂糖凝胶具有网络结构,因此电泳时,带电颗粒的分离速度不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小。
5. 由于实验中相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此他们能以同样的速度向正极移动。
6. 相对分子质量小者泳动快,大的泳动慢。
7. 溴化乙锭是分子生物学实验中常用的DNA荧光染料,含有一个可以嵌入DNA堆积碱基之间的一个三环平面基团,它与DNA的结合几乎没有碱基序列特异性。
DNA吸收254nm处的紫外辐射并传递给染料,被吸收的能量在可见光谱红橙区的590nm处重新发射出来。
溴化乙锭-DNA复合物的荧光产率比没有结合DNA的染料高出20-30倍。
所以当凝胶中含有游离的溴化乙锭(0.5μg/mL)时,可以检测到少至10ng的DNA条带8. TBE(成分:Tris,EDTA,硼酸,蒸馏水)的作用:a.稳定体系酸碱度(正负极氧化还原反应,使正极变酸、负极变碱性)b. 使溶液具有导电性,以利于DNA分子的迁移c. 其中的EDTA螯合镁离子,防止电泳时激活DNA酶9.引物二聚体: 引物二聚体是引物的3’端间相互错配扩增形成的。
引物二聚体的出现是必然的,只是或多或少的问题,电泳时看不到引物二聚体带也不代表没有二聚体出现,只是含量低我们的肉眼看不到而已。
琼脂糖凝胶电泳进行PCR结果分析
![琼脂糖凝胶电泳进行PCR结果分析](https://img.taocdn.com/s3/m/69cc1b0ce418964bcf84b9d528ea81c758f52e3e.png)
琼脂糖凝胶电泳进行PCR结果分析琼脂糖凝胶电泳是一种常用的PCR结果分析方法,它可以用来检测PCR扩增产物的大小和纯度。
在分子生物学研究中,琼脂糖凝胶电泳是非常重要的一步,因为它可以帮助研究人员确定PCR反应的成功与否,并分析PCR产物的质量。
首先,琼脂糖凝胶电泳电泳是一种以琼脂糖为基质的凝胶,通过电场作用将DNA分子在凝胶中进行分离的方法。
琼脂糖凝胶由琼脂糖和缓冲剂混合而成,再通过加热、冷却形成凝胶。
凝胶中的琼脂糖会形成一种网状结构,用来限制DNA分子的流动,使得不同大小的DNA分子能够分离开来。
在进行PCR结果分析时,首先需要将PCR反应产物与DNA标记物混合在一起。
DNA标记物通常是一种特定长度的DNA分子,可以用来作为参照物来确定PCR扩增产物的大小。
常用的DNA标记物有DNA ladder,它是一种包含了多个不同长度DNA片段的混合物。
在琼脂糖凝胶电泳中,DNA标记物会在电场作用下在琼脂糖凝胶中移动,并形成一个长度标记的图案。
将PCR反应产物和DNA标记物加载到琼脂糖凝胶槽中后,接通电源进行电泳。
电泳时间和电压需要根据实验需要进行调节,一般来说,电泳运行时间为30分钟至2小时,电压为50-150V。
在电泳结束后,需要对凝胶进行染色,以可视化DNA分子的位置。
常见的染色剂有乙溴化锂(EB)和SYBR Green。
这些染色剂可以与DNA分子结合并发出荧光,使得DNA分子能够被观察到。
染色后,凝胶通常在紫外光下进行观察和记录。
根据琼脂糖凝胶电泳的结果,可以进行PCR产物的大小和纯度分析。
通过与DNA标记物的比较,可以确定PCR扩增产物的大小范围。
如果PCR扩增产物的大小与预期一致,则说明PCR反应成功。
另外,通过观察PCR 产物带的强度,可以初步判断PCR产物的丰度和纯度。
高强度的PCR产物带通常表示PCR扩增产物的丰度高,纯度好,反之则表示存在杂交DNA或PCR扩增产物不纯的情况。
总之,琼脂糖凝胶电泳是一种常用的PCR结果分析方法,在分子生物学研究中具有重要的应用价值。
dna琼脂糖凝胶电泳
![dna琼脂糖凝胶电泳](https://img.taocdn.com/s3/m/75021872c950ad02de80d4d8d15abe23482f038a.png)
DNA琼脂糖凝胶电泳1. 简介DNA琼脂糖凝胶电泳(DNA agarose gel electrophoresis)是一种常用的分离和分析DNA片段的技术。
它利用琼脂糖凝胶作为分离介质,通过电场作用,将DNA片段按照大小进行分离。
这种技术广泛应用于基因测序、基因突变检测、DNA片段扩增等领域。
2. 原理DNA琼脂糖凝胶电泳的原理基于DNA的带负电荷特性和凝胶电泳的原理。
DNA分子是由带负电荷的核苷酸单元组成,当施加电场时,DNA会向阳极迁移。
琼脂糖凝胶是一种由聚糖组成的网状结构,可以形成孔隙,使得不同大小的DNA片段能够在凝胶中移动。
在琼脂糖凝胶中进行电泳时,首先需要制备琼脂糖凝胶。
通常使用琼脂糖粉末溶解在缓冲液中,并加热至溶解。
将溶解的琼脂糖倒入电泳槽中,并插入电泳槽两端的电极。
待琼脂糖凝固后,形成凝胶。
凝胶制备完成后,将待分析的DNA样品与DNA加载缓冲液混合,并加热至退变。
退变是为了使DNA样品中的双链DNA转变为单链DNA,便于在电泳过程中进行分离。
将退变后的DNA样品加载到琼脂糖凝胶孔上,并施加电场。
在电泳过程中,由于琼脂糖凝胶的孔隙结构不同大小,不同大小的DNA片段会以不同速率迁移。
较小的DNA片段会迁移得更快,而较大的DNA片段则迁移较慢。
通过控制电场强度和时间,可以使得不同大小的DNA片段达到预期的分离效果。
3. 实验步骤3.1 准备工作•准备琼脂糖粉末和缓冲液。
•准备电泳槽、电极和样品孔模具。
•配置DNA加载缓冲液。
3.2 制备琼脂糖凝胶•将适量的琼脂糖粉末加入缓冲液中,并加热搅拌至完全溶解。
•将溶解的琼脂糖倒入电泳槽中,插入电极,待凝固。
3.3 退变DNA样品•将待分析的DNA样品与DNA加载缓冲液混合,并加热至退变温度(通常为95°C)。
•快速冷却样品至4°C。
3.4 装载样品•在琼脂糖凝胶孔上注射适量的退变后的DNA样品。
•加载DNA分子量标记物到一侧孔隙作为参考。
实验二、DNA凝胶电泳
![实验二、DNA凝胶电泳](https://img.taocdn.com/s3/m/0e11257086c24028915f804d2b160b4e767f818e.png)
实验二、DNA凝胶电泳
二、琼脂糖凝胶电泳:
1.DNA分子大小:线性DNA分子在一定琼脂糖浓度内的迁移率与DNA分 子量的对数成反比。
2.琼脂糖浓度:小于0.5kb 的DNA片段所需的凝胶浓度为1.2-1.5%; 分离大于10kb 的DNA片段所需的凝胶浓度为0.3-0.7%; DNA片段大 小在两者之间的所需的凝胶浓度为0.8-1.0%。
3、DNA分子构象:对相同分子量的质粒DNA的三种构象,超 螺旋DNA移动最快,而线状双链DNA移动最慢。
4.电源电压:在低电压时,线性DNA片段的移动速率与所 加电压成正比,但电压增高,不同分子量的DNA片段的移 动速率将以不同幅度增加;片段越大,升高的幅度也越 大。因此电压增高,琼脂糖有效分离范围将缩小。一般 所加电压不得超过5V/cm.
箔或黑纸包裹容器,储于温室即可。 4、DNA分子量标准:
DNA/EcoR I/Hind III: DNA/EcoR I: 21.2, 7.4, 5.8, 5.6, 4.9和 2.5kb。 DNA/ Hind III: 23.1, 9.4, 6.6, 4.4, 2.3, 2.0, 0.56和 0.12kb.
实验二、DNA凝胶电泳
三、试剂: 1、5TBE缓冲液:Tris. 54g, 硼酸27.5g, 加入20ml
的0.5mol/L EDTA(pH8.0), 定溶至1000ml. 2、6上样缓冲液:0.25% 溴酚兰, 40%(w/v)蔗糖水溶液。 3、溴化乙啶(EB)溶液母液:将EB配制成10mg/L,用铝
实验二、DNA凝胶电泳
实验二、DNA凝胶电泳
一、概述
琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离和纯化DNA片段 的标准方法。其中,琼脂糖凝胶分离DNA片段大小范围较 广,不同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从200bp至近50kb的 DNA片段。
DNA的琼脂糖凝胶电泳分析
![DNA的琼脂糖凝胶电泳分析](https://img.taocdn.com/s3/m/f6a60f0303d8ce2f00662335.png)
❖ 3、加样:用移液器将质粒DNA3ul与6× 上样缓冲液1ul混匀后加入加样孔,记录点 样顺序。(注意:家央视需将枪头深入加 样孔内再吹出样品,以免样品从凝胶表面 扩散;加样时枪头不要刺穿或碰坏凝胶孔 壁,否则将导致样品将从凝胶底部扩散或 DNA带型不整齐。)
❖ 4、电泳:接通电泳槽与电泳仪之间的电源 (注意正负极,切记DNA样品由负极往正 极泳动,即靠近加样孔德一端应为负极)。 调节电压值5V/cm,开始电泳。当溴酚蓝染 料移动到距凝胶前沿1~2cm处,停止电泳。
❖ (3)琼脂糖的浓度 一定大小的DNA片段在不同浓
度的琼脂糖凝胶中的电泳迁移率不同。要有效地分 离大小不同的DNA片段,需选用适当的琼脂糖凝胶 浓度。不同浓度的琼脂糖凝胶适宜分离的DNA片段 大小范围见表。
琼脂糖凝胶 0.3 0.6 0.7 0.9 1.2 1.5 2.0 浓度(%)
可分辨的线
10~ 7~ 6~ 4~ 3~
❖ 加样缓冲液可以增大样品密度,以确保DNA 均匀进入样品孔内,还可以使样品呈现颜色, 从而使加样操作更为便利。
❖ 溴酚蓝在琼脂糖凝胶中移动的速率约为二甲 苯青FF的2.2倍, 溴酚蓝在琼脂糖凝胶中移动 的速率约与长300bp的双链线性DNA相同,而 二甲苯青FF在琼脂糖凝胶中移动的速率则与 4kb双链线性DNA相同。
性DNA大小 60~5 20~1 0.8 0.7 0.4 0.2 0.1 范围(kb)
❖ 3、DNA分子在琼脂糖中泳动时有电荷效应 和分子筛效应,但主要是分子筛效应。在 pH8.0~8.3时,核酸分子剪辑几乎不解离, 磷酸解离,核酸分子带负电,在电泳时向正 极移动。采用适当浓度的凝胶介质作为电泳 支持物,在分子筛的作用下,使分子大小和 构象不同的核酸分子泳动率出现较大差异, 从而达到分离核酸片段检测其大小的目的。 核酸分子中嵌入荧光染料(如EB)后,在 紫外灯下可观察到核酸片段所在的位置。
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– 可在凝胶电泳液中加入终浓度为0.5ug/ml的EB,有时亦可在电泳 后,将凝胶浸入该浓度的溶液中染色10~15min
– EB染料有许多优点,如染色操作简便、快速,灵敏度高,10ng或 更少的DNA即可检出。
(注意:EB被认为是一种强致癌物质,操作时应尽量小心,配置和 使用EB时都应带上手套,且注意不要把EB洒到桌面或地板上。 )
• 采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分子筛的作用下, 使分子大小和构象不同的核酸分子泳动率出现较大的差异,从而 达到分离核酸片段检测其大小的目的。
• 核酸分子中嵌入荧光染料(如 EB )后,在紫外灯下可观察到核 酸片段所在的位置。
实验器材和试剂
• 实验器材: – 桥是平板电泳槽、电泳仪、微波炉、紫外透 射仪
– 银染色
影响琼脂糖凝胶电泳的因素
• DNA分子的大小:实验证明, DNA片段迁移距离与其分子量 的对数成反比;
• 琼脂糖的浓度:一定大小的 DNA片段在不同浓度的琼脂凝 胶中,电泳迁移率不相同;
• DNA分子的构型:不同构型的 DNA在琼脂糖凝胶中的电泳速 度差别较大
ห้องสมุดไป่ตู้
琼脂糖凝胶的优点
(1) 操作简单,电泳速度快,样品不需事先处理 就可进行电泳。
电泳指示剂:
• 核酸电泳常用的指示剂有两种 – 溴酚蓝( bromophenol blue, Bb ); – 二甲苯青( xylene cyanol, Xc ),它携 带的电荷量比溴酚蓝少,在凝胶中的迁 移率比溴酚蓝慢
核酸电泳的染色剂
• 最常用的染色剂
– 溴化乙锭(ethidium bromide,EB)
• 该技术操作简便快速,可以分辨用其它方法 (如密度梯度离心法)所无法分离的DNA片段。
• 当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶 (Ethidium bromide, EB)染色,在紫外光下至少 可以检出1-10ng的DNA条带,从而可以确定 DNA片段在凝胶中的位置。
• 此外,还可以从电泳后的凝胶中回收特定的 DNA条带,用于以后的克隆操作。
• 根据指示剂泳动的位置,判断是否终止电泳 当溴酚蓝染料移动到距凝胶前沿1~2cm处,
停止电泳
5. 结果观察
• 电泳结束后,将凝胶板取出。 在紫外仪上观察电泳带及其位 置,记录实验结果。
注意事项
1、 倒胶时把握好胶的温度,不要高于60℃ ,否 则温度太高会使制板变形;
2、 胶一定要凝固好才能拔梳子,方向一定要竖 直向上,不要弄坏点样孔;
质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳
主讲人:文琪 同组人员:黄梦秋 张如骐 肖重科
1
实验目的
• 掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的原 理和方法。
实验原理
• DNA分子在琼脂糖中泳动时有电荷效应和分子筛效应,但主要为 分子筛效应。
• 在 pH 值为 8.0~8.3 时,核酸分子碱基几乎不解离,磷酸全部解 离,核酸分子带负电,在电泳时向正极移动。
• 样品: DNA分子量标准品,质粒 • 试剂
– 琼脂糖 – 1×电泳缓冲液(TBE) – 6×上样缓冲液 – 溴化乙锭(EB) :10mg/ml
上样缓冲液
• 0.25%溴酚兰;0.25%二甲苯青;30%甘 油水溶液
• 作用: – ①增加样品密度,使其比重增加,以 确保DNA均匀沉入加样孔内 – ②在电泳中形成肉眼可见的指 示带,可预测核酸电泳的速度和位置 – ③使样品呈色,使加样操作更方便
实验操作
• 制备琼脂凝胶 • 胶板的制备 • 加样 • 电泳 • 紫外透射仪检测
操作步骤
1. 准备
用蒸馏水将电 泳槽和梳子 冲洗干净, 放在水平桌 面上,并架 好梳子
2. 配制1%琼脂糖凝胶及倒胶
具体步骤: • 三角瓶内:0.6g琼脂糖 +60ml(0.5×TBE) • 煮胶溶解 • 冷却至60℃(不烫手) • 加EB • 倒板 • 室温下充分凝固 • 垂直向上拔出梳子 • 将胶板放入电泳槽 • 向电泳槽中加入0.5xTBE缓冲液至刚没过凝胶表面1~2nm。
后必须立即固定染色。 4.与PAGE相比,分子筛作用小,区带少。
• 银染色
– 银染色液中的银离子(Ag+)可与核酸形 成稳定的复合物,然后用还原剂如甲 醛使Ag+还原成银颗粒,可把核酸电泳 带染成黑褐色。
– 主要用于聚丙烯酰胺凝胶电泳染色, 也用于琼脂糖凝胶染色。
– 灵敏度比EB高200倍,但银染色后, DNA不宜回收
3. 加样
• 将DNA样品(5ul)与6 × 上样缓冲液(1ul) 混匀后, 用微量加样枪小心加入样 品孔内。
– 注意加样枪的枪头不可插入 过深,以免刺穿凝胶,导致 样品外溢。
• 每加完一个样品要更换枪 头,以防止EB污染。
4. 电泳
• 接通电源,一般红色为正极,黑色为负极,切 记DNA样品由负极往正极泳动(靠近加样孔的 一端为负),电压为5 V/cm(长度以两个电极 之间的距离计算)
(2)琼脂糖凝胶结构均匀,对样品吸附极微,因此 电泳图谱清晰,分辨率高,重复性好。
(3)琼脂糖透明无紫外吸收,电泳过程和结果可直 接用紫外监测及定量分析。
(4)电泳后区带易染色,样品易洗脱,便于定量测 定。制成干膜可长期保存。
缺点:
1.机械强度差,易破碎,浓度不能太低。 2.易被细菌污染,不易保存,临用前配制。 3.琼脂糖支持层上的区带易于扩散,电泳
琼脂糖凝胶
• 天然琼脂(agar):又名琼胶、菜燕、冻 粉
• 从石花菜及其它红藻类植物提取出来 的一种线状高聚物。
琼脂糖(agarose)
琼 脂
琼脂胶(agaropectin):含硫酸根和羧基的强酸
性多糖,在电场作用下能产生较强的电渗现象。
琼脂糖凝胶电泳
• 琼脂糖凝胶电泳是分离鉴定和纯化DNA片段的 标准方法。
3 、点样时枪头下伸,点样孔内不能有气泡,不 要刺穿凝胶;
4、EB有毒,切勿用手接触,更不要污染环境, 胶勿乱扔;
5 、紫外线照射不要太久。