细菌几丁质酶的结构与功能研究进展
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究 。E—ma :sajn j .d .n i dhou @nf eu c 。 l u
一
2一
江苏农业科学
21 年第 4 卷第 4 02 0 期
成桶状结构外 , 还有一个 Ⅳ端 口折 叠丰 富的结构域 ( 丁质 几 结合 域) 和一个小 的 o+ t 结构域 , 其功能 尚不清楚。其他 1 8
活性分别下 降了 3 %和 6 %_ 0 5 I 。在含有 多个结构 域的细菌 菌株 中也 发 现类 似 结果 , 嗜 水 气 单 孢 菌 ( e m ns - 如 Ar oa o
其杀虫抑 真菌的作用 [] 微生物学报 , 0 , ( )10— 8. J. 2 94 2 :8 15 0 9
区域 。
收稿 日期 :0 1 0— 8 2 1 —1 0
dgaa s 4 erd n 0几丁质酶 B含有 2个催化域 , 中 N端催化 2— 其 域 降解几丁二糖衍生物 4 一 t lm ele l me y blfr —N, i e hu iy N 一d c. a
t ci boe y ht is 的速率是 C端催化域 的 1 . l o 3 6倍 , C端催化域 而
wfh n 8 z o g 8@ y h o c r. r a o . o cl n 。
根据几丁质结合域三维结构的不同 , 可以分 成 I Ⅱ Ⅲ 、 和
型。真菌 和植 物的几丁质结合域属于 I型 ; 病毒和 昆虫 的几
丁质结合域 属于 Ⅱ型 ; 细菌的几丁质结合域属 于 Ⅲ型。 目前
Biblioteka Baidu
通信作者 : 丁少军 , , 男 博士 , , 教授 博士生导师 , 主要从事生物技术研
气单胞菌 A rm nzcv e 、 e oa ai ) 肠杆 菌 ( ne bc rs. G一1 o a E t oat p ) r e 株的几丁质 酶信号肽序列完全相同。有些细菌几丁质酶基 因
育 的各个时期都需要一定量几丁质。几丁质代谢随昆虫的不 同生长发育阶段 而变化 , 并保持相对稳定 , 这对昆虫正常生长 发育至关重要 。高等植物 和高等动物体 内则不含几 丁质 , 几 丁质酶对高等动物 、 物没有直接毒性 , 植 因此选择几丁质酶来 破坏 昆虫几丁质结构或几 丁质代谢平衡 , 于协 同防治虫 害 对 具有极 大的发展潜力 。 。 自 2 0世纪 8 0年代 以来 , 已经从
cins eef m no oahgncfnu e ilu cniJ . ht aegn o etm p toei gsVrcl m l a i ] i r u t ii e [
江苏农业科学
21 0 2年第 4 o卷第 4期
钟万芳, 丁少军.细菌几 丁质酶 的结构与功能研 究进展 [ ] J .江苏农 业科 学, 1 , ( ) 1 3 2 24 4 : — 0 0
细菌几 丁质酶 的结构与功能研究进展
钟 万芳 , 少军 丁
(. 1 南京林业大学 , 江苏南京 20 3 ; . 10 7 2 江苏省农 业科学 院植物保护研究所 , 江苏南京 20 1 ) 10 4
tnlcin s/yoy epoue yB c l p ml G [ ] n i a ht a l e m rd cdb aiu u i S 2 J .E - o ie s ls s u
zmeadMi oi eh ooy2 1 ,8 3 :2 2 1 y n c ba T cnlg ,0 14 ( ) 2 5— 3 . r l
能具有重要意义 。因此可以利用几丁质酶降解真菌细胞壁 中 的几丁质 , 从而抑制甚 至杀死病原 真菌… 。几 丁质也是 昆虫 体壁 、 内外表皮 、 呼吸道 、 肠腔等组织 的主要成分 , 昆虫生长发
由于大多数 细菌几丁质 酶为胞外酶 , 因此都具 有信号肽 序列 , 信号肽的剪切位 点常位 于 2个 Aa残基之 间。几 丁质 l 酶不同 , 其信号肽的长度及剪切位点也各不相 同, 同源性较 但 高 的几丁质酶信号肽 的相似性也较高 , 如黏质沙雷 氏菌 、 鼠 豚
几丁质结合域 中的芳香族氨基酸 Tp8 r6 7后 , 本消除了其与 基 几丁质的结合能力 。 与纤维素酶 的纤维素结合域相 似 , 丁质酶的几 丁质结 几
[] 2刘
东, 陈月华 , 蔡
峻 , 苏云金芽孢杆菌几丁质 酶 B特性及 等.
合域主要负责与几丁质结合 , 使催化域更好地发挥水解作 用。 如 Sil v i等发现 ,/ /h r 几丁质酶 C i t V r o  ̄ bo v hA的几 丁质结合域 缺失后 , 丧失 了结合到晶体几丁质的能力 , 虽然该几 丁质酶仍 然能降解 晶体几 丁质 , 但是 降解能力较野 生型几丁质 酶有所 下降” 。K a等发 现 缺失 了几 丁质 结 合域 的 Arm ns @m e oa o s. o1S 2 几 丁质酶对胶体几丁质和 晶体几 丁质 的水解 pN .0 一 4
工、 修饰及蛋 白的输 出机制 不 同所 引起 的。值 得关 注 的是 ,
序列 的同源性 , 糖苷水解酶可分为 5 8个家族 , 根据该分类 方法几丁质酶属于 1 8和 1 9家族 。1 族存在 于大 多数 细 8家
Sr t ye pi t tpo cs lau e m c s的几丁质酶基因在 自身宿主中表达时可分 泌到胞外 , 但在大肠杆菌中表达时却 留在大肠杆菌细胞内 。
12 催 化 域 .
菌、 真菌、 病毒、 线虫 、 昆虫、 节肢 动物、 哺乳 动物 和一 些植 物 中 J1 , 9家族主要存在于植物和少 数革兰 氏阳性细 菌中。细
菌几丁质酶 由于潜在 的商业用途颇受关 注。 目前 , 助 x射 借
线 晶体衍射技术和 N MR技术 , 黏质沙雷 氏菌 (ert  ̄r 8 Sr / i c 一 a a T e cr) 0k e ̄ 6 u的几 丁质酶 A 和环状 芽孢 杆菌 ( a/ cc— l B c/ i u / r ln) as WL一1 6 u的几丁质酶 A 的三 维结构都 已被 解 2株 ok
ae l itoe的速率是 N端催化域 的 2 7倍 。进一步研究 ct c t r s y h oi .
发现 , N端催化域和 c端催化域分别表现外切几丁质酶 、 内切
几 丁质酶活性 。
1 3 几 丁质 结合 域 .
作者简介 : 钟万芳 (9 8 ) 男 , 17 一 , 福建上杭人 , 博士研究 生 , 助理研究 员, 主要 从 事微 生 物 农 药 研 究。T l ( 2 ) 4 9 8 1 E—m i e: 0 5 830 9 ; a: l
[ ] aY JY nJP, uxM,t .I rvn teisccdl cit a 3 C i , a H e a mpoig h net ia at i — 1 i vy gis rs tn u x q i u ac tsmoq ie y epes n o ant eiatC l un  ̄ si u sut sb xrsi f s e qf a o o cins eeciCi aiu hei [ ] pl n rnMir・ hf aegn A B l ss ar u J .A p E v o co i h n c l p c s i
动物 、 植物 、 生物 中克隆获得了几 丁质酶基 因。根据氨基 酸 微
在另一种细菌中表达时 , 信号肽剪切位点会 发生改变 , 如环状 芽孢杆菌 WL一 2几丁质 酶 A的信号 肽剪切位 点在 Aa。 1 l4 一 Aa 间, l之 4 而在大肠杆 菌中表达 时却 在 A 一Lu, 间 。 : e, 之 信号肽剪切位点发 生改变 可能是 因为 不 同细 菌在 翻译 后加
催化域是几 丁质 酶催化几 丁质水解 的关 键区域 , 同源性 较高 , 都含有 2个高度保守 的区段。其 中 Gu和 Ap残基高 l s
度保守 , 可能是在降解几丁质 时直接与几 丁质糖 苷键作用 的
残基 。须要指出的是 , 催化域 的同源性与菌株 的亲缘远 近没 有关联 , 如气单胞菌 A rm nss. o1 S一 4菌株 的几 丁质 eo oa p N .0 2 酶 C i、 h 、 h hl C i C i 2 3催化域 的相似性并 不高 】 。催 化域 的
析 。本文重点介绍 了细 菌几丁质酶 的结构域及其 功能 , 旨在 为阐明其作用机理提供参考 。
1 细菌几 丁质酶的结构域 与功 能
保守氨基酸残基 差异决定 了该酶属于糖苷水解酶 1 8或 l 9家 族, 目前 除链霉 菌属 、 气单胞 菌 N . 0 4 菌株、 o 1 S一2 伯克霍尔 德 氏菌等少数 细菌 的几 丁质 酶属于 1 9家族外 , 其他 都属 于
1 8家族 。 有些细 菌 几 丁 质 酶 含 有 多 个 催 化 域 , Mi oub e 如 c bl r r f i
大多数细菌几 丁质酶前体都具有相似 的结 构域 , N端 从
到 C端依次 为信 号肽 (i a ppie 、 化域 ( a yi d— s n l et ) 催 g d ct t o l a c ma ) 几丁质结合 域( h nb dn o a ) i 、 n ci i igdm i 及一个短的 C端 i t n n
基金项 目: 国家 自然科学 基金 ( 编号 :0 0 3 1 ; 3 50 4 ) 江苏省 自然科学基 金( 编号 :K 0 17 ) 江苏省农 业科技 自主 创新 资金 [ 号 : X B 2 168 ; 编 C
(9) 1 ] 0 65 。
降解几丁三糖衍生 物 4 一m t lm ei rl e yu blf y —N, N 一t. h le N , r i
摘要 :细菌几丁质酶 因其潜在 的应用价值而越来越 受关注 。细 菌几 丁质 酶属于 糖苷水解 酶家族 的 1 、9家族 。 81 典型的细菌几丁质酶包括将成熟几丁质酶分泌到胞外的信号肽 、 起催化作用 的催化 区、 特异性结合氨基葡萄糖及几 丁 质 的几丁质结合 区以及一个功能 尚不清楚的短的 c端区域。本文重点介绍了细菌几丁质酶的结构域及其 功能 。 关键词 :细菌 ; 几丁质酶 ; 结构域
试验证 明了这 一点 , H rt 如 ad 等突变 B cl iuasC i aiu c cln h ls r A1
家族几丁质酶也具有相同的桶状结构 , 因此具有相 同功能。
参考 文献 :
[ ] hs i , h ai Sdg i e a i t eo f i n — 1 G a m A m d nG,aeh M,t .Fr p ro a f c e S a 1 s r t bu
还不清楚这 3种类型 的结合域在功能上是否存在差异 。 在许多细菌几丁质酶 的几 丁质结合域 中, 芳香族 氨基酸
Tr Tp y和 r 高度保守 , 构域与纤维 素酶、 白酶 的序列也 该结 蛋 存在相似性。几 丁质酶通 过不同折叠 , 将结合域 中的芳香族 氨基酸暴露在分 子表 面 , 通过其 实现与几 丁质的结合 。突变
bo,07,3 2 )7 4 7 4 . i 20 7 ( 3 :7 4— 7 6 l
[ ] h ,a R QuJ , . s a o dca c r a o f 4 Z uY P P J , i e a I l i a hr t i tno a n z t 1 o tn n a ez i
中图分类号 : 9 9 15 Q 3 .0 文献标志码 : A 文章编号 : 0 10 (0 2 0 00 — 2 1 2— 3 2 2 1 )4— 0 1 0 0
几丁质 (  ̄ n 是真菌细胞壁 的重要成分 , ct) i 与真菌细胞 的
1 1 信 号 肽 .
发生和维持以及分 隔的形成 有关 , 丁质对真菌 生长及其 功 几
一
2一
江苏农业科学
21 年第 4 卷第 4 02 0 期
成桶状结构外 , 还有一个 Ⅳ端 口折 叠丰 富的结构域 ( 丁质 几 结合 域) 和一个小 的 o+ t 结构域 , 其功能 尚不清楚。其他 1 8
活性分别下 降了 3 %和 6 %_ 0 5 I 。在含有 多个结构 域的细菌 菌株 中也 发 现类 似 结果 , 嗜 水 气 单 孢 菌 ( e m ns - 如 Ar oa o
其杀虫抑 真菌的作用 [] 微生物学报 , 0 , ( )10— 8. J. 2 94 2 :8 15 0 9
区域 。
收稿 日期 :0 1 0— 8 2 1 —1 0
dgaa s 4 erd n 0几丁质酶 B含有 2个催化域 , 中 N端催化 2— 其 域 降解几丁二糖衍生物 4 一 t lm ele l me y blfr —N, i e hu iy N 一d c. a
t ci boe y ht is 的速率是 C端催化域 的 1 . l o 3 6倍 , C端催化域 而
wfh n 8 z o g 8@ y h o c r. r a o . o cl n 。
根据几丁质结合域三维结构的不同 , 可以分 成 I Ⅱ Ⅲ 、 和
型。真菌 和植 物的几丁质结合域属于 I型 ; 病毒和 昆虫 的几
丁质结合域 属于 Ⅱ型 ; 细菌的几丁质结合域属 于 Ⅲ型。 目前
Biblioteka Baidu
通信作者 : 丁少军 , , 男 博士 , , 教授 博士生导师 , 主要从事生物技术研
气单胞菌 A rm nzcv e 、 e oa ai ) 肠杆 菌 ( ne bc rs. G一1 o a E t oat p ) r e 株的几丁质 酶信号肽序列完全相同。有些细菌几丁质酶基 因
育 的各个时期都需要一定量几丁质。几丁质代谢随昆虫的不 同生长发育阶段 而变化 , 并保持相对稳定 , 这对昆虫正常生长 发育至关重要 。高等植物 和高等动物体 内则不含几 丁质 , 几 丁质酶对高等动物 、 物没有直接毒性 , 植 因此选择几丁质酶来 破坏 昆虫几丁质结构或几 丁质代谢平衡 , 于协 同防治虫 害 对 具有极 大的发展潜力 。 。 自 2 0世纪 8 0年代 以来 , 已经从
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江苏农业科学
21 0 2年第 4 o卷第 4期
钟万芳, 丁少军.细菌几 丁质酶 的结构与功能研 究进展 [ ] J .江苏农 业科 学, 1 , ( ) 1 3 2 24 4 : — 0 0
细菌几 丁质酶 的结构与功能研究进展
钟 万芳 , 少军 丁
(. 1 南京林业大学 , 江苏南京 20 3 ; . 10 7 2 江苏省农 业科学 院植物保护研究所 , 江苏南京 20 1 ) 10 4
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能具有重要意义 。因此可以利用几丁质酶降解真菌细胞壁 中 的几丁质 , 从而抑制甚 至杀死病原 真菌… 。几 丁质也是 昆虫 体壁 、 内外表皮 、 呼吸道 、 肠腔等组织 的主要成分 , 昆虫生长发
由于大多数 细菌几丁质 酶为胞外酶 , 因此都具 有信号肽 序列 , 信号肽的剪切位 点常位 于 2个 Aa残基之 间。几 丁质 l 酶不同 , 其信号肽的长度及剪切位点也各不相 同, 同源性较 但 高 的几丁质酶信号肽 的相似性也较高 , 如黏质沙雷 氏菌 、 鼠 豚
几丁质结合域 中的芳香族氨基酸 Tp8 r6 7后 , 本消除了其与 基 几丁质的结合能力 。 与纤维素酶 的纤维素结合域相 似 , 丁质酶的几 丁质结 几
[] 2刘
东, 陈月华 , 蔡
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合域主要负责与几丁质结合 , 使催化域更好地发挥水解作 用。 如 Sil v i等发现 ,/ /h r 几丁质酶 C i t V r o  ̄ bo v hA的几 丁质结合域 缺失后 , 丧失 了结合到晶体几丁质的能力 , 虽然该几 丁质酶仍 然能降解 晶体几 丁质 , 但是 降解能力较野 生型几丁质 酶有所 下降” 。K a等发 现 缺失 了几 丁质 结 合域 的 Arm ns @m e oa o s. o1S 2 几 丁质酶对胶体几丁质和 晶体几 丁质 的水解 pN .0 一 4
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序列 的同源性 , 糖苷水解酶可分为 5 8个家族 , 根据该分类 方法几丁质酶属于 1 8和 1 9家族 。1 族存在 于大 多数 细 8家
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12 催 化 域 .
菌、 真菌、 病毒、 线虫 、 昆虫、 节肢 动物、 哺乳 动物 和一 些植 物 中 J1 , 9家族主要存在于植物和少 数革兰 氏阳性细 菌中。细
菌几丁质酶 由于潜在 的商业用途颇受关 注。 目前 , 助 x射 借
线 晶体衍射技术和 N MR技术 , 黏质沙雷 氏菌 (ert  ̄r 8 Sr / i c 一 a a T e cr) 0k e ̄ 6 u的几 丁质酶 A 和环状 芽孢 杆菌 ( a/ cc— l B c/ i u / r ln) as WL一1 6 u的几丁质酶 A 的三 维结构都 已被 解 2株 ok
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发现 , N端催化域和 c端催化域分别表现外切几丁质酶 、 内切
几 丁质酶活性 。
1 3 几 丁质 结合 域 .
作者简介 : 钟万芳 (9 8 ) 男 , 17 一 , 福建上杭人 , 博士研究 生 , 助理研究 员, 主要 从 事微 生 物 农 药 研 究。T l ( 2 ) 4 9 8 1 E—m i e: 0 5 830 9 ; a: l
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动物 、 植物 、 生物 中克隆获得了几 丁质酶基 因。根据氨基 酸 微
在另一种细菌中表达时 , 信号肽剪切位点会 发生改变 , 如环状 芽孢杆菌 WL一 2几丁质 酶 A的信号 肽剪切位 点在 Aa。 1 l4 一 Aa 间, l之 4 而在大肠杆 菌中表达 时却 在 A 一Lu, 间 。 : e, 之 信号肽剪切位点发 生改变 可能是 因为 不 同细 菌在 翻译 后加
催化域是几 丁质 酶催化几 丁质水解 的关 键区域 , 同源性 较高 , 都含有 2个高度保守 的区段。其 中 Gu和 Ap残基高 l s
度保守 , 可能是在降解几丁质 时直接与几 丁质糖 苷键作用 的
残基 。须要指出的是 , 催化域 的同源性与菌株 的亲缘远 近没 有关联 , 如气单胞菌 A rm nss. o1 S一 4菌株 的几 丁质 eo oa p N .0 2 酶 C i、 h 、 h hl C i C i 2 3催化域 的相似性并 不高 】 。催 化域 的
析 。本文重点介绍 了细 菌几丁质酶 的结构域及其 功能 , 旨在 为阐明其作用机理提供参考 。
1 细菌几 丁质酶的结构域 与功 能
保守氨基酸残基 差异决定 了该酶属于糖苷水解酶 1 8或 l 9家 族, 目前 除链霉 菌属 、 气单胞 菌 N . 0 4 菌株、 o 1 S一2 伯克霍尔 德 氏菌等少数 细菌 的几 丁质 酶属于 1 9家族外 , 其他 都属 于
1 8家族 。 有些细 菌 几 丁 质 酶 含 有 多 个 催 化 域 , Mi oub e 如 c bl r r f i
大多数细菌几 丁质酶前体都具有相似 的结 构域 , N端 从
到 C端依次 为信 号肽 (i a ppie 、 化域 ( a yi d— s n l et ) 催 g d ct t o l a c ma ) 几丁质结合 域( h nb dn o a ) i 、 n ci i igdm i 及一个短的 C端 i t n n
基金项 目: 国家 自然科学 基金 ( 编号 :0 0 3 1 ; 3 50 4 ) 江苏省 自然科学基 金( 编号 :K 0 17 ) 江苏省农 业科技 自主 创新 资金 [ 号 : X B 2 168 ; 编 C
(9) 1 ] 0 65 。
降解几丁三糖衍生 物 4 一m t lm ei rl e yu blf y —N, N 一t. h le N , r i
摘要 :细菌几丁质酶 因其潜在 的应用价值而越来越 受关注 。细 菌几 丁质 酶属于 糖苷水解 酶家族 的 1 、9家族 。 81 典型的细菌几丁质酶包括将成熟几丁质酶分泌到胞外的信号肽 、 起催化作用 的催化 区、 特异性结合氨基葡萄糖及几 丁 质 的几丁质结合 区以及一个功能 尚不清楚的短的 c端区域。本文重点介绍了细菌几丁质酶的结构域及其 功能 。 关键词 :细菌 ; 几丁质酶 ; 结构域
试验证 明了这 一点 , H rt 如 ad 等突变 B cl iuasC i aiu c cln h ls r A1
家族几丁质酶也具有相同的桶状结构 , 因此具有相 同功能。
参考 文献 :
[ ] hs i , h ai Sdg i e a i t eo f i n — 1 G a m A m d nG,aeh M,t .Fr p ro a f c e S a 1 s r t bu
还不清楚这 3种类型 的结合域在功能上是否存在差异 。 在许多细菌几丁质酶 的几 丁质结合域 中, 芳香族 氨基酸
Tr Tp y和 r 高度保守 , 构域与纤维 素酶、 白酶 的序列也 该结 蛋 存在相似性。几 丁质酶通 过不同折叠 , 将结合域 中的芳香族 氨基酸暴露在分 子表 面 , 通过其 实现与几 丁质的结合 。突变
bo,07,3 2 )7 4 7 4 . i 20 7 ( 3 :7 4— 7 6 l
[ ] h ,a R QuJ , . s a o dca c r a o f 4 Z uY P P J , i e a I l i a hr t i tno a n z t 1 o tn n a ez i
中图分类号 : 9 9 15 Q 3 .0 文献标志码 : A 文章编号 : 0 10 (0 2 0 00 — 2 1 2— 3 2 2 1 )4— 0 1 0 0
几丁质 (  ̄ n 是真菌细胞壁 的重要成分 , ct) i 与真菌细胞 的
1 1 信 号 肽 .
发生和维持以及分 隔的形成 有关 , 丁质对真菌 生长及其 功 几