生物信息学课堂测验

括
、
。
8. 成熟的microRNA长度约
个碱基，其前体双链RNA通
常具有
结构，在细胞核内经
切割，抑止基因的
表达。
9. 多序列比对的工具有
和
。
二、选择题（每题1分，共20分）
1 以下哪一个是mRNA条目序列号：
A. J01536
B. NM_15392
C. NP_52280
D. AAB134506
2 Refseq和GenBank有什么区别：
D. PROSITE
4直系同源定义为：
A. 不同物种中具有共同祖先的同源序列
B. 具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源 序列
C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列
D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列
5如果有一段DNA序列，它可能编码多少种蛋白质序列：
A. 1
B. 2
■. Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息
D. GenBank源于Refseq
3如果你需要查询文献信息，下列哪个数据库是你最佳选择：
A. OMIM
B. Entrez
■. PubMed
D. PROSITE
4直系同源定义为：
■. 不同物种中具有共同祖先的同源序列
B. 具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源 序列
■. ФX174
D. 人类基因组
10构建进化树最直接的错误来源是：
■. 多序列比对错误
B. 采样的算法差异
C. 假设进化分支是单一起源 D. 尝试推测基因的进化关系
11下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法：
A. 邻位连接法（NJ法） B. Kimura算法
■. 最大似然法（ML） D. 非加权平均法（UPGMA）
A. 1-5%
B. 5-10%
C. 10-20%
D. 20-4-%
9第一个被完整测定的基因组序列是：
A. 啤酒酵母的3号染色体 B. 流感病毒
C. ФX174
D. 人类基因组
10构建进化树最直接的错误来源是：
A. 多序列比对错误
B. 采样的算法差异
C. 假设进化分支是单一起源 D. 尝试推测基因的进化关系
11下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法：
A. 邻位连接法（NJ法） B. Kimura算法
C. 最大似然法（ML） D. 非加权平均法（UPGMA）
12下列不能用做系统发育分析的软件有（ ）
A. Clustal X B. Oligo 6 C. MEGA D. AMOVA
13从头预测真核基因的原因有（ ）
12下列不能用做系统发育分析的软件有（ ）
A. Clustal X ■. Oligo 6 C. MEGA D. AMOVA
13从头预测真核基因的原因有（ ）
A. 外显子/内含子边界难以确定 B. 内含子长度可能只有几 个碱基对
C. 编码区域的GC含量并不总是与非编码区相同 ■. 以上三 个方面的原因
14下列不属于三大核酸序列数据库的是（ ）
A. GenBank B. EMBL C. DDBJ ■. Swiss-Prot
15向核酸数据库GenBank提交数据，应使用下列哪个软件 （）
A. BLAST
■. Sequin C. SRS D. TreeBASE
wenku.baidu.com
16 NCBI使用的搜索引擎是（ ）
A. SRS
7系统发生树的两个特征是：
A. 进化分支和进化节点 ■. 树的拓扑结构和分支长度
C. 进化分支和树根
D. 序列比对和引导检测方法
8蛋白质编码区域占人类基因组百分比是：
■. 1-5%
B. 5-10%
C. 10-20% D. 20-4-%
9第一个被完整测定的基因组序列是：
A. 啤酒酵母的3号染色体 B. 流感病毒
A. BLAST
B. Sequin C. SRS D. TreeBASE
16 NCBI使用的搜索引擎是（ ）
A. SRS
B. Entrez C. getentry D. google
17 GBFF的数据格式中结尾标识是（ ）
A. //
B. ! C. *
D. <
18．SnRNA的功能是
A. 参与RNA的剪接
■. Entrez C. getentry D. google
17 GBFF的数据格式中结尾标识是（ A）
■. //
B. ! C. *
D. <
18．SnRNA的功能是
■.参与RNA的剪接
B.激活RNA聚合酶
C.形成核糖体
D.是rRNA的前体
19AtPTR1-AtPTR6氨基酸序列相似度非常高，在构建进化树 时，应该优先选择什么方法？
B.激活RNA聚合酶
C. 形成核糖体
D.是rRNA的前体
19AtPTR1-AtPTR6氨基酸序列相似度非常高，在构建进化 树时，应该优先选择什么方法？
A. FM 法 B. N/J法 C. MP 法 D. ML法
20 miRNA的主要作用是（ ）
A.蛋白质的合成
B.参与rRNA的修饰
C. 参与mRNA的特异降解 D.参与小体RNA的拼接
二、选择题（每题1分，共20分）
1 以下哪一个是mRNA条目序列号：
A. J01536
■. NM_15392
C. NP_52280 D. AAB134506
2 Refseq和GenBank有什么区别：
A. Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA序 列
B. GenBank提供的是非冗余序列
A. FM 法 B. N/J法 ■. MP 法 D ML法 20 miRNA的主要作用是（ ）
A. 参与蛋白质的合成 B. 参与rRNA的修饰 ■. 参与mRNA的特异降解 D. 参与小体RNA的拼接
A. Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA序 列
B. GenBank提供的是非冗余序列
C. Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息
D. GenBank源于Refseq
3如果你需要查询文献信息，下列哪个数据库是你最佳选择：
A. OMIM
B. Entrez
C. PubMed
武汉生物工程学院课程考试试题 2012-2013学年第二学期课堂测验
课程名称：生物信息学 使用班级：10生工、生技钱班 考试方式：开卷 考试时间：50分钟
一、填空题（每题1分，共30分）
1. 生物信息学三大核酸序列网站是
、和
，
基因组浏览器有
。
2. 数据库常用的数据检索工具有
、
和
。
3. 生物信息学常用的软件有
C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列
D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列
5如果有一段DNA序列，它可能编码多少种蛋白质序列：
A. 1
B. 2
C. 3
■. 6
6要在数据库查询一段与某DNA序列编码蛋白质最相似的序 列，应选择：
A. blastn B. tblastn C. tblastp ■. blastx
、
和
；常用
引物设计软件有
；常用系统发育分析软件
有
；常用多序列联配的软件有
。
4. 引物设计最常用的软件有
和
。DNAMAN软
件的主要作用有
和
。
5. 蛋白质三级结构预测的主要方法包括
、
和
。
6. 系统发育树根据树的具体表达形式分为物种树和
。
系统发育树的构建方法有
、
。
7. 蛋白质一级结构是指
，二级结构基本单元包
C. 3
D. 6
6要在数据库查询一段与某DNA序列编码蛋白质最相似的序 列，应选择：
A. blastn B. tblastn C. tblastp D. blastx
7系统发生树的两个特征是：
A. 进化分支和进化节点 B. 树的拓扑结构和分支长度
C. 进化分支和树根
D. 序列比对和引导检测方法
8蛋白质编码区域占人类基因组百分比是：
A. 外显子/内含子边界难以确定 B. 内含子长度可能只有几 个碱基对
C. 编码区域的GC含量并不总是与非编码区相同 D. 以上三 个方面的原因
14下列不属于三大核酸序列数据库的是（ ）
A. GenBank Prot
B. EMBL C. DDBJ D. Swiss-
15向核酸数据库GenBank提交数据，应使用下列哪个软件 （）