基因敲除方法的比较
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方法原理优点不足应用
利用同源重组进行基因敲除利用DNA转化技术,
将含有目的基因和靶
基因同源片段的重组
载体导入靶细胞,通
过载体与靶细胞染色
体上同源序列间的重
组,将外源基因整合
入内源基因组内,使
外源基因得以表达。
通过研究靶细胞或者
个体在目的基因插入
前后遗传特性的改
变,达到研究基因功
能的目的。
具有高度特
异性和方向
性,外源片
段也具有可
操作性
1)操作复杂,实验周期长,费用
偏高;(2)在敲除过程中,被破坏
的常常只是靶基因的部分外显
子而并不是整个编码区,残留
的编码序列有可能组合出新的
未知的功能,这将给表型分析
带来麻烦;(3)对于某些必需基
因,敲除后会造成细胞死亡,也
就无法研究这些必需基因的功
能;(4)由于基因功能上的冗余,
敲掉一个基因并不能造成容易
识别的表型;(5)同一个打靶载
体在不同遗传背景下进行基因
敲除,获得的表型差异很大。
噬菌体的
Cre/Loxp系统
和酿酒质粒的
FLP/FRT系统
利用随机插入突变进行基因敲除利用某些能随机插入
基因序列的病毒,细
菌或其他基因载体,
在目标细胞基因组中
进行随机插入突变,
建立一个携带随机插
入突变的细胞库,然
后通过相应的标记进
行筛选获得相应的基
因敲除细胞
效率高、基
因完全失
活、容易分
离鉴定被插
入引起失活
的目的基因
等
1以农杆菌介导的T-DNA插入
突变只适用于那些容易被
T-DNA转化的植物,且常常会引
起的染色体重排现象,使突变
体表型与T-DNA插入无关而难
以进行遗传学分析。
2转座子插入突变要求转座子
本身较短,容易操作,且对任何
拟敲除区域有较高转座效率等
以农杆菌介导
的T-DNA插入
突变
转座子插入突
变
RNA干扰引起的基因敲除是由与生物体内源
靶基因mRNA 同
源的双链RNA
特异性引发的靶m
RNA降解,导致目
的基因表达沉默的一
种反向遗传学技术。
1)特异性强,
针对同源基
因共有序列
的RNAi则
只能导致同
源基因失
活,不影响
其他内源性
mRNA的表
达;(2)效率
高;(3)穿透
性强
1缺乏有效的siRNA载体
2无法彻底去除目的基因
3在哺乳动物中的应用还处于
探索阶段,实验方法不够成熟。
1对于一些敲
除后小鼠在胚
胎时就会死亡
的基因,可以
在体外培养的
细胞中利用
RNAi技术研究
它的功能。
2由于RNAi能
高效特异的阻
断基因的表
达,它成为研
究信号传导通
路的良好工具。
3RNAi还被用来研究在发育过程中起作用的基因,如可用RNAi来阻断某些基因的表达,来研究他们是否在胚胎干细胞的增殖和分化过程中其起着关键作用。