pubmed检索教程

和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方
面的研究内容。
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一、数据库概况
（三）文献来源：
70多个国家和地区；近5000种生物医学期刊
美国卫生研究院文献选择技术评估委员会 Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选
stroke[ti] AND thrombolysis[ti]
stroke[ti] thrombolysis[ti]
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三、PubMed 基本检索规则
著者检索：姓全称在前，名首字母在后，[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据
二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码
标准期刊缩写
文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号
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三、PubMed 基本检索规则
截词检索：treat* 可检出：treat, treated, treatment...
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二、 MEDLINE的检索平台
校园网内可用平台（IP控制） Ovid SP Web of Knowledge EBSCO OCLC First Search
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校园网内可用平台的Medline
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MeSH选项：基本检索框前Search下拉菜单的
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Hale Waihona Puke Baidu2021/2/4
（2）医学主题词表（MeSH）
用规范词查找“肝肿瘤”的文献
文章A
著者用词： Liver cancer
规范主题词 MeSH： Liver neoplasms
文章B
著者用词： Liver tumor
规范主题词 MeSH： Liver neoplasms
Species
研究对象人/动物限定
Languages
语种限定
Sex
性别限定
Subjects
各主题领域限定
Journal categories 各种专题子数据库限定
Ages
年龄限定
Search fields
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字段限定
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五、PubMed 高级检索
一个网页中集多种功能于一体
词表中：liver cancer See liver neoplasms
进入 MeSH
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MeSH 注释界面
MeSH详细注释界面
MeSH词检索
例1：检索2009-2013年关于舌根癌治疗的文献。
课题分析：
舌根癌的不同表达形式（OR）：
tongue base cancer、 cancer/carcinoma/tumor of tongue base、 cancer of the base of tongue…
的检索词
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四、PubMed 检索限制
PubMed可以针对检索结果作进一步的限制
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Article types
文献类型限定
Text availability 全文、免费全文、摘要限定
Publication dates 出版日期限定
三、PubMed 基本检索规则
自动转换匹配检索词：
对常用医学名词自动在规范词索引（主题词、副 主题词、物质名称）中转换、并默认在所有记录 字段中匹配。
如：liver cancer
"liver neoplasms"[MeSH
Terms] OR ("liver"[All Fields] AND "neoplasms"[All
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设定的限制
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一、数据库概况
（一）编制单位：美国国立医学图书馆(NLM)
（二）收录学科内容：
主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文 献。
包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺 学、基础研究；临床、护理、公共卫生、卫生政 策发展或相关教育活动的内容。
2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物
治疗的不同表达形式（OR） ：
therapy/treat/treatment, surgery, radiotherapy…
两个概念之间：舌根癌 AND 治疗
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输入检索词， 查找规范词
未匹配到规范词
改用上级概念 “舌癌”匹配
规范词
输入自由词， 查找规范词
强迫短语检索：“ ”，不进行自动转换匹配和扩 展检索 如：“acute low back pain” “ang 1”（血管紧张素1缩写）检出1085篇 比较：ang 1 检出9956篇，误检多，其中有：
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促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
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NCBI网站
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NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据
获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列；
获 取 Swiss-port,PIR,PRF,PDB 等 蛋 白 质 序 列 ， 从核酸序列翻译到蛋白质的序列；
思考题：中国学者的名字该如何转换呢？ 如： 闻玉梅 卢正宏
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三、PubMed 基本检索规则
刊名检索：全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如：Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
电子出版日期
20
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电子出版日期
文献出版日期
数据加入PubMed日期
文献勘误
参考文献勘误
全部著者姓名
全部调研者姓名
作为文章主题的著者全称
文献相关注释
基金编号
基因符号
期编号
资助调研者
资助调研单位
国际标准期刊号
美国立医学图书馆识别号
期刊全称
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输入刊名检索发表在该刊上 的文献（限定出处字段SO）
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PubMed记录字段说明
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文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论 定稿版 校样版 输入日期 输入完成日期
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三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入布尔逻辑运算式：（运算符须大写）如： asthma AND (therapy OR treatment)
字段限定符：[ ]，空格按词组匹配
试比较：
stroke AND thrombolysis[ti]
stroke thrombolysis[ti]
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（三） PubMed收录数据
MEDLINE Indexed
1966 to prensent 的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和 摘要，每条记录标有： [PubMed-indexed for MEDLINE]
OldMEDLINE
1949-1965年间的MEDLINE数据，无MeSH字段和摘要，每 条记录标有： [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]
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（三） PubMed收录数据
MEDLINE Inprocess
最新的MEDLINE处理中数据，未标引，无MeSH字段。每 条记录标有：
[PubMed-in process]。
Publisher-Supplied
出版商提供的电子文献题录，每条记录标有:
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二、PubMed的检索功能
高级检索 检索指南
基本检索输入框
检索工具： 特定文献检索
临床查询 专题查询
个人空间
其他资源： 规范词数据库
期刊数据库 临床试验等
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三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入一个或多个检索词（系统默认空格 为AND检索） 如：stroke thrombolysis（中风与溶栓）
最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘 版权拥有者 题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录 其他关键词 提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号
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作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。
近年数据涉及37种语种，回溯至1949年的数据涉 及60种语种。47%为美国本土出版文献，90%为 英文文献，79%的文献有文摘。
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（以上由2009年7月数据库提供）
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二、 MEDLINE的检索平台
广域网免费平台：NCBI-PubMed（含非 MEDLINE数据）
[PubMed-as supplied by publisher]，分为两类：
MEDLINE 收录，逐步转为In Process, Indexed状态。
Not MEDLINE：PubMed 收录，MEDLINE不收录，一
直标注[PubMed-as supplied by publisher]或[PubMed]
获取基因和染色体图谱；蛋白质三维结构数据 及大分子模式（MMDB）等其他生物信息数 据库检索。
PubMed等文献数据。
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（二） PubMed的特点
广域网免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取） 提供检索词智能转换匹配 界面简洁，操作简便(须IE7.0以上版本)
其他检索资源 基本检索
检索式编制
检索词索引
检索历史
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五、PubMed 高级检索
Search Builder（检索式编制）： 检索框中只能输入检索词，不能输入检索式。 多个字段检索要分多次输入。
Search History（检索历史）： 检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。 可组配检索式，如：#1 OR #2，#1 AND child 点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。
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PubMed数据库
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一、 PubMed简介
开发机构： NCBI（美国国立生物技术信息中心）
任务:
利用计算机信息处理技术，建立分子生物学、生物化 学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并开展相关 先进方法的研究。
促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。
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六、PubMed其他资源
1. Mesh Database（规范化医学主题词表）
功能：
确定规范化主题词
查看主题词词义注释、树状结构表
选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词
进入途径：
MeSH Database链接：PubMed主页，Advanced Search界面
Fields]) OR "liver neoplasms"[All Fields] OR
("liver"[All Fields] AND "cancer"[All Fields]) OR
"liver cancer"[All Fields]
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结果显示页右侧Details 显示系统自动匹配转换
副主题词 同义词
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规范词隶属关系树
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建构检索语句
选择副主题词
39 复旦大学图书馆文献检索教研室 限定检索主要主题词，只 查重点论述的文献
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输入舌根的自由词检索式， 进行AND运算。
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初步结果， 未限定年份