原核表达系统三大要素的选择及优化
原核表达
一、原理1、E . coli表达系统E . coli是重要的原核表达体系。
在重组基因转化入E . coli 菌株以后，通过温度的控制，诱导其在宿主菌内表达目的蛋白质，将表达样品进行SDS-PAGE 以检测表达蛋白质。
2、外源基因的诱导表达提高外源基因表达水平的基本手段之一，就是将宿主菌的生长与外源基因的表达分成两个阶段，以减轻宿主菌的负荷。
常用的有温度诱导和药物诱导。
本实验采用异丙基硫代-β-D-半乳糖昔（IPTG）诱导外源基因表达。
不同的表达质粒表达方法并不完全相同，因启动子不同，诱导表达要根据具体情况而定。
二、材料1、诱导表达材料( 1 ) LB （Luria—Bertani）)培养基酵母膏(Yeast extract) 5g 蛋白胨(Peptone) 10gNaCl 10g 琼脂(Agar) 1-2%蒸馏水(Distilled water) 1000ml pH 7.0适用范围：大肠杆菌( 2 ) IPTG 贮备液：2 g IPTG溶于10 mL 蒸馏水中，0 . 22 μm 滤膜过滤除菌，分装成1 mL /份，－20 ℃保存。
( 3 ) l×凝胶电泳加样缓冲液：50 mmol / L Tris -CI ( pH 6 . 8 )50 mmol / L DTT2 % SDS （电泳级）0.1 ％溴酚蓝10 ％甘油2、大肠杆菌包涵体的分离与蛋白纯化材料1 ）酶溶法（1）裂解缓冲液：50 mmol / L Tris-CI ( pH 8 . 0 )1 mmol / L EDTA100 mmol / LNaCI（2）50 mmol / L 苯甲基磺酰氟（PMSF ）。
（3）10 mg / mL 溶菌酶。
（4）脱氧胆酸。
（5）1 mg / mL DNase I。
2 ）超声破碎法( 1 ) TE 缓冲液。
( 2 ) 2×SDS -PAGE 凝胶电泳加样缓冲液：100 mmol / L Tris-HCI ( pH 8 . 0 )100 mmol / L DTT4 %SDS0.2 ％溴酚蓝20 ％甘油三、实验方案1、外源基因的诱导表达( 1 ）用适当的限制性内切核酸酶消化载体DNA 和目的基因。
原核表达操作步骤及注意事项
原核表达操作步骤及注意事项时间：2010-03-03 14:05:01 来源：作者：点击：1046次将克隆化基因插入合适载体后导入大肠杆菌用于表达大量蛋白质的方法一般称为原核表达。
这种方法在蛋白纯化、定位及功能分析等方面都有应用。
大肠杆菌用于表达重组蛋白有以下特点：易于生长和控制；用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵；有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具各种特性的质粒可供选择。
但是，在大肠杆菌中表达的蛋白由于缺少修饰和糖基化、磷酸化等翻译后加工，常形成包涵体而影响表达蛋白的生物学活性及构象。
表达载体在基因工程中具有十分重要的作用，原核表达载体通常为质粒，典型的表达载体应具有以下几种元件：（1）选择标志的编码序列；（2）可控转录的启动子；（3）转录调控序列(转录终止子，核糖体结合位点)；（4）一个多限制酶切位点接头；（5）宿主体内自主复制的序列。
原核表达一般程序如下：获得目的基因－准备表达载体－将目的基因插入表达载体中（测序验证）－转化表达宿主菌－诱导靶蛋白的表达－表达蛋白的分析－扩增、纯化、进一步检测一、试剂准备1、LB培养基。
2、100mM IPTG（异丙基硫代-β-D-半乳糖苷）：2.38g IPTG溶于100ml ddH2O中，0.22μm滤膜抽滤，-20℃保存。
二、操作步骤（一）获得目的基因1、通过PCR方法：以含目的基因的克隆质粒为模板，按基因序列设计一对引物（在上游和下游引物分别引入不同的酶切位点），PCR循环获得所需基因片段。
2、通过RT-PCR方法：用TRIzol法从细胞或组织中提取总RNA，以mRNA为模板，逆转录形成cDNA 第一链，以逆转录产物为模板进行PCR循环获得产物。
（二）构建重组表达载体1、载体酶切：将表达质粒用限制性内切酶（同引物的酶切位点）进行双酶切，酶切产物行琼脂糖电泳后，用胶回收Kit或冻融法回收载体大片段。
2、PCR产物双酶切后回收，在T4DNA连接酶作用下连接入载体。
重组蛋白的表达系统(详细版)
终止子：转录终止子按照是否依赖和不依赖ρ因子的作用分为两类，这两类终止子均在终止点前含有一段7-20bp的回文序列。终止子可以保护mRNA在核外不被降解，显著延长mRNA的寿命，由此提高重组蛋白的表达量。但是对于T7系统来说，由于T7 RNA聚合酶效率极高，宿主中随时都有充足的mRNA以供翻译，因此大部分在T7系统中表达的重组蛋白并不在意质粒上是否有终止子，只有一些自身带有翻译起始信号的外源基因需要终止子。启动子受细胞类型的限制，在不同的细胞系中有很大不同，因此需根据宿主细胞（尤其是真核宿主）的类型选择不同的启动子以便于目的基因的高效表达。
表4：常用原核表达载体质粒
1.3 优化表达条件
重组蛋白的表达流程很少有一次成形的，为了提高蛋白表达量、改善蛋白质量，表达条件和白不表达时：
2
如果重组蛋白不表达（包含体和可溶蛋白都没有），首先检查cDNA和质粒是否正确，蛋白对宿主菌是否有很大毒性，然后尝试更换菌株、质粒载体和融合标签。原核蛋白在大肠杆菌中不能表达的情况很少见，通常是真核蛋白不能表达。不能表达的重组蛋白，即使在更换了宿主、载体后可以表达，表达量也不会很高，如果需要大规模生产，最好尝试酵母和昆虫细胞表达系统。
融合标签：融合标签是与目的蛋白共表达的一段多肽，方便重组蛋白的纯化、固定和检测，表3给出了常用的重组标签。如果不需要对重组蛋白进行纯化，尽量不要引入融合标签，以免影响蛋白性质；如果重组蛋白本身能够结合某种亲和柱，如某些金属结合蛋白可以结合Ni-NTA，某些糖结合蛋白能够特异识别糖类，也不必引入标签。融合标签的引入能够大大简化重组蛋白的纯化流程，并提高蛋白溶解度。商业化表达质粒，如pET、pGEX等提供了各种纯化标签和融合蛋白供选，应根据蛋白具体情况进行选择。His-tag是最常用的纯化标签，它具有很多优点：标签较短（10-20个氨基酸残基），不带电（pH8.0），免疫原性差，通常不影响重组蛋白的结构和功能，Ni2+亲和力高，能够通过一步纯化达到60%-90%的纯度。如果蛋白质溶解度不高，导致折叠困难、表达量低，可以选择较大的融合标签（GST、MBP、Trx等）帮助重组蛋白表达和折叠，提高重组蛋白溶解度，从而提高表达量。较大的融合标签有时也会导致翻译困难甚至提前中止，纯化后发现大部分都是标签蛋白也是常见现象。翻译的提前中止会大大影响重组蛋白产率和后续纯化，所以在短标签能够达到目的的时候，尽量不要选择大的融合标签。标签位置的选择也很重要：N端标签（短的或长的）自身带有启动子和适应宿主偏好的密码子，可以帮助目的蛋白表达，提高表达量，但是提前中止翻译的蛋白片段也会被一并纯化出来，降低重组蛋白纯度，对蛋白酶敏感的、自身容易降解的以及一级序列中有集中的疏水残基区的蛋白尤其要避免使用N端标签；C端标签则可以保证只有完整蛋白得到纯化。另外，如果蛋白的近N端或近C端有重要功能区，如酶活中心、配体结合位点、二硫键、多聚体稳定界面、相互作用界面等，则要避免纯化标签位于该末端，以免影响重组蛋白的结构和功能。如果融合标签对蛋白性质有较大影响，但又是纯化所必须的，就可以考虑在纯化过程中去除标签。主要有三种方法：化学裂解，如溴化氰（CNBr）、羟胺（NH2OH）等，能够简单有效地去除标签，但反应条件苛刻（羟胺需要在pH9.0下反应），特异性较差，而且会引入不必要的修饰，除包含体蛋白的处理外已经很少使用了；酶解，如PPase等，其底物一般是一段比较长的肽链，特异性强，是目前比较常用的方法，缺点是酶切反应需要较长的时间，也增加了蛋白纯化的步骤，使纯化变得繁琐；IMPACT质粒，该质粒在纯化标签和目的蛋白之间插入了一个蛋白质内含子（intein），intein具有可诱导的自切割活性，使用IMPACT质粒表达的重组蛋白，只需要改变缓冲液的pH和温度，即可切掉融合标签。
原核表达系统的工作原理
原核表达系统的工作原理原核表达系统是指利用原核生物（如大肠杆菌等）来表达外源蛋白质的工具，在生物技术和基因工程领域应用十分广泛。
原核表达系统通过重组DNA技术将目标基因插入原核细胞的表达载体中，并利用细胞自身的代谢机制，将目标蛋白质大量表达出来。
本文将详细介绍原核表达系统的工作原理。
1. 原核表达系统的基本构成原核表达系统的基本构成包括表达载体和宿主细胞两部分。
表达载体是一种重组DNA分子，通常包括以下基本组成成分：（1）起始位点（起始密码子）：在大肠杆菌中通常为AUG。
（2）表达基因：包括编码目标蛋白质的DNA序列和转录启动子、转录终止子等序列。
（3）选择标记：旨在筛选出带有目标基因的细胞，并提高表达效率。
常用的选择标记有抗生素抵抗基因和荧光标记基因等。
（4）复制起点：能够使表达载体在宿主细胞内进行自我复制，提高表达效率。
宿主细胞则是一种能够实现表达载体遗传信号转录、翻译和合成目标蛋白质的生命体。
2. 原核表达系统的工作流程原核表达系统通过以下几个步骤来实现目标蛋白质的表达：（1）制备表达载体将目标基因插入表达载体中，构建成重组DNA分子。
（2）转化宿主细胞将制备好的表达载体转化（transform）到宿主细胞内。
转化过程中，表达载体通过电击、热激或溶菌酶处理等方法，被宿主细胞吞噬并与其细胞质融合。
（3）表达基因转录和翻译转录因子识别插入表达载体的启动子序列，调节基因在宿主细胞内能够合成被表达的mRNA。
转录后的mRNA与核糖体结合，开始翻译，合成蛋白质。
（4）目标蛋白质的后处理和纯化将宿主细胞内表达的蛋白质从培养基或细胞酶中提取出来。
通常采用离心、过滤或柱层析等方法，对蛋白质进行分离和纯化。
3. 原核表达系统的优缺点原核表达系统在生物技术和基因工程领域应用广泛，主要因为其有以下的优缺点。
（1）优点①高效：能够表达大量的目标蛋白质，通常能够达到10%以上的蛋白质总产量。
②简便：操作简便，不需要昂贵的设备，很容易进行规模化操作。
【关于优化原核表达的一些总结】
我认为，进行原核表达条件优化主要应注意以下几方面：1．密码子最优化（codon of optimization）：大肠杆菌某些核糖体蛋白质中的使用频率不同，有最佳密码子（optimal codons）或偏爱密码子（preferred codons），稀有或利用率低的密码子（rare or low-usage codons）。
大肠杆菌稀有密码子主要有ATA，CTA，CCC，ACG，CGA，CGG，AGG，GGA，GGG等。
另外，大肠杆菌偏爱的终止密码子为UAA，而哺乳动物偏爱的终止密码子为UGA。
同时，终止密码子的下游碱基对翻译有效终止有影响，大肠杆菌中UAAN，N的影响力次序为：U>G>A，C；哺乳动物中UAGN，N的影响力次序为：A，G>>C，U。
我用的pET-43.1，先用宿主菌BL21（DE3），没有目的带出现，后改用RosettaBlueTM（DE3），目的蛋白表达效率达50%以上，并且是可溶的。
2．启动子是DNA链上RNA聚合酶的识别位点和结合位点，外源基因表达的理想启动子是可以指导高效转录，保证目的基因高效表达的启动子。
乳糖启动子是最常用的启动子，但容易引起外源基因的渗漏表达，对细胞的生长产生毒害作用；其他从乳糖启动子构建而来的启动子，多用IPTG诱导，IPTG对菌体也有毒害作用。
若IPTG对宿主菌有毒，可以同时加入IPTG和乳糖诱导表达，这样可减少IPTG的浓度。
若目的蛋白有毒，可用Invitrogen公司的pLEX系统等。
3．培养基的成分：用M9ZB和NZCYM培养基培养细菌，增加细菌质粒拷贝数；用LB培养基表达外源蛋白，提高蛋白表达量。
【毒性较大蛋白表达条件优化】：１）一般发酵时高温、高浓度诱导剂（ＩＰＴＧ）有利于表达表达包涵体形成，减少毒性。
２）加大氨苄的浓度（可达400mｇ／ｍｌ）并提高培养基中葡萄糖浓度（可达0.5％）有利于稳定表达，并要及时补充葡萄糖使其浓度维持在0.5％。
原核表达
pET原核表达金标准（转）pET, 原核, 表达转自网络pET，原核表达金标准（转）pET 载体中，目标基因克隆到T7 噬菌体强转录和翻译信号控制之下，并通过在宿主细胞提供T7 RNA 聚合酶来诱导表达。
Novagen 的pET 系统不断扩大，提供了用于表达的新技术和选择，目前共包括36 种载体类型、15 种不同宿主菌和设计用于有效检测和纯化目标蛋白的许多其它相关产品。
优点•是原核蛋白表达引用最多的系统•在任何大肠杆菌表达系统中，基础表达水平最低•真正的调节表达水平的“变阻器”控制•提供各种不同融合标签和表达系统配置•可溶性蛋白生产、二硫键形成、蛋白外运和多肽生产等专用载体和宿主菌•许多载体以LIC 载体试剂盒提供，用于迅速定向克隆PCR 产物•许多宿主菌株以感受态细胞形式提供，可立即用于转化阳性pFORCE TM 克隆系统具有高效克隆PCR 产物、阳性选择重组体和高水平表达目标蛋白等特点。
pET 系统概述pET 系统是在大肠杆菌中克隆和表达重组蛋白的最强大系统。
根据最初由Studier 等开发的T7 启动子驱动系统，Novagen 的pET 系统已用于表达成千上万种不同蛋白。
控制基础表达水平pET 系统提供6 种载体- 宿主菌组合，能够调节基础表达水平以优化目标基因的表达。
没有单一策略或条件适用于所有目标蛋白，所以进行优化选择是必要的。
宿主菌株质粒在非表达宿主菌中构建完成后，通常转化到一个带有T7 RNA 聚合酶基因的宿主菌（λDE3 溶原菌）中表达目标蛋白。
在λDE3 溶原菌中，T7 RNA 聚合酶基因由lacUV5 启动子控制。
未诱导时便有一定程度转录，因此适合于表达其产物对宿主细胞生长无毒害作用的一些基因。
而宿主菌带有pLysS 和pLyE 时调控会更严紧。
pLys 质粒编码T7 溶菌酶，它是T7 RNA 聚合酶的天然抑制物，因此可降低其在未诱导细胞中转录目标基因的能力。
pLysS 宿主菌产生低量T7 溶菌酶，而pLysE 宿主菌产生更多酶，因此是最严紧控制的λDE3 溶原菌。
原核表达条件的优化
【专题讨论】原核表达条件优化！会不会是蛋白质的表达量低，电泳并不能反映出来，典型的例子是干扰素，虽然电泳没有新生条带，但是裂解上清的活性却很高。
“疑为降解条带”会不会是宿主菌蛋白，42度发酵，可抑制宿主菌蛋白表达疑为降解条带”会不会是宿主菌蛋白?那条带也挂在亲合柱子上的，发酵的细菌蛋白却没有。
挂在亲合柱子上,也有可能是非特异性条带，如用HIS TAG亲合柱，加大米错量试一下。
胞内表达有生物活性蛋白的一些策略包涵体的形成仍然是胞内基因表达巨大障碍，考虑到易聚合蛋白质复性的艰辛以及收得率的问题,胞内直接表达有生物活性的蛋白质仍然有一定的意义，到现在为止，形成包涵体的理化因素仍然不清楚，统计分析的出的结论是六个因素与包涵体的形成有关：电荷的分布、转型氨基酸残基的含量、半胱氨酸的含量、脯氨酸的含量、亲水性和总氨基酸数量（1）。
有多种手段用于减少包涵体的形成以及促进蛋白质的折叠，如低温培养（3、4、11）、宿主菌的选择（12）、某些氨基酸残基的取代（14）、共表达分子伴侣（17）、硫氧还蛋白的融合表达或与目标蛋白共表达（18）和利用硫氧还蛋白还原酶缺陷菌株作为宿主菌（2、16）等。
胞内的氧化还原势是另外的问题，细菌的胞内蛋白质半胱氨酸残基和二硫键较少，含有大量二硫键的蛋白质则被输送到胞浆以外。
这样那些依靠二硫键来稳定蛋白质四级结构的蛋白质在细菌的胞浆内因为缺乏形成二硫键的系统如DsbA/DsbB难以正确折叠。
有人分离到允许胞内二硫键形成的突变株，这些突变株使编码硫氧还蛋白还原酶的TrxB基因失活以及造成一定的还原势。
硫氧还蛋白本身对于二硫键的形成不是必需的（16），该作者认为胞内有其他的类似于硫氧蛋白的蛋白能被硫氧还蛋白还原酶还原，在硫氧还蛋白还原酶缺陷的情况下，处于氧化状态的这类蛋白质能促进二硫键的形成。
这些硫氧还蛋白还原酶缺陷菌被证实为在大肠杆菌中生产复杂蛋白质的很有价值的工具。
Novagen公司pET宿主菌系列中的AD494（DE3）和Origami B(DE3)都是TrxB基因突变菌株。
原核表达条件优化
原核表达条件优化E.coli中蛋白表达量的因素除载体启动子结构以外，还有质粒拷贝数、质粒稳定性、mRNA结构、密码子的偏爱性和宿主菌的生长状态等因素[58]。
由于V ector NTI suitor7.0软件模拟表达，可知mRNA结构和密码子的偏爱性两个影响因素不会造成表达困难，所以本实验的工作主要针对载体拷贝数、载体稳定和宿主菌的生长状态。
本实验中重组表达质粒PrP-pET-32a（+）不稳定的原因可能是PrP对E.coli BL21（DE3）具有细胞毒性。
pET-32a（+）来源于pBR-322，pBR-322源于ColE1。
ColE1、pBR-322 、pET-32a（+）都失去了分配功能区par。
而天然质粒具有功能区par，可以保证质粒在每次细胞周期中准确的进行分离，并均等的分配到子代细胞中去。
功能区par对质粒PrP-pET-32a（+）的稳定性是不可缺少的[4]。
缺少功能区par的pET-32a （+）质粒在每次细胞周期中随机分配到子代细胞中去，无细胞毒性时约98% E.coli BL21（DE3）会带有质粒（见《pET System Manual》34页）。
表达有细胞毒性蛋白的E.coli BL21（DE3）不具有生长优势，而且随细菌培养时间的增加β-内酰氨酶将逐渐释放到溶液中去，破坏溶液中的AMP。
【β-内酰氨酶功能强大，细菌培养稀释1000倍以后还能破坏几乎所有的AMP（见《pET System Manual》33页）】。
这样本不具有生长优势的表达菌又失去了选择压力，造成大部分新生细菌无质粒，表现为表达困难。
本实验证实约60%以上的细菌无质粒。
鉴于以上原因，本实验将融合蛋白Trx-PrP C27-30表达分成两个阶段，前一个阶段为质粒生长阶段，主要保证质粒的稳定性和提高质粒的拷贝数；后一个阶段为融合蛋白表达阶段，待细菌生长达饱和以后，诱导融合蛋白Trx-PrP C27-30的表达。
原核表达系统的选择和高效表达策略
大肠杆菌表达系统的几种表达方式
• 融合表达：表达载体的多克隆位点上有一段融合表达标签（Tag）， 表达产物为融合蛋白（有分N端或者C端融合表达），方便后继的纯化 步骤或者检测。对于特别小的分子建议用较大的Tag（如GST）以获 得稳定表达；而一般的基因多选择小Tag以减少对目的蛋白的影响。 His-Tag是最广泛采用的Tag。
• 缺点：
• 大肠杆菌表达体系与其他表达体系相比, 也具有一些缺 • 点: ①高效表达易形成包涵体。②不能进行翻译后的加工
修饰, 如糖基化、磷酸化及酰基化等。
大肠杆菌表达系统的操作流程
大肠杆菌表达系统操作的一般程序如下： 获得目的基因－准备表达载体－将目的
基因插入表达载体中（测序验证）－转化 表达宿主菌－诱导靶蛋白的表达－表达蛋 白的分析－扩增、纯化、进一步检测。
合倾向的中间体的浓度； （4）选择中等强度或低强度的启动子代替强启动子，降低重组蛋白的合
成速度； （5）选择适合的宿主菌株； （6）表达含可溶性多肽或信号肽的重组蛋白，提高可溶性； （7）蛋白质的可溶性往往与自身的氨基酸序列有关，因此可利用诱突
技术改变其氨基酸序列，提高目的蛋白的可溶性； （8）诱导过程中加入化学物质，以增加渗透压或改变培养基的pH值。
大肠杆菌表达系统的基本概念
• 对于做表达来说，如果不是要研究启动子的强弱，通常比较 少关心或者用到报告基因吧。绿色荧光蛋白是最常用的报告 基因了（注意选择适用原核表达版本的GFP），其他还有半 乳糖苷酶，荧光素酶等等。一些融合表达Tag也有报告基因 的功能。 启动子、终止子和核糖体结合位点： 启动子：启动子的强弱是对表达量有决定性影响的因素之 一。从转录模式上看有组成型表达和诱导调控型表达。lac 和Tac，PL和PR，T7是最常用的启动子。
原核表达系统三大要素的选择及优化
原核表达系统三大要素的选择及优化(总4页)--本页仅作为文档封面，使用时请直接删除即可----内页可以根据需求调整合适字体及大小--原核表达系统是目前使用最广泛、最完善的重组蛋白表达系统，具有遗传背景清晰、表达周期快、表达量高、成本低等优势，缺点是无法进行蛋白的翻译后修饰，得到具有生物活性蛋白的几率较小。
原核表达系统适用于表达原核来源的蛋白或不需要翻译后修饰的真核来源蛋白。
在原核蛋白表达过程中，需要综合考虑表达菌株、质粒载体、表达条件三大因素，以获得最满意的表达效果。
下面为大家一一介绍这三大因素的选择和优化。
1. 表达菌株菌株的选择往往是大家最容易忽视的，大多数人会选择使用自己实验室有的或用过的表达菌株。
当蛋白表达效果不佳时，大多会在质粒载体或表达条件上找原因，而不会考虑菌株的选择是否合适。
但作为表达宿主，菌株一定会对外源基因表达蛋白产生影响。
图1 大肠杆菌原核表达系统常用的菌株包括大肠杆菌、芽孢杆菌和链霉菌。
其中运用最为广泛的就是大肠杆菌表达系统。
以下为大家列出了一些常用的大肠杆菌表达菌株，可根据不同的需求进行选择。
2. 质粒载体质粒表达载体上的重要元件包括启动子，多克隆位点，终止子，复制子，信号肽，融合标签，筛选标记等。
根据载体上这些元件的特性，有多种质粒可供选择。
图2 大肠杆菌表达质粒pET-22b(+)图谱启动子：根据启动子的强弱考虑，强启动子可以提高蛋白表达量；弱启动子可以降低本底表达、增加可溶表达、表达小量伴侣蛋白等。
根据启动子的作用方式考虑，组成型启动子使宿主不停的表达重组蛋白；诱导型启动子使宿主在特定诱导条件下表达重组蛋白。
终止子：终止子的作用在于保护mRNA在核外不被降解，延长mRNA的寿命，以提高重组蛋白表达量。
对于T7系统来说，由于T7 RNA聚合酶效率非常高，保证一直有充足的mRNA提供翻译，所以终止子对其影响不大，只有一些自身带有起始密码子的外源基因需要终止子。
复制子：复制子决定质粒载体拷贝数，拷贝数越高，重组蛋白表达量就越高。
原核表达条件优化
原核表达条件优化【专题讨论】原核表达条件优化！之所以首先介绍Novagen公司的产品是因为用过它的pET系列载体，感觉很好用。
Novagen的母公司是德国默克（Merck）公司，它是国际著名的化学及制药公司总部位于德国的Darmstadt，已有300多年的历史。
已在全世界55个主要国家设立了分公司，其中在28个国家建有62个生产基地。
Novagen公司出品的pET系列载体是目前应用最为广泛的原核表达系统，已经成功地在大肠杆菌中表达了各种各样的异源蛋白。
pET 系列载体是利用大肠杆菌T7噬菌体转录系统进行表达的载体，其表达原理见下图。
T7噬菌体具有一套专一性非常强的转录体系，利用这一体系中的元件为基础构建的表达系统称为T7表达系统。
T7噬菌体基因编码的T7RNA聚合酶选择性的激活T7噬菌体启动子的转录。
它是一种高活性的RNA聚合酶，其合成mRNA的速度比大肠杆菌RNA聚合酶快5倍左右。
并可以转录某些不能被大肠杆菌RNA聚合酶有效转录的序列。
在细胞中存在T7 RNA聚合酶和T7噬菌体启动子的情形下，大肠杆菌宿主本身基因的转录竞争不过T7噬菌体转录体系，最终受T7噬菌体启动子控制的基因的转录能达到很高的水平。
T7噬菌体启动子的转录完全依赖于T7 RNA聚合酶，因此T7 RNA 聚合酶的转录调控模式就决定了表达系统的调控方式。
噬菌体DE3是λ噬菌体的衍生株，一段含有lacⅠ，lacUV5启动子和T7 RNA聚合酶基因的 DNA片段倍插入其int基因中，用噬菌体DE3的溶源菌，如BL21(DE3)、 HMS174(DE3)等作为表达载体的宿主菌，调控方式为化学信号诱导型，类似于Lac表达系统。
从开始涉及表达的时候可以根据是否要用基因本身的起始密码子进行选择，Novagen公司仅提供三个载体：pET-21(+)，pET-24(+)和pET-23(+)。
如果你打算利用载体的起始密码子，那么就有许多选择。
根据是否要可溶性表达，选择加有不同标记的载体。
原核表达综述
[Merck推荐]原核表达秘笈之宿主菌株选择指南在原核蛋白表达过程中，选择构建一个合适原核表达体系需要综合考虑3大因素：表达载体、宿主菌株、表达诱导条件,以获得最满意的表达效果。
事实上，在平时的实验中，最容易被忽视的就是宿主菌的选择——多数人会直接选择自己实验室曾经用过的表达菌株，或者是载体配套的菌株，而不去追究原因——即使表达结果不佳，大多在表达条件和载体上找原因，也不会考究菌株的选择是否适合。
作为原核表达的宿主，对外源基因的表达会产生一定的影响，是勿庸置疑的。
每一个宿主细胞都像一个微观的小工厂，按照细胞固有的程序完成“你给它们安排的生产任务”——因为很难亲眼观察微观世界中表达是如何进行的，当出现问题时，我们需要经验判断问题所在。
宿主细胞对原核表达可能会产生哪些影响呢？知其然还要知其所以然。
比如，菌株内源的蛋白酶过多，可能会造成外源表达产物的不稳定，所以一些蛋白酶缺陷型菌株往往成为理想的起始表达菌株。
堪称经典的BL21系列就是lon和ompT蛋白酶缺陷型，也是我们非常熟悉的表达菌株。
大名鼎鼎的BL21(DE3)融源菌则是添加T7聚合酶基因，为T7表达系统而设计。
真核细胞偏爱的密码子和原核系统有不同，因此，在用原核系统表达真核基因的时候，真核基因中的一些密码子对于原核细胞来说可能是稀有密码子，从而导致表达效率和表达水平很低。
改造基因是比较麻烦的做法，Rosetta 2系列就是更好的选择——这种携带pRARE2质粒的BL21衍生菌，补充大肠杆菌缺乏的七种（AUA, AGG, AGA, CUA, CCC, GGA 及CGG）稀有密码子对应的 tRNA，提高外源基因、尤其是真核基因在原核系统中的表达水平。
（已经携带有氯霉素抗性质粒）当要表达的蛋白质需要形成二硫键以形成正确的折叠时，可以选择K–12衍生菌Origami 2系列，thioredoxin reductase (trxB) 和glutathionereductase (gor)两条主要还原途径双突变菌株，显著提高细胞质中二硫键形成几率，促进蛋白可溶性及活性表达。
蛋白的原核表达及纯化方法
蛋白的原核表达及纯化方法小伙伴们！今天咱就来唠唠蛋白的原核表达及纯化这事儿。
这在生物实验领域可是个挺重要的活儿呢，好多研究都得靠它。
下面咱就细细说说具体的方法哈。
一、原核表达系统的选择。
咱得先挑个合适的原核表达系统呀。
常用的原核表达系统有大肠杆菌表达系统、芽孢杆菌表达系统啥的。
大肠杆菌表达系统那可是相当受欢迎的，为啥呢？因为它培养简单、生长快、成本还低。
就像咱平常过日子，当然得选那种既方便又实惠的方式啦。
不过呢，不同的蛋白可能对表达系统有不同的要求，所以得根据咱要表达的蛋白的特点来选哦。
比如说，有些蛋白可能在大肠杆菌里表达会形成包涵体，这时候可能就得考虑其他系统啦。
二、表达载体的构建。
选好了表达系统，接下来就得构建表达载体啦。
这就好比给蛋白搭个“房子”，让它能在里面好好“住”下来，顺利表达。
一般咱得先把目的基因克隆到合适的载体上。
这个过程就需要用到一些酶啦，像限制性内切酶，它就像一把“小剪刀”，能把基因片段给剪下来，然后再用DNA连接酶把它接到载体上，就像用胶水把东西粘起来一样。
而且呀，载体上还得有一些调控元件，像启动子、终止子这些，它们就像是房子里的各种设施，能保证蛋白的表达顺利进行。
启动子能启动基因的转录，终止子能让转录在合适的地方停下来，不然就乱套啦。
三、蛋白的诱导表达。
载体构建好了，就该让蛋白开始表达啦。
这时候就需要诱导啦。
不同的表达系统诱导的方法不太一样哦。
就拿大肠杆菌来说吧，常用的诱导剂是IPTG。
当咱把IPTG 加到培养体系里的时候，就像是给蛋白发了个“信号”，告诉它：“该开始干活啦！”然后蛋白就会按照咱设计的路线开始表达啦。
不过呢，诱导的条件也得好好摸索一下，像诱导的时间、诱导剂的浓度这些，都可能会影响蛋白的表达量和活性哦。
要是诱导时间太短，蛋白可能还没表达够呢；要是时间太长，又可能会对蛋白的质量有影响。
四、蛋白的纯化。
蛋白表达出来了，可里面还混着好多其他乱七八糟的东西呢，这时候就得把蛋白给纯化出来啦。
PET系统_原核表达详细总结
PET-MRI能够用于研究肿瘤生长和转移、药物代谢和疗效评估等科研项目，为新药研发和 疾病治疗提供帮助。
药物研发
PET-MRI能够用于监测药物在体内的分布、活化度和代谢过程，有助于药物研发和优化治 疗方案。
pet系统的发展历程
1970年代
PET技术开始发展并应用于临床诊 断。
1990年代
MRI技术开始应用于临床诊断，并 开始出现将PET和MRI技术结合的研 究。
加强质控和安全性
通过建立完善的质控体系和加强产品安全性评估 ，提高产品的质量、安全性和可靠性。
THANKS
2000年代初
第一台PET-CT问世，随后PET-MRI 技术也开始进入临床试验阶段。
2010年代
PET-MRI技术逐渐成熟并开始广泛 应用于临床诊断、科研和药物研发 等领域。
02
原核表达系统概述
原核表达系统的定义
原核表达系统是一种在原核生物中利用基因 工程技术表达特定基因产物的技术平台。
原核表达系统以原核生物的基因组、质粒或 噬菌体为载体，通过基因重组将目的基因插 入表达元件，转化原核细胞并表达目的蛋白
白的生物学活性。 • 安全性：原核表达载体可能含有致病基因，对人类和环境存在潜在危害。 • 蛋白纯化：原核细胞表达的蛋白质可能存在不稳定性，需要纯化以消除杂质影响。
03
pet系统与原核表达系统的关系
pet系统中原核表达系统的应用
01
生产重组蛋白
通过原核表达系统，生产具有生物活性的重组蛋白药物，如胰岛素、
存在毒性
某些原核表达系统生产的重组蛋白可能存在毒性，需进行去除毒性处理。
04
原核表达系统的下游应用
基因鉴定
基因序列验证
原核生物基因的表达及其调控
由此可见：σ亚基对识别DNA链上的转录信号是不可缺少的，它是核心酶和启动子之间的桥梁。 σ因子的取代在细胞发育和对环境应答的反应中起主导作用。如在枯草杆菌中就有不同相对分子质量的σ因子
Figure 9.6 RNA polymerase moves like an inchworm during elongation, when it presses from the back end and release from the front end.
色氨酸操纵子模型结构： 5种结构基因：trpE、D、C、B、A； 调控结构：启动子、操纵基因、前导序列、弱化子； 阻遏物trpR基因：与trp操纵子相距较远；
色氨酸操纵子的负调控：
trpR基因编码无辅基阻遏物 与色氨酸结合 形成有活性的色氨酸阻遏物 与操纵子结合 阻止转录；
在启动子与终止子之间是一个转录单位，通常将mRNA开始的一个核苷酸定为o点(即+1)．由此向右常称为下游(downstream)，其核苷酸依次编为正序号；起始点左例称为上游(upstream)．其核苷酸则依次以负号表示．紧接起始点左侧的核苷酸为-1。
离体实验表明：全酶所转录的RNA和细胞内所转录出的RNA，其起始点相同，序列相同，若仅用核心酶进行转录，则模板链和起始点的选择都有很大的随意性，而且往往同一段DNA的两条链都被转录。
前导序列可翻译出一段14个氨基酸的短肽，在该短肽的第10、11位置上是两个色氨酸密码子；两个密码子之后是一段mRNA序列，该序列可分为四个区段，区段间可互补配对，形成不同的二级结构。
问题：弱化子如何进行调控？
. 当有色氨酸时，完整翻译短肽 核糖体停留在终止密码子处，邻近区段2位置 阻碍了2,3配对 使3, 4区段配对 形成发夹结构终止子 RNA酶在弱化子处终止，不能向前移动。
原核蛋白表达方法
原核蛋白表达方法简介：蛋白质是生物体内最基本的分子组成单位，对于生命体的正常功能起着至关重要的作用。
在研究和应用中，为了获得特定的蛋白质产物，科学家们常常需要对目标蛋白进行大量表达。
原核蛋白表达方法是一种常用的蛋白质表达方法，通过利用原核生物体的表达系统，使目标基因在细菌或古细菌中高效表达，从而获得大量目标蛋白。
原核蛋白表达方法的基本流程：1. 选择适当的表达载体：表达载体是原核蛋白表达的基础，一般包括启动子、转录终止子、选择标记等。
常用的表达载体有质粒、噬菌体等。
根据实验需求，选择合适的表达载体进行目标基因的克隆。
2. 转化宿主细胞：将经过重组的表达载体转化至宿主细胞。
常用的宿主细胞有大肠杆菌(E.coli)、酵母菌等。
转化方法可以是热激转化、电转化等。
3. 优化表达条件：调控表达载体的启动子、温度、培养基等条件，以提高目标蛋白的表达水平。
此外，还可以通过添加诱导剂、调整培养时间等方式来优化表达条件。
4. 提取目标蛋白：待细菌或古细菌在培养基中生长一定时间后，收取菌液。
通过离心、破碎细胞壁等方式，将目标蛋白从细菌或古细菌中提取出来。
提取方法可以是化学提取、超声波破碎等。
5. 纯化目标蛋白：通过蛋白质纯化技术，将提取得到的目标蛋白从混合物中分离出来。
纯化方法可以是亲和层析、离子交换层析、凝胶过滤层析等。
6. 验证目标蛋白：通过蛋白质电泳、Western blot等方法对目标蛋白进行验证，确认其纯度和活性。
原核蛋白表达方法的优势：1. 原核生物体生长速度快，表达周期短，可以快速获得目标蛋白。
2. 表达水平高，可以得到较高产量的目标蛋白。
3. 表达系统相对简单，易于操作。
原核蛋白表达方法的应用：1. 科学研究：用于获得特定的蛋白质，以研究其结构、功能和相互作用等。
2. 药物研发：用于大规模合成蛋白药物，如重组蛋白、抗体等。
3. 工业应用：用于生产酶制剂、饲料添加剂等。
原核蛋白表达方法的改进和发展：为了进一步提高原核蛋白表达方法的效率和产量，科学家们不断进行改进和发展。
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原核表达系统是目前使用最广泛、最完善的重组蛋白表达系统，具有遗传背景清晰、表达周期快、表达量高、成本低等优势，缺点是无法进行蛋白的翻译后修饰，得到具有生物活性蛋白的几率较小。
原核表达系统适用于表达原核来源的蛋白或不需要翻译后修饰的真核来源蛋白。
在原核蛋白表达过程中，需要综合考虑表达菌株、质粒载体、表达条件三大因素，以获得最满意的表达效果。
下面为大家一一介绍这三大因素的选择和优化。
1. 表达菌株
菌株的选择往往是大家最容易忽视的，大多数人会选择使用自己实验室有的或用过的表达菌株。
当蛋白表达效果不佳时，大多会在质粒载体或表达条件上找原因，而不会考虑菌株的选择是否合适。
但作为表达宿主，菌株一定会对外源基因表达蛋白产生影响。
图1 大肠杆菌
原核表达系统常用的菌株包括大肠杆菌、芽孢杆菌和链霉菌。
其中运用最为广泛的就是大肠杆菌表达系统。
以下为大家列出了一些常用的大肠杆菌表达菌株，可根据不同的需求进行选择。
2. 质粒载体
质粒表达载体上的重要元件包括启动子，多克隆位点，终止子，复制子，信号肽，融合标签，筛选标记等。
根据载体上这些元件的特性，有多种质粒可供选择。
图2 大肠杆菌表达质粒pET-22b(+)图谱
启动子：根据启动子的强弱考虑，强启动子可以提高蛋白表达量；弱启动子可以降低本底表达、增加可溶表达、表达小量伴侣蛋白等。
根据启动子的作用方式考虑，组成型启动子使宿主不停的表达重组蛋白；诱导型启动子使宿主在特定诱导条件下表达重组蛋白。
终止子：终止子的作用在于保护mRNA在核外不被降解，延长mRNA的寿命，以提高重组蛋白表达量。
对于T7系统来说，由于T7 RNA聚合酶效率非常高，保证一直有充足的mRNA 提供翻译，所以终止子对其影响不大，只有一些自身带有起始密码子的外源基因需要终止子。
~
复制子：复制子决定质粒载体拷贝数，拷贝数越高，重组蛋白表达量就越高。
表达载体通常会选用高拷贝的复制子，但过高的拷贝数会影响质粒稳定性和宿主生长。
常用的高拷贝复制子包括pCoE1，pMBI (pUC)等。
融合标签：融合标签是与目的蛋白共同表达的一段多肽。
较小的融合标签（如His-tag）一般不影响重组蛋白的结构和功能；较大的融合标签（如GST）可以帮助蛋白表达和折叠，提高蛋白溶解度。
N端标签自身带有启动子和宿主偏好密码子，可以提高蛋白表达量，但提前中止的蛋白片段也会一并被纯化；C端标签则可保证只有完整的蛋白得到纯化。
标签位置还应该避免位于蛋白重要功能区末端。
筛选标记：在没有压力的培养环境下，宿主中的外源质粒常随着复制而丢失。
为了稳定
质粒表达，需要在质粒载体中加入筛选标记，使宿主在压力环境下生长。
常用的抗生素筛选标记有：青霉素抗性、卡那霉素抗性、氯霉素抗性和四环素抗性等。
需要根据不同的菌株和培养环境，选择合适的筛选标记。
3. 优化表达条件
新建的重组蛋白表达系统常常会出现蛋白不表达、或表达量不理想等情况。
为了提高重组蛋白表达量、改善蛋白质量，一般都需要对表达条件进行优化。
原核表达条件的优化主要从以下几方面考虑：
蛋白不表达：如果重组蛋白不表达，首先检查cDNA和质粒是否正确，然后尝试更换菌株、质粒载体、标签等。
通常原核来源的蛋白不能表达的情况很少见，如果是真核蛋白不能表达，还可以更换表达系统，尝试酵母或昆虫细胞表达系统。
蛋白表达量低：宿主菌蛋白的密码子使用频率一般是不同的，有最佳密码子、偏好密码子、稀有密码子和利用率最低的密码子。
检查目的蛋白的密码子构成，使其适应宿主菌的密码子偏好。
如果重组蛋白N端存在大量集中稀有密码子，会降低mRNA的稳定性，显著降低翻译速度，引起翻译提前中止，将这些稀有密码子突变成宿主偏好的密码子，能够显著提高蛋白表达水平。
另一种方法，还可以将菌株更换为提供稀有密码子tRNAs的菌株（如Rosetta）。
此外，高GC含量、回文结构和相距较近的两个起始密码子都会阻碍转录启动。
可溶表达低：如果重组蛋白可溶表达低，可尝试降低诱导后培养温度，引导重组蛋白降低表达速度，提高正确折叠率，一般25-30℃就能明显改善蛋白折叠。
重组蛋白在所有细胞中表达水平相当时，减少诱导剂可明显增加蛋白可溶表达量。
使用M9ZB和NZCYM培养基，可增加细菌的拷贝数；使用LB培养基，可提高外源蛋白的表达量。
高毒性蛋白：宿主菌的生长会受到外源基因表达的影响。
经过改造的宿主在很大程度上能够容忍重组蛋白，重组蛋白可以占到细胞总蛋白量的50%以上。
但少数高毒性蛋白的本底表达会杀伤宿主，导致质粒丢失，所以需要降低重组蛋白的本底表达量。
采用的方法包括在培养基中加入1%的葡萄糖、使用严格启动和低拷贝数的载体、选择可表达T7溶菌酶的宿主等。
除此之外，还可以通过共表达重组蛋白抑制剂、提高抗生素浓度等方法提高重组蛋白表达量。
包涵体表达：过量表达的重组蛋白会在大肠杆菌细胞内凝聚，形成无活性的包涵体沉淀。
包涵体蛋白的优势在于能够轻松获得超高表达量，不可溶蛋白不会被宿主蛋白酶降解，重组蛋白毒性被大大抑制，蛋白纯度高且易纯化；其缺点在于包涵体蛋白折叠混乱、二硫键配对
混乱、没有生物活性、需要变复性。
提高培养温度、延长培养时间、加大菌密度都有利于诱导包涵体形成。