医学本体临床路径知识库建设方法学研究

1引言

近年来，我们致力于医院临床信息系统的应用开发与研究。在医院临床路径电子化应用实践中，我们积累了大量的患者临床中的电子数据，如何利用这些电子数据，使医院信息系统更加“智能”，能辅助医生进行临床医疗决策，是临床信息化建设面临的主要问题之一。为了解决临床决策的信息支持问题，我们进行了临床路径知识库的建设研究，总结了临床路径信息化应用中临床路径知识库的构建方法。在医院新一代智能化电子病历的开发实施中，临床路径知识库建设具有重要地位，新一代电子病历应用将基于临床知识库应用，重点是患者诊疗计划制订与执行过程中的控制，要求其具有语义理解模型框架，能动态自适应调整诊疗计划，满足医疗机构和患者的个性化需求[1]。

新一代电子病历相关目标的实现，需要在病种临床路径执行中具有知识库的支持。临床知识库建设主要是建立面向诊疗过程实践的知识库表达方法及模型的建设[2]。在建设过程中，有必要对临床路径知识库建设方法学进行研究。在临床路径电子化应用实践中，我们提出了临床路径知识库建设的5个步骤：（1）知识来源标识；（2）建立知识分类体系框架；（3）知识抽象；（4）本体知识库建设工程化方法；（5）知识库评价与改进。通过这5个步骤，经过不断改进，目前我们建立了58个病种的临床路径知识库，并在医院临床实践中得到初步应用，取得了良好的效果。

2临床路径知识库方法学

2.1临床路径知识源

首先，临床路径知识库建设是对临床路径知识源进行标识。我们在分析临床路径知识来源过程中，考虑了大家公认的、可获得的临床路径知识源。它们是：（1）医疗专家相关领域知识，包括临床医生、相关研究者以及临床路径开发人员；（2）国内外已经开发的临床路径本体原型；（3）相关病种已发表的文献（包括主流看法以及争议文献）；（4）医疗机构已实际应用的临床路径方案。临床路径应用初期，由于临床知识代码体系标准缺乏，知识库资源有限，临床路径知识库开发研究没有系统化的方法。由于工作环境的不断变化，临床路径知识库建设要求临床医生具有扎实的、相关病种疾病的知识体系，包括临床推理过程、流程以及对诊疗任务的熟悉等。在实际应用中，我们总结了相关临床知识分类方法，建立了临床路径知识分类体系架构，对临床病种相关诊疗流程进行了抽象，开发出了临床路径知识库模型。在整个过程中，临床医生对实际临床路径以及相关文献资源的理解是知识库建设的基础和源泉。

其次，是参考了国际上已存在的临床路径知识库本体。我

医学本体临床路径知识库建设方法学研究

郑西川1，谭申生1，于广军2

（1.上海交通大学附属第六人民医院计算机中心，上海200233；

2.上海申康医院发展中心，上海200041）

[摘要]目的：从一组实际运行的临床路径应用中提取面向实践的临床知识，实现临床路径本体知识库的规范表达。

方法：采取工程化方法建立临床路径知识库，包括临床路径知识源标识与分类、知识抽象方法、本体工程方法和临床路径本体评价。结果：建立了58个病种临床路径本体知识库，并在实际应用中进行了验证。结论：临床路径本体知识库建设对临床路径电子化深度应用有重要意义，对新一代电子病历研发有参考借鉴作用。

[关键词]本体知识库；临床路径；方法学

[中国图书资料分类号]TP391[文献标识码]A[文章编号]1003-8868（2012）02-0035-03

Construction Methodology of Medical Ontology Clinical Pathway Knowledge Base

ZHENG Xi-chuan1,TAN Shen-sheng1,YU Guang-jun2

(puter Center,the Sixth People's Hospital Affiliated to Shanghai Jiaotong University,Shanghai200233,China;

2.Development Center,Shanghai Shenkang Hospital,Shanghai200041,China)

Abstract Objective To abstract practice-oriented knowledge from a cohort of real clinical pathways and to represent this knowledge as a clinical pathway ontology.Methods Engineering methodology was adopted to construct clinical pathway knowledge base,which included(1)knowledge source identification and classification of clinical pathways according to variations in setting,stage of care,patient type,outcome and specialty;(2)iterative knowledge abstraction using grounded theory;

(3)ontology engineering as adapted from the Model-based Incremental Knowledge Engineering approach;and(4)ontology

evaluation through encoding a sample of real clinical pathways.Results The clinical pathway ontology knowledge base was developed,which included58class diseases,and was applied in real clinical setting.Conclusion Clinical pathway ontology knowledge base has significant function in the electronic application of clinical pathway,which will be a reference for developing a new generation of electronic medical records.[Chinese Medical Equipment Journal，2011，33（2）：35-36，43] Key words ontology knowledge base;clinical pathway;methodology

作者简介：郑西川（1965—），男，硕士生导师，主要从事电子病历系统、数字化

医院相关标准、区域医疗信息系统方面的研究工作，E-mail：zhengxc116@163.

com。

研究报告Study Report·35·