蛋白质提取、纯化、鉴定的方法(一)
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蛋白质提取、纯化、鉴定的方法(一)
一、硫酸铵沉淀
硫酸铵是用于沉淀蛋白质的最常用的盐。低浓度硫酸铵使蛋白质的溶解度增大,即所谓的盐溶(salting in),但当硫酸铵浓度增加到一定浓度后,蛋白质的溶解度开始减小,即所谓的盐析(salting out)。当硫酸铵达到一定浓度时,蛋白质析出。不同蛋白质的盐析浓度有差异,了解目的蛋白质析出所需的硫酸铵浓度,就可部分纯化这种蛋白质。注意,目的蛋白质的浓度与盐析浓度有一定的关系,如1mg/ml与0.01mg/ml的蛋白质浓度所需的盐析浓度是不一样的,低浓度的蛋白质盐析需要较高浓度的硫酸铵。硫酸铵沉淀不仅可去除一些杂蛋白,还可去除其他的杂质如脂质等各种小分子。
二、三相分配技术
举一个例子来说明该技术的原理:提取E.coli中的绿色荧光蛋白,E.coli 与适当浓度的硫酸铵混匀,加入等体积的叔丁醇,振荡混匀,低速离心,分成三相。上层为有机相,含有细菌的膜脂和脂溶性物质如色素;中层,含有绿色荧光蛋白;下层为相,含有完整细胞壁的E.coli、核酸和大量的蛋白质等。
这个技术的原理是,适当浓度的硫酸铵可沉淀大量的蛋白质但不沉淀绿色荧光蛋白;叔丁醇可溶解细菌的细胞膜,因此可释放绿色荧光蛋白;同时叔丁醇是种有机溶剂,可使蛋白质和核酸等大分子变性,使其在原位沉淀,仍留在细菌的细胞壁内。
该方法的优点是操作简便,省去了消化细胞壁和去除核酸及大多数杂蛋白等烦琐步骤。但该方法只适用于那些能够耐受有机溶剂的蛋白质。这样的技术得到的是部分纯化的蛋白质。
三、层析技术
1.离子交换层析这一技术是根据不同的蛋白质有不同的等电点,其吸附在离子交换剂上的强弱有分别,来对蛋白质进行分离。离子交换剂可分为两种,阳离子交换剂(如羧甲纤维素)和阴离子交换剂(如DEAE-纤维素)。在某一pH值条件下,当阳(阴)离子交换剂带有负(正)电荷而蛋白质带有正(负)电荷时,蛋白质就可吸附在阳(阴)离子交换剂上。各种蛋白质的等电点可能不同,因此其吸附在离子交换剂上的强度不同,用不同离子强度的洗脱液可将pI不同的蛋白质洗脱。要注意的是pI相近的蛋白质很多,因此用此方法提取的目的蛋白质不一定是纯的。在使用离子交换剂时,必须知道离子交换剂的pKa值,如羧甲基的pKa值是
4.5,这说明当流动相的pH为5. 5时,90%羧甲基与质子基本解离,带负电,然而当流动相pH为5. O时,羧甲基与质子开始结合,当pH到达4.0时,羧甲基质子化,不带电,失去离子交换功能。当然,还必须知道目的蛋白质的等电点。实验者若要做好离子交换层析,必须了解离子交换层析的详细原理和操作规范。
2.聚焦层析聚焦层析是一种离子交换层析,与普通的离子交换层析不同的是洗脱方法。普通的离子交换层析是用变换流动相的离子强度来洗脱蛋白质,而聚焦层析是用pH梯度来洗脱蛋白质。洗脱液用高分子缓冲液(polymeric buffer,如ampholytes),amloholytes可非常好地控制pH的洗脱梯度。理论上,pI相差0.05的蛋白质也可以被分开。
3.亲和层析亲和层析是一种非常有效的层析方法,基于蛋白质,配体(如抗体、抗原、受体、激素、酶、底物、酶,抑制剂等)分子之间的特异结合性。将一种配体交联到固相载体上,理论上就可以提取混合物中的目的蛋白质。在用亲和层析纯化时,必须首先考虑抗体,抗原、受体、激素、酶、底物等的解离常数(Kd),Kd一定要小于0.003mM。当Kd小于0.003mM时,95%,的酶、抗体或受体等会吸附在亲和吸附剂(affinity adsorbents)上。洗脱时,流动相中的底物(配体)对酶(受体)的亲和性往往大于固定相中的底物(配体),因此可以有效洗脱。有时,若配体不易获得或非常昂贵,也可以用其他方法洗脱,如增加离子强度,破坏目的蛋白质与其配体之间的离子相互作用,但增加离子强度可增强目的蛋白质与固相吸附剂的疏水吸附,因此可以加一些表面活性剂如TritonX-100
降低目的蛋白质与固相吸附剂的疏水吸附作用。有些目的蛋白质与亲和吸附剂的相互作用非常强,很难洗脱,可以加一些离液剂(chaotropic agent)如尿素。