核酸的结构与功能
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真核生物DNA以非常有序的形式存在于细胞核内 在细胞周期的大部分时间里,DNA以松散的染色质形式存在,在细胞分裂期,则形成高度致密的 染色体。 DNA染色质呈现出的串珠样结构 染色质的基本单位是核小体
DNA是遗传信息的物质基础
DNA的基本功能是以基因的形式荷载遗传信息,并作为基因复制和转录的模板。它是生命遗传的物质 基础,也是个体生命活动的信息基础。 基因从结构上定义,是指DNA分子中的特定区段,其中的核苷酸排列顺序决定了基因的功能。
一个脱氧核苷酸3'的羟基与另一个核苷酸5'的α-磷酸基团缩合形成磷酸二酯键。 多个脱氧核苷酸通过磷酸二酯键构成了具有方向性的线性分子,称为多聚脱氧核苷酸,即DNA链。
RNA也是具有3',5''—磷酸二酯键的线性大分子
RNA也是多个核苷酸分子通过酯化反应形成的线性大分子,并且具有方向性; RNA的戊糖是核糖; RNA的嘧啶是胞嘧啶和尿嘧啶。
这种杂化双链可以在不同的DNA直之间形成,也可以在DNA和RNA分子间或者RNA与RNA分子间形 成。这种现象称为核酸分子杂化。
核酸分子杂交的应用
研究DNA分子中某一种基因的位置 鉴定两种核酸分子间的序列相似性 检测某些专一序列在待检样品中存在与否
核酸酶
核酸酶是指可以水解核酸的酶 根据底物的不同分类:DNA酶(专一降解DNA),RNA酶(专一降解RNA) 依据切割部门不同:核酸内切酶(分为限制性核酸内切酶和非特异性限制性核酸内切酶),核酸外切酶 (5'→3ʻ或3'→5'核酸外切酶)
RNA的结构与功能
Байду номын сангаас
RNA与蛋白质共同负责基因的表达和表达过程的调控。 RNA通常以单链的形式存在,但有复制的局部二级结构或三级结构 RNA比DNA小的多 RNA的种类、大小和结构远比DNA表现出多样性。
mRNA是蛋白质合成中的模板
信使RNA是合成蛋白质的模板 不均一核RNA(hnRNA)含有内含子和外显子 外显子是氨基酸的编码序列,而内含子是非编码序列 hnRNA经过剪切后成为成熟的mRNA。
核酸的一级结构是核苷酸的排列顺序
定义:核酸中核苷酸的排列顺序。由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。 核酸分子的大小常用碱基数目来表示。 小的核酸片段(<50bp)常被称为寡核苷酸。自然界中的DNA和RNA的长度可以高达几十万个碱基。
DNA的空间结构与功能
DNA的空间结构:构成DNA的所有原子在三维空间具有确定的相对位置关系。 DNA的空间结构又分为二级结构和高级结构。
疏水作用力和氢键共同维系着DNA双螺旋结构的稳定
相邻碱基对会有重叠,产生了疏水性的碱基堆积力 碱基堆积力和互补碱基对的氢键共同维系着DNA结构的稳定
DNA双螺旋结构的多样性
DNA的多链螺旋结构
Hoogsteen氢键 在酸性的溶液中,胞嘧啶的N—3原子被质子化,可与鸟嘌呤的N—7原子形成氢键;同时,胞 嘧啶的N—4的氢原子也可与鸟嘌呤的O—6形成氢键,这种氢键被称为Hoogsteen氢键。 Hoogsteen氢键,不破坏Watson—Crick氢键,由此形成了C+GC的三链结构。 四链结构:鸟嘌呤之间通过Hoogsteen氢键形成特殊的四链结构。 真核生物DNA3'—末端是富含GT的多次重复序列,因而自身形成了折叠的四链结构。
变性的核酸可以复性或形成杂交双链
当变性条件缓慢地除去后,两条解链的互补链可重新配对,恢复原来的双螺旋结构,这一现象称为 DNA复性。 热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程称为退火。 减色效应:DNA复性时,其溶液OD260降低。
核酸分子杂交
不同种类的DNA单链分子或RNA分子放在同一溶液中只要两种单链分子之间存在着一定程度的碱 基配对关系,在适宜的条件可以在不同的分子间形成杂化双链。
tRNA的3'—末端连接氨基酸
tRNA的3'—末端都是以CCA结尾 3'—末端的A与氨基酸共价连结,tRNA成为了氨基酸的载体 不同的tRNA可以结合不同的氨基酸
tRNA的反密码子识别mRNA的密码子
tRNA的反密码子环上有一个由三个核苷酸构成的反密码子 tRNA上的反密码子依照碱基互补的原则识别mRNA上的密码子
成熟的真核生物RNA
从AUG开始,每三个核苷酸为一组编码了一个氨基酸,称为三联体密码。成熟的mRNA由氨基酸 编码区和非编码区构成。 5'—末端的帽子结构和3'—末端的多聚A尾结构。
大部分真核细胞mRNA的5'末端都以7—甲基鸟嘌呤—三磷酸核苷为起始结构
帽子结构:m7GpppNm mRNA的帽结构可以与帽结合蛋白(CBP)结合。
核酸酶的功能
参与DNA的合成、修复以及RNA的剪接 消除多余的、结构和功能异常的核酸,以及侵入细胞的外源性核酸 降解食物中的核酸 体外重组DNA技术中的重要工具酶
两条多聚核苷酸链在空间的走向呈反向平行。两条链围绕着同一个螺旋轴形成右手螺旋的结 构双螺旋结构的直径为2.37nm,螺距为3.54nm。 脱氧核糖和磷酸基团组成的亲水性骨架位于双螺旋结构的外侧,疏水的碱基位于内侧。 双螺旋结构的表面形成了一个大沟和一个小沟。
DNA双链之间形成了互补碱基对
碱基配对关系称为互补碱基对 DNA的两条链则互为互补链 碱基对平面与螺旋轴垂直
核酸的结构与功能
核酸的化学组成及其一级结构 核酸(DNA和RNA) 核苷酸 磷酸 核苷和脱氧核苷 戊糖 核糖 脱氧核糖
碱基 嘌呤 嘧啶
核苷酸是构成核酸的基本组成单位
分子组成: 碱基:嘌呤碱,嘧啶碱 戊糖:核糖,脱氧核糖 磷酸 碱基:碱基是含氮的杂环化合物
DNA是脱氧核苷酸通过3',5'—磷酸二酯键连接形成的大分子
在真核生物mRNA的3'末端有多聚腺苷酸结构
真核生物的mRNA的3'—末端转录后加上长短不一的聚腺苷酸。 帽子结构和多聚A尾的功能: mRNA核内向胞质的转位 mRNA的稳定性维系 翻译起始的调控
mRNA依照自我的碱基顺序指导蛋白质氨基酸顺序的合成
从mRNA分子5'末端起的第一个AUG开始,每3个核苷酸为一组称为密码子或三联体密码。 AUG被称为起始密码子;决定肽链终止的密码子则称为终止密码子。 位于起始密码子和终止密码子之间的核苷酸序列称为开放阅读框,决定了多肽链的氨基酸序列。
以rRNA为组分的核蛋白体是蛋白质合成的场所
核蛋白质RNA(rRNA)是细胞内含量最多的RNA(>80%)。 rRNA与核蛋白体蛋白结合组成核蛋白体,为蛋白质的合成提供场所。
snmRNA参与基因表达的调控
snmRNAs:细胞的不同部位存在的许多其他种类的小分子RNA,统称为非mRNA小RNA。 RNA组学是研究细胞内snmRNA的种类、结构和功能。同一生物体内不同种类的细胞、同一细胞在不 同时空状态下snmRNA表达谱的变化,以及与功能之间的关系。 snmRNA的种类:核内小RNA,核仁小RNA,胞质小RNA,催化性小RNA,小片段干涉RNA snmRNAs的功能:参与hnRNA的加工剪切 核酶:某些小RNA分子具有催化特定RNA降解的活性,这种具有催化作用的小RNA亦被称为核酶或催 化性RNA。 小片段干扰RNA:siRNA是生物宿主对外源侵入的基因表达的双链RNA进行切割所产生的特定长度和特 定核酸序列的小片段RNA。siRNA可以与外源基因表达的mRNA相结合,并诱发这些mRNA的降解。基 于此机理,人们发明了RNA干扰技术。
DNA变性是双链解离为单链的关键
定义:在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。 DNA变性的本质是双链间氢键的断裂。 DNA解链时的紫外吸收变化 增色效应:DNA变性时其溶液OD260增高的现象。 连续加热DNA的过程中以温度相对于A260值作图,所得的曲线称为解链曲线。 解链温度:解链过程中,紫外吸光度的变化达到最大变化值的一半时所对应的温度。 G+C含量越高,解链温度就越高。
DNA的高级结构是超螺旋结构
超螺旋结构:DNA双螺旋链再盘旋即形成超螺旋结构 正超螺旋:盘旋方向与DNA双螺旋方向相同 负超螺旋:盘旋方向与DNA双螺旋方向相反
原核生物DNA的环状超螺旋结构
原核生物DNA多为环状,以负超螺旋的形式存在,平均每200碱基就有一个超螺旋形成
真核生物DNA的高度有序和高度致密的结构
核酸在真核细胞和原核细胞中表现了不同的时空特性
核酸的理化性质
核酸的酸碱及溶解度性质 核酸为多元酸,具有较强的酸性 核酸的高分子性质 粘度:DNA>RNA dsDNA>ssRNA 沉降行为:不同构象的核酸分子的沉降的速率有很大差异,这是超速离心法提取和纯化核酸的理论基础。
核酸分子具有强烈的紫外吸收
核酸在波长260nm处有强烈的吸收,是由碱基的共轭双键所决定的。这一特性常用作核酸的定性和定 量分析。 紫外吸收的应用 DNA或RNA的定量 确定样品中核酸的纯度
mRNA的成熟过程是hnRNA的剪接过程
tRNA是蛋白质合成中的氨基酸载体
转运RNA在蛋白质合成过程中作为各种氨基酸的载体,将氨基酸转呈给mRNA。 由74~95核苷酸组成 占细胞总RNA的15% 具有很好的稳定性
tRNA中含有多种稀有碱基
tRNA具有茎环结构
tRNA具有局部的茎环结构或发卡结构 tRNA的二级结构—三叶草形(氨基酸臂,DHU环,反密码环,TψC环,附加环)
DNA的二级结构是双螺旋结构 DNA双螺旋结构的研究背景
Chargaff规则: 不同的生物种属的DNA的碱基组成不同
同一个个体的不同器官或组织的DNA碱基组成相同 A=T,G=C 获得了高质量的DNA分子的X射线衍射照片 提出了DNA分子双螺旋结构模型
DNA双螺旋结构模型要点
DNA是反向平行,右手螺旋的双链结构
DNA是遗传信息的物质基础
DNA的基本功能是以基因的形式荷载遗传信息,并作为基因复制和转录的模板。它是生命遗传的物质 基础,也是个体生命活动的信息基础。 基因从结构上定义,是指DNA分子中的特定区段,其中的核苷酸排列顺序决定了基因的功能。
一个脱氧核苷酸3'的羟基与另一个核苷酸5'的α-磷酸基团缩合形成磷酸二酯键。 多个脱氧核苷酸通过磷酸二酯键构成了具有方向性的线性分子,称为多聚脱氧核苷酸,即DNA链。
RNA也是具有3',5''—磷酸二酯键的线性大分子
RNA也是多个核苷酸分子通过酯化反应形成的线性大分子,并且具有方向性; RNA的戊糖是核糖; RNA的嘧啶是胞嘧啶和尿嘧啶。
这种杂化双链可以在不同的DNA直之间形成,也可以在DNA和RNA分子间或者RNA与RNA分子间形 成。这种现象称为核酸分子杂化。
核酸分子杂交的应用
研究DNA分子中某一种基因的位置 鉴定两种核酸分子间的序列相似性 检测某些专一序列在待检样品中存在与否
核酸酶
核酸酶是指可以水解核酸的酶 根据底物的不同分类:DNA酶(专一降解DNA),RNA酶(专一降解RNA) 依据切割部门不同:核酸内切酶(分为限制性核酸内切酶和非特异性限制性核酸内切酶),核酸外切酶 (5'→3ʻ或3'→5'核酸外切酶)
RNA的结构与功能
Байду номын сангаас
RNA与蛋白质共同负责基因的表达和表达过程的调控。 RNA通常以单链的形式存在,但有复制的局部二级结构或三级结构 RNA比DNA小的多 RNA的种类、大小和结构远比DNA表现出多样性。
mRNA是蛋白质合成中的模板
信使RNA是合成蛋白质的模板 不均一核RNA(hnRNA)含有内含子和外显子 外显子是氨基酸的编码序列,而内含子是非编码序列 hnRNA经过剪切后成为成熟的mRNA。
核酸的一级结构是核苷酸的排列顺序
定义:核酸中核苷酸的排列顺序。由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。 核酸分子的大小常用碱基数目来表示。 小的核酸片段(<50bp)常被称为寡核苷酸。自然界中的DNA和RNA的长度可以高达几十万个碱基。
DNA的空间结构与功能
DNA的空间结构:构成DNA的所有原子在三维空间具有确定的相对位置关系。 DNA的空间结构又分为二级结构和高级结构。
疏水作用力和氢键共同维系着DNA双螺旋结构的稳定
相邻碱基对会有重叠,产生了疏水性的碱基堆积力 碱基堆积力和互补碱基对的氢键共同维系着DNA结构的稳定
DNA双螺旋结构的多样性
DNA的多链螺旋结构
Hoogsteen氢键 在酸性的溶液中,胞嘧啶的N—3原子被质子化,可与鸟嘌呤的N—7原子形成氢键;同时,胞 嘧啶的N—4的氢原子也可与鸟嘌呤的O—6形成氢键,这种氢键被称为Hoogsteen氢键。 Hoogsteen氢键,不破坏Watson—Crick氢键,由此形成了C+GC的三链结构。 四链结构:鸟嘌呤之间通过Hoogsteen氢键形成特殊的四链结构。 真核生物DNA3'—末端是富含GT的多次重复序列,因而自身形成了折叠的四链结构。
变性的核酸可以复性或形成杂交双链
当变性条件缓慢地除去后,两条解链的互补链可重新配对,恢复原来的双螺旋结构,这一现象称为 DNA复性。 热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程称为退火。 减色效应:DNA复性时,其溶液OD260降低。
核酸分子杂交
不同种类的DNA单链分子或RNA分子放在同一溶液中只要两种单链分子之间存在着一定程度的碱 基配对关系,在适宜的条件可以在不同的分子间形成杂化双链。
tRNA的3'—末端连接氨基酸
tRNA的3'—末端都是以CCA结尾 3'—末端的A与氨基酸共价连结,tRNA成为了氨基酸的载体 不同的tRNA可以结合不同的氨基酸
tRNA的反密码子识别mRNA的密码子
tRNA的反密码子环上有一个由三个核苷酸构成的反密码子 tRNA上的反密码子依照碱基互补的原则识别mRNA上的密码子
成熟的真核生物RNA
从AUG开始,每三个核苷酸为一组编码了一个氨基酸,称为三联体密码。成熟的mRNA由氨基酸 编码区和非编码区构成。 5'—末端的帽子结构和3'—末端的多聚A尾结构。
大部分真核细胞mRNA的5'末端都以7—甲基鸟嘌呤—三磷酸核苷为起始结构
帽子结构:m7GpppNm mRNA的帽结构可以与帽结合蛋白(CBP)结合。
核酸酶的功能
参与DNA的合成、修复以及RNA的剪接 消除多余的、结构和功能异常的核酸,以及侵入细胞的外源性核酸 降解食物中的核酸 体外重组DNA技术中的重要工具酶
两条多聚核苷酸链在空间的走向呈反向平行。两条链围绕着同一个螺旋轴形成右手螺旋的结 构双螺旋结构的直径为2.37nm,螺距为3.54nm。 脱氧核糖和磷酸基团组成的亲水性骨架位于双螺旋结构的外侧,疏水的碱基位于内侧。 双螺旋结构的表面形成了一个大沟和一个小沟。
DNA双链之间形成了互补碱基对
碱基配对关系称为互补碱基对 DNA的两条链则互为互补链 碱基对平面与螺旋轴垂直
核酸的结构与功能
核酸的化学组成及其一级结构 核酸(DNA和RNA) 核苷酸 磷酸 核苷和脱氧核苷 戊糖 核糖 脱氧核糖
碱基 嘌呤 嘧啶
核苷酸是构成核酸的基本组成单位
分子组成: 碱基:嘌呤碱,嘧啶碱 戊糖:核糖,脱氧核糖 磷酸 碱基:碱基是含氮的杂环化合物
DNA是脱氧核苷酸通过3',5'—磷酸二酯键连接形成的大分子
在真核生物mRNA的3'末端有多聚腺苷酸结构
真核生物的mRNA的3'—末端转录后加上长短不一的聚腺苷酸。 帽子结构和多聚A尾的功能: mRNA核内向胞质的转位 mRNA的稳定性维系 翻译起始的调控
mRNA依照自我的碱基顺序指导蛋白质氨基酸顺序的合成
从mRNA分子5'末端起的第一个AUG开始,每3个核苷酸为一组称为密码子或三联体密码。 AUG被称为起始密码子;决定肽链终止的密码子则称为终止密码子。 位于起始密码子和终止密码子之间的核苷酸序列称为开放阅读框,决定了多肽链的氨基酸序列。
以rRNA为组分的核蛋白体是蛋白质合成的场所
核蛋白质RNA(rRNA)是细胞内含量最多的RNA(>80%)。 rRNA与核蛋白体蛋白结合组成核蛋白体,为蛋白质的合成提供场所。
snmRNA参与基因表达的调控
snmRNAs:细胞的不同部位存在的许多其他种类的小分子RNA,统称为非mRNA小RNA。 RNA组学是研究细胞内snmRNA的种类、结构和功能。同一生物体内不同种类的细胞、同一细胞在不 同时空状态下snmRNA表达谱的变化,以及与功能之间的关系。 snmRNA的种类:核内小RNA,核仁小RNA,胞质小RNA,催化性小RNA,小片段干涉RNA snmRNAs的功能:参与hnRNA的加工剪切 核酶:某些小RNA分子具有催化特定RNA降解的活性,这种具有催化作用的小RNA亦被称为核酶或催 化性RNA。 小片段干扰RNA:siRNA是生物宿主对外源侵入的基因表达的双链RNA进行切割所产生的特定长度和特 定核酸序列的小片段RNA。siRNA可以与外源基因表达的mRNA相结合,并诱发这些mRNA的降解。基 于此机理,人们发明了RNA干扰技术。
DNA变性是双链解离为单链的关键
定义:在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。 DNA变性的本质是双链间氢键的断裂。 DNA解链时的紫外吸收变化 增色效应:DNA变性时其溶液OD260增高的现象。 连续加热DNA的过程中以温度相对于A260值作图,所得的曲线称为解链曲线。 解链温度:解链过程中,紫外吸光度的变化达到最大变化值的一半时所对应的温度。 G+C含量越高,解链温度就越高。
DNA的高级结构是超螺旋结构
超螺旋结构:DNA双螺旋链再盘旋即形成超螺旋结构 正超螺旋:盘旋方向与DNA双螺旋方向相同 负超螺旋:盘旋方向与DNA双螺旋方向相反
原核生物DNA的环状超螺旋结构
原核生物DNA多为环状,以负超螺旋的形式存在,平均每200碱基就有一个超螺旋形成
真核生物DNA的高度有序和高度致密的结构
核酸在真核细胞和原核细胞中表现了不同的时空特性
核酸的理化性质
核酸的酸碱及溶解度性质 核酸为多元酸,具有较强的酸性 核酸的高分子性质 粘度:DNA>RNA dsDNA>ssRNA 沉降行为:不同构象的核酸分子的沉降的速率有很大差异,这是超速离心法提取和纯化核酸的理论基础。
核酸分子具有强烈的紫外吸收
核酸在波长260nm处有强烈的吸收,是由碱基的共轭双键所决定的。这一特性常用作核酸的定性和定 量分析。 紫外吸收的应用 DNA或RNA的定量 确定样品中核酸的纯度
mRNA的成熟过程是hnRNA的剪接过程
tRNA是蛋白质合成中的氨基酸载体
转运RNA在蛋白质合成过程中作为各种氨基酸的载体,将氨基酸转呈给mRNA。 由74~95核苷酸组成 占细胞总RNA的15% 具有很好的稳定性
tRNA中含有多种稀有碱基
tRNA具有茎环结构
tRNA具有局部的茎环结构或发卡结构 tRNA的二级结构—三叶草形(氨基酸臂,DHU环,反密码环,TψC环,附加环)
DNA的二级结构是双螺旋结构 DNA双螺旋结构的研究背景
Chargaff规则: 不同的生物种属的DNA的碱基组成不同
同一个个体的不同器官或组织的DNA碱基组成相同 A=T,G=C 获得了高质量的DNA分子的X射线衍射照片 提出了DNA分子双螺旋结构模型
DNA双螺旋结构模型要点
DNA是反向平行,右手螺旋的双链结构