PubMed中文使用手册

PubMed中文使用手册

（一）PubMed简介：

PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开

发的、基于WWW的查询系统。

PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。

PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务，MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。

PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生

物学数据，序列中心的数据等等。

PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。

（二）页面介绍:（更新很快，但其内容变化一般不大）

在你的浏览器中的URL地址框中健入

/pubmed/

并单击回车键后，你将进入Pubmed的主页面。如图：

1. 主页面左侧框的介绍（注：Cubby和tutorial为最新

加入的）

MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表

Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。

Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。

Clinical Queries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、病原学与预后。

Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式)

关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。

Related Resources

Order Documents提供一种收费性质服务，可以使用户在当地得到文献的全文拷贝（费用与发送方式各不相同）。

Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。Grateful Med 也提供MEDLINE的接入，并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。

Consumer Health提供与MEDLINE plus的链接，MEDLINE plus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。

Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。

2. 主页面底部的介绍

Disclaimer 在这里可以得到版权的相关信息，不承诺责任与担保的声明，与NLM下载的相关政策。

Write to the Help Desk发e-mail给NLM消费者服务部。

NCBI|NLM|NIH这里是对创建和维护PubMed的机构网页链接。

下面将举例说明查询的主体部分，也就是页面上部的使用方法。

假如我们这次的工作是查找与gallstone、pain有关的文献。

在对话框中输入查询词。比如我们这次输入的是gallstone pain，然后单击“go”按钮或按回车键，PubMed将会自动开始检索，并将检索到的相关条目显示在屏幕上。

你可以随时向查询框输入查询词，点击“go”按钮开始新的查询。“clear”按钮可以帮你清除查询框中的内容，然后开始一个新的查询。

在查询框前search提示后有一个下拉式菜单，你可

以在这里选择其他的信息资源或NCBI的数据库。

Structure 搜索分子结构数据库

(MMDB)The Molecular Modeling Database，这个数据

库保存的是由X线晶体成像、NMR分光光度法建立的三维

分子结构。

Genome 提供所有基因与染色体纪录与图片的查询服务，这个库中数以百万的基因序列是由庞大的基因排序工作得来的。

PopSet 这个数据库中的内容是由相关种族、人类发展、突变研究得来的人类进化与人种差异的结果。

下面我们将详细介绍查询结果屏幕。

Display Option（显示选项）

在Display后面有一个下拉式菜单，在这里可以选择各种显示选项。

Summary（简要格式）：在缺省设置下PubMed采用这种显示格式，他所显示的内容包括以下几项：

作者：纪录中的所有作者都奖杯显示出来。

相关：列出相关内容，如文章、蛋白质、核苷酸等（列出的文章不以摘要格式显示）。

文章题目：英语以外的语种的题目将被翻译成英语，并且加上括号。

来源：提供文献所在期刊名的缩写，出版时间，卷，页数，也包括语种（针对非英语文献），出版类型。没有摘要的文献将显示

“No abstract available”

标识数字：提供PubMed标示（PMID）与MEDLINE唯一标识（UI）。

Brief（简报格式）：显示的条目内容包括作者姓名、文献名的前10个字母、PubMed唯一标识。

Abstract（摘要格式）：将会显示以下几项内容：文献题目、作者、第一作者单位（地址）、期刊来源（期刊名简写、出版日期、卷、页数）、如果必要加上标注、出版类型、非英语文章加上标注、摘要、备注、PubMed与MEDLINE的唯一标识。

Legend（图例格式）：显示文献出处、名称、作者、第一作者单位（地址）、摘要、PubMed与MEDLINE的唯一标识。

Citation（引证格式）：提供如下信息：文献出处、文献题目、作者、第一作者单位（地址）、如果必要加上标注、出版类型、摘要、红体显示题目中的错误字串、备注、MeSH词、人名作为主题、（如果存在）化学物质、（如果存在）巨大数字、PubMed与MEDLINE的唯一标识。

MEDLINE格式（MEDLINE）：用两字符的形式显示MEDLINE纪录中所有的内容，使用这种格式可以把记录下载到管理书目的软件程序。

Retrieval Summary（查询概要）：查询概要显示了查到所有条目的数量，以及需要多少页来显示，缺省情况下20条/页。

Show后的下拉式菜单可以选择相应得每页显示的条目数。

Page（选择页数）：PubMed根据你的选择而显示不同页的内容，所选中的页数以红色显示，单击〉〉或〈〈显示其他页码。

Details（详细内容）：

1)单击Details按钮可以显示你正在进行的查询方案，包括查询词、MeSH 表映射与PubMed词语索引的映射；错误信息，比如禁用词、截断警告、错误拼