研究生课件+第四讲+启动子

反式作用因子(trans-acting factors)
由不同染色体上基因编码的、能直接或间接地识 别或结合在各顺式作用元件核心序列上并参与调 控靶基因转录效率的一些结合蛋白。
反式作用因子有两个重要的功能结构域：DNA
结合结构域和转录活化结构域，它们是其发挥转
录调控功能的必需结构。
3‘调控序列: 终止子
Domain B
Domain A
含有重复的-343— -90部分的35S启动子比350bp的35S 启动子的强度大10倍。
•
CaMV 35S 启动子是一个组成型启动子，不仅 可以能在双子叶植物中高效启动基因表达，而且 在许多单子叶植物中也可以高效启动基因表达。 另外 CaMV 35S 启动子内部没有我们常用的酶切 位点，因而容易克隆和使用，在植物基因工程中 得到了广泛的应用。
植物生物技术
第四讲 控制植物基因表达的启动子
第一节 植物基因的结构
能编码蛋白质的基因称为结构基因。真核生物的结构基 因是断裂的基因，含有若干段编码序列，这些可以编码的序 列称为外显子。在两个外显子之间被一段不编码的间隔序列 隔开，这些间隔序列称为内含子。每个断裂基因在第一个和 最后一个外显子的外侧各有一段非编码区，称为侧翼序列， 在侧翼序列上有一系列控制基因表达的调控序列 。
• CaMV 35S 启动子是花椰菜花叶病毒 （cauliflower mosaic virus，CaMV) 双链 DNA病毒基因组中启动35S RNA基因转录 的启动子， CaMV 35S promoter，它可以 利用宿主细胞核 RNA 聚合酶进行基因转录， 并且不依赖于病毒的产物。
35S启动子的结构
4. 静止子(silencer)
• 最早在酵母中发现，以后在T淋巴细胞的T抗 原受体基因的转录和重排中证实这种负调控顺式 元件的存在。目前对这种在基因转录降低或关闭 中起作用的序列研究还不多，但从已有的例子看 到：静止子的作用可不受序列方向的影响，也能 远距离发挥作用，并可对异源基因的表达起作用。
茎
叶片横切面
根
花
幼苗
35S 启动子控制的GUS基因在烟草中表达
• 由于CaMV 35S 启动子在植物中成功的应 用，人们也克隆了其它病毒的启动子，如 cassava（木薯） vein mosaic virus (CsVMV) promoter ， Australian banana streak virus (BSV) promoters，mirabilis mosaic virus (MMV) promoter and figwort （玄参）mosaic virus (FMV) promoter，这 些启动子也能够在植物中高效高效启动基 因的转录。
CAAT框(CAAT box)
TATA框(TATA box)
2.上游启动子元件(upstream promoter element): 包括通常位于－70bp附近的CAAT盒和GC盒、以及
距转录起始点更远的上游元件。这些元件与相应的
蛋白因子结合能提高或改变转录效率。不同基因具 有不同的上游启动子元件，其位置也不相同，这使 得不同的基因表达分别有不同的时间与空间表达调 控。这些上游启动子元件中，最普遍的是增强子元
•
利用病毒来源的启动子进行植物转基因有 令人担心的问题，如： • 转基因食物与感染人类的病毒存在时， 启动子可能与病毒基因重组、导致病毒基 因的大量表达。 • 植物细胞可能不识别病毒来源的启动子 序列，把它当作外源DNA，对它进行修饰、 使它失去作用，导致基因沉默。
原核生物组成型启动子之二： 农杆菌胭脂碱合成酶基因启动子 Nos promoter
花椰菜花叶病毒35S启动子=CaMV35S启动子
11281 11341 11401 11461 11521 11581 11641 11701 11761 11821 tttcccgcct tcgccgtaaa aaatcttcgt cagtctcaga tcctcggatt gtggctccta ccgacagtgg ttccaaccac acgcacaatc tggagagaac tcagtttagc gactggcgaa caacatggtg agaccaaagg ccattgccca caaatgccat tcccaaagat gtcttcaaag ccactatcct acgggggact ttcatggagt cagttcatac gagcacgaca gcaattgaga gctatctgtc cattgcgata ggacccccac caagtggatt tcgcaagacc cttgac caaagattca agagtctctt cacttgtcta cttttcaaca actttattgt aaggaaaggc ccacgaggag gatgtgatat cttcctctat aatagaggac acgactcaat ctccaaaaat aagggtaata gaagatagtg catcgttgaa catcgtggaa ctccactgac ataaggaagt ctaacagaac gacaagaaga atcaaagata tccggaaacc gaaaaggaag gatgcctctg aaagaagacg gtaagggatg tcatttcatt
真核基因在3′端终止密码的下游有一个核苷酸顺序为AATAAA，这一顺序可能 对mRNA的加尾(mRNA尾部添加多聚A)有重要作用。这个顺序的下游是一个反向 重复顺序。这个顺序经转录后可形成一个发卡结构。发卡结构阻碍了RNA聚合酶 的移动。发卡结构末尾的一串U与转录模板DNA中的一串A之间，因形成的氢键 结合力较弱，使mRNA与DNA杂交部分的结合不稳定，mRNA就会从模板上脱落 下来，同时，RNA聚合酶也从DNA上解离下来，转录终止。AATAAA顺序和它下 游的反向重复顺序合称为终止子，是转录终止的信号。
35S启动子的核心长度为60bp左右；其上游有其它元件，控 制启动子的转录效率和特异性，其中包括增强子。
Domain A:与在根部起作用有关。
Domain B：是烟草转录因子ASF-1的结合部位，与在植物叶片、茎等绿色 组织中起作用有关。 -343 -90 +9
增强子 上游部分：与转录强度有关（增强子功能）。
1. 核心启动子元件(core promoter element):
件单独起作用时只能确定转录起始位点和产生基础水平的转录。
指RNA
聚合酶起始转录所必需的最小的DNA序列，包括TATA盒和 CAAT盒。核心元
（1） TATA框(TATA box)：位于5′端转录起始点上游约20-30个核苷酸的地 方。TATA框是一个短的核苷酸序列，其碱基顺序为TATAATAA。TATA框是 RNA聚合酶的重要的接触点，它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始 转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时，mRNA的转录就会从不正常的 位置开始。 （2） CAAT框(CAAT box)：位于5′端转录起始点上游约70-80个核苷酸的地 方。CAAT框是启动子中另一个短的核苷酸序列， 其碱基顺序为 GGCTCAATCT。CAAT框是RNA聚合酶的另一个结合点，一般认为它控制 着转录的起始频率，而不影响转录的起始点。当这段顺序被改变后，mRNA 的形成量会明显减少。
带增强子的35S启动子
N co I(2 4 0 0 ) SacI(3 0 0 ) SalI(1 4 3 0 ) Eco RI(1 ) 2 X CaMV3 5 S X h o I(1 5 5 0 0 ) H y g ro my cin X h o I(1 4 5 0 0 ) p o ly A LB n o s N h eI(7 2 5 0 ) K an amy cin RB N h eI(1 0 6 5 0 ) pC a mbia -Ag l5 -ia a M G USp lu s 1650 0bp 1 n o s iaaM SalI(4 5 0 0 ) PstI A g l5 Sp h I H in d III(4 5 2 0 ) lacZ 3 5 S P N co I(5 2 0 0 ) Bg lII(5 2 0 6 )
• 在植物基因工程中，我们要构建基因表达盒 (gene expression cassette)，表达盒的结构 为：
原核生物和真核生物的启 动子 启动子 目的基因 终止子
基因组DNA
植物基因表达的结构
多为原核生物的： CaMV35S基因的polyA; 农杆菌胭脂碱基因的Tnos
Hale Waihona Puke Baidu 第二节 启动子的结构
件。
• 3.增强子（enhancer）
是一种能够提高同一条DNA链上基因转录效率 的顺式调控元件。最早是在SV40病毒中发现的长 约200bp的一段DNA，可使旁侧的基因转录提高 100倍，其后在多种真核生物和原核生物中都发
现了增强子。增强子通常长100－200bp，也和启
动子一样由若干组件构成，基本核心组件常为8－
③增强子要有启动子才能发挥作用。没有启动子 存在，增强子单独不能表现活性。
④增强子对启动子没有严格的专一性。同一增强
子可以影响不同类型启动子的转录。例如当含有
增强子的病毒基因组整合入宿主细胞基因组时，
能够增强整合区附近宿主某些基因的转录；当增 强子随某些染色体段落移位时，也能提高移到的
新位置周围基因的转录。
12bp，可以单拷贝或多拷贝串连形式存在。增强
子的作用有以下特点：
①增强子可以远距离作用。通常可距离1-4 kb、 个别情况下离开所调控的基因30kb仍能发挥作 用，而且在基因的上游或下游都能起作用。 ②增强子作用与其序列的正反方向无关。将增
强子方向倒置依然能起作用。而将启动子倒就
不能起作用，可见增强子与启动子是很不相同 的。
启动子
5‘调控序列
结构基因
3‘调控序列
Kzhi
• 植物基因表达: • 在启动子和其它调节因子（如转录因子、 增强子）作用下，RNA聚合酶II将功能基因 转录成mRNA， mRNA再并进一步翻译成蛋 白质的过程。
增强子区
转录因子
RNA聚合酶
启动子区
转录因子
结构基因
基因表达可以在转录水平和翻译水平进行调节。 基因转录受到一些作用元件的影响： • 顺式作用元件(cis-acting elements): 是基因周围 （同一染色体或DNA分子）能与特异转录因子结合 而影响基因转录的DNA序列。主要是起正性调控作 用的顺式作用元件，包括启动子(promoter)、增强 子(enhancer)；近年又发现起负性调控作用的元件 静止子(silencer) 。
第三节 启动子的类型
一、组成型启动子
• 可以在所有细胞、组织和器官中持续发挥作用的 启动子。如看家基因的启动子。组成型启动子用 来控制基因的持续表达，如抗病、抗虫、抗不良 环境的基因。 • 在植物基因工程中，用于控制基因组成型表达的 启动子主要有2个来源：微生物和植物。
1. 病毒来源的组成型启动子—CaMV35S 启动子
启动子：位于结构基因5’端上游、能够指导RNA聚合 酶同模板正确结合、启动基因转录的一段DNA序列。
增强子区
启动子区
结构基因
真核启动子比原核更复杂、序列也更长，它不 像原核启动子那样有明显共同一致的序列，而且 单靠RNA聚合酶难以起动转录，而是需要多种蛋 白质因子的相互协调作用。不同真核启动子之间 大小、序列很不相同。不同物种的启动子有时不 能互用，如动物和植物之间。 • 真核启动子中包含了许多调节基因转录的元件， 它们控制着基因表达的强弱或者时空差异。根据 对基因表达的必须性，这些元件分为2类：核心启 动子元件和上游启动子元件
卫矛 Nos promoter
Nos promoter 烟草 35S promoter
2. 植物来源的组成型启动子
• 在植物中有很多看家基因，在各种类型细胞和 所有时间内都表达。启动这些基因表达的启动子 就是组成型启动子。现在许多这类启动子已经被 克隆，并在植物基因工程得到了应用。 • 肌动蛋白（actin）是细胞基本骨架的成分， actin基因家族的基因都是组成型基因，其启动子 就是组成型启动子。通过检测报告基因的表达， 发现1.5kb的拟南芥actin2基因启动子几乎在拟南 芥所有器官和整个发育过程中都起作用，仅在种 皮、胚轴、子房和花粉囊中不起明显作用。 • 水稻的actin1基因启动子仅不在木质部中起作用。