婴儿胆汁淤积的肠道菌群组成及功能变化

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婴儿胆汁淤积的肠道菌群组成及功能变化

周建利,王朝霞,周少明,张 巧, 霞

深圳市儿童医院消化内科,广东深圳518026

摘要:目的 研究胆汁淤积婴儿的肠道菌群组成及功能变化。方法 纳入2014年9月—2016年2月深圳市儿童医院收治的42例胆汁淤积婴儿(胆汁淤积组)及同期32例正常对照婴儿(对照组),收集以上婴儿的大便标本,采用鸟枪法测序了解入选婴儿肠道菌群特征,应用京都基因与基因组百科全书、eggNOG数据库探索菌群功能改变。计量资料2组间比较采用Wilcoxon秩和检验;计数资料2组间比较采用χ2检验。得到的菌种和基因功能通路等数据用Shannon系数、Wilcoxon秩和检验和DESeq2进行计算分析,利用Cytoscape将2组的丰富菌种和相关联系直观表现出来。结果 胆汁淤积组病因包括胆道闭锁11例(26.2%),Citrin蛋白缺乏症4例(9.5%),胆管发育不良4例(9.5%),原因未明23例(54.8%)。2组肠道菌群组成在门水平有显著差异(Z=0 000046,P<0.05),其中厚壁菌门和拟杆菌门在胆汁淤积组中显著增加;在种水平上也有差异(Z=0.000014,P<0.05),胆汁淤积组中有益菌如双歧杆菌明显减少,而潜在致病菌如韦永氏球菌和农研丝杆菌明显增多;在功能水平上也有差异(Z=0.0198,P<0.05),胆汁淤积组肠道菌群的功能明显减弱,如氨基酸代谢、糖代谢等。结论 胆汁淤积婴儿肠道菌群的组成及功能发生改变,胆汁淤积婴儿肠道菌群

中有益菌明显减少,潜在致病菌增多,补充双歧杆菌等有益菌可能减少潜在致病菌的产生,从而改变疾病的发展。

关键词:婴儿;胆汁淤积;胃肠道微生物组

中图分类号:R575.6 文献标志码:A 文章编号:1001-5256(2021)01-0126-05

Compositionandfunctionalchangeofintestinalmicrobiotaininfantilecholestasis

ZHOUJianli,WANGZhaoxia,ZHOUShaoming,ZHANGQiao,QIANXia.(DepartmentofGastroenterology,ShenzhenChildren’sHospi tal,Shenzhen,Guangdong518026,China)

Abstract:Objective Toinvestigatethecompositionandfunctionalchangeofintestinalmicrobiotaininfantilecholestasis(IC).MethodsAtotalof42infantswithICwhowereadmittedtoShenzhenChildren’sHospitalfromSeptember2014toFebruary2016wereenrolledasICgroup,and32normalinfantsduringthesameperiodoftimewereenrolledascontrolgroup.Fecalsampleswerecollected,andshotgunse quencingwasusedtoinvestigatethefeaturesofintestinalmicrobiota.TheKyotoEncyclopediaofGenesandGenomes(KEGG)andeggNOGdatabasewereusedtoinvestigatethefunctionalchangesofintestinalmicrobiota.TheWilcoxonrank-sumtestwasusedforcomparisonofcontinuousdatabetweengroups,andthechi-squaretestwasusedforcomparisonofcategoricaldatabetweengroups.Shannoncoefficient,theWilcoxonRanksumtest,andDESeq2wereusedtocalculateandanalyzethedataofstrainsandthefunctionalpathwaysofgenes,andCytoscapewasusedtogiveavisualrepresentationofabundantstrainsandtheirassociation.Results AsfortheetiologyofICintheICgroup,11(26.2%)hadbiliaryatresia,4(9.5%)hadCitrindeficiency,4(9.5%)hadbileductdysplasia,and23(54.8%)hadun

knowncause.Therewasasignificantdifferenceinthecompositionofintestinalmicrobiotaatthephylumlevelbetweenthetwogroups(Z=0 000046,P<0.05),andtheICgrouphadsignificantincreasesinFirmicutesandBacteroidetes.Therewerealsosignificantdiffer

encesbetweenthetwogroupsatthespecieslevel(Z=0.000014,P<0.05),andtheICgrouphadsignificantreductionsintheprobioticbacteriaincludingBifidobacteriumandsignificantincreasesinthepotentialpathogensincludingVeillonellaandNiastellakoreensis.Therewasasignificantdifferenceinthefunctionofintestinalmicrobiotabetweenthetwogroups(Z=0.0198,P<0.05),andtheICgrouphadsignificantreductionsinthefunctionsofintestinalmicrobiotasuchasaminoacidmetabolismandcarbohydratemetabolism.Conclusion ChangesinthecompositionandfunctionofintestinalmicrobiotaareobservedininfantswithIC,withasignificantreductioninprobioticbac teriaandasignificantincreaseinpotentialpathogens,andsupplementationwithprobioticbacteriaincludingBifidobacteriumcanreducetheproductionofpotentialpathogensandchangediseaseprogression.

Keywords:Infant;Cholestasis;GastrointestinalMicrobiome

DOI:10.3969/j.issn.1001-5256.2021.01.025

收稿日期:2020-07-05;修回日期:2020-10-26

基金项目:深圳市科技计划项目(JCYJ20160429174706491)

作者简介:周建利(1989—),男,主治医师,主要从事婴儿胆汁淤积、儿童脂肪肝等研究

通信作者:周少明,zhousm15d@aliyun.com 婴儿胆汁淤积是由各种原因引起毛细胆管胆汁形成、分泌和/或胆汁排泄异常,使血中胆红素升高,以直接

胆红素增高为主[1]。其病因较多,主要包括肝内胆汁淤积和肝外胆汁淤积,而后者主要以胆道闭锁最多见,国外流行病学资料[2]显示,活产婴儿中肝内胆汁淤积发生率

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