文献精读介绍+英文文献检索+获取文献方法
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MESH TRANSLATION TABLE
MeSH为Medical Subject Headings的缩写,是美国国立医学图
书馆编写的医学主题词表),MeSH注释表包括MeSH词、副主 题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称 同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词, 则该词将被作为MeSH词和自由词(即text word)同时进行检索。 例如,如果我们输入Cancer,PubMed会按:(“Neoplasms
第一作者所属单位和地址
全部字段 作者姓名 出版时间 录入时间 第一作者姓名 作者姓名全称(02年以后) 最后一个作者(通讯作者) 期号、部分号、增刊号 国际标准刊号 原文语种
Journal [TA]: MeSH Major Topic [MAJR]:
期刊名称(含全称、缩写、ISSN号) MeSH主要主题词,用*表示
PUBLISHER-SUPPLIED CITATIONS
由出版商直接提供的电子版文献,数据记录末尾标注为 [PubMed-as supplied by publisher]。有些出版商允许 在网络上提供正式出版前的文献,刊登此文献的杂志标 注为[Epub ahead of print]。这样标记的数据,大部分进 入“in-process”,经过MeSH标引后再转入“indexed for MEDLINE”。此外,还有少部分出版商提供的文献不 进行标引,保持[PubMed-as supplied by publisher]标 识或[PubMed]标识。
Previewing the number of search results Displaying the search details
Searching by a specific field
Searching by a specific field
通过“Builder”检索框后面的“Show index list”选项可 查询在所有字段或某一特定字段中的索引,可以从索引 中选择一个或几个词来完善检索策略。
推荐使用期刊名称全称或MEDLINE缩写形式检索期刊。
FULL AUTHOR TRANSLATION TABLE/AUTHOR INDEX
输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写,不用标 点符号)的格式,PubMed将自动地截取作者姓名中名的 首字母以适应不同的名缩写。 尽可能输入作者全名
[MeSH]OR cancer[tw]),Neoplasms是cancer的MeSH词。
如何了解MESH词组
http://mesh.medlive.cn/
JOURNALS TRANSLATION TABLE
包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例 如,如果你输入“New England Journal of Medicine”, PubMed将按“N Engl J Med[ta]”查询。 如果期刊名称正好是医学主题词表(MeSH)中的词, PubMed会将其当作MeSH词进行检索。因此,在此种 情况下应使用期刊名称检索字段标识[ta]。
MEDLINE内容涉及临床医学、护理学、牙科学、 兽医学、卫生保健和基础医学,其内容已覆盖了美 国及其它70多个国家和地区的4,500余种期刊。 MEDLINE所提供的在线检索内容只起始于1976年, 而早于60年代中期(1966)的引文条目,则可在 NLM所提供的OLDMEDLINE服务在线检索。
批量文献匹配检索器(Batch Citation Matcher):可 对同一批文献进行检索,如检索Science期刊2002年第 一期杂志。
检索忽略/禁用词表
PUBMED ADVANCED SEARCH BUILDER
通过高级检索页面的“ PubMed Advanced Search Builder ”可以进行特定字段的限定检 索。通过选择要检索的字段,然后在检索框中输入检索词,再选择“AND”、“OR”、 “NOT”三种逻辑关系之一,即可将输入的检索词在所选字段中检索的策略以相应的 逻辑关系加入到检索框中。
科研公开课:文献精读
(第一节)
讲者:魏晓为 南京医科大学附属南京医院 (南京市第一医院)
课程的目的
分享文献阅读经验
培养文献阅读理解能力
锻炼科研思路-文献阅读-科研思路的学习 模式
文献综述的学习与撰写
文献阅读的意义
专业 知识
告诉我们大家都在 研究什么 告诉我们还能做什 么 告诉我们怎么做
常用SCI检索网站
PubMed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed)
是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM) 的国 家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)开发的一个以网络为基础的医学文献检索系统
TA(Journal Title Abbreviation): 刊名缩写
主题词搜索
在检索式提问框中输入一个或更多的词,PubMed就会利用`
自动词语匹配'功能将重要的词或词组用`AND'组合在一起进 行检索。
在多个检索词间可使用布尔逻辑运算符 “AND”、“OR”、 “NOT” ,需注意的是,逻辑运算符须用大写字母,逻辑运
MeSH Subheadings [SH]:
MeSH Terms [MH]: Title/Abstract [TIAB]: TW(Text Words): VI(Volume): UID(PMID):
MeSH副主题词
MeSH主题词 题目/摘要 文本词 卷号 PubMed文献唯一识别
学术 视野
文献
科研 知识
科学 思维
文献阅读的常见问题
阅读文献的三大问题:
坐不住,记不住,想不开(摘自唐凌峰博客)
坐不住:过量阅读、疲劳阅读。。。 记不住:盲目阅读、无中心阅读
想不开:缺乏科学思维
文献阅读的层次
阅读层次 泛读 阅读文献的标题、摘要、前言、结论,判断文献 是否与研究课题相关 与研究课题相关的文献要精读,精读时需要思考 一下几点:论文解决了什么问题、研究现状是什 么、现实意义有哪些、解决问题时采用了什么方 法、本研究有什么不足等 自己学到了什么
广义的精读
精准、高效的检索
精确的阅读 精髓的领悟
文献精读的基础
具有一定的英文基础 具有一定的文献检索能力
过程即是锻炼
具有一定的科研思维能力 具有一定的文献阅读方法
文献精读-首先学会检索
英文文献的检索
获取文献的效率 文献质量的鉴别
文献检索
SCI(科学引文索引 ):(Science Citation Index, SCI)是 由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据 库,其覆盖生命科学、临床医学、物理化学、农业、生 物、兽医学、工程技术等方面的综合性检索刊物。 EI(工程索引 ):(Engineering Index,EI), 由美国工程信 息公司出版,报道工程技术各学科的期刊、会议论文、 科技报告等文献。
精读
阅读总结
摘自网络(
科研思路的培养-泛读到精读
泛读-精读贯穿科研的整个过程,一定是发现问 题、论证问题、提出新问题的循环过程
泛读 问题 问题
论证
精读
文献精读的意义
文献精读是指针对在文献泛读的基础上提炼出
来领域针对性强、内容可信度高、参考价值高
的一系列文献,深入阅读理解此类文献的研究 思路、方法及结果,以获得有效的信息训练、 拓展自身的科研思维,指导课题的设计及文章 的书写。
一个空格的词组,譬如,infection*包括infections,但不
包括infection control。此外,截词检索将关闭自动词语 匹配功能,也不能进行扩展检索。如:gastric cancer*不 会匹配MeSH词,也不会扩展检索相应文献。
特定内容的检索
特定文献检索:
单一文献匹配检索器(Single Citation Matcher): 通过特定的条件(如期刊名、文献的卷号、发表日期、 文献首页页码等)快速地找到所需文献
IN PROCESS CITATIONS
为加快报道速度, 1996年8月开始, PubMed将尚
未标引MeSH主题词、文献类型的最新文献记录先 存入临时库中,该库中的记录只具有简单的书目信 息和文摘、记录标记为[PubMed-in process],In Process Citations中的数据经标引部门标引主题词、 文献类型、GenBank获取号等标引数据后加入到 Medline数据库之中。
ADVANCED SEARCH
PUBMED的Advanced Search页面整合了多种对 检索有用的辅助功能,可实现如下操作: Searching by a specific field Browsing the index of terms
Combining searches using history
通过Advanced Search页面中的“Search Builder ”下拉列
表选择“Author”字段,在字段后的检索框中输入作者 姓名,姓名的输入具有自动完成属性。
作者检索
截词检索
利用通配符<*>进行检索,在词的末尾加*号,PubMed 就会检索出以该词为词根的所有词,但不包括*号后有
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
BROWSING THE INDEX OF TERMS
OLDMEDLINE
OldMedline:收录部分1966年以前出版且
未被Medline收录的文献记录,标识为
[PubMed-OldMedline]。
PUBMED主要可检索字段
AD(Affiliation ):
ALL(All Fields): AU(Author): DP(Publication Date): EDAT(Entrez Date): 1AU(First Author Name): FAU(Full Author Name): LASTAU(Last Author) IP(Issue): IS(ISSN): LA(Language):
PUBMED文献数据库
Medline
In Process Citations
Publisher-Supplied Citations
OldMedline
MEDLINE
MEDLINE是PubMed的主体,文献记录均使用美国 国立医学图书馆的《医学主题词表》(MeSH)进 行主题标引;
ISTP(科技会议录索引 ):(Index to Scientific & Technical Proceedings,ISTP),由ISI出版,报导世界 上每年召开的科技会议的会议论文。
常用SCI检索网站
优点:中文界面、涵盖中文文献数据库、操作简 便、功能便利
小功能丰富、但文章页面信息有限,无法直接获取作者及 摘要信息
PUBMED-科研人员的检索首选
资料全面:收录从1948年至今80多个国家和地区37 种文字的5400多种生物医学期刊上的文献;
实时跟新:每日更新(周二到周六),每天增加约 3000条完整记录; 文献信息完善:PUBMED引文90%为英文文献,79%有 英文摘要 生物信息查询:提供与综合分子生物学数据库的链 接与接入服务
算符的优先顺序为从左向右的顺序,可通过加括号提高运算
的优先级。
对于输入检索框中未加标识的检索词,PubMed依次在 下列词表中查找匹配的内容:
1.MeSH translation table
2.Journals translation table 3.Full Author translation table 4.Author index 5.Full Investigator (Collaborator) translation table 6.Investigator (Collaborator) index