生物化学第九次作业

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第九次生化习题

一、名词解释(英文)

Glyoxylate cycle,乙醛酸循环:植物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA后在乙醛酸体内生成琥珀酸,乙醛酸和苹果酸,其中琥珀酸可用于糖的合成,成为乙醛酸循环。动物体内无乙醛酸体。

脂肪酸经过β-氧化分解为乙酰CoA,在柠檬酸合成酶的作用下乙酰CoA与草酰乙酸缩合为柠檬酸,再经乌头酸酶催化形成异柠檬酸。随后,异柠檬酸裂解酶(isocitratelyase)将异柠檬酸分解为琥珀酸和乙醛酸。再在苹果酸合成酶(malate synthetase)催化下,乙醛酸与乙酰CoA 结合生成苹果酸。苹果酸脱氢重新形成草酰乙酸,可以再与乙酰CoA缩合为柠檬酸,于是构成一个循环。其总结果是由2分子乙酰CoA生成1分子琥珀酸,反应方程式如下:

2乙酰CoA+NAD+→琥珀酸+2CoA+NADH+H+

琥珀酸由乙醛酸体转移到线粒体,在其中通过三羧酸循环的部分反应转变为延胡索酸、苹果酸,再生成草酰乙酸。然后,草酰乙酸继续进入TCA循环或者转移到细胞质,在磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEP carboxykinase)催化下脱羧生成磷酸烯醇式丙酮酸(PEP),PEP再通过糖酵解的逆转而转变为葡萄糖6磷酸并形成蔗糖。

H-DNA, H-DNA又称铰链DNA,是三螺旋结构中较为特殊的一种,1987年由Mirkin等在一种持粒的酸性溶液中首次发现。H-DNA可在任何以镜象重复的寡聚核苷酸中产生(核苷酸序列具有H回文结构)。它是由部分未缠绕的复合DNA中的一个富嘧啶链,经回折同复合体中伸展的富嘌呤链间形成Hoogsteen氢键而形成的分子内三螺旋,即DNA的双链所形成的三链螺旋。由于形成过程中发生TAT或者C+GC的转化,故称H-DNA。并把这类序列称为H回文序列。

Induced fit hypothesis,

Linking and Writhing number of DNA,

Tm and Cot1/2 values,

Optimal pH of enzyme,酶的最适PH值。酶活性最高时的PH成为最适Ph。

Intron and exon, 内含子(intron):真核细胞基因DNA中的不编码序列,这部分序列并不编码蛋白质,又称间隔序列或插入序列

tRNA and SnRNA, 小核RNA它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spilceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。现在发现有五种snRNA,其长度在哺乳动物中约为

100-215个核苷酸。snRNA一直存在于细胞核中,与40种左右的核内蛋白质共同组成RNA剪接体,在RNA转录后加工中起重要作用。另外,还有端体酶RNA(telomeraseRNA),它与染色体末端的复制有关;以及反义RNA(antisenseRNA),它参与基因表达的调控。

Molecular hybridization of Nucleic acid, 分子杂交(简称杂交,hybridization)是核酸研究中一项最基本的实验技术。其基本原理就是应用核酸分子的变性和复性的性质,使来源不同的DNA(或RNA)片段,按碱基互补关系形成杂交双链分子(heteroduplex)。杂交双链可以在DNA 与DNA链之间,也可在RNA与DNA链之间形成。

Saccharide, 定义:糖是多羟醛或多羟酮及其缩聚物和某些衍生物的总称

peptide bond, 一分子氨基酸的α-羧基和一分子氨基酸的α-氨基脱水缩合形成的酰胺键,即-CO-NH-。分子量为43。氨基酸借肽键联结成肽链。

hyperchromic effect and hypochromic effect,

Specific activity.

Semi-discontinuous replication of DNA, DNA的半不连续复制他认为3′→5′走向的DNA链的合成是不连续的,是由许多5′→3′方向合成的DNA片段连接起来的,这些不连续的DNA 片段称为冈崎片段(Okazaki fragment)。原核细胞冈崎片段的长度为1000~2000个核苷酸,相当于1个顺反子(cistron)的大小,即基因的大小;真核生物冈崎片段的长度为100~200个核苷酸,相当于1个核小体DNA的大小。

3′→5′走向的DNA链是不连续的,另一条链根据最近的实验,认为5′→3′走向的DNA 链是连续的,因此称semidis continuous replication。

Exon or extron, 外显子(exon or extron):真核细胞基因DNA中的编码序列,这部分序列可转录为RNA,并翻译成蛋白质,也称表达序列

Urea cycle,尿素循环(urea cycle):是一个由4步酶促反应组成的,可以将来自氨和天冬氨酸的氮转化为尿素的循环。该循环是发生在脊椎动物的肝脏中的一个代谢循环。肝脏是动物生成尿素的主要器官,由于精氨酸酶的作用使精氨酸水解为鸟氨酸及尿素。精氨酸在释放了尿素后产生的鸟氨酸,和氨甲酰磷酸反应产生瓜氨酸,瓜氨酸又和天冬氨酸反应生成精氨基琥珀酸,精氨基琥珀酸为酶裂解,产物为精氨酸及延胡索酸。由于精氨酸水解在尿素生成后又重新反复生成,故称尿素循环。

ω-oxidation of fatty acid,脂肪酸的氧化形式,长链上每两个碳原子一组氧化成二氧化碳和水,依次进行的氧化方式

Motif of protein,蛋白质分子中的一些二级结构单元,往往有规则地聚集在一起形成全由α-螺旋、全由β-片层或α-螺旋与β-片层混合、均有的超二级结构基本形式,具体说,形成相对稳定的αα、βββ、βαβ、β2α和αTα等超二级结构又称模体(motif)或模序。

Allosteric enzyme and allosteric effect变构酶allosteric enzyme 具有变构效应的酶。变构效应迄今有三个定义。(1)天冬氨酸氨甲酰转移酶是嘧啶核苷酸合成途径初始阶段的酶,

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