多底物酶促反应动力学
酶促反应动力学实验报告
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酶促反应动力学实验报告酶促反应动力学实验报告摘要:本实验旨在研究酶促反应的动力学过程。
通过测量不同底物浓度下酶催化反应速率的变化,分析酶的催化特性和底物浓度对反应速率的影响。
实验结果表明,酶促反应速率与底物浓度呈正相关关系,但随着底物浓度增加,反应速率逐渐趋于饱和。
1. 引言1.1 酶的作用1.2 酶促反应动力学2. 实验方法2.1 材料准备2.2 实验步骤3. 实验结果与分析3.1 反应速率与底物浓度关系曲线3.2 酶活性计算公式及计算结果4. 讨论与结论4.1 反应速率与底物浓度关系解释4.2 实验误差及改进方案1 引言1.1 酶的作用酶是一类生物催化剂,能够加速生物体内化学反应的进行。
它们通常是蛋白质或核酸分子,并具有高度特异性。
在细胞内,酶参与调节代谢途径、合成新物质以及降解废物等重要生物过程。
1.2 酶促反应动力学酶促反应动力学研究酶催化反应速率与底物浓度、温度和pH等因素之间的关系。
其中,底物浓度是影响酶催化速率的重要因素之一。
当底物浓度较低时,反应速率随着底物浓度的增加而迅速增加;当底物浓度较高时,反应速率逐渐趋于饱和。
2 实验方法2.1 材料准备- 酶溶液:根据实验要求选择合适的酶溶液。
- 底物溶液:根据实验要求配置不同浓度的底物溶液。
- 缓冲液:用于维持实验环境中恒定的pH值。
- 试管或微孔板:用于进行反应混合和观察。
- 分光光度计:用于测量反应混合液的吸光度变化。
2.2 实验步骤1. 准备一系列不同浓度的底物溶液,并标明其浓度。
2. 在试管或微孔板中分别加入相同体积的酶溶液和不同浓度的底物溶液,混合均匀。
3. 将反应混合物放入分光光度计中,设置适当的波长并记录吸光度值。
4. 在一定时间间隔内,测量吸光度值的变化,并记录下来。
5. 根据实验数据计算反应速率。
3 实验结果与分析3.1 反应速率与底物浓度关系曲线根据实验数据绘制反应速率与底物浓度关系曲线。
实验结果显示,随着底物浓度的增加,反应速率也增加。
酶促反应动力学
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第一节 酶促反应的动力学方程
一、化学动力学基础
1、反应分子数和反应级数 1)反应分子数
指在反应中真正相互作用的分子数。
A
P
A+B
P+Q
2)反应级数
指实验测得的反应速率与反应物浓度之间的关系,符合 哪种速率方程,则这个反应就是几级反应。
蔗糖 + H2O 蔗糖酶 葡萄糖 + 果糖
1
3)零级反应的特征
反应速率与反应物浓度无关。初始浓度增加,反应速度不变, 要使反应物减少一半所需完成的反应量增加,因此最后表现为半 衰期与初始浓度成正比。
二、底物浓度对酶促反应的影响
1、酶促反应初速度与底物浓度之间的关系 1903年Henri以蔗糖酶水解蔗糖为例,研究底物浓度与酶促反
应速度之间关系时,发现两者的关系符合双曲线关系。
k2
Km= (k2+k3)/k1
Km是[ES]的分解常数与生成常数的比值。 Km的真正含义是, Km越大意为着[ES]越不稳定,越容易分解。但不能说明[ES]是容 易分解成底物还是产物。
kcat/Km可表示为 [k3/(k2 + k3)]k1, k3/(k2 + k3)代表[ES] 分解成产 物的分解常数占[ES] 总分解常数的比值。 k3/(k2 + k3)越大,说明 [ES]越容易分解成产物。 k1是[ES] 生成常数。因此, kcat/Km数 值大不仅表示[ES]容易生成,还表示[ES]易分解成产物。真正代 表酶对某一特定底物的催化效率。所以,也称为专一性常数。 极限值是k1 ,意为[ES]不会再分解为底物。
酶的化学本质是蛋白质,因此,酶 对温度具有高度的敏感性,随着温度 的升高,分子的构象会逐渐地被破 坏,失去催化活性。
酶促反应动力学
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反应速度:
V K3 [ES] K3 [E][S] K2 [S] K1 Vmax [S] KS [S]
KS现在称为底物常数
1925年Briggs和Haldane提出稳态理论
米氏推导酶促反应速度公式时,认为[ES]的积累是快速 平衡的结果,而没有考虑ES E+P这一步。而Briggs认为应 当考虑这一步,因为并不总是K3<<K2, ES E+P这一步也可 能速度很快,这时,E,S和ES将不能处于一个平衡状态。布 氏提出稳态理论。
①物理意义: 当反应速度达到最大反应速度(Vmax)的一半 时的底物浓度.
②Km的引伸意义:Km是酶学研究中的重要研究数据,表示 了酶的一个基本性质.
Km值是酶的特征常数之一,与酶的性质有关,而与酶 的浓度无关,不同的酶,其Km值不同.
对于专一性不强的酶来说对于每一个底物都有一个 相应的Km值.
当[S]>>Km时
V V max[S] V max[S] V max Km [S] [S]
当[S]=Km时
V V max[S] V max Km [S] 2
米氏方程定量的表达了反应初速度与底物浓度之间的关系 与实验结果相符合。
三、米氏方程的讨论
2、米式方程中各参数的意义 1) Km的意义
(单底物酶促反应)
酶的底物饱合现象——中间络合物学说
酶与底物先络合成一个中间产物,然后中间 产物进一步分解成产物和游离的酶。
酶催化剂 E S K K 12 ES K3 P E
非酶催化剂
E
SP
中间产物假说证据
Michaelis 与 Menten 提出酶催化动力学
E +S ES E +P
4.3酶促反应动力学
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反应速率的测定:反应速率与时间的关系反应级数:一级反应一级反应的反应物消耗和产物形成与时间的关系曲线C [P]ln ———(a-x)(b-x)——a-x x 二级反应或与时间的关系二级反应(b-x)a-x k零级反应k零级反应x 与时间关系E + SE -S E -SE -P E -P E + P一级反应零级反应混合级反应底物浓度对酶催化反应初速率的影响VVmax[S]当底物浓度较低时反应速度与底物浓度成正比;反VVmax[S]随着底物浓度的增高反应速度不再成正比例加速;反当底物浓度高达一定程度[S]V Vmaxk1中间产物v[s]米氏方程曲线K m 值的推导K m 值mol/L V max V[S]K m V max /2k1K m的意义(1)(2)K m的意义(3)(4)(5)Vm 的意义-1/Km1/VmaxV maxK m [S]1[S]V mVK mV max1底物数酶分类催化反应酶种类占总酶百分率E + S1+ S2→ ES1S2→ EP1P2→ E + P1 + P2氨基酸的氨基转移反应当[S]>>[E]时,V max = k3[E]酶浓度对反应速度的影响在最适温度下,温度升高,活化分子增多,酶活性提高。
在最适温度上,温度升高,酶活性降低。
Vt/℃最适温度激活剂激活剂小结。
【生物化学】第六章 酶促反应动力学
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本章纲要
一、化学动力学基础 二、底物浓度对酶反应速度的影响 三、抑制剂对酶反应速度的影响 四、激活剂对酶反应速度的影响 五、温度对酶反应速度的影响 六、pH对酶反应速度的影响
一、化学动力学基础
了解反应速率及其测定 反应分子数和反应级数
一、化学动力学基础
㈠ 反应速率及其测定
单位时间内反应物的减少量或生成物的增加量用瞬时速率表示, 单位: 浓度/时间,研究酶反应速度以酶促反应的初速度为准。
第六章 酶促反应动力学
Enzyme kinetics
概述
研究酶促反应的速率以及影响此速率的各 种因素的科学,是酶工程中的重要内容
研究酶结构和功能的关系以及酶的作用机 制,需要动力学提供实验数据
发挥酶促反应的高效率,寻找最为有利的 反应条件
酶在代谢中的作用和某些药物的作用机制 具有理论研究的意义和实践价值
C是反应物的浓度变化, K为速率常数,是时间的倒数 基元反应:反应物分子在碰撞中一步直接转化为生成物分子的反应。
一、化学动力学基础
2. 反应级数:实验测得的表示反应速率与反应浓度之间关系的概念。 对于基元反应
1.一级反应单分子反应符合V=KC的反应
蔗糖+水
葡萄糖+果糖 V=KC蔗糖C水
由于水的浓度变化影响可忽略(非限制性因素)则V=KC蔗糖
二、底物浓度对酶反应速度的影响
㈠ 中间络合物学说
L.米歇利斯和L.M.门腾(1913)基于酶被底 物饱和的现象,提出“中间产物”学说:
酶与底物反应时,通过特异识别作用,先 形成酶底物复合物,然后再形成产物和酶分 子,酶分子重新结合底物。
该学说已得到大量实验证实
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07-酶促反应动力学
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17
(二)、可逆抑制和不可逆 抑制的动力学鉴别
加入一定量的抑制剂,以V~[E]作图
不可逆抑制剂:部分酶失活 原点右移, 斜率不变 当[E] > 不可逆抑制剂浓度 时能显现出酶的活性
可逆抑制剂:原点不变, 斜率下降
18
(三)、可逆抑制作用的动力学
1.竞争性抑制
底物、抑制剂和酶之间有如下平衡
S + E + I
ki2 ki1
k1 k2 k3
ES
P + E
k2 Km k1
ki 2 Ki ki1
EI Ki:抑制常数(inhibitor constant)
19
(三)、可逆抑制作用的动力学
溶液平衡时 [E] = [Ef ] + [ES] + [EI]
Arg127,Glu270,Tyr248,Zn2+
37
Ser48,His51,NAD+, Zn2+
4、活性中心位于酶表面的一个裂缝内
疏水微环境 使底物分子有效浓度很高 个别极性残基有利于催化作用
5、底物与酶通过弱相互作用结合
稳定酶与底物的结合
6、具有柔性
酶的活性中心易受影响
酶活性
一级序列决定三维结构 氨基酸残基提供了结构基础
Vmax [ S ] V Km [S ]
[S ] Km [S ] [S ] Km V Vmax Vmax Vmax Vmax
纵轴截距: Km/Vmax , 斜率: 1/ Vmax, 横轴截距: -Km
13
二、酶的抑制作用
能引起蛋白质失活的条件都影响酶的活力, 引致酶活性丧失的作用称为失活作用 抑制作用(inhibition): 引起酶活力降低或丧失的现象 抑制剂(inhibitor): 使酶发生抑制作用的物质
10章酶反应动力学-教学用
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将实验测定的米-曼氏曲线的坐 标作平移,并用新坐标系 (x,y) 表示旧坐标系(v0,[S]),米-曼 氏方程可以转变为 xy = -Km 其 曲线为以坐标轴(x,y)为渐近线 的直角或等轴或等边双曲线
Vmax 2
从米-曼氏方程或其曲线可以看出三种情况:
当[ S ] [ K m ],v0 Vmax[ S ] Km
基于快速平衡模型或平衡稳态模型的米氏方程: 早年的米式方程 最初,Michaelis 和 Menten 根据“快速平衡假说”推出米式方程。 快速平衡假说:一些假设
k1 E S ES k-1
反应可逆,且很快达到平衡 限速步骤,K2 << K-1 P的生成不足以破坏快速平衡
k2 ES PE
5为初始底物浓度s的函数所做的底物饱和曲线也称米曼氏作图或米曼氏曲线将实验测定的米曼氏曲线的坐标作平移并用新坐标系xy表示旧坐标系v0s米曼氏方程可以转变为xykm其曲线为以坐标轴xy为渐近线的直角或等轴或等边双曲线从米曼氏方程或其曲线可以看出三种情况
第 10 章
教学内容
酶促反应动力学
酶促反应动力学: 研究酶促反应的速度及其影响因素的科学。为酶的机理研究提供实验 证据,指导酶在生产中的应用。
2. Kcat 的意义: 催化常数或转换数
3. Kact/KM 的意义: 催化效率指数或专一性常数
1. KM的意义: 真实解离常数和表观解离常数
① 米氏常数KM是 v0=1/2 Vmax时的底物浓度。遵循米-曼氏动力 学的酶,也称为米-曼型酶, 是指呈现v0对[S]的双曲线关系的酶。 ② KM的真实意义决定于酶促反应机制的特定方面, 如反应步骤 数目和各步的速率常数。对于简单的二步反应: KM=(K-1+K2)/K1 当K2是限速步骤的速率常数时,即k2<<k-1 ,KM即Ks。 此时, KM 的意义是真实解离常数,代表ES复合体中酶对 底物的亲和力大小, 但是这种意义对大多数酶是不适用的。 当 k2、k-1 相当时,KM是三个速率常数的函数。
酶促反应动力学分析
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酶促反应动力学分析酶促反应是生物体内化学反应的重要形式之一,对于维持生命活动的正常进行起着至关重要的作用。
酶促反应动力学则是研究酶催化反应的速度以及影响反应速度的各种因素,通过对这些因素的分析,可以深入了解酶的作用机制、优化反应条件以及为相关的生物化学和生物技术应用提供理论基础。
酶促反应的速度通常用单位时间内底物的消耗量或产物的生成量来表示。
在一定条件下,酶促反应速度与酶浓度、底物浓度、温度、pH 值、抑制剂和激活剂等因素密切相关。
首先来谈谈酶浓度对酶促反应速度的影响。
在底物浓度足够大的情况下,酶促反应速度与酶浓度成正比。
这是因为酶的浓度越高,能够与底物结合并催化反应的酶分子数量就越多,从而导致反应速度加快。
打个比方,就好像有更多的工人参与到一项工作中,工作完成的速度自然就会更快。
底物浓度对酶促反应速度的影响则较为复杂。
在反应刚开始时,反应速度随底物浓度的增加而急剧上升,此时反应速度与底物浓度成正比,这被称为一级反应。
然而,当底物浓度增加到一定程度时,反应速度不再随底物浓度的增加而增加,而是趋于一个恒定值,此时反应速度与底物浓度无关,被称为零级反应。
这种现象可以用酶与底物结合的中间复合物理论来解释。
简单来说,酶的活性中心数量是有限的,当所有的活性中心都被底物占据时,即使再增加底物浓度,反应速度也不会再提高。
温度对酶促反应速度的影响具有双重性。
一方面,在一定范围内,温度升高可以加快分子的运动速度,增加酶与底物的碰撞机会,从而提高反应速度。
另一方面,温度过高会导致酶的变性失活,使反应速度急剧下降。
每种酶都有其最适温度,在这个温度下,酶的催化活性最高。
就像人在适宜的环境温度下工作效率最高一样,酶在最适温度下也能发挥出最佳的催化效果。
pH 值对酶促反应速度的影响也不可忽视。
大多数酶的活性都有一个最适 pH 值范围,在这个范围内,酶的活性最高。
pH 值的改变会影响酶分子中某些基团的解离状态,从而改变酶的活性中心结构,影响酶与底物的结合以及催化反应的进行。
酶促反应动力学
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几种抑制剂
不可逆抑制剂 非专一性~:有机磷化合物(抑制蛋白酶和酯酶
活力)、有机汞、有机砷(与Cys的-SH)、重金属 盐、烷化试剂、氰化物、硫化物、CO(与酶中金 属结合)、青霉素(与糖肽转肽酶的Ser的-OH结合)
专一性~
Ks型~:亲和标记试剂 Kcat型~:自杀性底物
几种抑制剂
可逆抑制剂:(竞争性~)5‘-氟尿嘧啶、磺胺 药、过渡态底物类似物
活化能
酶反应与活化能
活化能是指一般分子成 为能参加化学反应的活 化分子所需要的能量;
要使反应进行迅速,途 径(1)外加能量;(2)降 低活化能;
中间络合物学说
1. 在酶催化反应S P时, 酶E先与底物S结合成中间 产物ES,ES转变为E和P, 表示为 E+S ES E+P
2. 实际的酶反应要复杂得多: 参加的底物不只一种;酶和 底物结合以及转化为底物和 酶的步骤有几步。
(5)Km=(k2+k3)/k1,若k3<<k2, 则Km近似于Ks; (6)Km可帮助推断某一代谢反应的方向和途径;
Vmax和k3
Vmax :当反应物浓度增加时,酶催化反应的速 度趋于一个极限值;
k3 (kcat) :当酶被底物饱和时每秒钟每个酶 分子转换底物的分子数,“转换数TN”
Vmax=[E]k3
锁-钥匙模型和诱导-契合模型
活性部位
只占相当小的部分(1~2%) 活性部位是一个三维实体 底物与酶相互作用的“诱导契合” 位于酶分子表面的一个裂缝内 底物通过次级键较弱的力结合到酶上 活性部位具有柔性或可运动性
酶分子中的其它部位为活性部位的形成提 供了结构的基础。
酶活性中心示意图
S-S
亲核催化:分别带有多电子的原子如O、S和N,可以提供电 子去攻击底物上相对带正电子的原子(如羰基碳),即所谓 的亲核攻击。
第10章 酶动力学
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+抑制剂
1/v
(1+ KI/[I])/Vmax Vmax/(1+KI/[I])
斜率=Km/vmax
斜率= Km/vmax
[S]
Km/(1+ KI/[I]) Km
-1/Km - (1+ KI/[I])/Km
1/vmax
1/[S]
无I 有I
与 图 形 特 征
反 竞 争 性 抑 制 的 速 度 方 程
反竞争性抑制的特点: ⑴ 反竞争性抑制剂的化学结构不一定与 底物的分子结构类似; ⑵ 抑制剂与底物可同时与酶的不同部位 结合; ⑶ 必须有底物存在,抑制剂才能对酶产 生抑制作用;抑制程度随底物浓度的增 加而增加; ⑷ 动力学参数:Km减小,Vm降低。
非 竟 争 性 抑 制
(3)反竞争性(Uncompetitive )抑制
反竞争性抑制剂
ES
k1 k-1
ES
I
KI’
k2
EP
v max [S ] Km K (1 I ) [S ] K [I ] (1 I ) [I ]
Km 降低 vmax 降低 斜率不变
v
vmax
v
EIS
I
E S
KI
k1 K-1
ES
v max [ S ]
k2
EP
v
EI
v
vmax
Km(1+[I]/KI)
[ S ] K m (1
[I ] ) KI
Km 升高 vmax 不变
+抑制剂
1/v
斜率=Km/vmax
斜率= Km(1+[I]/KI)/vmax
Km
[S]
酶促动力学
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米氏方程 V=
[S]:底物浓度
Vmax [S] Km + [S]
V:不同[S]时的反应速度
Vmax:最大反应速度(maximum velocity)
Km:米氏常数(Michaelis constant)
S+E
米氏方程式推导基于以下前提
ES
P+E
★ 反应刚刚开始,产物的生成量极 少,逆反应可不予考虑。 ★ [S]>>[E]
3.重金属—Ag、Cu、Hg等盐能使大多数酶失活,加 入EDTA可以除去。 4.烷化剂—这一类试剂中往往含一个活泼的卤素原 子,如碘乙酸、碘乙酰胺和2,4-二硝基氟苯等,使 酶蛋白中的 –SH、-NH2、-OH等发生烷基化, 失活。 5.氰化物、硫化物和CO—这类物质能与酶中的金属 离子形成较为稳定的络合物,使酶的活性受到抑制。 6.青霉素—抗菌素类药物,与糖肽转肽酶活性部位 Ser-OH共价结合,使酶失活。 “自杀性底物”
(同一种酶有几种底物就有几个Km值,其中Km值最小的底物 一般称为该酶的最适底物或天然底物) 359
5. 当反应速度达到最大反应速度的90%,则
v = ——————
Km + [S]
90%Vmax =100%Vmax [S]/(Km +[S])
即 [S] = 9Km
Vmax · [S]
3
利用作图法测定 Km和Vmax
三、酶的抑制作用
(一)抑制作用与抑制剂 凡使酶的活性降低或丧失,但并不引起酶蛋 白变性的作用称为抑制作用。主要是由于酶 的必需基团化学性质的改变而引起的。(抑制作 用不同于失活作用)
能够引起抑制作用的化合物则称为抑制剂。
(抑制剂不同于变性剂)
第六章 多底物酶促反应动力学
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E
E-NAD+
E-NADH
E
E:为马肝 醇脱氢酶
第六章 多底物 酶促反应动力学
为什么有顺序性? 被认为酶上与第二底物结合 位点原先在酶结构内部(中间), 第二底物无法与之结合。 由于第一底物结合改变了酶 原有结构,暴露了酶结构上第二 底物结合位点,使酶上第二个结 合位点能够顺利地与B结合。 A,B的结合是在酶的不同位点上。
其反应历程如下:
第六章 多底物 酶促反应动力学
第六章 多底物 酶促反应动力学
规律总结如下:
1 [A]固定底物,[B]变化底物,[p]=0, [Q]=常数 2 [A]固定底物,[B]变化底物,[p]=常数, [Q]=0 1 [B]固定底物,[A]变化底物,[p]=0, [Q]=常数 2 [B]固定底物, [A]变化底物,[p]=常数, [Q]=0
Suc磷酸化酶
G-1-P + 32Pi ======== G-1-32P + Pi 研究认为,这种现象是蔗糖磷酸化酶的 乒乓机制造成, 转移葡萄糖基。
第六章 多底物 酶促反应动力学
第六章 多底物 酶促反应动力学
= V Vm
1 V
+
[A] 1 Vm
当A=∞,
=
KmB 1 Vm [B]
+
Vm
第六章 多底物 酶促反应动力学
具体实验方法: 以A、B双底物反应作为例子,可将 底物B固定在几个不同浓度下。 固定在某一B浓度时,测不同A浓度 对反应速度影响; 也可固定A在某一浓度,测定不同B浓 度对反应速度影响,再分别作双倒数图。
第六章 多底物 酶促反应动力学
3.同位素交换法 下面简单阐述同位素交换法在研究多 底物动力学上的应用。 先举一个例子:
酶促反应动力学多底物动力学
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k2[B] k-4[Q] k-3[P]
EQ:
k1[A]
k-1
k-1
k2[B] k-4[Q] k3
k-2 k-4[Q] k3
k2[B] k-4[Q] k3
V=k4[EQ] – k-4[E][Q] =(k4∙КEQ – k-4[Q]∙КE) [E0]/∑К
=
num1[A][B] - num2[P][Q]
反应速度:Vf= К12 [E] ; Vr= К21 [EA]
❖ К具有方向性,是一种矢量。其方向与酶形式旳 流向有关
(二)King-Altman 法环节:
(1)首先写出反应历程,然后将反应历程安排成封 闭环形式。环旳角数就是酶存在形式数目,用n表 达。然后在各角之间连线上标出各步反应旳К。
E + A k1 EA k2 EP k3 E + P
3!
=3
(3-1)!(3-3+1)!
King- Altman 图形不包括封闭环形式:
E1
E2
E3
E4
❖ n=4,m=5
n-1线(3线)图数目=
5!
=10个,
(4-1)!(5-4+1)!
❖ 2个封闭环形式无效,应清除。共有8个有效旳 King- Altman 图形
反应历程中有时可能没有逆反应,此时有些 KingAltman 图形不存在。
分为: 非中心复合物:酶未完全被底物饱和 中心复合物: 酶已经完全被底物饱和,
(EAB EPQ); (EA EP)
(二) 反应机制旳分类和命名
(以双底物双产物反应为例):
1. 序列(sequential)反应机制: 酶必需与全部底物都结合之后才有产物放出。对于双
酶工程 第二章酶动力学 第一节酶促反应动力学
![酶工程 第二章酶动力学 第一节酶促反应动力学](https://img.taocdn.com/s3/m/967e185bf56527d3240c844769eae009581ba290.png)
1913年前后,米彻利斯(Michaelis)和曼吞(Menten) 在前人工作的基础上,通过大量的定量研究,提出了酶促动力 学基本原理,并推导出了著名的米-曼氏方程,推导过程如下:
根据上述反应式,中间产物ES的生成速度(底物S的消失速度)
v1=k1[S][E]-k2[ES]
(2-1)
而ES的消失速度(产物P的生成速度) v2=k3 [ES],当反应达到 平衡时,即v1=v2时
第一节 酶促反应动力学
对许多酶的性质的观察和研究得知,在低的底物浓度[S]下, 反应速度(v)直接与底物浓度[S]成正比;在高底物浓度[S]下, 速度趋向于最大值(Vmax),此时反应速度与底物浓度[S]无关 (如图2-1)。
图2-1 单底物酶促反应的反应速度与底物浓度的关系
第一节 酶促反应动力学
图2-5 乒乓反应机理 实际上,多底物酶促反应动力学是非常复杂的,以上只是作以简要介绍, 有关详细内容,可查阅相关专著。
将米氏方程改写成以下形式
以 对作图,绘出曲线,横轴截距即为-值,纵轴截距则是 (图2-2)。
第一节 酶促反应动力学
图2-2 双倒数作图
第一节 酶促反应动力学
二、多底物动力学 通常情况下,酶催化反应涉及两个(少数情况下三个)底物。 现在我们考虑一个涉及两种底物和两种产物的酶促反应物反应。现在已知的生化反应 中有六成以上属于这一种反应。双底物反应的机理有下面三种 可能:
第一节 酶促反应动力学
1.有序反应机理(ordered reaction) 这种情况下,A和B分别可被说成是先导底物和后随底物,Q 是A的产物,最后被释放。A和Q竞争同游离酶E结合,但A和B则 不会(或者Q和B也不会)发生竞争(如图2-3)。依赖烟酰胺腺 嘌呤二核苷酸(NAD+或NADP+)的脱氢酶的反应就属于这种类型。
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格子型 包埋法
微胶囊
交联法
O E
O
O E
E O
E
2.3.1.3 固定化对酶性质的影响
• 底物专一性的改变 • 稳定性增强 • 最适pH值和最适温度变化 • 动力学参数的变化
2.3.1.4 影响固定化酶促反应的主要因素
• 分子构象的改变 • 位阻效应 • 微扰效应 • 分配效应 (可用Kp 定量描述)链接 • 扩散效应 (可定量描述)
两侧同除
,得
当反应符合米氏方程规律时,
故,
令
,
,
,
上式可转化为无因次形式,得
,
边界条件:
,
该微分方程无解析解,只能用数值法求解。
西勒准数( )
的物理意义是表面反应速率与内扩散速率 之比。对各类反应动力学与固定化酶的形状, 普遍化的的定义式为 :
引入无因次参数,则 无解析解,只有数值解。
可见,Da准数是决定效率因子 和比浓度C* 的唯一参数,因而是表征传质过程对反应速率影响 的基本准数。
Da准数越小,固定化酶表面浓度越接近于主体 浓度CS, 越接近于1。Da准数越大,固定化酶 表面浓度越趋近于零, 越小,越趋近于零。
为提高固定化酶外扩散效率,应设法减小 Da准数。减小Da准数的措施:
CSS
CS
外扩散过程分析 外扩散速率:
酶促反应速率: 达到平衡时,
即
N, r
rmax
Nmax
(CSS,rout)
0 CSS
CS
N,r Nmax
rmax
0
(CSS,rout) CSS CS
Da准数 :
当
时,
过程为外扩散控制。
当
时,
过程为反应控制。
式中:
表明C*为Da准数的函数,即
(
时,
)
表明 为C*的函数,即
分配系数 (Kp)链接
分配系数:载体内外底物(或其他物质)浓度之比。
Kp的测定: 已知底物浓度(CS0 ),体积(V0)的溶液 中,放入不含底物的一定体积的载体,并保持适宜 条件,当达到平衡时,测定载体外溶液的底物浓度 (Cs)。
2.3.2 固定化酶促反应过程分析
2.3.2.1 外部扩散过程 以表面固定化酶为例。
2.2.3 多底物酶促反应动力学
一般的多底物酶促反应可表示为: 这里讨论:双底物双产物情况
反应机制:
关键问题:底物A、B哪个先和酶结合? 任何一个都有可能先与酶结合 (随机机制) A先与酶结合或B先与酶结合 两底物同时与酶结合 (可能性极小)
随机机制(分支机制)
EP EB
E
EAB
EPQ
酶的固定化技术是将水溶性的酶分子通过一定的方式, 如静电吸附,共价键等与载体如角叉菜胶、离子交换树脂 等材料制成固相酶的技术。
细胞的固定化技术: 为省去从微生物(或动、植物)中 提取酶的操作,确保酶的稳定性,采用直接固定化微生物 细胞、动植物细胞、组织技术。
2.3.1.2 酶和细胞固定化方法
物理吸附法 载体结合法 离ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ结合法
内扩散过程
Da准数是决定外扩散
准数是决定内扩散
效率的唯一参数。
效率的主要参数。
Da准数定义: 外扩散效率因子定义:
西勒准数定义: 内扩散效率因子定义:
Da<<1,过程为反应控制; <<0.3时,过程为反应控
Da>>1,过程为外扩散控 制; >>0.3时,过程为内
制
扩散控制。
1、降低固定化酶颗粒的粒径,增大比表 面积,但由于粒径减小会伴随压降增加, 因此应用中综合考虑,确定合适的粒径。
2、使固定化酶表面流体处于湍流状态以 增大 。
2.3.2.2 内部扩散过程
具有大量内孔的球形固定化酶颗粒
dr r
R
内扩散效率因子
稳定状态下,对底物进行物料衡算:
流入量-流出量=反应量
整理,得
见教材33页图2-10
内扩散效率因子in 是 和的函数。
对in影响不大,影响in的主要参
数是西勒准数。如果
,则
不随变化,近似等于1,也就是说
没有内部传质阻力,若
,
则
,反应为内扩散所限制。
为提高固定化酶内扩散效率, 应设法减小。
减小的措施主要是适当降低固 定化酶颗粒粒径。
外扩散过程
E
EA
EQ
(不形成三元复合物)反应模型
+A
-P
+B
-Q
E
EA
EG
EQ
E
-A
+P
-B
+Q
( EG:修饰过的酶 )
简单机制
+A
+B
-Q
-P
E
EA
EAB EPQ
EP +P
E
-A
-B
+Q
双底物酶促反应动力学
反应机理:
解之,得 式中:
2.3 固定化酶促反应动力学
2.3.1 固定化酶促反应动力学基础 2.3.1.1 酶的固定化技术定义