生存分析概述及实例分析

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表分析和K-M分析。
半参数方法:它比参数模型灵活,与非参数方法相比更容易对 分析结果进行解释。生存分析中使用的半参数模型是Cox比例风险 模型。
非参数方法
生命表分析 K-M分析
生命表分析
生命表分析将观测时间分成时间段,按时间段逐个统计事件发
生的情况,以此估计生存函数。假设共有k个时间段 [ t 0 , t 1) , [ t 1 ,
下表记录了5个实验对象的存活时间, 其中F代表失效,S代表存活,2和4为 右删失数据。
[0,31) :此区间5个实验对象均存活, 故 S(t)=5/5=1. [31,65) :个体1在31小时死亡,故本区 间 S(t)=1×4/5=0.8
个体编号 1 2 3 4
生存状态 F S F S
存活时间/小时 31 65 150 220
用 t 表示观测时间,将生存函数记作 S(t),是指个体生存时
间大于 t 的概率。 S(t)= P(T> t ),显然 S(t)是非升函数,且S(0) = 1, S(∞)= 0,
风险函数
风险函数(hazard function),又称为瞬时死亡率,
记作 h(t)。是指在t时刻存活的个体,在t+∆ t 时刻死亡 的概率。
完全数据: A B C D E 起始 观测时间区间 删失数据示意图 死亡 死亡 终止 死亡
A,观测期内死亡
右删失数据:
退出
未知
B,观测未终止时因故退出
C,观测终止时尚未死亡
左删失数据: D,死亡时间在某一时刻之前,具体时间未知 区间删失数据: E,死亡时间位于某一区间,具体时间未知
生存函数
生存函数(survival function),又称为累积生存率,我们 用符号T表示个体的生存时间(从开始记录到事件发生的时间),
异,其中Log Rank检验的p值小于0.05,表明 两种治疗方法有显著性差异。
除了治疗方法对小白鼠的生存状况有影响,其他因素如性别,年龄,体重等都可能对其生 存时间造成影响。加入这些数据后,用Cox独立协变量比例风险模型重新分析。
1.输入数据
2.设置参数
3.输出结果
分类变量是指不连续的变量,此例中治疗方法的值只取
案例分析
两组小白鼠用来检验癌症的治疗状况。一组使用传统治疗方法,
另一组使用试验方法,试验人员记录了小白鼠的存活时间及状态: Days为存活时间或观测时间;Status表示生存状态,取值1表示死亡, 0表示存活;Group表示治疗方法,取0表示传统疗法,取1表示试验 疗法,共有64组数据。
原始数据如下:
半参数方法
生存分析中我们常常遇到个体的生存状况受到多种因素 影响的情况。这些对生存时间有影响的变量称为协变量。在 分析生存数据时要将协变量的影响考虑进去。Cox半参数模 型就很好地解决了这个问题。它假定风险函数由两部分构成:
基准风险函数和协变量线性组合的指数。
Cox半参数模型又分为独立协变量比例风险模型和时间
t
[65,150) :个体2在65小时退出实验, 本区间无个体死亡, S(t)=0.8×4/4=0.8. [150,220) :个体3在150小时死亡,S (t)=0.8×2/3=0.53.
5
F
300
用S(t)表示实验对象的累积存活概率, 分时间段计算如右:
[220,300) :个体4在220小时退出实验, 本区间无个体死亡, S(t)=0.53×2/2=0.53.
P(t T t t) h( t) = lim t 0 t
显然,h(t)非负,且无上限。
分析方法
按照是否使用参数,可以将生存分析中的分析方法分为三类:
参数方法:若已经证明某事件的发展可以用某个参数模型很好
地拟合,就可以用参数方法做该事件的生存分析。常用的参数模型 有指数分布模型、对数分布模型、正态分布模型,威泊分布模型等。 非参数方法:当被研究事件不能被参数模型很好地拟合时,可 以采用非参数方法研究它的生存特征。常用的非参数方法包括生命
首先用生命表分析方法对数据进行处理:
1.输入数据 2.选择生命表分析
3.设置参数
4.输出结果
中位数生存时间是生存率为 50%时,生存时间的平均水平。
从中位数生存时间来看,传统
治疗方法的中位数为241天,试验 方法的中位数为266天,明显高于
可以看出,大约在200天时两种治疗方法的生存
传统治疗方法。可以判断试验方法 的疗效相比传统治疗方法有所提高。
(10号)
21160311055
侯笛
目录
1
概述
2
常用术语
3
分析方法
4
案例分析
概述
定义
生存分析是研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的 一门学科。由于最初研究的关键事件是死亡,故称为生存分 析。生存分析是统计科学的重要分支,其研究的两个重要变 元为“事件”和“寿命”。 事件:生存分析中定义的事件有死亡、损坏、失败、解雇、 病发等等。例如病人的死亡,产品的失效,疾病的发生,职 员被解雇。 寿命:从记录开始到事件发生的时间。
函数相交,在200天以前传统治疗方法的存活率较高,
而在200天以后试验方法的治疗效果明显优于传统治 疗方法。
用K-M方法对数据进行处理,结果如下:
生存函数分布和生命表分析的结果相似。 K-M方法可以记录删失数据,且由于分段较多 整体呈现密集的锯齿,而生命表分析的分布则 较为平缓。
在结果检验上,不同检验方法结果有所差
t=300时,个体5死亡,S(300)=0
以SPSS对上例进行K-M分析,结果 如下:
1.输入数据
2.进行K-M分析
参数设置
输出结果
K-M分析生存函数图
生命表分析与K-M分析的比较
生命表分析适用于大样本的情况,特别是没有个体数据的情形,主 要优点是对生存时间的分布没有要求。 K-M分析中时间区间的划分是以事件的发生为依据的,因此必须知道 每个个体的生存时间数据,适用于小样本的情况。
此表给出了各个变量的单个模型系数检验结果,可以看到体重变 量的p=0,说明体重对风险函数有极显著影响。体重每增加1(盎司), 风险大约为原来的1/3;治疗方法的p=0.068,影响几乎显著,传统方 法的风险为试验方法的1.75倍;而性别和年龄对风险的影响微弱。 结论:综合几种不同的分析方法,我认为综合以上三种模型的分析结果,我认为在本实验中 白鼠体重是影响其生存时间的重要因素,治疗方法的不同也有比较重要的影响,而年龄和性别几 乎不对其生存时间产生影响。
特点
生存分析的优点在于其能够处理删失数据。
生存分析的统计资料以生存时间为反应变量,此类资料的
生存时间变量大多不服从正态分布,且由于删失值的存在,
不适合用传统的分析方法处理。此时就应选wk.baidu.com生存分析的方
法。
研究内容
生存分析研究的内容主要有以下两个方面:
一 对生存过程的描述
二 分析生存过程的影响因素并对生存的结局加以预测
应用领域
生存分析虽然源自医学领域,但其在生物学,保险学,可靠性 工程学,经济学,教育学,社会学等领域都有广泛的应用。比如: 医疗科学中病人的去世 保险行业中的赔偿 可靠性工程中产品的失效 金融领域中银行账户从开立到取消的时间的研究 教育行业中学生的中途退学 客户关系管理中的客户流失
常用术语
生存数据
ni di S (t) ni ti<t
i = 1 , 2 ,… ,k ,且S(t)为递减函数。
K-M分析
Kaplan-Meier分析,也称为乘积极限分析,是Kaplan和Meier在
1958年提出的一种估计生存函数的非参数方法。与生命表分析不
同,K-M分析以事件发生的时间点将观测区间分段,用来估计生存 函数。下举例说明其具体的分析过程。
t 2) , … , [ t k-1 , t k ) , 每个区间中事件发生的次数分别为 d 1 ,d
2
,… , d k , 每个区间中的个体总数分别为 n 1 , n 2 ,… , n k ,所以在
第 i 个区间个体存活的概率为(n i - d i )/ n i ,而个体可以从第 一个区间存活到第 i 个区间的概率(累积生存率)为:
0和1,性别只取F和M。不同于体重、年龄这些连续变量, 分类变量在计算风险比例时以参考类别作为参照。如在本 案例中治疗方法这一因子以试验方法作为参照。计算结果 为传统方法的风险率相对于参考的倍数。
上表为模型系数的综合检验结果。可以看到p=0,小于
0.05,说明这些因素中有些变量对白鼠的生存时间有显著影响。
相依性协变量比例风险模型两种。二者的区别在于协变量的
取值是否和时间有关。
Cox独立协变量比例风险模型
该模型可写成如下形式:
h{(t ), ( z1, z 2, zm)} h0(t ) exp( 1 z1 2 z 2 mzm)
式中,Z1,Z2,…Zm为协变量,这里的协变量与时间无关,β1,β2,…βm为 对应协变量的未知参数。h 0(t)是基准风险函数。 实际应用中常比较两个不同个体风险函数的比率,即危险率。可以证明危险 率为常数,因此该模型又称为比例风险模型。 当协变量与时间有关时,危险率将不再是常数,此时称为时间相依性比例风 险模型。
T

H

A
N

K
S

生存分析中所分析的数据通常称为分析数据,一般度量的是某个 事件发生所经历的时间长度。生存数据可以分为完全数据和删失数据。 完全数据:指提供了完整信息的数据。例如,在研究产品的失效
时间时,某个样品从进入研究直到失效都在我们的观察中,可以得到
该样品的具体失效时间,这就是一个完全数据。 删失数据:是指在观测期内,我们并没有看见个体的状态发生改 变,无法确定个体具体的生存时间。又分为左删失数据,右删失数据, 区间删失数据。
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