遗传病相关个体化医学检测技术指南(试行)
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前
言
遗传病是指由于基因突变或染色体数目或结构变异导致的疾病。目前,大部 分遗传病没有很好的治疗方法, 因此根据其发病的分子基础进行有针对性的个体 化医学检测就显得十分必要。 本指南由国家卫生计生委个体化医学检测专家委员会编订, 是国家卫计委个 体化医学检测技术系列指南之一, 旨在对遗传病个体化医学检测中所涉及的遗传 咨询、诊断技术选择和规范、实验室建设和运行、诊断结果解释等方面进行一般 性的技术指导。 本指南起草单位:上海交通大学医学遗传研究所、上海市儿童医院、复旦大 学出生缺陷研究中心、河南省人民医院、厦门大学生命科学院、温州医科大学。 本指南起草人:曾溢滔、曾凡一、马端、廖世秀、李庆阁、颜景斌、任兆瑞、 王伟、黄淑帧、马竞、秦胜营、梅艳巧、徐沁、贺光、张卉、侯巧芳、王莉、廖 逸群、黄秋英、李伟、吕建新。
10.1 Duchenne 肌营养不良(DMD/BMD)基因诊断指南 ................................. 56 10.2 地中海贫血基因诊断指南 ............................................................................. 63 11. 12. 13. 附录 A 产前诊断相关知情同意书 ................................................................ 71 附录 B 基因检测知情同意书 ........................................................................ 74 附录 C 不同诊断方法的优缺点 .................................................................... 77
6.3 线粒体病 ........................................................................................................... 43 7. 遗传病诊断结果的报告和解释 ............................................................................. 47 7.1 总体原则 ........................................................................................................... 47 7.2 细胞遗传学实验的检测报告 ........................................................................... 47 7.3 分子遗传学实验的检测报告 ........................................................................... 48 8. 遗传病检测实验室设计要求 ................................................................................. 50 8.1 细胞遗传学检测实验室的设计 ....................................................................... 50 8.2 分子遗传学检测实验室的设计 ....................................................................... 51 8.3 对检测实验室人员及设备的要求 ................................................................... 51 9. 遗传病个体化医学检测的质量保证 ..................................................................... 53 9.1 标准操作程序(Standard Operation Procedure,SOP) ............................... 53 9.2 质控品和室内质量控制 ................................................................................... 54 9.3 室间质量评价 ................................................................................................... 55 10. 常见遗传病分子诊断示例 ................................................................................ 56
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1. 本指南适用范围 本指南仅对遗传病相关个体化医学检测项目的研究背景、技术要点、有效性 评估以及临床应用等进行描述, 同时为使用者提供以检测实践为目的的指导性建 议。本指南主要内容包括:遗传病及相关检测技术发展的概述,不同类型遗传病 样本的采集及处理原则和方法,常见遗传病细胞与分子检测方法的介绍,遗传病 个体化医学检测实验室的设置及质量控制, 常见遗传病的介绍及诊断方法的选择 以及分子诊断结果的报告和解释。 本指南主要适用于遗传病个体化医学检测实验室的技术人员, 用于规范相关 的检测过程,同时对进行遗传病临床咨询及诊治的医师也具有一定的参考价值。 2. 标准术语 1) 遗传(heredity, inheritance) :性状由亲代向子代传递的现象或过程。 2) 遗传病(genetic disease) :由于基因突变或染色体数目或结构变异导致的疾 病。 3) 医学遗传学(medical genetics) :应用遗传学的理论与方法研究遗传因素在疾 病发生、流行、诊断、预防、治疗和遗传咨询等中的作用机制及其规律的遗 传学分支学科。 4) 临床遗传学(clinical genetics) :从临床出发研究遗传因素与疾病的病变过程 及其诊治关系的遗传学分支学科,是医学遗传学在临床上的应用。 5) 先天性疾病(congenital disease) :婴儿一出生即存在的疾病。既可能是由于 遗传性因素引起,也可能是由于母亲怀孕期接触某些有害的环境因素而导致 的胎儿先天异常。 6) 出生缺陷(birth defect) :又称先天缺陷,是指由于先天性、遗传性或不良环 境等原因引起的出生时存在的各种结构性畸形和功能性异常。 7) 基因诊断(gene diagnosis) :又称分子诊断,是通过对某个遗传病患者的某 一特定基因(DNA)或其转录产物(mRNA)进行分析并作出诊断的技术。 8) 遗传咨询(genetic counseling) :为患者或其家属提供与遗传疾病相关的知识 或信息服务。 9) 先证者(proband) :在家族中首先被确认的遗传病患者。 10) 携带者(carrier) :携带某一特定隐性遗传病致病基因突变的杂合子个体。
遗传病相关个体化医学检测技术 指南(试行)
目
录
1. 本指南适用范围 ....................................................................................................... 2 2. 标准术语 ................................................................................................................... 2 3. 遗传病检测概述 ....................................................................................................... 5 3.1 遗传病的分类及分子基础 ............................................................................. 5 3.2 遗传病诊断技术发展概况 ............................................................................. 6 4. 遗传病分子检测前质量控制 ................................................................................... 7 4.1 遗传咨询 ......................................................................................................... 7 4.2 知情同意 ......................................................................................................... 9 4.3 样本采集 ....................................................................................................... 10 4.4 样本运输、提取与保存 ............................................................................... 12 4.5 样本的质量控制 ........................................................................................... 14 4.6 样本信息采集与录入 ................................................................................... 15 5. 遗传病的细胞、分子诊断技术及质量控制 ......................................................... 15 5.1 染色体核型分析技术 ....................................................................................... 16 5.2 FISH 技术 .......................................................................................................... 17 5.3 实时荧光 PCR 及相关技术 ............................................................................. 19 5.4 MLPA 相关技术 ................................................................................................ 25 5.5 基因芯片技术 ................................................................................................... 27 5.6 Sanger 测序技术 ................................................................................................ 28 5.7 焦磷酸测序技术 ............................................................................................... 30 5.8 高通量测序技术 ............................................................................................... 33 5.9 时间飞行质谱生物芯片系统(Sequenom MassARRAY)........................... 35 6. 常见遗传病及诊断方法选择 ................................................................................. 37 6.1 染色体病 ........................................................................................................... 37 6.2 核基因病 ........................................................................................................... 39