第2节多肽链合成机理
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mRNA-30S- fmet- tRNAifMet
2) 70S起始复合物的形成
30S起始复合物与50S亚基 结合→形成70S起始复合物 (具有生物学功能),
同时GTP水解生成GDP和P i, IF1 、IF2 、IF3被释放。
fmet- tRNAifMet P位点;
占据
4.2 多肽链合成的延伸(elongation)
go
2) 转肽(transpeptidation ) 3) 移位(translocation)
2) 转肽 (transpeptidation )
① 酶: 肽酰转移酶(peptidyl transferase);
②肽键的形成
肽酰基从P位转到A位, 肽酰-tRNA的羧基与
氨酰-tRNA的氨基之间形成肽键;
6)翻译与转录不偶联
原核细胞翻译与转录可同时进行
7) 合成速度
真核细胞:慢 3个肽链/核糖体/秒;
原核细胞:快 10-15个肽链/核糖体/秒
6 蛋白质合成的抑制剂
抗菌素: 氯霉素、四环素、链霉素,与70S亚
基结合, 抑制原核细胞的翻译,但对真核细胞 不起作用。
亚胺环己酮: 只作用真核生物的80S 核糖体。 白喉霉素与EF2,抑制肽链的移位作用。
2、 mRNA上翻译的方向
3、氨基酸的活化 4、多肽链合成的过程 5、真核生物与原核生物蛋白质合成比较 6、 蛋白质合成的抑制剂
3 氨基酸的活化(氨酰tRNA的合成)
游离-OH
高能酯键 只有 3’-酯参与转肽反 应
氨酰tRNA合成酶 氨酰-AMP
活性位点
氨酰tRNA
酯键
Gln-tRNA
③) 嘌呤霉素:
在肽酰转移酶作用下,可与肽酰-tRNA结合,形成肽酰嘌呤霉
素(易从核糖体上脱落),导致多肽链合成的中断.
转肽图示1
转肽图示2
新的肽键
嘌呤霉素抑制蛋白质合成的机理
3) 移位(translocation)
①延伸因子EFG (也称移位酶),消耗 1GTP。
②移位
核糖体沿mRNA(5’→ 3’)作相对移动。每次移动1个
止三个阶段,能量消耗情况:进位(1GTP),移位(1GTP), 终止(1GTP),每掺入1个氨基酸(形成1个肽键)共消耗 4ATP。
3)多肽合成过程中,多种因子参与:
氨酰tRNA合成酶,起始因子(IF1、 IF2、 IF3),延伸因子(EF-Tu、
EF-Ts 、EFG),释放因子(RF1、 RF2、 RF3)等。
2)亚基的聚合
3)辅基的连接
3、靶向输送
蛋白质合成后,定向地被输送到其执行功能的
场所称为靶向输送。
在这些蛋白质分子的氨基端,一般都带有一段 疏水性的肽段,称为信号肽。
靶向输送图示
信号肽
由10~40个氨基酸残基组成,N端为带正电荷的氨基酸
残基,中间为疏水的核心区,而其组成可被信号肽酶
识别并裂解, C端由小分子氨基酸残基组成。
校正部位(水解活性,第2个活性部位)
Ile-氨酰tRNA合成酶:Ile-tRNAIle,错载:Val-tRNAIle
Val-tRNAIle + H2O → Val + tRNAIle 蛋白质多肽链合成忠实性起重要作用
4、多肽链合成的过程(大肠杆菌)
4.1 多肽链合成的起始(initiation) 4.2 多肽链合成的延伸(elongation)
分泌型蛋白质的定向输送:信号肽与信号肽识别粒子
(SRP)识别并特异结合→SRP与膜上的停泊蛋白
(DP)识别并结合→分泌型蛋白质进入ER腔内→高
尔基体→细胞外
信号肽图示
Basic residue Hydrophobic core Small and neutral residue
分泌型蛋白质的靶向运输
met- tRNAiMet
(真核)
fmet- tRNAifMet ( 原核 )
met-tRNAiMet 、fmet- tRNAiMet、 met- tRNAMet 形成图示
fmet- tRNAimet-tRNAiMet
fmet- tRNAiMet
fmet- tRNAifMet甲酰化的作用
SD序列
10
10
4.1.2 起始氨基酸
1)
起始氨基酸
甲酰甲硫氨酸(fMet, 原核),甲硫氨酸(Met, 真核)
2) 携带Met的 tRNA
① tRNAiMet : 负责起始氨基酸的掺入 ② tRNAMet : 负责Met掺入多肽链内部
3)起始氨酰-tRNA:甲硫氨酰-tRNA合成酶
第2节 蛋白质合成机理
教学目标
1、理解肽链延伸的方向以及mRNA上翻译的方向; 2、理解与掌握大肠杆菌中多肽链合成的机理(过程) 3、了解真核生物与原核生物多肽链合成的区别; 4、了解蛋白质合成的抑制剂;
5、了解多肽合成后加工及定向运输;
本节主要内容
1、肽链延伸的方向和速度
每种mRNA只转译出1种多肽。
4)80S起始复合物:9种起始因子
eIF-1、eIF-2 、eIF-3、eIF-4A、eIF-4B、IF-4C、
eIF-4D、eIF –4E、 eIF-5
5)肽链延伸因子与终止因子
真核生物细胞的延伸因子为EF1α和EF1 βγ 终止因子只有1种,eRF,可识别3种终止密码
Amino acid arm
ATP
Anticodon arm synthetase Gln-tRNA合成酶
氨酰-tRNA合成酶
对氨基酸和tRNA(同功tRNA )两者都具有专一性; 20种 氨酰tRNA合成酶对氨基酸和与之对应的tRNA专一性称为 “第 二遗传密码”
活性部位
氨基酸——专一性很高,tRNA——专一性较低,氨酰tRNA
作业
1、真核生物与原核生物蛋白质多肽链的
区别有哪些?
2、多肽链合成后,一级结构的加工方式 有哪些?
3、什么是信号肽?理解信号肽在分泌型 蛋白质的定向运输中的作用。
6、哪些机制可保证翻译的准确性? 7、大肠杆菌细胞中,多肽链是如何合
成的?
5、真核生物与原核生物蛋白质合成比较
1)核糖体更大 :
真核细胞为80S
2)起始tRNA: 真核细胞为met-tRNAmet
3)起始密码子: AUG ,mRNA的5′端, 无SD序列, 但
其5′-帽子与起始因子的识别有关。 mRNA为单顺反子,
密码子的距离。
空载tRNA从P位点移出,肽酰-tRNA进入P位点,A
位点空出,为新的氨酰-tRNA的进位做准备。
移位图示
新的肽键
4.3 多肽链合成的终止(termination)与释放
4.3.1 终止信号
1)终止密码子: UAA、UGA、UAG
2) 释放因子(Releasing factor, RF)
4.2.1肽链的延伸因子(elongation factor,EF) EF-Tu、EF-Ts、 EFG (原核)
EF-Tu、EF-Ts:促使氨酰-tRNA进入A位点
EFG:促进移位
4.2.2 多肽链延伸的过程
1) 进位
① 新的氨酰-tRNA进入A位, ② 延伸因子EF-Tu、EF-Ts参与此过程 ③ 消耗1分子GTP
第3节 多肽链合成后的加工与定向运输
1、一级结构的加工修饰
1) N端甲酰蛋氨酸或蛋氨酸的切除
2)氨基酸的修饰:糖基化、羟基化、磷酸化、 甲酰化等。
3) 二硫键的形成: 专一性氧化酶 4) 肽段的切除
2、高级结构的形成:
1)构象的形成
在分子伴侣、折叠酶等蛋白质因子协助下,
形成特定的空间构象。
4.3 多肽链合成的终止(termination)与释放
4.1 多肽链合成的起始
4.1.1 起始密码子(起始信号)
1) 起始密码子
AUG, GUG(少数)
2) SD序列——Shine和Dalgarno(20世纪70年代)
在距AUG上游约10个碱基左右的位置,有一段富含嘌呤碱基 的序列,称为SD序列; SD序列能与16S rRNA 3`端的嘧啶碱 基进行碱基互补性的识别,帮助起始,也是与核糖体结合的 位点。
① 甲酰化后才能与起始因子、30S小亚基结合;
② 使fMet- tRNAifMet结合在核糖体P位点
③甲酰化可防止起始氨基酸进入延伸中的肽链, ④ EF-Tu识别未甲基化的 Met- tRNAMet ,使Met掺入 到多肽链内。
4.1.3 70S起始复合物的形成
起始因子(initiation factor, IF)
IF1 、IF2
、IF3(原核)
IF3: 70S核糖体的30S和50S亚基分开; IF1与IF2 :促进fmet- tRNAifMet、mRNA与 30S 亚基的结合
1) 30S起始复合物的形成
IF1、IF3促进下,30S与 mRNA起始部位结合;
SD序列
然后与fmet- tRNAifMet 、 GTP 、 IF2结合,形成 30S起始复合物:
练习
1、蛋白质多肽链的延伸方向为——;沿信使
RNA模板的解读方向为——。
2、1分子AA活化,需消耗——个高能磷酸键。
3、蛋白质多肽链的合成可分为——、——
、——三个阶段。
4、在蛋白质多肽链的合成过程中,消耗能量
的步骤有——、——。
5、肽键的形成由——催化合成,在移 位反应中,需要——的参与,一次移动 的距离为——密码子的。
RF1: 识别UAA、UAG
RF2 : 识别UAA、UGA
RF3: 不识别终止密码子,激活RF1、 RF2的活性。
4.3.2 终止机制
RF与终止密码子结
合, 使肽酰转移酶
活性转变成酯酶活
性.
水解P位点上肽酰tRNA的酯键,然后 释放了多肽链和tR NA。
蛋白质合成过程总结
1) 原料:氨基酸(活化),消耗2个高能磷酸键(2ATP); 2) 多肽合成过程分为:起始、延伸(进位、转肽、移位)、终