细菌,古菌分类方法

细菌，古菌分离鉴定方法
张冉 2017.03
一.古菌及古菌分类进程：
以表型为基础
数学分类系统 化学分类系统 古菌被认为是原核生物的独立群体 多相分类法（表形、化学特征、基因型、系统发育信息） 暂定非培微生物（provisional status Candidatus ）
二．细菌、古菌分类历史
三．细菌、古菌鉴定方法
注：1.同源蛋白：指进化上相关的蛋白质。

即不同物种中具有相同或相似功能的蛋白质或具有明显序列同源性的蛋白质。

同源基因：两个相比较的序列之间的匹配程度。

一般来说，如果两条基因序列相似性达80% ，就可以把它们称为“同源基因(homologous gene)”。

为了便于研究，Fitch又把同源基因分为直向同源基因（从祖先继承下来的基因）、横向同源基因（基因重复而产生的同源基因）和异源同源基因（基因在不同物种之间横向转移）。

附.论文中出现的表格
表2.16S rRNA基因序列分析的优缺点
表3.DNA杂交的优缺点
表4.多位点序列分析（MLSA）优缺点
表5.非培微生物的特征描述。