目的基因的克隆转化及重组子筛选

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目的基因的克隆、转化及重组子筛选

一.实验目的:

(1)学习和掌握DNA片段胶回收的方法。

(2)学习DNA连接的有关技术。

(3)掌握用CaCl2 法制备感受态细胞的原理和方法。

(4)学习和掌握质粒DNA的转化和重组质粒的筛选方法。

(5)掌握质粒提取的基本方法。

(6)学习和掌握限制性内切酶的使用方法。

二.实验原理:

(1)cDNA的TA克隆:Taq酶能够在PCR产物的3’末端加上一个非模板依赖的A,而T载体是一种带有 3’T突出端的载体,在连接酶作用下,通过粘性末端连接,把PCR产物插入到质粒载体的多克隆位点,称为 T-A克隆。可用于PCR产物的克隆和测序。

(2)感受态细胞制备原理:细菌处于容易吸收外源DNA的状态叫感受态,细菌处于0℃,CaCl2的低渗溶液中,细胞膨胀,细胞壁通透性增强,在冷热变化刺激下细胞膜表面产生裂隙,使外源DNA进入。

(3)蓝白斑筛选:载体带有一个LacZ基因的调控序列和头146个氨基酸的编码信息,编码α-互补肽;宿主细胞编码C端部分序列。诱导物IPTG 和乳糖的结构相似,可以与乳糖操纵元的阻遏蛋白结合,从而解除阻遏蛋白的作用,使载体得以合成α-互补肽,与宿主细胞编码的C端部分结合形成β-半乳糖苷酶,而X-Gal是β-半乳糖苷酶的显色底物,在β-半乳糖苷酶的催化下会产生蓝色产物。可用于重组克隆的筛选,重组克隆无法产生α-互补肽,因而无法使X-Gal显色,培养基上表现为白色菌落。

三.实验材料:

大肠杆菌DH5a、LB培养基、0.1mol/L CaCl2DNA割胶回收试剂盒,试管,Amp/IPTG/X-Gal,三角玻璃棒,玻璃珠,牙签,1µl pMD19-T Vector、质粒提取试剂盒。

四.实验步骤、现象、结果及分析:

(1)cDNA电泳及胶回收

1. 提取总RNA,反转录cDNA,用设计好的引物扩增出不同的目的片段。取目的基因产物进行琼脂糖电泳,紫外灯下切胶。

2.把所割胶放入1.5 ml EP管,称重如下表一。

表一:cDNA琼脂糖凝胶重量

空管2管3管

重量(g)0.9045 1.2280 1.2961

净重(g)0.3235 0.3916

3.按1g/1ml 的量,大致各加入400µl Binding Buffer,65℃水浴7min;(每隔2-3 min,摇一下);

4.把溶液转移至spin-column,10000g 离心1 min ,倒出套管内残液;

5.在柱子中加入300µl Binding buffer,10000g 离心1min,倒出套管内残液;

6.在柱子中加入700ul 的SPW 溶液,放置3min,10000g 离心1min ,去残液;

7.10000g 离心1min(去乙醇);

8.把柱子放入干净的1.5ml EP 管。加Elution Buffer 20µl。室温放置1min,10000g 离心1min。

9.检测DNA 的纯度和浓度,如下表二所示。选取质量好的2号组进行接下来的连接转化。

表二:cDNA 吸光度测定

(2)感受态细胞制备

1.从新鲜培养的LB 平板上挑单个DH5a 大菌落接种到3mlLB 培养液中,37 ℃ 剧烈振荡培养过夜(教师准备)。

2.取过夜培养的大肠杆菌DH5a 按 1:50 取1ml 菌液接种到 50ml LB 培养基中,37 ℃ 振荡培养,1hr 后用分光光度计测其OD 值为0.182,1.5 hr 后再测其OD 值,为0.304,到达其对数生长期(细菌对数生长期 OD 600 为 0.2-0.4)。

3.分别取1ml 菌液至1.5 ml 离心管中标记为1号、2号、3号,培养物冰上放置 10 min ,5000 r/min ,离心 2 min ,用枪头吸取废液,弃去,收集底部菌体。

4.分别加入500µl 预冷的 0.1 mol/L CaCl 2 ,用枪头吹散,使菌体悬浮于预冷的 CaCl 2 中,冰上放置10分钟。

5.离心机5000r/min ,离心 2min ,用枪头吸取弃上清,分别加入100µl 预冷的 0.1 mol/L CaCl 2,小心用枪头吹散,0℃ 保存 3hr 。

(3)连接和转化 组别 实验组 正对照组

负对照组 操作 连接:从2号胶回收DNA EP 管中取4µl ,加入1µl pMD19-T Vector 、5µl Solution Ⅰ组成10µl 连接反应体系,在16℃下进行连接反应;

转化:30min 后加入1号100µl 感受态细

胞EP 管中,以手指轻轻触碰混匀,冰中

放置30min 进行转化,接着42℃热激

45sec ,再在冰中放置1min ,最后加入

390µl LB 液体培养基于37℃振荡培养50min 。

取1µl(5ng/µl)

质粒加入2号

100µl 感受态细

胞EP 管中。 无需取任何物质加入3号100µl 感受态细胞EP 管中。 样品组-100µl :

从上述500µl 体

系中取100µl 加入

LB/Amp/IPTG/X-G

al 平板,最后加入

玻璃珠,摇动混匀,

于37℃倒置、过夜

培养。 样品组-200µl : 从上述500µl 体系中取200µl 加入LB/Amp/IPTG/X-G al 平板,最后加入玻璃珠,摇动混匀,于37℃倒置、过夜培养。 从上述101µl 体系中取50µl 加入LB/Amp/IPTG/X-Gal 平板,最后加入玻璃珠,摇动混匀,于37℃倒置、过夜培养。 从上述100µl 体系中取100µl 加入LB/Amp/IPTG/X-Gal 平板,最后加入玻璃珠,摇动混匀,于37℃倒置、过夜培养。

注:LB/Amp/IPTG/X-Gal 平板配制:

取固体LB 培养基于微波炉中融化,在超净工作台中冷却至55℃左右,加入80µl 氨苄青霉素,混匀,倒入四个已消毒并做好标记的平板,分别是:样品组100µl 、样品组200µl 、

2组 3组 A260/A280 1.864 1.867 浓度(ng/µl) 146.718 128.242

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