实验7-ACE基因多态性分析
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溶液Ⅲ 250 μl 重悬沉淀,振荡10秒;(变性)
(NaOH)
转至1.5 ml离心管, 99℃×5min;
加溶液IV 50 μl 振荡5秒;(中和)
(Tris-HCl)
3000g×5min,
上清转移至新0.5 ml离心管,取5 ul用于PCR.
2. PCR反应
• 取消毒的 0.2ml 离心管,加入下列成分:
插入片段
插入型 (I 型 )
缺失型 (D 型)
490bp
190bp
三、操作步骤
• 基因组DNA抽提 • PCR反应 • 琼脂糖凝胶电泳检测
1. 基因组DNA抽提
溶液Ⅰ 10 ml 漱口20秒 收集漱口水;
(4%蔗糖溶液)
3000g×5min×RT,弃上清;
溶液、实验结果: ACE基因多态性电泳图
2k
1k 750bp 500bp 250bp 100bp
五、注意事项
1. 清洁口腔,充分漱口。 2. 裂解细胞后震荡时间不易长,以免
DNA断裂。
六、思考题
1. 何为基因多态性? 2. 基因多态性的临床意义有哪些?
• 真核生物基因组中非编码序列多于编码序列
编码序列
基因组
调控序列
非编码序列 重复序列
串联重复序列(串联排列:大卫星、小卫星、微卫星
)
重复单位长度:1-几千bp;重复次数:几次-几百万次
散在重复序列(散在分布:Alu家族)
Alu家族 • 重复单位:300bp左右;130+31+130bp • 具Alu酶切位点 • 30-50万次 • 功能:基因调控 • Alu元件的插入、删除和重组与许多先天性遗传
2×PCR Buffer mix
10 μl
DNA模板
5 μl
引物混合物(10μM each) 2 μl
ddH2O
3 μl
总体系
20 μl
• 扩增程序为:94℃变性 5min
94℃变性30s 55℃复性30s 35个循环 72℃延伸40s
72℃延伸10min, 4℃保存
3. 琼脂糖电泳检测
• 制备1.5%琼脂糖凝胶 • 点样,电泳 • 紫外灯下观察结果
疾病和癌症相关
淋巴细胞染色体 :绿色为Alu序 列
• ACE基因分析的理论基础 ACE基因第16内含子存在一段长度为287bp(Alu序列)的 插入/缺失(I/D)多态性片段,I/D多态性与血液ACE水平有 明确关系,DD型ACE水平最高,ID次之,II最低。左室肥大 患者中DD型频率明显增高。
• 实验原理 以DNA为模板,ACE基因特异的引物序列位于287bp插入/缺 失片段的两侧进行PCR扩增,故II型扩增片段长度约为 490bp,DD型扩增片段长度约为190bp,ID型扩增片段为2 个,分别为190bp和490bp。根据PCR扩增片段的大小可进 行多态性分析。
• ACE基因多态性分析 PCR方法分析基因多态性
ACE基因多态性分析 (血管紧张素转换酶, Angiotensin converting enzyme,
ACE)
基因诊断:利用现代分子生物学和分子遗传学的方 法,从DNA、RNA水平检测基因的存在、结构异常 和表达状态,从而对疾病做出诊断的方法。
基因多态性:指在一随机婚配的群体中,染色体同 一基因座位点上有两种或两种以上的基因型,它可 决定人体对疾病的易感性、临床表现多样性和对药 物治疗反应的差异性。
颊粘膜上皮细胞 基因组DNA的抽提 及ACE基因多态性分析
李姣 生物化学与分子生物学教研室 同济大学医学院再生医学系 Email:07085@
基因组DNA来源:颊粘膜上皮细胞
二、实验原理
• 基因组DNA抽提 碱裂解法抽提基因组DNA(本实验) 用蛋白酶K和苯酚提取大分子DNA 裂解-蛋白酶K-沉淀法快速提取DNA