毕赤酵母表达系统资料整理

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Mut+和Muts

毕赤酵母中有两个基因编码醇氧化酶——AOX1及AOX2,细胞中大多数的醇氧化酶是AOX1基因产物,甲醇可紧密调节、诱导AOX1基因的高水平表达,较典型的是占可溶性蛋白的30%以上。AOX1基因调控分两步:

抑制/去抑制机制加诱导机制。简单来说,在含葡萄糖的培养基中,即使加入诱导物甲醇转录仍受抑制。为此,用甲醇进行优化诱导时,推荐在甘油培养基中培养。注意即使在甘油中生长(去抑制)时,仍不足以使AOX1基因达到最低水平的表达,诱导物甲醇是AOX1基因可辨表达水平所必需的。AOX1基因已被分离,含AOX1启动子的质粒可用来促进编码外源蛋白的目的基因的表达。AOX2基因与AOX1基因有97%的同源性,但在甲醇中带AOX2基因的菌株比带AOX1基因菌株慢得多,通过这种甲醇利用缓慢表型可分离Muts菌株。在YPD(酵母膏、蛋白胨、葡萄糖)培养基中,不论是Mut+还是Muts其在对数期增殖一倍的时间大约为2h。Mut+和Muts菌株在没有甲醇存在的情况下生长速率是一样的,存在甲醇的情况下,Mut+在对数期增殖一倍的时间大约为4至6个小时,Muts在对数期增殖一倍的时间大约为18个小时。

菌株GS

115、X-

33、KM71和SMD1168的区别

GS

115、KM71和SMD1168等是用于表达外源蛋白的毕赤酵母受体菌,与酿酒酵母相比,毕赤酵母不会使蛋白过糖基化,糖基化后有利于蛋白的溶解或形成正确的折叠结构。GS

115、KM

71、SMD1168在组氨酸脱氢酶位点(His4)有突变,是组氨酸缺陷型,如果表达载体上携带有组氨酸基因,可补偿宿主菌的组氨酸缺陷,因此可以在不含组氨酸的培养基上筛选转化子。这些受体菌自发突变为组氨酸野生型的概率一般低于10-8。GS115表型为Mut+,重组表达载体转化GS115后,长出的转化子可

能是Mut+,也可能是Muts(载体取代AXO1基因),可以在MM和MD培养基上鉴定表型。SMD1168和GS115类似,但SMD1168基因组中的Pep4基因发生突变,是蛋白酶缺陷型,可降低蛋白酶对外源蛋白的降解作用。

其中X-33由于是野生型,因此耐受性比较好,如果担心转化率的话可以考虑这种酵母菌,而X33与GS115一样都是属于MUT+表现型,也就是说可以在含甲醇的培养基中快速生长,但是据说会对外源基因表达有影响,KM71的亲本菌在精氨酸琥珀酸裂解酶基因(arg4)有突变,在不含精氨酸的培养基中不能生长。用野生型ARG4基因(约2kb)插入到克隆的野生型AOX1基因的BamHI(AOX1基因密码子)及SalI(AOX1基因密码子)位点,取代了AOX1基因16-227密码子,此结构转化至KM71亲本菌(arg4his4)中,分离产生KM71MutsArg+His-菌株,Arg+转化子遗传分析显示野生型AOX1被aox1::

ARG4结构所取代,所以KM71所有转化子都是Muts表型。AOX1位点没有被完全缺失,理论上可用你的目的结构通过基因取代方法替换aox1::

ARG4结构,这样重组菌株的表型是His+MutsArg-,这意味着重组菌株生长时需精氨酸。但仅添加精氨酸并不能完全缓和arg4突变的影响,arg4菌株在含精氨酸的最小培养基中不能很好地生长。因此不推荐在KM71中通过取代aox1::

ARG4结构来获得His+转化子。

一般来说,如果是胞内表达,应尽量用Muts细胞,这样得到的蛋白产物中醇氧化酶蛋白量较少而目的蛋白量相对较多,使下游纯化更易进行。而对于分泌蛋白的表达,无论是甲醇利用慢(Muts)还是甲醇利用快(Mut+)的细胞都可应用。

基因重组

Pichia.pastoris酵母菌体内无天然质粒,所以表达载体需与宿主染色体发生同源重组,将外源基因表达框架整合于染色体中以实现外源基因的表达,包括启动子、外源基因克隆位点、终止序列、筛选标记等。细菌内同源重组被认为是重组质粒构建过程的难点,因为未线性化的环状质粒之间发生同源重组的几率非常低,所以重组转移载体必须用特定的限制性内切酶进行线性化处理。这

种处理的目的是防止随机插入重组时质粒在功能区断开,造成目的基因表达失活,让同源重组以指定的方式发生。

表达载体主要分为以下几类:

(1)胞内表达载体主要有pHIL-

D2、p

A0815、pPIC3K、pPICZ、pHWO10,pGAPZ、pGAPZa(Invitrogen)等。该类载体可以将目的基因表达在胞内,可以避免毕赤酵母的糖基化,主要适合于那些不能被糖基化相关基因的表达;

(2)分泌型表达载体主要有pPI

C9、pHIL-S

1、pPICZα、pYAM75P等。由于毕赤酵母本身的泌内源蛋白非常少,将外源蛋白分泌到胞外,非常有利于目的蛋白质的纯化及积累。常用的分泌的信号序列主要是由89个氨基酸组成的α交配因子(α-factor)的引导;

(3)多拷贝插入表达载体如pPIC9K,pPI

C3.5K。

在某些情况下,毕赤酵母中重组基因多拷贝整合可增加所需蛋白的表达量。该载体均可用于在体内(pPI

C3.5K,大多数转化子是Mut+表型;然而由于质粒含有AOX1基因序列,有可能在AOX1位点发生重组,破坏野生型AOX1基因,产生His+Muts转化子,则需要在MD及MM平板上检测可证实His+ Mut+转化子。

线性化酶切位点插入事件GS115表型KM71表型

His+Mut+His+Muts

SalI或StuI插入his4

SacI插入5’AOX1His+Mut+His+Muts

BglII取代AOX1His+MutsHis+Muts(不推荐)

xx酵母表达常用培养基

10×YNB(

13.4%的无氨基酸酵母氮源),134gYNB固体溶于1L蒸馏水,过滤灭菌,4℃保存。

YPD完全培养基:

酵母提取物10 g/L,蛋白胨20 g/L,葡萄糖20 g/L(固体培养基含

1.5%xx)。

转化培养基RDB:

每100mL加入山梨醇18g(186 g/L),琼脂糖2g(20g/L)121℃灭菌20分钟,然后待温度降至60℃以后在超净台上加入10×YNB 10mL(

13.4 g/L),10×葡萄糖10mL(20 g/L),500×生物素

0.2mL(4×10-4g/L),100×AA1mL。混匀,倒平板(灭菌时只加入80ml水即可)。

选择培养基MD(最小葡萄糖):

配100mL,向80mL水中加入琼脂糖2g(20g/L)121℃灭菌20分钟,待温度降至60℃以后在超净台上加入10×YNB 10mL(

13.4 g/L),10×葡萄糖10mL(20 g/L),500×生物素

0.2mL(4×10-4g/L)。

选择培养基MM(最小甲醇):

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