蛋白质(生物技术)

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2、β-折叠(β-pleated sheet)
多肽链充分伸展,肽平面折叠成锯齿状;
侧链交错位于锯齿状结构的上下方;
氢键维系:氢键的方向垂直长轴;
可有顺平行片层和反平行片层结构。 3、其它 (1)肽链主链出现的180°回折部分称β-转角。 (2)蛋白质分子中那些没有确定规律性的部分肽 链构象称为无规卷曲。
蛋白质一级结构是空间结构和生物 功能的基础,一级结构决定空间结 构;但一级结构并非决定空间结构 的唯一因素。空间结构是生物活性 的直接体现。
刘新文,蛋白质化学
一、一级结构与功能的关系
1、一级结构中的保守序列决定空间结构 (1)不同蛋白质之间的比较:相似结构相似功能、 不同结构不同功能 (2)同一蛋白质不同状态的比较:一级结构决定空 间结构 【经典举例】酶原激活、分子病、蛋白变性与复性 (3)保守序列、保守氨基酸改变,功能改变;保守 氨基酸不变,功能不变 【经典举例】分子病
【经典举例】镰形细胞贫血症:编码珠蛋白β链的
结构基因第六个密码子由CTT→CAT,相应的多
肽序列中N端的第六个氨基酸由Glu→Vla;其空
间结构发生相应改变,在表面形成互补区,使蛋 白质分子之间彼此聚合,促使红细胞在低氧压下 变形成镰形,丧失运输氧的生物活性。
刘新文,蛋白质化学
4、蛋白构象疾病:疯牛病,由于朊病毒蛋白 (PrP)构象改变导致蛋白质聚集,形成抗蛋白 水解酶的淀粉样纤维沉淀。
蛋白质化学
刘新文,蛋白质化学
第一节 蛋白质(protein) 的生物学功能
刘新文,蛋白质化学
刘新文,蛋白质化学
2、蛋白质的重要生物学功能
其他生物学功能:营养蛋白,结构,毒蛋白
3、氧化供能
刘新文,蛋白质化学
第二节 蛋白质的分子组成
刘新文,蛋白质化学
一、元素组成
1、主要元素:碳、氢、氧、氮和硫,有些蛋白 质还含有少量磷和金属元素。
1、按照组成分类:单纯蛋白、结合蛋白 单纯蛋白:只有氨基酸组分 结合蛋白:氨基酸组分+其他组分(辅基) 2、按照生物功能分类:酶、调节蛋白、转运蛋白、
运动蛋白、防御蛋白、营养蛋白、储存蛋白、结构蛋白、 毒蛋白,等
3、根据形状分类 纤维蛋白 球状蛋白
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第四节 蛋白质结构与功能的关系
变性环境 温和复性
变性蛋白
(具有正确的一级结构但无 高级结构,无生物活性)
温和复性
去除部分变性剂
非天然蛋白
(具有正确的一级结构和错误 的高级结构,无生物活性)
【经典举例】Rnase
刘新文,蛋白质化学
2、前体蛋白与活性蛋白的转变
前体蛋白
(一级结构冗余,高 级结构错误,因此无 生物活性)
适合环境 (切除冗余及 其它变化)
活性蛋白
(具有正确的一级结 构和高级结构,因此 具有生物活性)
【经典举例】酶原激活:胃蛋白酶原切除N端42
个氨基酸后形成活性中心及其他空间构象,转变
为具水解蛋白质活性的胃蛋白酶;胰蛋白酶原切 除N端6个氨基酸后形成活性中心及其他正确构象, 转变为具有水解活性的胰蛋白酶。
刘新文,蛋白质化学
3、分子病(molecular disease):由于基因结 构改变,蛋白质一级结构中的关键氨基酸发生改 变,从而导致蛋白质功能障碍,出现相应的临床 症状,这类遗传性疾病称为分子病。
2、特点:各种蛋白质的含氮量很接近,平均含
氮量为16%。 3、定氮法测定蛋白质含量: 蛋白质含量=6.25×样品含氮量
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二、结构单位——氨基酸(amino acid)
1、蛋白质的结构单位
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5、成肽反应:
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第三节 蛋白质的分子结构
刘新文,蛋白质化学
•与未折叠的肽段(疏水部分)进行可逆的结合,
辅助二硫键的正确形成;
•引导肽链的正确折叠并集合多条肽链成为较大的
结构; •可以解聚错误聚合的肽段,防止错误发生。
刘新文,蛋白质化学
二、空间结构与功能的关系
空间结构中的特定区域体现生物活性 1、空间结构体现生物特异性 2、空间结构体现生物活性
3、空间结构的灵活性,体现了生物活性的可调
线呈“S”型。
多种空间构象,多种活性状态
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4、空间构象并非生物活性的唯一影响因素
刘新文,蛋白质化学
2、肽分类、命名
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2、肽分类、命名
3、生物活性肽: 谷胱甘肽 神经肽:脑啡肽、内啡肽、强啡肽、P物质、Y肽 肽类激素:催产素、加压素等
其他:生长因子;短杆菌S;甜味肽等
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1、透析、超滤 根据性质:分子大小
2、盐析(salting out)
根据性质:蛋白质的沉淀 作用机理:中性盐中和表面电荷,破坏水化层 影响因素:表面电荷、水化层、溶剂性质
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3、电泳:
根据性质:蛋白质的两性解离
作用机理:异性电荷互相吸引
影响因素:电荷种类及数量、分子大小及形状、 溶液离子强度及pH等 4、层析 (1)离子交换层析:电荷、分子量、分子形状 (2)亲和层析:生物特性
(1)沉淀:不稳定蛋白质从溶液中析出 (2)结絮:变性蛋白质的絮状沉淀,沉淀可溶于强 酸、强碱
(3)凝固:沉淀结块,凝块不溶于强酸、强碱
Fra Baidu bibliotek
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5、变性(denaturation)、复性(renaturation)
(1)变性:在某些理化因素作用下,蛋白质的空间
结构被破坏,从而导致其理化性质改变、生物活性丧 失的现象称为变性。变性不涉及一级结构的变化。 理化性质的变化:紫外吸收、化学活性及粘度上升,
一、蛋白质的基本结构形式
1、连接方式:肽键
肽键(peptide bond):一个氨基酸的羧基与
另一氨基酸的氨基缩水而成的酰胺键称为肽键。 (…CONH…) 肽平面(peptide unit):由肽键中的四个原子 和与之相邻的两个碳原子共同构成的刚性平面。
(CαCONHCα)
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1、α-螺旋(α-helix)
右手螺旋:3.6个AA/圈,螺距0.54nm;
氢键维系:链内氢键(AA1…AA4),平行长轴;
侧链伸出螺旋
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2、β-折叠(β-pleated sheet)
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影响二级结构形成的因素
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次 级 键 介 导 蛋 白 质 高 级 结 构 形 成
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四、超二级结构、域结构
1、超二级结构( supersecondary structure )
(1)基序或模序(motifs or modules,模体符) 在许多蛋白质中,有两个或三个具有二级结构的肽段 在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,称为
亚基(subunit):寡聚蛋白中的单条独立的多肽
链,具有独立的一、二、三级结构,单独存在时 一般无生物学活性。亚基之间以非共价键联系, 亚基可以相同或不同。 亚基之间以非共价键联系,包括疏水键(主
要)、盐键、氢键、范德华力
亚基可以相同或不同
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七、蛋白质的分类
一级结构是空间结构及生物活性的基础…..特异 一级结构的连接键:肽键(主要)、二硫键
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三、二级结构
蛋白质的二级结构是指多肽链骨架中原子的局部空 间排列,不涉及侧链的构象,也就是该肽段主链骨架 原子的相对空间位置,主要有α-螺旋、β-折叠、β-转 角和无规则卷曲。维持二级结构的力量为氢键。
长度缩短:球形、椭球形、杆状,等 多数同时含有α-螺旋和β-折叠 氨基酸位置由侧链极性决定:非极性(内)、极性(表 面,少数内部)、带电(表面) 次级键维系:疏水键、盐键、氢键、范德华力、二硫键
功能区:表面或特定部位
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六、四级结构
寡聚蛋白中亚基的立体排布及相互作用。
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一、理化性质
1、两性解离与等电点:同“氨基酸两性解离”
2、紫外吸收:最大吸收波长=280nm
3、胶体性质:不能透过半透膜 4、沉淀、凝固
蛋白质在溶液中维持稳定的因素: 表面电荷、水化层(溶剂化层) 变性蛋白不一定沉淀,沉淀蛋白也不一定变性
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独特的空间构象,与分子整体以共价键相连,并承
担特定的生物学功能。 结构域与分子整体以共价键相连
具有相对独立的空间构象和生物学功能
同一蛋白质中的结构域可以相同或不同,不同 蛋白质中的结构域也可能相同或不同
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五、三级结构
蛋白质的三级结构是指在一条多肽链中所有原子 的整体空间排布,包括主链和侧链。三级结构的形 成使得在序列中相隔较远的氨基酸侧链相互靠近。
【举例】低温下酶活性低,但并不影响构象;盐
析时沉淀的酶无活性,但构象不变。
5、蛋白构象疾病:错误构象相互聚集,形成抗 蛋白水解酶的淀粉样纤维沉淀,产生毒性而致病。 老年痴呆 疯牛病
亨汀顿舞蹈病
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1、蛋白质的变性与复性
天然蛋白
(具有正确的一级结 构和高级结构,因此 具有生物活性)
节特性
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别构效应(别位效应、变位效应,allosteric
effect):蛋白质分子的特定部位(调节部位)与
小分子化合物(效应物)结合后,引起空间构象发
生改变,从而促使生物学活性变化的现象称为变构 效应。包括正协同、负协同效应 【经典举例】血红蛋白(Hb):由α2β2四聚体组 成,每个亚基含有1个血红素辅基;Hb的氧解离曲
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2、一级结构并非影响空间结构的唯一因素 分子伴娘(molecular chaperons,分子伴侣): 在蛋白质加工、折叠形成特定空间构象及穿膜进 入细胞器的转位过程中起关键作用的一类蛋白质。
正常动物PrPc
(二级结构多为α 螺旋、 对蛋白酶敏感、水溶性)
致病蛋白PrPsc
未知蛋白 (二级结构及 其它变化)
(一级结构相同,但二 级结构全为β折叠,抗蛋 白酶、水溶性差、蛋白 聚集成淀粉样沉淀)
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第五节 蛋白质的理化性质 及分离纯化
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4、蛋白质的基本结构形式:
多肽链 (…NHCHCONHCHCO…)
多肽链的方向性:从N末端指向C末端。
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二、蛋白质的一级结构 (primary structure)
一级结构是指蛋白质的多肽链中氨基酸的排列顺
序;主要靠肽键维系。
二~四级结构称为蛋白质的空间结构,或空间构 象;主要靠次级键维系,尤其是疏水键。 一级结构体现生物信息:20n ………….多样
模序。有的将这种规则的二级结构的聚集体称为超二
级结构,它们可直接作为三级结构的“建筑块”或域 结构的组成单位,是蛋白质发挥特定功能的基础。 (2)类型:αα、ββ、αβα、锌指结构、亮氨酸拉链
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2、域结构(domain,结构域) 域结构是在较大的蛋白质分子中所形成的两个或 多个在空间上可明显区别的局部区域。结构域具有
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二、蛋白质的分离纯化
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二、蛋白质的分离纯化
易被蛋白酶水解;溶解度下降、结晶能力丧失。
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(2)复性
(3)应用
①利用变性: 酒精消毒 高压灭菌 血虑液制备
②防止变性:低温保存生物制品
③取代变性:乳品解毒(用于急救重金属中毒)
6、呈色反应:双缩尿反应,等 双缩尿反应可检测蛋白质的水解程度
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