(精选)蛋白质翻译及翻译后修饰

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5’AUG CCA UGC ACC CGG GUU …………..CAA UAG 3’ Pro Cys Thr Arg Val …………..Gln
密码有简并性(degeneracy),即一个氨基酸可由几个密码子表示; 通用性,大多数生物使用同样的遗传密码,但也会有所偏爱。
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遗 传 密 码 表
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1.2 转运RNA (tRNA)
原核的核糖体(70S)= 30S小亚基 + 50S大亚基 30S小亚基: 16S rRNA + 21种蛋白质 50S大亚基: 23S,5SrRNA + 34种蛋白质
真核的核糖体(80S)= 40S小亚基 + 60S大亚基 40S 小亚基: 18S rRNA + 33种蛋白质 60S 大亚基: 28S,5.8S,5SrRNA + 45种蛋白质
氨基酸与tRNA的 连接方式
甲酰基
翻译起始时, 第一个氨基酸 一般是甲硫氨酸, 其氨基要甲酰 化成为甲酰甲硫 氨酸,予以保护。
fMet-tRNA
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2.2 起始复合物的形成
首先IF3、IF1帮助30S小亚基 与mRNA结合,IF2和GTP帮助 甲酰甲硫氨酸-tRNA与AUG配 对,接着IF3脱离,形成30S 起始复合物。50S大亚基进入, IF1和IF2脱离,形成70S起始 复合物,需要GTP。甲酰甲硫 氨酸-tRNA处于P位。
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遗传密码
上世纪60年代,利用均聚核苷酸实验,破译了遗传密码。 遗传密码为三联体(每三个碱基代表一个氨基酸),由5’到3’阅读, 无间断。即使在少数重叠基因(如病毒)中,其开放阅读框架(open reading frame, ORF)仍按此原则。 起始密码为AUG, 终止密码为UAA,UAG和UGA。
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沉降系数 S
生物大分子在离心场中沉降,受到三种力的影响,它们是离 心力,浮力和摩擦力。物质在单位离心力场的沉降速度是个定值, 称为沉降系数(sedimentation coefficient) 。
蛋白质、核酸等的沉降系数在1 X 10-13到 200 X 10-13秒 之间。 为方便将10-13秒作为一个单位,称Svedberg单位,用S表示。
原核tRNA有30-40种,真核有50-60种,含70-90个核苷酸, 并 有多种稀有碱基。
tRNA是最小的RNA, 占细胞总RNA 的15%左右,其功能 是搬运氨基酸和解读密码子。
tRNA 具有“四环一臂”和“三叶草” 形的典型结构。
注意:3’端CCA氨基酸受位和反密码子环
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tRNA的结构—“四环一臂”
密码子与反密码子的配对方式
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变偶性或摆动性——反密码子5’端的碱基与 密码子的第三位配对不严格
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1.3 核糖体(ribosome)与核糖体rRNA
核糖体是rRNA 与几十种蛋白质的复合体,有大、小两个亚基构成。含有 合成蛋白质多肽链所必需的酶、起始因子(IF)、延伸因子(EF)、释放 因子(RF)等。
反应如下:
A A t R N A A T P 氨 酰 基 - t R N A 合 成 酶 A A - t R N A A M P P P i
氨基酸的羧基与tRNA 的3’端CCA-OH 以酯键相连,因此其氨基是自 由的。
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tRNAfmet fMet-tRNA合成酶
酯键
Met 甲酰FH4
其数值不仅与物质分子的质量有关,也与分子的形状有关。
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rRNA只有4-5种,但占细胞 RNA 的大部分 。
图为原核生物的两种RNA 16S rRNA和5S rRNA 的结构
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核糖体的结构
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核糖体有4个基本功能
1. 容纳mRNA,并能沿着mRNA由5’—— 3’ 移动,由tRNA解读其密码;
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蛋白质翻译系统示意图
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1.1 信使RNA (mRNA)
mRNA是遗传信息的载体(载有遗传密码,genetic code),是 合成蛋白质的蓝图(模板),它以一系列三联体密码子(codon) 的形式从DNA转录了遗传信息。每个密码子代表一个氨基酸。
mRNA占细胞总RNA的5-10%,不稳定,寿命短。 原核的mRNA 是多顺反子;真核的mRNA 是单顺反子。
倒L形的三级结构
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tRNA的功能是解读mRNA上的密码子和搬运氨基酸。 tRNA上至少有4 个位点与多肽链合成有关:即3’CCA氨基酸接受位
点、氨基酰-tRNA合成酶识别位点、核糖体识别位点和反密码子位点。 每一个氨基酸有其相应的tRNA携带, 氨基酸的羧基与tRNA的 3’
CCA-OH 以酯键结合。而tRNA的反密码子可以与mRNA上相应的密码 子互补结合, 以使氨基酸正确“对号入座” (因为密码子的序列对应于 多肽链上 的氨基酸序列)。
第15章 蛋白质翻译
Protein Biosynthesis (Translation)
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本章主要内容
翻译系统 蛋白质生物合成的过程 多肽链翻译后的修饰 蛋白质的到位
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原核
真核
基因在原核和真核细胞中最终得到表达
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1 蛋白质的翻译系统
原料氨基酸,20种 mRNA是合成蛋白质的“蓝图(或模板)” tRNA是原料氨基酸的“搬运工” rRNA与多种蛋白质结合成核糖体,作为合成多肽链的 “装配机(操作台)”
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一个嘌呤丰富区 起始密码
起始密码AUG上游的S.D序列(一个嘌呤丰富区)与其核糖 体小亚基中16S rRNA的3’端互补结合有利于30S起始复合 物的形成
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2.3 肽键的形成和延伸
(注意新的AA-tRNA如何定位,第一个肽键如何形成,核糖体如何移动…)
氨酰基tRNA进入A位
新的氨基酸-tRNA的进位依赖Tu-Ts因子和GTPห้องสมุดไป่ตู้协助
2. 氨基酰位点(A位点),可结合氨基酰tRNA(AA-tRNA);
3. 肽酰基位点(P位点),可结合肽酰基tRNA(肽-tRNA);
4. 脱氨基酰tRNA的出口位(E位点) ; 5. 肽酰基转移酶中心,是形成肽键的位点
等。
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2 蛋白质的生物合成过程
2.1 氨基酸的活化
所有参与合成多肽链的氨基酸都要激活,并由数十种高度专一的氨基 酰-tRNA合成酶催化。该酶由两个识别位点,它们能识别特定的氨基 酸和选择其所对应的tRNA,使两者连接起来(利用ATP)。
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