市级医院临床科研资源共享平台项目

上海市级医院临床科研资源共享平台建设项目共享情况
临床遗传学平台
项目批准号：SHDC12007701
项目名称：以芯片比较基因组杂交（aCGH技术为核心的多功能临床分子遗传学和分子病理学共享平台平台建设单位：上海市儿童医院
项目负责人：方秉华包黎明曾凡一
联系地址：上海市北京西路1400弄24号邮政编码：200040
联系人：李嫔任兆瑞
平台介绍：
上海市儿童医院拥有上海交通大学基础博士点，临床硕士培养点和博士后流动站，是上海交通大学《遗传学》国家重点学科和上海市重点学科的领衔和主持单位。

医院所属的在遗传病的防治领域作出了许多在国内外颇具影响力的贡献，特别是在遗传
病的诊断和治疗以及新生儿筛查和遗传咨询等方面形成了鲜明的特色和优势，是我国第一个
获得美国国立卫生研究院科学基金的单位。

在常见遗传病如地中海贫血、血友病、杜氏肌营养不良、苯丙酮尿症、亨廷顿舞蹈症、先天性肾上腺皮质增生症、性分化异常等的基因诊断和产前诊断方面处于国际先进水平。

最近，与国外公司合作共同研发MLPA —微阵列芯片技术，并与国内多家单位合作和共享运用该技术对200多例DMD和染色体异常病人进行了准确的基因诊断，达到国际领先，相关论文已在国际着名杂志《Human Mutatio n》发表。

在基因治疗方面，应用反义核酸结合RNA干扰技术在细胞和模型小鼠中对：地中海贫血进行基因治疗获得成功，该成果获得上海市科技进步一等奖（2003年），相关论文已被国际着名杂
志《Hum Mol Genet》和《Haemalologica》接受发表。

医院拥有一批在医学遗传学领域作出杰出贡献的专家、教授，国家“973”项目首席科
学家，中青年学术带头人和业务骨干，形成了实力强大的学术梯队。

在技术方法上，采用美国Perkin Elmer公司的Spectral Genomics aCGH芯片及分析软件，冰岛Nimble Gen Systems提供染色体断裂位点分析所需的高分辨率芯片和分析软件。

aCGH 分子病理项目中样本处理和全基因扩增法，将试用已商品化的试剂盒。

芯片生物信息数据的
分析将聘请美国辛辛那提儿童医学中心生物信息中心主任徐燕教授担任指导。

表1-1 临床遗传学平台可供共享的设备
表1-2 临床遗传学平台可供共享的技术项目及收费价格
临床药理学平台
项目批准号：SHDC12007702
项目名称：临床药理学科研共享平台
平台建设单位：曙光医院
项目负责人：蒋健马越鸣
联系地址：上海市普安路185号邮政编码：200021
联系人：高月球
电子信
箱：平台
介绍：
曙光医院为卫生部首批中药临床药理基地，2006年通过了SFDA专家组的现场检查，至今承担了卫生部或国家食品药品监督管理局下达的新药临床试验任务200多项。

医院下设的临床药理科由药物临床研究评价研究室，I期临床试验研究室，药物代谢动力学实验室和数据管理中心组成。

是国家（教育部）重点学科中医内
科学、国家（教育部）重点学科中药学、国家（教育部）省部共建实验室、上海市优势学科中医内科学、上海市浦东新区新药临床试验研究平台的重要组成部分。

医院与中科院药物研究所药物代谢研究中心、上海中医药大学GLP实验室、
上海中医药大学临床药理研究中心有良好的合作关系，具备开展药物代谢研究的
软硬件条件和技术支撑。

建在浦东张江的I期病房符合国际一流标准，至今已完成I期药物临床试验36项，药代实验室已经具备血药浓度检测方法确证及检测等基本技术，完成药代和生物等效性试验31项。

医院承担的援非项目盐酸阿莫地喹生物等效性试验，是中国第一个接受WH（委托并监察的I期临床试验项目，已经通过WH啲验收。

表2- 1 临床药理学平台可供共享的设备
表2 -2 临床药理学平台可供共享的技术项目及收费价格
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病原学平台
项目批准号: SHDC12007703
项目名称：病原微生物与传染病防治临床科研资源共享平台平台建设单位：公共卫生临床中心
项目负责人：袁正宏联系地址：金山区漕廊公路2901号邮政编码：201508
联系人：胡芸文
电子信箱：
平台介绍：
上海市公共卫生临床中心作为市政府2004 年重大建设项目一号工程，建设目标是加强本市的公共卫生体系建设和传染病的临床诊治，构筑起一个可供国内外开放交流合作的公共卫生科研平台，为提升上海的公共卫生医疗与教学科研能力发挥作用。

下属科研中心设有 6 个实验平台，分别为：分子生物学平台、药代动力学和蛋白质组学平台、免疫学平台、细胞生物学平台、高致病性病原微生物研究平台、实验动物平台。

采用科学研究与临床医技一体化的管理模式，两者互为补充、相互促进、资源共享、共同提高。

采用灵活多样的政策吸引国内外专家利用技术和设备平台共同开展传染性、感染性疾病病原学，病毒分离，免疫与病理，药物筛选与疫苗，临床诊断、治疗和预防等方面的研究，逐步建立“以我为主，广泛合作”的国际合作新模式。

通过多种形式的国内外合作交流，科研共享平台将发展成为集传染病实验室诊断、科学研究、平台服务和人才培训为一体的设备精良、技术先进、运转高效的开放式现代化实验室平台。

在传染病病原学和生物学特性、发病机制、诊断方法与技术、疫苗研究等方面形成特色，全面提高检验、检测及科研能力，为疾病预防控制、治疗、公共卫生监督、预防医学研究及突发事件应急处置等提供实验技术支持。

通过国际合作，科研共享平台力争成为世界卫生组织西亚太区传染病与公共卫生研究合作中心之一，努力成为在国际相关领域有重要影响的传染病与公共卫生研究平台。

表3－ 1 病原学平台可供共享的设备
表3- 2 病原学平台可供共享的技术项目及收费价格
基因组学平台
项目批准号: SHDC12007704 项目名称：肿瘤功能基因组学和分子形态科研资源共享平台建设平台建设单位：第一人民医院项目负责人：彭志海、黄倩联系地址：上海市武进路85 号邮政编码：200080 联系人：李啸华平台介绍：
上海市第一人民医院建有博士后、博士、硕士研究生培养站、点分别为12、19和29个。

医院长期致力于胃肠道肿瘤、肝脏移植和腹部大脏器联合移植的临床和基础研究。

从1999 年起，着眼于肿瘤功能基因组学研究，对中国人群在全基因组水平筛选胃肠道肿瘤相关基因，同时探索新的肿瘤标记物。

已完成散发性结直肠癌、散发性胃癌全基因组杂合缺失扫描、精细定位研究，以及散发性结直肠癌基因芯片扫描、候选基因筛选工作，目前正在对筛选基因开展全面验证工作，同时对胃癌开展基因芯片扫描，候选相关基因筛选工作。

相关工作已连续获得“863”重
点项目子项目、 3 项国家自然科学基金、上海市百人计划一期、二期项目、上海市科委重点项目、上海市医学领军人才、上海市自然科学基金等国家市级项目资助。

并获2006 年上海市科技进步奖一等奖等一系列奖项，同时部分科研成果被《Clinical Cancer Research 》等SCI 期刊收录。

目前已建立Western blot 、real-time PCR 、MSP、Pyrosequencing 技术、
逆转录PCR基因转染、动物实验、流式细胞技术等技术平台，熟练应用Applied Biosystems 3730、3130基因分析仪、PyroMark ID 定量遗传分析系统、Eppendorf real-time PCR系统等大型仪器设备，并形成一支具有良好团队精神和较强科研攻关能力的人才梯队。

与上海交通大学Bio-X 生命科学研究中心、卫生部纳米生物技术重点实验室、卫生部肝胆肠外科研究中心、中南大学生物医学工程研究院、Texas 大学MD Anderson 癌症研究中心等国内外知名研究机构开展多年的合作，共同完成多项课题。

表4— 1 基因组学平台可供共享的设备
表4-2 基因组学平台可供共享的技术项目及收费价格
临床免疫学平台
项目批准号：SHDC12007705
项目名称：风湿自身免疫性疾病临床转化型研究综合技术平台建设平台建设单位：仁济医院项目负责人：陈顺乐
联系地址：上海市山东中路145号邮政编码：200001
联系人：黄新芳
平台介绍：
上海交通大学医学院附属仁济医院建有上海市风湿疾病研究所。

医院下属的风湿病学科是上海市医学领先专业重点学科，上海市教委重点学科，上海市卫生
局临床医学中心，具有20年研究红斑狼疮、类风湿性关节炎、骨关节炎等风湿性疾病的丰富临床经验和扎实的实验基础，是国内最早开展风湿病学研究的主要基地之一。

拥有一批在风湿病学领域颇具影响力的专家、教授。

学科“SLE系列研究”曾获国家、市、部级科技进步奖，并获各类科研基金共946万，在系统性
红斑狼疮等风湿性疾病领域的研究水平已达到国际先进水平。

在建的共享平台下设主要自身免疫性疾病临床标本库和临床数据库平台，利用基因组、转录组、蛋白组等研究策略解析风湿病发病机制的组学技术平台，常见自身免疫性疾病动物模型及细胞免疫学研究平台，疾病诊断和治疗的医学转化
型研究平台，建有的SLE遗传资源管理数据库为目前亚太地区规模最大的SLE 遗传资源库。

已建立的技术有：基因芯片技术、实时定量RT-PCR焦磷酸测序
技术、DNA自动测序法、等位基因分型、基因芯片聚类分析技术，ETDT genehunter、FBAT遗传分析技术及流式细胞技术等。

与国外多家知名研究机构建立了良好的合作关系，并聘任国外知名专家担任平台顾问。

表5-1 临床免疫学平台可供共享的设备
表5-2 临床免疫学平台可供共享的技术项目及收费价格
组织工程学平台
项目批准号：SHDC12007706
项目名称：组织工程与再生医学及其他临床科研资源共享平台建设
平台建设单位：第九人民医院项目负责人：曹谊林刘伟联系地址：上海市制造局路639号邮政编码：200011
联系人：刘伟刘德莉
平台介绍：
上海交通大学附属第九人民医院下属的上海市组织工程研究重点实验室正
式成立于1997年，是国内第一家专门进行组织工程研究的中心与基地，2000年被评为上海市十大“重中之重”学科之一。

实验室有一支充满活力与创造性的研究人才梯队；三年来，通过全体研究人员的辛勤努力与通力合作，先后申请、承担及完成国家973计划、863计划、国家自然科学基金、卫生部、上海市科委、上海市教委等重大和重点科研项目20余项。

同时实验室注重与上海及其周边地区基础医科交融、合作，使组织工程学成为推动相关学科发展的实验基地。

实验室有一支基本的科研队伍，职称从主任技师到技师形成梯队，掌握基本科研技术，对重大仪器设备配有专职技术人员，能手把手指导学生实验，对仪器维护有一定经验。

表6- 1 组织工程学平台可供共享的设备
表6-2 组织工程学平台可供共享的技术项目及收费价格
临床分子生物学平台
项目批准号：SHDC12007707
项目名称：临床分子生物学科研资源共享平台
平台建设单位：瑞金医院项目负责人：陈赛娟联系地址：上海市瑞金二路197号邮政编码：200025
联系人：蒋薇薇
平台介绍：
医学基因组学国家重点实验室是以上海血液学研究所分子生物学实验室和瑞金医院分子中心为基础组建起来的。

该实验室在白血病、血友病研究及cDNA 测序方面作出了杰出的贡献。

承担了包括“ 863重大项目、“973”划、国家九五”攻关、杰出青年基金、国家自然科学基金面上项目、重大项目、上海市青年启明星计划”等在内的一批课题，并承担了与史克必成公司，美国哈佛大学的国际合作项目。

主要研究成果发表在《Scie nee〉、《PNAS》、《Genome Research、《Blood》、《Leukemia》、《Sem inar in Hematology》、《On coge ne＞、《Geno mics》、《Gene》等一批国际性权威杂志及国内核心期刊。

获得了上海市科技进步一等奖、二等奖，卫生部科技进步二等奖，三等奖，国家科技进步二等奖、三等奖，国家自然科学二等奖及科技部杜邦”科技创新奖等一批奖项。

医学基因组学国家重点实验室建立了一套完善的分子生物学技术平台，包括蛋白质组平台（包括二维电泳，串联质谱鉴定，2D-NANO-HPLC肽段分离系统，蛋白指纹图谱鉴定系统）、大规模DNA测序平台、cDNA microarray平台、Massarray 时间飞行质谱生物芯片系统、激光共聚焦显微镜、生物大分子相互作用技术平台、流式细胞分析及分选平台、定量PCR检测平台、染色体荧光原位
杂交及染色体涂抹等分子遗传学技术平台、病理切片及显微切割技术平台、抗体
制备和斑马鱼活体实验平台。

并已开始建立统一标准的白血病和胃肠道肿瘤标本库和信息库。

表7- 1 临床分子生物学平台可供共享的设备
表7-2 临床分子生物学平台可供共享的技术项目及收费价格
实验动物学平台
项目批准号：SHDC12007708
项目名称：人类疾病动物模型研发及相关资源技术共享服务平台的建设及其应用平台建设单位：瑞金医院项目负责人：王铸钢联系地址：上海市瑞金二路197号邮政编码：200025
联系人：蒋薇薇平台介绍：
上海交通大学医学院附属瑞金医院多年来在实验动物环境条件、人类疾病的小型猪及豚鼠模型、遗传工程小鼠模型及斑马鱼等模式生物资源及相关技术、研究水平及成果产出等方面在国内医疗单位中位居前列。

瑞金医院实验动物大楼将于2008年3月建成投入使用，这将是目前上海医疗机构中最大的集科研、教学为一体的综合性实验动物大楼，具有实验动物遗传、增殖、微生物、病理以及免疫等多方面、多功能的实验服务及技术平台共享服务，包括依托于上海南方模式动物中心的动物模型表型分析、斑马鱼技术平台及大动物实验平台等。

科研综合楼占地面积近2000平米，包括动物饲养实验区（普通级、清洁级、SPF级微生物控制单元），检测实验区、辅助区等区域，可同时容纳大动物80只、兔100只；斑马鱼10000条；大动物实验区域设有动物饲养区域、手术区域，同时设有检疫室供大动物进室时检疫；小动物饲养和实验区域近1000平米，采用独立送风隔离笼具”（IVC），具有SPF级、清洁级和普通级的实验动物生产繁殖能力，实验操作均在超净台内进行，从而保证实验动物为SPF级（无特定病原体动物），并提供标准化动物及标准化的实验条件。

已有的斑马鱼鱼房占地200平方米，位于瑞金医院科教大楼地下室，可养殖近5万条成鱼。

在此基础上开展和建立多种重大疾病相关动物模型的建立、鉴定和维持，各系统疾病模型表型的分析平台的建立、发病机制的体内水平研究、诊断和治疗研究，斑马鱼模式动物分析平台。

表8- 1 实验动物学平台可供共享的设备
表8-2 实验动物学平台可供共享的技术项目及收费价格
专用实验材料费用，由纳入共享的各课题组自己支付；②项目经费支付：指设备仪器使用费，共用的试剂、耗材费，人员培训、技术指导和实验等各类劳务费用，此部分共用资源
费用纳入预决算，由本项目经费支付。