中心试验室试验指引-中国医学科学院北京协和医院中心试验室
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自动切胶仪
作者:郭丹
修订日期:2014-9-18
【目的及应用】:
Ettan自动切点仪可以与多种凝胶染色方式兼容,包括考马斯亮蓝染色,银染和SYPRO荧光染色等。通过识别两个参照标志物的坐标位置(X和Y)来确定出胶内蛋白点的精确坐标,误差不超过1毫米,一个循环可以切下9600个蛋白胶粒。
【试剂及设备】:
1.1 设备:Ettan Spot Picker自动切胶仪
【实验步骤】:
1.仪器开机系统设置
1.1 仪器开机:按下仪器背部的总开关,系统电源即被接通,进入主界面启动Ettan Spot Picker 控制软件。要求仪器复位的对话框将会出现。点击“OK”。
1.2系统设置:选择“System:System Setup”
推荐在设置任何系统位置前,都先使用“Initialize Instrument”“Go to Home”按钮。“System Setup”屏中可以允许用户设置:
(1) Rinse Station清洗站的位置(XYZ轴,无须每次设置);
(2) 切胶平面的Pick头高度(Z轴,必须每次设置);
(3) 96孔板A1孔的位置(XYZ轴,无须每次设置);
(4) 切胶时所需要的一些参数设置(无须每次设置)。
注:在任何情况下,用户都可以通过点击“Cancel”按钮退出“System Setup”程序。如果选择了“Cancel”,则对“System Setup”进行的所有修改将全部丢失。如果需要保存修改设置,则点击“Save and Exit”。
1.3系统灌注
将缓冲管放在适合切胶的溶液中。在载入切胶列表后,软件将会告知用户切下所有蛋白点所需要的溶液提及。推荐使用双蒸水或者合适的清洗/脱色液作为切胶时的系统缓冲液。
注意:在灌注系统前必须确保系统设置中清洗站的位置已经被正确设置
(1)选择“Tools: Prime Syringe”。
(2)在“Prime Syringe”中,输入清洗次数(推荐为5-10次),按“Prime”键。
(3)可以使用“ Stop”键中止清洗。
(4)清洗结束后,点击“Exit”
2. 放置凝胶
(1)将凝胶盘放于Ettan Spot Picker。
(2)将凝胶放于凝胶盘上,并用少量液体(例如:固定/储存液或双蒸水)覆盖凝胶至约2毫米
厚。如果待切蛋白点数量较多,则需要更多体积的液体以补偿挥发造成的损失。为了避免产生气泡,放置凝胶前需要在胶盘内加入少量液体,然后将凝胶从一侧逐渐倾斜,直至放入胶盘内。
(3)放置凝胶时,要使参照标志位于胶盘中央的平行线内。注意不要使参照标志与平行线相交
或接触,以免影响到参照标志的识别。
(4)将凝胶固定器装在胶盘内的缝隙中,是用凝胶固定器稳固的固定凝胶,用手指转动螺丝将
其固定。
注意:对于面积较大的凝胶,凝胶固定器需要在放置凝胶前就固定在胶盘上。否则,凝胶可能被凝胶固定器破坏。
3. 切胶操作
3.1 载入切点列表
(1)在“Load Pick List”窗口中,选择使用的参照标志类型(黑色/白色),点击“Load Pick List”。
(2)浏览寻找切点列表。
(3)选中切点列表,点击“Open”。
(4)如果使用ImageScanner对凝胶进行扫描,检查“Use Correction”框。在“Scanner Id”列表项中
选择使用的扫描仪,并在“Resolution(DPI)”列表项中选择凝胶扫描时使用的分辨率(300DPI)。
(5)选中“Open”。切点列表数据将会显示于屏幕上,窗口的主要部分将显示出待切蛋白点的图
像和有关信息。X和Y轴坐标列显示为空白,因为参照标志尚未被识别。
(6)在“Load Pick List”窗口中,选择“Next”。
(7)如果微孔板尚未放置,则使用合适的编号标记它们(如图所示),并将前四块(或更少)
微孔板放于自动切点仪的微孔板架上。
(8) 点击“Next”。
3.2识别参照标志
(1) 打开Camera的镜头盖;先使用Auto自动检测Markers,要求Markers位于胶中央Camera
的视野中并且形状完整,Camera能够自动识别并接受Markers,即窗口由红色变为绿色。
(2)当自动检测无法识别Markers,需要Manual手动检测:使用兰色方向箭头移动Camera至
Markers上,使Markers位于视野中央,同时可以通过拖动的“Contrast”和“Threshold”选项调节,直到获得质量较好的图像信息。如果图像清晰度不够,则可以通过调节相机光圈和聚焦,使其在“Camera view”中显示为一个清晰的圆点,直到Camera能够识别并接受Markers。
3.3切胶
(1) 在“Pick Spots”窗口中,点击“Pick”。
(2) 在“Result File Location”窗口中,选择存放切点结果文件的位置。
(3) 输入待输出的文件夹和文件名称。切点结果将会以文件夹的形式存放于所选位置。切点过
程中每块含有胶粒的微孔板(即使是部分)都会以一个单一文件的形式储存。
(4) 点击“Create Directory & Start Picking”。
3.4 重复切点过程
对于切点结果不满意或者切失败的点,可以通过重复该切点过程来完成切点。重复时或许需要调整某些切点参数,例如增加jazz.
(1) 标出微孔板的位置和漏切的蛋白胶粒孔位置。
(2) 在“Load Pick List”窗口内,点击“Load Pick List”。
(3) 寻找已执行的切点程序结果文件(extension.mfl)
(4) 选择结果文件。不要使用修正功能!点击“Open”。
(2)结果表格将会显示在屏幕上。