微生物的分类
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第三十五讲微生物的分类
教学目的:了解微生物分类的基本知识
教学重点:微生物分类等级及命名方法
教学难点:微生物分类系统
课时分布:1学时
教学过程:
一、微生物在生物分类系统中的地位
分类是认识客观事物的一种基本方法,要充分认识和利用生物就必须对生物进行分类,没有分类,面临的将是一团乱麻。
生物分类系统:指按亲缘关系分群归类编排成的系统
生物界中的分类系统,因不同的人采用的分类方法、分类依据不同,因而形成的生物分类系统不同,有将生物界分成:
二界:植物界、动物界
三界:植物界、动物界、原生生物界
四界、五界、六界的。
到了70年代末,伍斯等通过对大量菌体细胞进行寡核苷酸序列分析,提出了目前比较为大家所接受的三界生物系统树:细菌、古生菌、真核生物。由于微生物种类繁多(约1.5万种),形体微小,构造简单,易受环境影响而发生变异,所以微生物之间的亲缘关系很难完全确定,对它的分类还有人为因素的参与,因此至今所提出的一些分类系统还不能很好地反映微生物自然系统分类。
二、微生物的分类单位与命名
(一)分类单位
微生物的分类同其它生物分类一样,借助分类单位进行的。
1、正式等级
主要的分类单位:界、门、纲、目、科、属、种
亚级:亚界、亚门、亚纲……………………亚种
科与属间设族,亚族(主要的分类等级不足以反映分类单元之间的差异时设)
2、非正式的分类等级:菌株、型、群、培养物
种——指一群在形态和生理方面非常相似或差别微小的个体。
同种生物祖先是同源的,由于处在不同的生态环境中而造形态、生理的微小变化,但总的特性是一致的。同时,生物在进化过程中,变异是不可避免的,也是产生新种的重要原因之一。因此微生物分类中所确定的种有人为的、暂时的性质。
亚种——基本特征与典型菌株基本相符,而个别较次要的特征不相符合但又稳定的变异株。是变种(现不再用)的同义词。
培养物——指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。
型——亚种以下的细分,当同种或同一亚种内不同菌株之间的性状差异不足以区分为新的亚种时可以分为不同的型。
菌株——同种不同来源的纯培养。
不同来源的同种微生物,它们的特性不可能完全相同,总会存在一些或大或小的差异,如不同环境中的枯草杆菌,它们的抗热能力,生长温度范围,发酵力等方面均有一定的差异。
居群——指一定空间中同种个体的组合。每一个物种在自然界中的存在都有一定的空间结构,所居住的群体单元称居群。
(二)命名
同其它生物一样,采用林萘创立的“双名法”,即用两个拉丁字来称呼一个微生物种,种的学名必须用该法命名:
属名 + 种名 = 种的学名
拉丁名词拉丁形容词
前:前字母大写后:全小写
例:Bacillus subtilis 枯草芽孢杆菌
Bacillus thuriuggiensys 苏云金芽孢杆菌
Staphylococcus aureus 金黄色葡萄球菌
三、生物分类系统
通过对微生物进行综合考察,确定它们在进化上的亲缘关系和性状上的相似程度,把类似的微生物归在一起,组成相互联系的类群,提出反映系统发育的分类系统。
当然,由于环境条件的影响,变异是不可避免的,同时,由于现代科学技术的高度发展,先进的精密科学仪器的问世,现在还不为人们所知的微生物必将为人所识,故分类系统并不是一成不变的,加上不同的人采用的分类依据,分类方法不同,得到的分类系统也不同,主要的分类系统有:
(一)细菌分类系统
1、“伯杰氏鉴定细菌学手册”(Bergey,s Manual of Systematic Bacteriology)
目前,国际上影响最大、最有权威、应用最广的细菌分类系统,共出版了9个版本,从第八版开始放弃了从界 种的完整的分类体系,将细菌归属于原核生物界,下分蓝细菌和细菌。将细菌进一步分成19部分,对蓝细菌未作进一步分类。
第九版(新版)内容有较大变动,全书共分四卷。采用了一些现代的分类方法如核酸杂交、寡核苷酸序列分析等,因而此第八版要更全面,更合理些。
2、“细菌和放线菌的鉴定”前苏联克拉西里尼科夫
3、“细菌分类学”法国普雷沃
(二)放线菌分类系统
1、美国瓦克斯曼分类系统
2、苏联克拉西里尼科夫
(三)酵母菌分类系统
荷兰罗德(Lodder)分类系统